Difference between revisions of "Os03g0347900"
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Revision as of 19:35, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0347900 |
|---|---|
| Description |
Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid domain containing protein |
| Version |
NM_001186485.1 GI:297722100 GeneID:9266636 |
| Length |
10742 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0347900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:13087373..13098114 |
| Sequence Coding Region |
13087558..13087851,13088086..13088334,13090989..13091124,13091552..13091770,13094571..13094949 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>gctgatcaattgaaggaggaggtaactttgctatttgaaacttgcaaggatgtggaggaaaaattgaaacttgtggatgtgctccaacatttgggaatagaccatcacttcgagagacgtattgccgttgctttaagcgacattcatggtgctgaattcaacagctccagcctccatgatgtcgcgcttcgattccgtttgcttcggcagcatgggctatgggtttctccagatgagttcaacaagtttaaaggcccagatgggagattcaacgctgaagtaatagatgatcccatgggcatgttgagcttatacaatgcagctcacctattaattcatggcgaggtggaattggaagacgctattttgctctcaaggcatcaactcgaaacaataatagcaagaaatctcaagtcgtcaccattatctcaacaagtaacacgggcccttcgaatacctttaccacggaccttgaagaggatagaggcgcttaattatatagcagaatacaatcaagagcaagcatgcaatccctctgtgctccaacttgcaaggctggattttaaccttctgcaacttcttcacttgagggagctcaaggaattttctcggtggggaaataatctatacggtgcagtggaactaacctactctcgagatcgtatagttgaatgctacttttggtcctatacaatttactacgaacagaaatatgcgcaagcacgaatcatccttgccaagatattcgtgctagcaaccttactagatgacacttatgatatgcatgctatattggaagagggccaaaagctcaatgaagcaatacagagatgggatgagagtgccatttctgttttgccggagtacttgaagaattactatgccaagctaatgagtaccttcaaagagattgaggatgaactgaaatcagaggagaagtactacattacttatgctgtaaaagcgtatcaaaggttatgcaagtcttacctccaggaagctgtatggtttcatcagaattacataccaagctttcaagaacatttggatgtgtccatcatctcctcgggctcttcaatgctatctgttgtgtcatttgttagtgccggtgatttagcaacaaaagaagcccttgaatgggcctttggttgcaccgatgctgtcaaggcttgtggcgaaattggacgcttccaggatgacttggctgcattcaagcacgggaagggcaaactagatatggccacctctgttgagtcctacatgaaggagcacaatgtcactggtgaggaagccacggctgtgataagtaatctggtcgaagacgcatggaaaactatcaatcaagcacgctttgagcgttcctcgcttgtgccggctgtgaaccgagtcgccaacttagcgatgagcataatgttcttctaccaaggcagcgaagacgcctacaccttcaacaagctcagcatgaatatcatcaagcagctgttcgtcaagcctatccccataatctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>ADQLKEEVTLLFETCKDVEEKLKLVDVLQHLGIDHHFERRIAVA LSDIHGAEFNSSSLHDVALRFRLLRQHGLWVSPDEFNKFKGPDGRFNAEVIDDPMGML SLYNAAHLLIHGEVELEDAILLSRHQLETIIARNLKSSPLSQQVTRALRIPLPRTLKR IEALNYIAEYNQEQACNPSVLQLARLDFNLLQLLHLRELKEFSRWGNNLYGAVELTYS RDRIVECYFWSYTIYYEQKYAQARIILAKIFVLATLLDDTYDMHAILEEGQKLNEAIQ RWDESAISVLPEYLKNYYAKLMSTFKEIEDELKSEEKYYITYAVKAYQRLCKSYLQEA VWFHQNYIPSFQEHLDVSIISSGSSMLSVVSFVSAGDLATKEALEWAFGCTDAVKACG