Difference between revisions of "Os04g0461400"

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Revision as of 19:54, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os04g0461400

Description

Hypothetical protein

Version

NM_001059531.2 GI:297602864 GeneID:4336058

Length

10932 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0461400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:23444227..23455158

Sequence Coding Region

23445173..23445373,23452134..23452191,23454976..23455058

Expression

GEO Profiles:Os04g0461400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:23444227..23455158 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008397:23444227..23455158 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgcttgcgttgattttgattctgtgccgcctagcgacccgcctctcttcatctagggttcaaccttcgagccggcttctcagttgctgcaagtggaggcggcaagctagagacagcaactgcatatcttgcaagaaaatcggttttatggccataccgatgattttcttgcaagctgtgcagttgttgtctcaagcttgctgcctccctttgccagaactattggatatgaaaacagagtcaagaaatgcagaatccaggtttgccaaaagcagcaatataaatatgttgtgtatacccatagaaacatgctgggttatcaactcactagtttttttttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLALILILCRLATRLSSSRVQPSSRLLSCCKWRRQARDSNCISC KKIGFMAIPMIFLQAVQLLSQACCLPLPELLDMKTESRNAESRFAKSSNINMLCIPIE TCWVINSLVFF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9786..9986#2968..3025#101..183#gccgcccgtcgcatgaccacgaccctcggatcgtggtggccgttggctccccgattagcttctcccattgccgctcctgtaggctgtagccccagccgatatgcttgcgttgattttgattctgtgccgcctagcgacccgcctctcttcatctagggttcaaccttcgagccggcttctcaggtgagacgttccaccgattttacagcttctcctcaggctctcatatatatgtatttttttttgcatagttaagttgttaattgctgatactgagttaactgaatgccccgagctgtgcggtcgttttggtgtgatttgtgtgaaaagtttgattagtttcgttgtagcatgaaattacaagcagcttatgcgttttgtttcatgtacggttgtcaatgccagtgttaatgttagcttagttcttttctttcttgatcagggagtgcattattaattgtttttttagagttgcactgatactagaattgccattacttagttttgttttgggaggattttgctgcttttaaccgtggttaggataagtggataactcttgtattggtctctaacgagattgcctctagtacttctttctagactttagtgtcagcgccctacatgtagtcatgtactgcacatccactctgatataatgaaagcttaagtttgaactaatttataattgttttggcttgtgaagtgtggtaacatatgttttctaactgaggatgtatacacagtttatctgatctgtgtatatgtcggatgtatgtgttcattatgcgtaacggacatatgagtatgctaaagttatactcttgcatgctgctaaagtttaacactcccttctatatgacataatatagtacaattcattcaagagaatgttttattctgaaacttcctggctgtagttacatttcttcagatgcatttactgagtttcagtctgcatgttagaatgtctatttggtggttttgtagaactcaagagtttatgcagtatatcttatggtagtttacttttgttgataggcatgcaatagtttcatagaggtgcatgaataaatagttaaaaatgcaaaatattctgccaatgctggaggtcaaattggcatgtgggctgaccatttgagaattgatgaattaattcagtaaaaatataaagcatatggttttcatgcttagacttgttgcttcattattatttccaaaatgttttcactgttggaacttggaaaggattccgtaacactaatacctttccagtaataaaagaatgtgatggatggtaattatggtgaacaatttgaaacataaccaacaactttgtgaattttaggttggatgtatgagtgtgatgtggggatactagtagtagattgtctaaaagatctctttgccgcatttttgtgtcacgtcccaagaggtgatgactgatgagcccaatcgcaatgcaacaataccaatgtgaatacagaatggagttgagaagatagaagagaagcaaagtatacagaaataactctattttatttcatctactcttttggacaaagcagtgctcagtttttgtatggtcctcatcttaacacctcagattataacaaccactaaatgggccttggcccaaacatactccattctcaatagcccattgccaaaagactttcatgttcctatccccactgctgtcagcacaaggaaacatttagtttttacagacacgttgaaaaatattttgtgctcaaggttgtatttttgtgactgtgttatatatcaaccttttctccttgcacaaattgagcttaatgaaaatttcatggcagattgttctgccattagcgctatactattattggattcttttttgacatgagcatgacactagtgtgatggagtctggttagtgttaatacatgtctcatcatataaatatcatccttgctattggcaggataataaaacaaaagagatactaagttgcatacccaatgtgttgtttatctgatgtcaaagttatcttcacagttttggagtttggaccagcacttgcattatgcagttcttgaaacagagcatttgagttgactagtttttgtagtgtctgtttggttgtgaactcatgtcttgcaacatgatcaggccttctatttttacagccctgtatcatgattgtcttttaatgtttgatgggccagtcaaattagtcactaaattatgaatatagttgttttgagcatgtcctaccagtgccaaatagattagtttttttttttttttgggggggggggtgggttgacctactggtactatggggtgaatttagctgagaacagcagttgattcttcatatctctgatttttagtttttctttcttcgctgatatgagcttttgtatgctttgatgaacacattgtatgccctctgcttttgagcatttaccactttactaaagtttctaattcagtgaagaaatactgaatatacaattgtattaaccaagtttcccatacaaaacctttgctagttccatgctattttcctgatgattattattattcaggacagtttgtactttgtagtagcactgcaccgctactagaaacacatgcaatgcaaaagctagtttgtagaacaatttgtatggaaatagttttccatgccatttgagctacaactgaaggtttctagttctgcattttgagcaaacatcaacttgttttttactgaaacataaacttgtttttaacacgaactctcgcggttcatagtaagggaaaggggaaggctgcattactgcaacatttaaatttgttaagcaaatatttgtgtagtatgccaatgaactttttgttgtatgtttgcaatttttttaactgccaatagcactagcaactaatttcaaatatgacccttttgatccagctgactaattcttcctttgccttctctgctagttgctgcaagtggaggcggcaagctagagacagcaactgcatatcttgcaagaaaatcgtaagtcttattattactatcgctaaattattttgctagtgtagttaatcaccaaaacattatcttctctaccccacacactattaaaacatgattaattcactccctttgacacttgtctccttgtagatgccatcatactctactcactccgtcccaaaatataagcatttttagctatgaatttggacaaccgtgtgtccagattcatagccaaaagttatattttgggacagaggtagtatgttaatattattattggaactgttcatgaattttactttatttttgaaattttccatgtctttgcatgcattatttcattttcatatctcgggggattaggcgctcccaacctagtgaagtacacattacatattccaagaattatttgaaacaagttatgatgtaattatcacccaaggtctcgtgattagtataaaatagtttttctgatatacataactaataatcattctatccggtggtacaagttagtaacatgaaagtgcatgggtatttaagaggcacaattagaggtgtaaggtccaaggtcttgggtcctagacaaaattattcttttgctataaactttctggacatattacattgatgtgcttctgattattttgtgtgtataaagttttgctaaaagtactatttgctacccgacccctctctcccccccctcccccctccccctttcggagaagatggcttggggaggttacgagcacttggctctgataccagctcttgcccaggcagtgctaggggtctagtcaccagatatgaggataggaatgcagcatctagatgcaatgttggatgtgagattggtatgtggcaactggatggtaatccagtttgttgattttcttaaaaaataattatgcaaacataaatgcagtacataaagtaaagacaaactgtaaataccataacatggtagttttatatagaatggtccatgtgttcattcatataccttgataggttgaagatagatccttctgaagattacaccaaggacttggtacaacacgttcataattatacatgtacaggactctcacaaggactcttacatagactctcacacttgactttcataagtcttctatttaggttataactatactactaacacttagatggagtggagtgaagtgtgatggctggtggagaggtgagaggaatggttgagtgagatgtgttttggttgtgttgtgttcctgagccccttatataggacttggtgaagaatctttatgatatatccatttgactttaaggggttttatgatgtccctttagatttcacggagagaatctttggtgatgacgcttttgaccttcaataaaagtatcataatatcgccttttgactataggcatatcttatcttgaatagtgtagattccttatcttcaatagtgttttttgtcggggatgacaagatcttcattcattatcttcactgtatatcatgggtgccaattgcatcatgtcaatttttgatggctctgttttctgataccactgagccaggcttctgtagtaaaatctggtttaattatacgtcctgctcccttgaaatattcacaactttggttataatatctgctaataaaaatccttgtgatcttgttttggaaaaccaactgatattcataatctatggtaatagcttcttcaatttctgcagcttcagaaaataatctccaattctcatgatttgcaatcattgtatacatttcttcttgttcatctgataatttgctaggaccgccttcttgaaaattaaattgtttattcatgatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagtgaattgctggacgagcatgtggtgtgaatttaggtggtatggagga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External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0461400, RefSeq:Os04g0461400