Difference between revisions of "Os02g0312800"

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Revision as of 19:13, 22 July 2012

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os02g0312800

Description

Ankyrin repeat containing protein

Version

NM_001053190.1 GI:115445750 GeneID:4329134

Length

8799 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0312800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:12368725..12377523

Sequence Coding Region

12369523..12369607,12369838..12369962,12370744..12370896,12371937..12372002,12373274..12373343
,12373423..12373493,12373564..12373767,12373942..12373991,12374089..12374170
,12374643..12374711,12375541..12375630,12375756..12375818,12376466..12376559
,12377133..12377199,12377338..12377461

Expression

GEO Profiles:Os02g0312800

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:12368725..12377523 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgacccgccgcgcgccgccacccgccgccgccgccgccgcggatggcagcatcgaggagaacgcgatggccatcctcgacaccgccggcatcaaggacgcccgcgacctccacgacgaccgttgcgccttcctggagaccgtgcgctccgcctgccttgccgccgacagcccctctcccccttcgtggagaatgtataatgccgttttccagattcttcaagacagcagctcgctggagcttaccatggcaagtctccacctcttaatggagttggggaagcaataccctagagcatatttgaccgattctggttctggccaagctttagtggcagttaaagaggcatggtcaccatttcaccttcgcagcgatgttggttgtggtgagattgggggaaacaacaggcacttagaccacctcttcgattcttcaagattttcatcattaatcgaggatatggttgaaacagctaatgacacagatgctaataatggaattgagcatataaagaacatggtgctgcttgaatatcttgtcagcacccttgaggctgattttgtacctcgtcagattgcatataaagagtcattagactgggtaattttcagggaatctcttctacagatgcttctggtttcacggaaggtggcattcaaatctttagtaaagaactgcatatcttttctgctcaatcaatataatcagggagttgaagatggcatatcttccaaagaaggttctgctaaatcagcacctgatctagaatcttccttagctatcatatcttttgaattcgaaagaaaagctcttgcatcagttcagaaacttttcactatggttatgaaccttgacttgattagaaaagaagcagacacaatgggtctgacttcaagagctgatgggtgcaggaatcctatcttggacgttattttagatgagctaacttacaacataagctatttatctccatttcttctgatctttgtggaatggaagtggaaattggagattatacttcagtacttttcaaaatattgtggcaagcctgcagttcgtactcggagatctgataattcacaacacgatttgacattggaaaatgtactgactttattttcaacggctgcaaccacaaaagccattgttaaaaagatgagttcagaagttgtccagctgctcttagcaaacgcataccaggtctgccttcatctggaatgtgattctagcaaagatagtgatacaacaaagaagattggagcgactctcctacagatatctgagagttttgtatctgcttttcataatatgagaaaaatcaacccggatatgcagctctcgccgtttgagaaagaagctctcttcactgctgcgtcaatggctagagttctaaagaacaaacaaagatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATRRAPPPAAAAAADGSIEENAMAILDTAGIKDARDLHDDRCA FLETVRSACLAADSPSPPSWRMYNAVFQILQDSSSLELTMASLHLLMELGKQYPRAYL TDSGSGQALVAVKEAWSPFHLRSDVGCGEIGGNNRHLDHLFDSSRFSSLIEDMVETAN DTDANNGIEHIKNMVLLEYLVSTLEADFVPRQIAYKESLDWVIFRESLLQMLLVSRKV AFKSLVKNCISFLLNQYNQGVEDGISSKEGSAKSAPDLESSLAIISFEFERKALASVQ KLFTMVMNLDLIRKEADTMGLTSRADGCRNPILDVILDELTYNISYLSPFLLIFVEWK WKLEIILQYFSKYCGKPAVRTRRSDNSQHDLTLENVLTLFSTAATTKAIVKKMSSEVV QLLLANAYQVCLHLECDSSKDSDTTKKIGATLLQISESFVSAFHNMRKINPDMQLSPF EKEALFTAASMARVLKNKQR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7917..8001#7562..7686#6628..6780#5522..5587#4181..4250#4031..4101#3757..3960#3533..3582#3354..3435#2813..2881#1894..1983#1706..1768#965..1058#325..391#63..186#ttcttgttcccgcctcgcccgccgttaacccccgaaaccccgctcaaaaccccccgaagaaaatggcgacccgccgcgcgccgccacccgccgccgccgccgccgcggatggcagcatcgaggagaacgcgatggccatcctcgacaccgccggcatcaaggacgcccgcgacctccacgacgaccgtacccccgcctcccagtcccctccctctccctttcccccgtttccaatctctccggaattttcctaggtttctctctctcttgcgcccaacctggtgattcccggcgctaatagatcttttgcgcgctcccccacaggttgcgccttcctggagaccgtgcgctccgcctgccttgccgccgacagcccctctcccccttcgtggtacggacataatccctcgtgtagtaggctacccccttctgtttaataaacctatgcccttggggtgaaatttttctggaacatgctggtagcaatcttactttaataaggacacatcttttgtgtgtgtgtgtgttttttttgtgcatattgatactcgtgattccttctccagaaattgtttcgcttgctgaaagtttttccgtacatgttcggggctatctgttcacagccttcagatgttttttttgcttatctgttttataaatttagtccaaagctcttgatatatatactcataccatcttctgcacttcttttaattaaaatggagtttgcatagatatgcacttgttttacactaatactgaattcacgcatgtatttgttacggtttcttttataacattccttgcactaggaatacttaatattttcttcttctgtaatttttctgattaactagttttctcctgtgagaaatatgctcattttgctcgttgtttgatcaatccacaacccctcatgatgatatgaaaaccttttcatgtgaatcctccttccttttgcaaggagaatgtataatgccgttttccagattcttcaagacagcagctcgctggagcttaccatggcaagtctccacctcttaatggagttggggaaggtgaaatgtttctaatccctttcacaatatttctggcatttttatgcaagcagtgaggactcttgtccctttggttgtatatatcatttactatctatgtattatttatttgtcactattgaatttactatttaagttttgaccactaatatattttaaattgtttgattaaaatgaatgagagtcttatcattaatttgttaaccaatgttagctagcagtattgtgtacttctaaatgtttacaaattacaattcgttgctggaaaaacaatcgtcaaaatttatgcagtgagttcaacagtgataagtacatgaaaaatggaaaaaatatgtttgagttctgacaatgtggacatatgctcatgatttttcttttgactttgaaacagtaggggaatcccctatggtatattttatattaaaggggcgtttatgtacaatgattcactatttaatatcttcttgaggggtgaaaaccatttaatactgcaatacttcttgaagtcttactactaaagaattttccttggtgtttagggcagctctgcttcaatcattgtgtactatgataaactatcaccagaaactattgttttttaattgccatctcatctcacttcatttatcttttacgttatcttgcagcaataccctagagcatatttgaccgattctggttctggccaagctttagtggcagttaaagaggtaaaaggatggtatagtttcaacaatcattttcttttgaagcacatagtaccatgtgtatatatgcttccattgaattttcatgtcatacatgttaccattaagtattttcttgttctctgcaggcatggtcaccatttcaccttcgcagcgatgttggttgtggtgagattgggggaaacaacaggcacttagaccacctcttcgattcttcagtaagttgatgttatatgccatttactcatcaagttctaatttctctctattttttttctgctgatgaaacttcccacccatgttttggccaaaaagtataatcatatgttattattgtcatgcatccttgtaaccaagttaacttagaggtaatggttcagcagctgtgtgccacatatggttgtggccctcatctgctaaagctcctgctggatcactagaggctggagccatgctggctggttggaggcctgcctaatttgctgactgcatctggcagaatgccatgatgaatacgacgacttgtccctccttgacgagcaggtagctatcaacctctgtagggtggtagccactggtgttacagagtgctcaggacatggcaatatctttggtaggcatgataaaaacacaagtcataaatctttttctcctacctttatgcaatcttggtcgaagagccaaacctgctcaggaagcaaacaaactttgcttttgtacagttgtaccctccccttgctgttgtgctgcttgggtttaaggctctaagcctctaggtcatctagttctaagcactgatttctacctagccactcaactgcttgagttctctaatggattatggatgttttccttattatgttggtacatggtactgtatattgtcaagaactgggaattacagttgccttttgagcctatttttattttaagttactatatttaagtatatccaaacttattgatcctacatatcaacgtatttggccttctgaatcctgatttttctgcatgtgagatatctaattctggttttcccttttgaagagattttcatcattaatcgaggatatggttgaaacagctaatgacacagatgctaataatggaattgaggtaattgacaataggccttggttctttgagtgatgggagtatttcaattggaaatccaggagcatatgtcatcatattataactcagcataaatatctgttctaattgactattaaaaagatgactacacgatgggaccataccatagtcattaaagatcaagcttaaattagagttctatacctcaatatggtcaactttctaatagtttaatgaaggtgcttaaactcatgttgagtttaatcctttttgacctacaggatatatatttttaatttctactgttatgctaatgaaagtaatctcatatattgcctattgagctgttatttctcaaatattgcacattggtttcttttattctatattttcattactgcattctatggctgtatttttcacacatagttatatttattttgctgctgcttaagacttcatagtttgacttttctctattgttgtaaattagcatataaagaacatggtgctgcttgaatatcttgtcagcacccttgaggctgattttgtacctcgtcagattgcatataaaggtaagttatactcatgagtcatgaacttggcttctgttttttgtatgtgtgtttatagaaaaagatattcttaccaattcttctggttttgtaacagagtcattagactgggtaattttcagggaatctcttctacagatgcttctggtatgatctacatccagagtccataaagaatatcttagttagatttattggccagttcttgtgctgcttctccatgtcaacatttttttttattgaagtggtgtggaactcatgcaagtttcttacgttgctctatggtattgctggaattcattctgttatccattacatcaggtttcacggaaggtggcattcaaatctttagtaaagaactgcatatcttttctgctcaatcaatataatcagggagttgaagatggcatatcttccaaagaaggttctgctaaatcagcacctgatctagaatcttccttagctatcatatcttttgaattcgaaagaaaagctcttgcatcagttcagaaacttttcactatggtgagtatttagttgtacacatagcttgcatgaagtacagatgctaacgatttcaagtttttctttttaggttatgaaccttgacttgattagaaaagaagcagacacaatgggtctgacttcaagagctgatgggtgcaggttatgtttctgatttctgacttcaatttgcttagctagggttcctttgatatctgacattccatttctctctttgtaggaatcctatcttggacgttattttagatgagctaacttacaacataagctatttatctccatttcttctggtaactgcaaatcattccatctatttgtccctgtcttaccctaaatatctacaattctttgttattgtaattgagtaattctcagcttgcatcagttggtcatgcatcaataacttgataaaaacctattcacagttcctacatgctacctgtaaatttccacttcagtatatgtagctcgccacgtgctaattgttcataaagggggatgggttatgacaatttgctactgtatagaggtacactactaaacttgaggatttgccactccatgtctctcaggtatgtggcctaggaaccacaaccacatgttacacattctcaagtgtcttaataattgcagtggggaataatctatactcaataaataaaaagaacagagagctcatatattggaagccttgatgaaactttagaagcttactgtctaattaatttctttgtgctgttactaaggcagctgtgctgttgttattttccctggaactccttaattgtttgtgtgatgcactcgttatagggctgtgaaggcccctgagatatttgtagctcctgacgactcggagtaaaaaaaagg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External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0312800, RefSeq:Os02g0312800