EIGRFQDDLAAFKHGKGKLDMATSVESYMKEHNVTGEEATAVISNLVEDAWKTINQAR FERSSLVPAVNRVANLAMSIMFFYQGSEDAYTFNKLSMNIIKQLFVKPIPII</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10264..10557#9781..10029#6991..7126#6345..6563#3166..3544#2744..2975#gtgtgtgcagcagagtttgcaatcttacatggcttctaacattagtgcagctgctcccatgttggtagaagctttcgatgcctcagtgtggggcgacttctttgtgaactatactccagaaccgttacaggcatgtttatattattgtttatgtgtactactcacaaaatttatgtagacacattctctagctcttaatatacataagttttcttacatatatgtaatttcagtatttttaattaatgctacagcataacccccaacacatatatagtacgttcatagtactcactttggaaatagattaaagaaatacttagttcatataaatgttagttttagttacatacgttgctttgtaagaccattataactaagcaacccagaataatttatatatcacatataaattaaggctgaactaatctaagcatccattactaaggacctcttcggattgagggatttttagaggattttcaagggaatactgtagatagaaaatatttcctttcctgtcattcggttcatagaaatcaacccaaaggaaaatcagaggaaaaattcctttcctgtggaaacaatagagaaacaaaggaaaatttccatccactcctacctcattttttctatttcctatgtttttcctctgcctatccaaacacatgtttaccaatcctatctacagaattcctgtgttttccaatcctccgttttacacatacattcctatcatattcctacgatttttctattcctacgtttttacattcccgtgatccgaataagccctaagtgtagttagtggtagtctctcttctcttattaagccacatcgcctcagttatttctaacccttgaatgattatctatggtccaaattatcttccatcttttattctcttataaagtccctccttttccttctctcattgacccataccacattagttttgcttttgaataagtaatttatatataattgaaattgttataaaccacatcatattgattgtttgtagctttttgtaatagtcgatcaaagataaaatttatgtaaagtatttatgttatttctacagttattatacaaaactctcacagtagtatgcagggttttatctagttattaatgctacagcataaccccatcatatatatagtacatttttcatagtattcactttggaaataaactaaagaaagaattagttcatataaatgttactttttttaatggtacgcaccagacagtgcgaggttcatattgatagagcagaaaaaattacacgattacaaccctaggaggttgtaaccaggaaaacgaagaaaaaatagccacccccacgcatcgacagcaccaacacacatacccgggagaaagctagcatcaaaccagccaccgctaggccaacaaaggaactacagccgatgtctcccaaaacctaacactaacaaccgacaccaaaccctcactctagccacctctttgggattgagggaaagagggtgagagagaagaatggaaccgctctcccccctaggccctccgacgtggccaactagcatacgctagggcgccgacacaagaggacatgcatctagagagtaagcttgcaccagttgtctaggaggattttggcaagggggttgccttgacgacgtctccatggagaggagtgacaaaaacactggcgctgccatccgtcaaggtctcaaagagagacgagattgggttttcacccgacagccccattggagaagatgagacggcacgacaacgccctcaagagggaaagagaagctcgaaaacgccatcgttgccggccgggccaaggctgagcaaggttttcacccgccgcccgccgcctacgaatccacagttgacgcacaatgttagttttcgctatatacattactttgtaagacaattataggtaagcaacttagactaatttatatagcacatttaaattaaggctgaactaatctaagcatccatatttcctaatttgcagcagtctccattcgtgttatattcatttactgtatcctaccaaggatatgattaattatacatacgtcgggattgacaattaactaagtagtatgttgtaggaagaaaaaaaatccattaaactatttcgtcggaacacttaatcctctaaactatttttttactcgtttcccaccccaaactattgaaaaatttcactttacgctttaacactatttctcctttatgtttccctctacatatataagacatttttcactaaaattctggtaggatgacagatgcattaaaacatacatctcaacttttttttcgatttttcttacagtttaatagagaggtaagaagcacttaagacttatttaaacatcaagatttaaaatccaagcaaatagtcatgaaacattttgaaaatattttagctttgataatgatatcatctatggctctaaaaagttttagcttaaaatacaactcgtataaagagtaaaaaaaaggagataaatgaagtgaaccatttttaatagtttaattatgaggtaaaatgataaaaaaatagttaaggggggttaactactttagtgaaatagttcgggagagtacaatggacttcttttccctcataaaaaaatatgctagaaattcatatgatttgatccccttgtgtgttagtcaataatagtcagtgtgtgtgcagaagtcggaggaatggatgagggataggctgatcaattgaaggaggaggtaactttgctatttgaaacttgcaaggatgtggaggaaaaattgaaacttgtggatgtgctccaacatttgggaatagaccatcacttcgagagacgtattgccgttgctttaagcgacattcatggtgctgaattcaacagctccagcctccatgatgtcgcgcttcgattccgtttgcttcggcagcatgggctatgggtttctccaggtatagtatgtgtgtaaactgcaaattaacctaacatatataattggcattaactctaaattaatttgtatctcatgaagtggagaggctggatgcaatgggtcattttttttcaacatgtaaaagaattggattgaaatcgatgattttgtattcttgtgataaaaagatcccgcatgattccttgcagatgagttcaacaagtttaaaggcccagatgggagattcaacgctgaagtaatagatgatcccatgggcatgttgagcttatacaatgcagctcacctattaattcatggcgaggtggaattggaagacgctattttgctctcaaggcatcaactcgaaacaataatagcaagaaatctcaagtcgtcaccattatctcaacaagtaacacgggcccttcgaatacctttaccacggaccttgaagaggatagaggcgcttaattatatagcagaatacaatcaagagcaagcatgcaatccctctgtgctccaacttgcaaggctggattttaaccttctgcaacttcttcacttgagggagctcaaggaattttctcggtatatttaattttcctaagtacttgtttcatgccacacattaatcccctctacttccatatagctagcactagtacagattcttctatctataacgggctctaatatgcctagaaatagcgggccgtcacaaggaagtcatctcaatcgggccgaaaagtgcccgattgagatatggtcatacagacatgttagatgggcataaaacttaagcccatcacggatgacaactatcagtgacaagccgtagtttaggcccgattgagataacatttcatttctcaaacgggcctaaagttgcagcccgtcacagataaccatgtgacgggcaccaactgtagtcccgattgagataacattccatatttcaaacgggcctcaagttagggtccgtcacagatgaccatcatccgtgacgtgcaccaatttgaggcccgtttgagataacaactaggcccgtcacagatgactcatcagtgacgggctatatacttaatctctatcgggcattaactaaagcccgtcaccgataagtatttttccatttttcatatgaagtgtttatatttgtaagttgaactataacaaaataattaagtgcaaaataataatttatttcatgagtcaaaataattttacgggtagtaaatgatttcaaatggaaaaaatgtcaacaacaatgttgtataacttatcaagatttacaacttttagtttggtcatttttctatataacattttttgaacagtttgaatttgaatttgaaaatatgacaacttcaaacaacattttcaaatactaaatgatttcaattgaaaaagtcatcaacaacaaagttgaataactcatcaagatctagaacttttatttttgttatttcttcatccgataaaatgttagcaatattattcacaaattttacatatatgtgttatagtttataaaaccagacaagagatatgttaattttgtgaacaatgttactgtcactttgtcgtatgaagaaatgaccaaaataaaagttttaaatcttgatgagttattcaactttgttgttgatgactttttcagttgatatcatttagtatttgaaaatattgtatgaagttgtcatattttcaaattcaaattcaaacggttcaaaaaatgttatatagaaaaatacccaaaataaaagttatagatcttgatgagttatacaagtttgttgttgatgacgttttcggttgaagtcgttcactgatctaaaattctatttgaatttttcaaactgaatttcaaatttcaaattgtttaaatagagtcagatggagaaatgaccaaaataaaaattttgcacctcgatgagttctacaactttggttttggtgac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