Difference between revisions of "Os02g0209000"

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Revision as of 19:11, 22 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os02g0209000

Description

WD40-like domain containing protein

Version

NM_001052798.2 GI:297598813 GeneID:4328693

Length

10028 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0209000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:6148184..6158211

Sequence Coding Region

6156372..6156733,6156806..6156842,6157400..6157454,6157566..6157627,6157717..6157737
,6158030..6158032

Expression

GEO Profiles:Os02g0209000

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:6148184..6158211 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MPLRLDIKRKLAQRSERAKSVDLHPTEPWILSSLYSGSVCIWNY QTQTMVKSFEVTELPVRSSKFITRKQWVVAGADDMFIRVYNYNTMDKVKVFEAHTDYI RCVAVHPTQPFVLSSSDDMLIKLWDWDKGWMCTQIFEGHSHYVMQVTFNPKDTNTFAS ASLDRTVKVCDFVPYICLA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1479..1840#1370..1406#758..812#585..646#475..495#180..182#gacaactctgttctaacttcttcttcctcagttcctctgcttctcgatcttgagcgatttcgaagatactactctcttcctcaactccgatcagatctagcctgattccggcggtgaacggcggcggaggttgtgtaacagccgcgtccccgccgtagccggccgtcgcgggcgtcacaatggtacgtgactcccctctctctctcgctctcgccttcccccaggctcgcgctgcttaggtttcgccgcgagtggggatcggtacggcgagggcgaaccgtttgacggccgcgccgcgccgcgcggtgccgtgccgtgccgtgccgagatccggtggctggagcgtcgaattccgcgtggatctggggtttttttttgtttgttgcgtactgacgtgattgccttctcgttcgtgctttcgtgtgattttttttttctctggcggcgaaatggcgatggctgtgatgttggcagccgctcaggttggatatcaaggtaaccactgcgcctctccctcggatctgcttagcttagtttggtttgttttggtgtgtttagctgaatgtgtttggtggttggatcagaggaagctcgcgcagaggtcggagagggccaagtccgtggatctgcatccgaccgagccatggtgagtgggcaagtttgtgtgtgtgacatgatttttgggttttggggtgctagtgatgtaatgattatgttgttcaaagtcacatgaataacttcctccggtgtaatgcaggattttgtcgagtctgtattcagggagcgtttgcatctggaactaccagacgcaggtacatgactgttcacagtagcttaattcgtcattttctgctggtttcatggattttatgaaatgatgattatctactaccagcacgctgagcttttgtactgcaaaatggatattcccatccatatgtaaaattcaagatacattggatttagtgtgcttgtagtagtaaactttgacgatatgcgctcatagtaagttgtaccagagcccggaaagaaaacaaagaaaaagaggggggggggggtcaaacatagcgatgaatgatgaattcttaaaacctagcgaggaagtcttcgatgcattgtagaaaggaatatggtcaaaatagaagtaacaaggagtcaatgaacttctagatggttgtttcagatgtgtgagtgttagctacataattgggacttcttaataggtttgcaaactatttagagcaaaacaggaggaggtaaaacataaaagtaaaatctagaaatcgatggacggaaaaagaaacatacatattttcagcatagttactcttaaagttaaactgattataatatattcatctatcctcagacgatggtgaaatcatttgaagtcacagagttaccaggtatgctttcccacctcatcgcttacttctgtttgatataccatcttgctaatataatcatccccatttcagttcggtcatctaaatttatcacacggaaacaatgggtagttgctggtgccgacgatatgttcatacgtgtgtacaattacaatacgatggataaggtcaaggtttttgaagctcatacggattacatcaggtgtgtggctgttcacccaacccagccttttgtgctgtcatcatctgatgacatgctgatcaagctttgggattgggataagggttggatgtgcactcaaatcttcgaggggcattctcactatgttatgcaagtcacatttaacccgaaagataccaatacttttgctagtgcttcacttgatcgcacagtaaaggtttgcgattttgttccttacatttgcttggcatagtttttgcatttctaacatttcttggtctggatttgaatgtggtgcccttatttaatttcaggtatggagtcttggttcccctgatcctaatttcacattagatggccattcaaaaggtgtcaattgtgttgattactttactggtggtgatcgcccatacttaattacaggctctgatgatcagaccgcgaaggtatgccatctgcagtgaattatcttgtgagtatattggacattgttacgagacacttcgttgaatcaggtttgggactatcaaacgaagagctgtgttcaaacgcttgaaggacatgcacataatgtctctgctgtttgtttccatccggagttacctataatacttactggctctgaggatgggacagttcgcttgtggcactctactacctacaggttctctcgctctctccccctatgatacaactcataggatacttcatgcatagtttgaattttgagataaattcatgtactcgttactctcgtgggtgtgttgttctattgatggcaataaaaactctgttcggtggcataaaatctggttcttaaataatcattggtgtgtcatatctattgatgaccttacaagcatagtttctggtcttcatgtccttgtttctttacgaattagtttgtgcatttagtaatttattatttagccatgtaattttgattgatgcagcattacattctttaatctaaatataaatttttgagtgaaagtgttacatttactcctatagcataagtttgtattacaactcagtcctattttagtaacaatatagagcaatttatagcttgaagtacgactagctaagaggaatattttctattaaacctgtcctgattggcatcagagctggtagtgatggttagggtcaaactaagagaaatatgcaactataccacttcctaacaattggtgacctctgaagtgaagcactgtgtccagagaatttgaagctaccattttcctgtggtgttgaaaataaggagattctcttgccatattttgaaactagcattctacaccaggatatagataaacaattttggggggtgcgaccaggatgcacatcacgcccatgccacaaacattcacttacgcgtagctactatgcttgttagttacatgaattacactgtcttcaataagtattataggttactatatatgcatatgcttagttggcacctggcaagatgttcttatctctgtgcattggtttgttcttctcttttttttgaagactgctttggttgttccatttttgtcaatcattgttttggatccttttaatcttactgtagactggaataacacgttgcttgtttcttacaggcttgagaacactcttaactatggccttgagcgagtgtgggctttaggatacatgaagggttcaagaaggtattggaaatattacactcttactattcggatgctatggacttacggttaatgtcaagtaccatgatactaaatatcacctattcatgtgctattgaagtttcccacacccaaaatgaatcacagtataaagatttgattagtttagcgtatatgttctctgctccatagttctctccaatgtagctataaactttttcgttgtctgctaaacagtttattccacaatttgctcttcacagaaacccttttcttttcatgttttcattaacttcttccttttcaagttaatttagtgatacgggaaaaaacttgacttgtgcagggttgtgatcggatatgatgaagggacaataatgataaaaattggccgtgaagttcctgttgctagcatggacagcagtggaaaaatcatatggtcaaaacataatgaaatccaaactgttaatatcaagactattggtgcagacaatgaggttttcttgttcaccatgctaatatgttgaaaacttgtatactttcttatacgtcttgtttactaacctgttccatttttcagattgcagatggtgagcgcttacccttggttgtgaaggagttgggaacctgtgatctttatccacaagtaagttcatatttgctatttaaacgaatgcatcattcgcatattgatgttttccaatagaaccaacttgatgcttgcaaatgagtcccaagtttctttttcctattcattacacgagtcacatgtatacaccatttgaccatgcatgttgaaatattttaatatgttagtttatttgacatttgcactggtgagttgttttatttaaacacaccatggagattctgttgttatagtaaaattaaattaatatcaaatctagtatagtgtaattatggagttggagtgccggttttgaaattgtacttgtcgggttaaataaatgtgatgaacttttctacgttctggtttatgtttgcatgttattaataatagtgtattcatttcagagtttaaggcacaatccaaatggaagatttgttgttgtatgtggagatggagaatacataatctacaccgcattggcatggagaaatagatcattcgggtctgcacttgaatttgtttggtcacttgatggagaatacgctgtcagagaaagcacctcgaggataaagatatacagtaaaaatttccaggtttgtactgcccactgccccttcttttaattatcgttgtacatcagagtaggggtccttcaatgcaatgtgtggggctagaaaaatttagtaggtgtgcacatttcatggacaagctggagtactgtgcacattccaatataaataaaattgccaaaaaaaaattgcaagtagttcaaaaaaaatatagcatgaatagaataccacaaattatataataaaaaaatgaatatctcatgaaacatttataaatcaccaccgtcgatcttcaaataacatatccattgtttcaaatcgtttttcacatttggctaatcacaattagaaaatccattaaaaatcatctacaatttattaatatcactgaaggtttcataatataaagttagttttattcttgtttttctttagaatataaaaaatcagtaaatgaccaactccttctggataggg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ggatccatattttacacaagagtacatagggtaaaagtatgcttgctggatccagaatgtttctttgatgcaatctgcaagacaacactttgtgcgagct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0209000, RefSeq:Os02g0209000