Difference between revisions of "Os02g0506500"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
(Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os02g0506500| Description = Molybdenum cofactor biosynthesis domain containing protein| Version = NM_001053454.1 GI:115446278 GeneID:4329438| Le...")
 
Line 1: Line 1:
 +
Please input one-sentence summary here.
 +
 +
==Annotated Information==
 +
===Function===
 +
Please input function information here.
 +
 +
===Expression===
 +
Please input expression information here.
 +
 +
===Evolution===
 +
Please input evolution information here.
 +
 +
You can also add sub-section(s) at will.
 +
 +
==Labs working on this gene==
 +
Please input related labs here.
 +
 +
==References==
 +
Please input cited references here.
 +
 +
==Structured Information==
 
{{JaponicaGene|
 
{{JaponicaGene|
 
GeneName = Os02g0506500|
 
GeneName = Os02g0506500|

Revision as of 19:15, 22 July 2012

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os02g0506500

Description

Molybdenum cofactor biosynthesis domain containing protein

Version

NM_001053454.1 GI:115446278 GeneID:4329438

Length

10720 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0506500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:18817995..18828714

Sequence Coding Region

18818105..18818185,18818285..18818344,18818474..18818587,18824450..18824578,18824673..18824741
,18825098..18825244,18825405..18825441,18826058..18826140,18826371..18826445
,18826934..18827008,18827303..18827389,18827481..18827596,18828046..18828098
,18828192..18828331

Expression

GEO Profiles:Os02g0506500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:18817995..18828714 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:18817995..18828714 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggacgaggagcagctgcgcgcgctgctccgcgacctggacgcgctcaagcagcgccccgaccccgccgccatcgatcggatgcgagagcgcgtggcgggaatggtgaccccggccgccgctgcacggtccaagatcaaggatatgagctcggaggtggtggacagcaatccctacagcaggctcatggcgctgcagcgtatggggatcgtggacaactacgagcgcatccgtgattactccatcgccatcgttggtataggtggcgttggtagtgttgctgctgagatgctcactagatgtggcattggtcgccttttgttgtatgactatgatacagttgaactggccaacatgaataggttgttctttcgcccagaccaggttggaatgaccaagacagatgctgctgtgcagacactatctggaataaatcctgatgttacgttggagagctattcattaaatattactacagtgaaaggatttgaaacatttttaggaagtctcaaagccagaagctctgatgggcgtaacactggagttgatcttgttttgagctgcgttgataactatgaagctcgtatggttgtaaaccaggcatgcaatgaacttggccagacatggatggagtctggtgtctcagaagatgctgtttctggtcatatacagttgctggttcctggtgaaacagcatgttttgcatgtgctcctccattggttgttgcatccggagtggatgagcgcacattaaagcgggaaggtgtttgtgctgcctctttaccaactacaatgggtgttgttgctggtctccttgtccagaatgctctgaaatatttgttgaagtttggacaagtttccccttacttgggatataattcacttaaggattatttcccaacaatggaaatgaaaccaaatccacagtgttcaaatccagcatgtgttcagagacagaaagaatatatgcagtcaaaacctgctagagatgcagcagcaaaagctaagatggaagctgaagcatcagcagcagatgaatgtccggtccatctagataatgattggaatattagtgttgtcgatgacagtgacacagtgacaccaagcattctaagcactggagctgatagcctcccagaaggccttgtccgcgaactcccaactgcagattcctaccaagaaccagttgctccagttacatccggggctattgatgacgaccttgaggagcttcagcgccagcttgatgccctaaactcgtcttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDEEQLRALLRDLDALKQRPDPAAIDRMRERVAGMVTPAAAARS KIKDMSSEVVDSNPYSRLMALQRMGIVDNYERIRDYSIAIVGIGGVGSVAAEMLTRCG IGRLLLYDYDTVELANMNRLFFRPDQVGMTKTDAAVQTLSGINPDVTLESYSLNITTV KGFETFLGSLKARSSDGRNTGVDLVLSCVDNYEARMVVNQACNELGQTWMESGVSEDA VSGHIQLLVPGETACFACAPPLVVASGVDERTLKREGVCAASLPTTMGVVAGLLVQNA LKYLLKFGQVSPYLGYNSLKDYFPTMEMKPNPQCSNPACVQRQKEYMQSKPARDAAAK AKMEAEASAADECPVHLDNDWNISVVDDSDTVTPSILSTGADSLPEGLVRELPTADSY QEPVAPVTSGAIDDDLEELQRQLDALNSS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>111..191#291..350#480..593#6456..6584#6679..6747#7104..7250#7411..7447#8064..8146#8377..8451#8940..9014#9309..9395#9487..9602#10052..10104#10198..10337#gatactcgattcgatagtgacaagaggaaaagcgcggctctctccgtctccggcggcggtgacgcgaggaggaggaggaggaggagcccgcgccgccgggccaagccatcatggacgaggagcagctgcgcgcgctgctccgcgacctggacgcgctcaagcagcgccccgaccccgccgccatcgatcgggtaagcccgcccacttcgcgccgcgattggcttcttctgacctgtgtggatctggtggtggttttgacctgtggatcggatctgtggttgtttgcttagatgcgagagcgcgtggcgggaatggtgaccccggccgccgctgcacggtccaagatcaaggtacgaagatctggcgcaaatactagggttttggttccctcctccccttggttggggggggggggaatggccgaattggaaattgggtgtgaaaagcttacagtctatgtgtcaactgatgcgatgcaggatatgagctcggaggtggtggacagcaatccctacagcaggctcatggcgctgcagcgtatggggatcgtggacaactacgagcgcatccgtgattactccatcgccatcgttgtaagcacagctcctgctcaatattgctttgggacagccatattagcttaacctaccttctgaaggaagattgcatatgctcagtgttagttttggacagacttatatgtgaccctaccttctgaaggacacacactaggcctctaaacctgccgtgaaagagtggttcaatcgagttatttcgtaagtcataatacttaattgacaaacattttagtattagttttaccattagttgtcacatttattctcacctgcacttggcagtaggagctttcagaattacccctttcagagcttccagaattacccctttcagtcttacaaacatatggtatggttagacaatgttgtcaggttctcggttctctcactaatacctgattaaatgggcaagaccgatgatggtttgtttggcttcttgaattgtcatttctgcaccaaagtcaaattttgtcacatgcctgttagatgtgtattagataggttgtatttatggttttatgtcttttggctttccatgttcctgtcttttggttttccttgtatctgtttatatatttgggctattgccctctggtgaatacaagtcgtgttcataacatggtatcagagcaggtttagacttctcgtcttcttataattttctctctcgacttctccatgattttctttgaggattatcggcctcttcatcttgaagccatgatgttcctcttgatctagtatggtgtcgctgagaatcgttcatctctgctccccaacgtcgtcaatttcttcagaacagtgtagagggctggtggttgtcctcatcaccggctgtcatcgcttcttgtcgccgaccgccgtcgcccctcgtcgtggcctccggccgccgtcggaacccgtcgctgctagtcgcgggcctccggaacccgtcgctgctcgtcgctggcctccggctggcgccgctcgtcacgggcctccggccgccgtcgcccctcgttgtaggcctccggacgtcgtcgaccctggtcgcgggcgcctccgcctgggttgtagggcgccgtcgcctgggtcgctcggtgtctgtttccccgatccggatctggatcgggaggtataaaaaaacgaaaaaaaaagaagaaaagaaaaaggcttctctggctctgctactgttgtgctctgatcgcacgtggtggctctatattttgggctgaggcattaaaaaaaaaaaacttgctgccgcttgttctgtttgctctctcgccgtcgcttcttccttcttgatgatgtcgtctttatccggcactgtgtctgttcctcgttgcccagttctttttgatggtgtcaactatagtcattgggctcagcacatgcgtcttcatatgcgtggtcagcgtctttgggatgttttatctggtgagctaccttttcctccttgccctattgctccaactatgccttcacttgcaagtcaagctactgatgacgatagagcaaaggctaaagagcagtttgatgatgccatggaaaattatcagagtcagtttgctttatacaaggcttggttggatgaggatgctcgagcttctgctattcttgtagctagtatggagattcatcttactggtgaggtggttactcttacttcagctcatctcatgtggacacacctacgtgatcgttatgctcctactagtgatgctctttaccttgctatggtgcgtcaggagcagtccttgcaacagggggatagtacggtggatgagttctatacacagttatcctctatttggcgtcagcttgattctttgggaccggctatttgtcatacctgtcagtgctgtcagcgtcagcgttctcacatggatcttcgtcggatctacgattttttcacacgcctccgatccgagtatgagtccactcgtgcacagttacttgctcgacatccgcgtgttactatcatggaagctcttacggagattcgttctgaggacattcgtcttcgagaggcgggtattctaccacttccttcttcggtgttagctattcgtactgtggcttctttggcttcttccacaccggctgttagttctacagtttcttcctcttaatcatcggcgcgtcctcctgccacagttgtgccatctggtaggggtcaccttcacttcacctattatgataaagatggacatgtggagtcattttgcttcaggaagaaggatttacgtcgtggcaattcttcgaagggtactagtggttcttctcagaagagtgctggaggttcagattcacaggaaattcttatgttacttcgtcgccttactgcttctgctgcgacaggttctgttggttctgtggctctaccttctgcacagtttggttctgctgttcttggttcttcatcttctactgagggaccatcttctgctccaggtactattccatggattctagattctggtgcttccttccatatgactcatgatagatctagtctttcatctatatgttctcctttagttcctactactgttcatactgtcgatggtactcctcttgctgttgttggtcgcgggactctttctacttcttccttcagtgtccctgctgtttcttacgttcccaaattggccatgcaactcatgtcagccggccaacttacggatcatggctgtcgtgtaattcttgattctgactcttgttgtgtccaggatcgtcacacgggtctcctggttggtactggccctcgccgccgtgattctcagcgtctttgggaccttgactggcttcgtcttcctttcgctgcgcctgctagtcttcttgcttccgctgcttcctctatggtgtcttttgctcagtggcatcataggttgggacatctttgtggttctcgtctgtcggctttagttcgtcgtggtcttttagggtctgtgttaggtgatgtctctttagatcaatgtcaaggttgtaagcttggaaagcaaatacaacttccctatcattctagtgagtctgtatctaagcgtccttttgatcttgttcattctgatgtgtggggcccagctccttttgtttccaaaggaggtcatcgctattatatcatatttatagatgacttttctcgtcatacttggatttacttcatgactcatcgctccgaagttttggctatttataaatcttttgctcgcataattcgcactcactttgattctcccatccgcgtgtttcgtgctgattccgctggtgagtacctttctatagagttgcgcgtttttctttccgagcagggtactctttctcagttttcttgtccgggtgctcatgctcagaatggtgtagcggaacgtaaacatcgtcatcttcttgagactgctcgtgctcttatgattgcttcttctgttcctcctcatttttgggctgaggctgtttccactgctaattacttgaccaacatccacccttcttctgctctacagggtgggattcctattgagcatctttgtggtcagcctcctgattattctaatctgcgtcttttcggttgtgcttgctatgtgcttcttgcaccacgtgagcgtacaaagttgacggctcagtctgttgagtgcgtttttctggggtatagtgctgaacataagggttattgttgttgggatcctgtaggacggcggatgcggatttctcgggatgttacttttgatgagtctcgtcctttcttttcgcgtcctagctccacatcatctcccgatgactcttctatttctcacttttcctgatactcctgttcgtgcttgcattccttctcctgtctcttcctctcagctggcaccttcttatgagaattctgcatcctcttatgtgcctcctcttacccaggtttatagtcgtaaacctcgtgtccagtagctttctctggatgcttctccggttgctcctcctcgatacaattttcgtgatcgtaatttagttacgattcgttcagaggatcgctatggttatgttgctacagttcttgctgaacctcgttcttatcgtgatgctgttgtccatcaggaatggcaacatgcgatggcagaggagcttgctgcacttgagcgtactggtacttgggatcttgttcccttaccttctcatgcttgtcccatcacttgtaagtggatctataaggtcaagactcgctttgatggaactcttgaacgctataaggctcgccttgtggcgcgtggtttccaacaagaacatggtcgtgactatgatgaaacttttgctcctgtggctcacatgactactgtttgaacacttcttgcaatagcttctgctcatcattggaatatatcgcaacttgatgtcaagaatgcttttctcaatggggaattgcatgaagaggtttacatgcggccacctcaaggctattcagttccagagggtatggtttgtcgtcttcgacgctctctttatggcctcaagcaggctcctcgtgcttggtttcaacggttttcctctgttgtcctggaagctggtttctcagctagtgctcatgatcctgctctctttgttcacacttcaccccacagtcgcacaattctacttctctatgtggatgatatgctaatcacgggtgaagatgcggagtttattacttttgttaaagcacgtctcagtgagcagtttcttatgactgatcttggtcctcttcgttattttcttggcattgagatttcccctactcctgagggatttcatctctcaagccaagtatattcaggatcttctggatagggcttctctcactgatcaacgcacagttgaaactcccatggagcttaatcttcatctttctgccactgatggtgaaccgttagctgatcccactcgctatcgtcatattgtcgggagtcttgtttatcttggtgtcactcgtcctgatattacatactctgtgcacattctgaaccaatttgtttctgcccccacacaaaatcactatagtcatcttcgtgtcctccgatatcttcgtggaactatctcgtgttgtcttttctttccacgctccacatctttacaacttcagggttattctgatgctacttgggccagtgattcctccgatcgtcgatctctttttgctttttgtgtttttcttggtggttccctcattgcttggaagactaagaaacaaacaacagtttctcgttctagtgcagaggctgagttaagaactatggcccttttgacagcagaggttacttggctacgatggttacttgaggattttggtgtttttgtgacttcaccgacttctttattgtcagacaatacaagtgctattagtattgctcgtgatcctataaaacatgagcttactaagcatattggtgtggatgcctcgtatacccgcacacaggtacaagatcaggtggttgctcttcagtacgtgccttccgagttgcagttggctgatttctttacaaaggcacaaactagagctcaacacaggttctatctctccaaactcagtgttgttgatccaccctgagtttgaggggggggggggtgttagatgtgtattagataggttgtatttatggttttatgtcttttggctttccatgttcctgtcttttggttttccctgtatctgtgtatatatttgggctattgccctctggtgaatacaagtcatgttcataacaatgccaacatgttcatggaaagtatttaagttttatgagacagacaaaacataaatagtatgcaactatacagtcttcttagtggacaattgatggctgaaagcgtcagcttctgcagtctgtacatatggagttttaactcaggaaaacagaccttaatataagtattcatgctctgcagggtataggtggcgttggtagtgttgctgctgagatgctcactagatgtggcattggtcgccttttgttgtatgactatgatacagttgaactggccaacatgaataggttgttctttcgcccagaccaggtaagctttgcggcaattacatgtatttgcttctctttcctttatgcaagttgtctttcagatggtaacatctatatcatccttatgcaactaggttggaatgaccaagacagatgctgctgtgcagacactatctggaataaatcctgatgttacgttggaggtgaaaactactgttaacctttttcatctccagctaattggttctatcatcaggttcaaattacacattaagttttactattaatacatgagaaaacatatctgggtcttgccaatgacttggtgaatcctatcttaattaatcattagacgaacttgctcttactcctttgcgaatgtctccttgttttctatcgtttcatctatggcaattgatgaatgttgtataaagtacagaatttcatttataagtttctctgttggatagtaaccttggatagagtaatatgctgtagtatatttattttccttctgcccatatgcaaaccaacattatacttgtttttcttcctgcagagctattcattaaatattactacagtgaaaggatttgaaacatttttaggaagtctcaaagccagaagctctgatgggcgtaacactggagttgatcttgttttgagctgcgttgataactatgaagctcgtatggttgtaaaccaggtgtgaactagtgaacatttccatgatatatagctccatcaaccaaattattgtctccttgttcatgactaatttaaccatagatgccagtgtataactgcatactgcattattcagtggtgcatcatttgttctttattcatttattccttcttttcaggcatgcaatgaacttggccagacatggatggagtctggtaagtagaaaaaactcagttaatgatcctgtcctcttgagaataaaatcatttgtgtactgtacttattagcaaccccaacagttatatcttcagcctttgttctttctcattagacatctcaaattgcatgtgaaatttgataatctaccttgccctgagaagttgctttagattacttgccttacatcagttgaccaaaaacatctacaaatatactttgactatcatcctttgttgtgagtttataatgtactactactagtcccctgcttacaattcctcaagcacagatattattgatgctaataaattacatcttattgttatggaagtatgaggaccatgctagtgaaatatgagatgatctctttatgttgatttttgtaccctttaataaaacattacatggaaatgcacatgcacttggggaaccaatatgtacagaatacatgttaaacatggtttcattctttgtgcctgtatagcccttggtaaaaaaggaaaaaagaacgaacagtttggttttgccatggacttcattttgtgctgacgctttgcttgcattagtcattataatctcgattgcatgtgacttgagaactttatgcatcaggtgtctcagaagatgctgtttctggtcatatacagttgctggttcctggtgaaacagcatgttttgcatgtgctcctccattggtaattttttataaatttgagattttgtactgtcttaatgaacatacttatacagtttactattttatattatggataaaatatttagtactggcttttgcatttgcattctacatagctggtttagtttgggagaggtgtccacctgtccggtgtctccgcacacttcctgtttttgcatatttatttctctattgcttcctagcttgattgtgaacctctgcacataggttgttgcatccggagtggatgagcgcacattaaagcgggaaggtgtttgtgctgcctctttaccaactacaatggtacgcttctatttttccttctgtttagttctcatccttttctcatctgacaaggacaactgtagttaaagctatgtggaaggttgaattagaatggttacatttgtgtagctgtttagcagccttaaatgctcgtatagttgtatatttttgttttaggcctacatgttaacaagtatggctacagttctgattttaggtctagtgtctaccacgcttttatctaatcacttgtgtgtattgttgttgcattgaaacaagtttttcttcatttttgaaaataatttgcaatgaattgcacagagtattgagcactacagttccatgtgattgtttattgatagagtgtttatgtctagggatagggttcttacacctattttcatcaaaattcttacagtattaccctgctagtttgttaacatcaattttctatcatcttcccctgcctccatttatttttggctgataaaaaatgttctttgcagggtgttgttgctggtctccttgtccagaatgctctgaaatatttgttgaagtttggacaagtttccccttacttggtaattgctaactttatgttttttcctgctcattgtggatccctttttctttgaaattttttggctgagaaaaaaacttttttgtaattttgttagcatttttgctattttctctattcctatgtaactgcacaagattagatactttttctggggaacaacatgatatactgttcatatgaaaaggggactccactgtggctcacgttgattctgattcatcatattcaactcaacattcgagcactgtactggttagtttctaaaatcttgtaatgccctctgattgcgcagggatataattcacttaaggattatttcccaacaatggaaatgaaaccaaatccacagtgttcaaatccagcatgtgttcagagacaggtgttgtcttctcccatgtgccctccctatgtttacattgttgacattgtgaaagatcgggaatgttacccttcttttgatcattttgtagaaagaatatatgcagtcaaaacctgctagagatgcagcagcaaaagctaagatggaagctgaagcatcagcagcagatgaatgtccggtccatctagataatgattggaatattaggtaagtcattcctcatgtactttattgaattccttgacaggcaaatgtgtaggaagtaggaactaacaacttatgtctaaatttggcaattactgagaattaataattaggatgtctgtgatcaattatgctaatgctcattacagattcagttgccatactaatggagctgacaagatagttgacttggatagaactttgtaccccatgctcaagcccacatcatttcttaagcaccctgcttgcaggattgcatgtgtttgaaaatgtttcatgctaaattttagctactcattattgtaggattcagaaactactaggctagggttgcactttggtgctaattgtaacttcattctctttttctgttgtactgcatcttgacatgcttgatgaataaaaatgtggcttttgtagaattgctaacttcaatatttgttcttatccagtgttgtcgatgacagtgacacagtgacaccaagcattctaagcactggagctggtaattcatttttgctattagaaaagttgtccctttatttaccgctctttggttgtatttaaccatttcgtcccacttttcgaaattatacagatagcctcccagaaggccttgtccgcgaactcccaactgcagattcctaccaagaaccagttgctccagttacatccggggctattgatgacgaccttgaggagcttcagcgccagcttgatgccctaaactcgtcttaatgttttgtaaaagctggaccgtcatcattaacttggtttctaccaaagctcaacactgggttagaaaaccaacctgggtactgatgcttgtgtttactccgacagagttacccatttcagtggatatagcttctgttcataccaaagaggttgaagggttttaagttacttacctgtactgttttgagcttttgtgtacaattttgccttgagttaatgtagattttatgaggctggaaaattcactgttaactaatgtggacgctctgctaattaccgataatagttcaaaaagaaaagtagaaggcattcgtccagaactgtgatgtcatgctgtaataggcttttgccagtgctgtccgtaaacctcaataagcttagct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0506500, RefSeq:Os02g0506500