Difference between revisions of "Os02g0712000"
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Revision as of 19:21, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0712000 |
|---|---|
| Description |
Peptidase, trypsin-like serine and cysteine domain containing protein |
| Version |
NM_001054440.1 GI:115448250 GeneID:4330499 |
| Length |
12270 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0712000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:30370294..30382563 |
| Sequence Coding Region |
30370603..30370779,30370898..30371009,30371709..30371866,30371960..30372175,30372495..30372722 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcaggctgcatctggtaccaaaggtggctctagtggttcccctgttgttgattgtcaaggaagagctgtcgccctgaatgctggaagtaaatcttccagtgcttctgcgtttttccttccattagaacgtgttgttagggcacttaatctgatacgtgacagttgggaagcttttggtagcaagcctgaatctgattacattcctcgtggtacacttcaggtgacctttcaacacaaaggatttgaagaaactcggcgtcttggactcaggaatgaaacagaacagatggtacgccttgtttctccatcaggcgagactggaatgctggttgttgattccgtggttccagaaggacctgcacataaacatttggaacctggtgatgtgcttgttcgcatgaatgatgaggttgtaacacagtttctcgcaatggagaccttgcttgatgacagtgttggcaaggagatagatttgcagatcgaaagaggtggtacacctttaacagtaaagttggaggttgaggatttgcactctataactccaaatcatttcttggaagttagtggtgctgtgatccatccactttcgtaccagcaggcaaggaattttaggttcaaatgcggtctcgtatatgttgctgaggcagggtacatgctctctcgggcatctgttccacgccatgctattattaaaaagctcgcaggagaggatattgaaaatttaggggaccttattgcatgtatttcaaaactatctagaggagcaagagttcctcttgaatatgtaaagtacaccgaccgttataggaataagtctgtactggtgaccattgatcggcatgaatggtatgcgcctcctcagttatatactcgaaatgatgcaactggcttgtggactgcaaaatcagctataccgccggaatctccttttatagcttcagctcatcatgctggtcctattgatgcaaactccaattctgtttcatctttaccagaatctagtcctatggatctcaagtgccagcatgagtctgagaatttgacagatggatgcatcaaaacacaaactgatgatgagattaatgtagatggatcccactcgagtgaagattctcttgttgagaaaaaaaggcggcgggtggatgaggagatagctgctgagggaacgatatcatcttctggtgatttagatgaaataaaaggtggtggtttgaggcatctgtctagtgttgatggttctgaccttgctcgaacaatatcaagtaatgcatcattggcagaacaagtaattgaaccagcccttgtaatgtttgaggtgcatgtaccaccagtgtgcatgcttgatggagtgcattcgcaacacttcttcggaactggtgtaataatatatcattcggactgtctgggtctggttgctgttgataggaatacagttgctgtatctatctctgatataatgctttcttttgctgcatatcccattgaaatacctgcagaagtcgtttttctgcatcccgttcacaattttgcattggttgcttatgacccttctgcactaggagctggagcatcagttgtccgggctgctaagcttcttcctgaacctgccttgcgccgaggagattctgtctacctagttgggctaagtagaagcttgcaggctacatcaaggaaatcaatcataactaatccctgcactgctgttaatattgggtcagctgactgtccacggtatcgtgcaattaatatggaggtcattgagctcgatactgattttggtagtgcattttcgggtatattgacggatgagcaaggaagagttcaagcattatgggcaagcttttccacccagctgaaatatggttgtagcagttcggaggatcatcaatttgttagaggtataccaatatatgcaataagtcaagtccttgagaaggtaatctctggtactcctggaccatttcgtattatcaatggagttaggaggccaataccattcatcagacttctggaggtggaactctatccaactttgctttcaaaggcaagaagttatggattgagtgatagctgggtgcaggctctagctaagaaggaccctgtgcgaagacaagttttgcgggtcaaaggttgtttggctggatccaaagcagaaaatctccttgaacagggagacatgatccttgctatcaataaggagccaattacatgcttcctagatatcgagaatgcttgccagaaattggaccaatctgttgattcagatggagtccttaacatgacaatattccgtcagggaaaagaaattgatcttattgttggaaccgatgtaagagatggcaatggaacaacacggatggtgaattggtgtggatgcataatccaggatcctcattcagcagtgcgcgcacttggttttttgcccgaagaaggtcatggagtttatgttgctagatggtgtcatggaagtcccgtacatagatatggtctctatgctctgcagtggatagtggaagttaatgggaagccaactccagatcttgaaacttttatacaagtggtgaagggattggaaaatggtgaatttgttagggtgcggaccgtccatttgaatggcaaacctcgtgtgcttactttgaaacaggaccttcactactggccgacctgggagctcaggtttgaaccagagacttccacatggaagaggggaataataaaagcgttgcaatcaactgtagcgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQAASGTKGGSSGSPVVDCQGRAVALNAGSKSSSASAFFLPLER VVRALNLIRDSWEAFGSKPESDYIPRGTLQVTFQHKGFEETRRLGLRNETEQMVRLVS PSGETGMLVVDSVVPEGPAHKHLEPGDVLVRMNDEVVTQFLAMETLLDDSVGKEIDLQ IERGGTPLTVKLEVEDLHSITPNHFLEVSGAVIHPLSYQQARNFRFKCGLVYVAEAGY MLSRASVPRHAIIKKLAGEDIENLGDLIACISKLSRGARVPLEYVKYTDRYRNKSVLV TIDRHEWYAPPQLYTRNDATGLWTAKSAIPPESPFIASAHHAGPIDANSNSVSSLPES SPMDLKCQHESENLTDGCIKTQTDDEINVDGSHSSEDSLVEKKRRRVDEEIAAEGTIS SSGDLDEIKGGGLRHLSSVDGSDLARTISSNASLAEQVIEPALVMFEVHVPPVCMLDG VHSQHFFGTGVIIYHSDCLGLVAVDRNTVAVSISDIMLSFAAYPIEIPAEVVFLHPVH NFALVAYDPSALGAGASVVRAAKLLPEPALRRGDSVYLVGLSRSLQATSRKSIITNPC TAVNIGSADCPRYRAINMEVIELDTDFGSAFSGILTDEQGRVQALWASFSTQLKYGCS SSEDHQFVRGIPIYAISQVLEKVISGTPGPFRIINGVRRPIPFIRLLEVELYPTLLSK ARSYGLSDSWVQALAKKDPVRRQVLRVKGCLAGSKAENLLEQGDMILAINKEPITCFL DIENACQKLDQSVDSDGVLNMTIFRQGKEIDLIVGTDVRDGNGTTRMVNWCGCIIQDP HSAVRALGFLPEEGHGVYVARWCHGSPVHRYGLYALQWIVEVNGKPTPDLETFIQVVK GLENGEFVRVRTVHLNGKPRVLTLKQDLHYWPTWELRFEPETSTWKRGIIKALQSTVA </aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>11785..11961#11555..11666#10698..10855#10389..10604#9842..10069#9395..9474#9140..9310#8915..9017#8645..8827#7383..7883#7096..7261#6630..6679#6069..6149#5798..5905#5257..5322#5087..5143#4689..4754#4190..4279#3221..3346#2510..2515#ggtggtctccccttctaaaatctcgccgagtccacaagcgcatttaccagcagctccactcccatccatccccgcgaccctcgctgatctcaccaccaccccgacccacccgcaccgccccaccatcacatcgcccgcgtgagattgctacccaaaaatcctcacctccgacgacgaattgaggaggaggggagagagagctcaaaaaccctaggaggaggtttgaggggccagatcgatggagagccccgcgaaggaggaggcgggaggggagctggcgatggagatcgagtccaccgtcacggcggaggactggcgccgggcgctggcactcgtggtgccctccgtcgtcgtcctccgcaccaccgcgccgcgggccttcgacaccgaggtcgccggcgccagctacgccaccggcttcgtcgtcgacaagtccaggggcatcatcctcaccaaccgacacgtcgtcaagccaggtaggggcccgcccgatcccgcccgtttccctccccgggagtttccgtgtgatttgtgcattgactcgtgtgctactggtttgatgctgctgtcgctgtgttcgcagggcctgtcgtcgcggaggcgatgttcgtgaacagggaggagatccccgtgtatcccctgtacagagatcctgtaagtgtttgctttcatttcatttcatttcatttctgttctattctattttgttctccctgtgctaatggcataatgttaatccaaaatttttccccctcttctcgaaacaggtacatgattttggtttttttcgctatgatccaggtgctatcaagttccttaagtatgatgagatcccgctagcacctgaagcagcatctgttggtctggaaatccgggttgtcggcaatgacagcggcgaaaaggttacgtaaaaactagattaacctctttcctagttgatattgtgaactatcatataatgagcaatgtagcacaagaaacttgctaggatttacatctccagaaattctcttatggactatgggacaatcatttttaattgttaggctttaggctttagtttcttatattggccttgtttagttccaaactttttcttcaaacttccaacttttccatcacatcaaaactttcctacacacataaacttccaacttttccgtcgcatcgttccaatttcaaccaaactttcaattttagcgcgaactaaacacacccattgttgagaagcacaatgtagagctcacaaagcaaatgttctgtacatcgtacagttcattgtgggctctattatcacatgatgcagtttggcatttcagcaacagcaagcgaactgtctcttcttgcatctaataaaggctaaaatgatacaattcattgaaacctctatgttccacacatgtagttcactgaaaactatataatcaaatggtacagtttggcatttcagcaagtgaactgtctcctctttcctgtaatattgtgtggtctgtagtgcttataagattttagcatatagggaaaaagacaatgcatacaacatcctattacgggcctttaatcaatatttgttgattcaggagacatctcttcaactagttggctcagaaactgtagatatgtgccaatcaatggtatagatcaaaacatttcacatattaggctggaaagaggcactggaacaaattattttacttcctatttaagtgtggtaattcagattctgttgtgtcctatgtgacatgctttgacgggacaatgatttgtactaacactagatagtgatgcattaatatgtatatacattttctggacctagatgtggaggttaatcacttaatcctttacattccatgggtacacatcagcataataacttcaaaaattatccgatagattgtgtttcatactgcaacggtttctgattttcattcaccgaatgcaggtgtcaattttggcgggaacacttgctcgacttgatagagaagcaccttactacaagaagtatgtctcctttctagttaccataacggcccattacattagtgctattttcttttctcatgattacccctggatctattgttggacatagggatcaaatatatagtacaaaattcatttgttggctactgaacttagaaaatagtaataaaatatagggagatacatatcatagaggatcagagatcatagtttacttgctatgcgaactttatttagtttcagtaagtgaagatacatatggagaaagcggattaaatctcaacctttcgcttcatttttctccaagccttttcaatccaccgaacttgggcaaaaaagactttgtagttcgtattcactctatattctctacccacccaaatggagcagcttgccaccaccagcttctactagataatactatatgattaataatttttatgtgcagccttgctgcatataatcttacgtttaaccttttttttttgacagggatgggtacaacgatttcaacacattctacatgcaggtacttttctcgggctactcaatattacatccatactctcgttctcttctgacttgtcagttgggacattaatacacaccttttaaccattacttatctgaatgatgtgctcatacaatatcgatattaaaatataatgatacccattttaaaaataatgacattaaagtagttctcgtgacaaatatactcttataattttttgcatgacatatttgaatatttttatgtatataataatggccaaaatttctaagtctgactgtatgcattctagaatgaaatctatttgagaatagtatatgtttaattcaaattggtgatgttcatgcatcttctgaaatatcgggcatgttttagtttgatgccgaaaccagccttatcaaattttgttaatgccacaccttatttatttatttttttgggtaaggtaggtatgtggtggtacgtttagtttgaaacctcatctatttgggtgtgatgttaggtcaggaagtttattagctaccaaatattggtatggaaaggtaggtatggttggtttgttgccttgctaaaatttggtaaggttagaaatggtagcaaaccaagcatgcccattatccgtgattttgtcttatagttcaattgcttttatccaatagaggttcactaattttccttttactctctctgtcattttaatgtaatcatatgtttctataggctgcatctggtaccaaaggtggctctagtggttcccctgttgttgattgtcaaggaagagctgtcgccctgaatgctggaagtaaatcttccagtgcttctgcgtttttccttccattagaacgtgtaagttgtttacaaaatgttcattgaaactagctaaatgcatgtgctttgctacggataaaagaaaacgtattaatgtgttacccatcttttttgctatagggaatattcatcttactctaatttaatgtggctatccatttagatttgatattttttaatattaagaagttcagggattaacttgcaaaatttacaatgggagtaggtggggtgacagattcattgccaccaccactaccttcttttaaaggagtatagatatactacttttagcccaggaagcttatgcttttgttctaaaattgcaaggtctcttatttaataagaccaacgaagtggtcctgctagttgaaattgatacgagtcataaaagcacacatgcaattaggttaacatctatactagacatcacaagaagagagagagagagatagaaagaaaaatataatttggcattgaccgacatccgagttcatacaaaaaggaatagcattgctgtttaatattgattaattgtaaggtctcttattgacaggaacaacgaagtggtcctgctagttcaaaatgatgtcattataaagcgcacatgcaattaggctaactttaacatctatactagattagctggcttaatgattttcatcaggtaaaagtatggtatgaagtatcctattatgcactagacatcacaaggagagagagagagaacttatagtttggcactttggcattgaccaaaatccgagatcatacaaataggaatgccattgctgtttaatatttattgattgcccgtggcacccttatgtttattatattgtttgtccaaactgtttccaggttgttagggcacttaatctgatacgtgacagttgggaagcttttggtagcaagcctgaatctgattacattcctcgtggtacacttcaggtgagcatgctgtctgatgatcccattgttctattttttttaccaagacctgctgtgtcattagatgtttatttctattacggtggagctactgaagatgtatggtgaacaagtaaacattttagcacttaattgttcttctttctttgtatgtcagtgataaagtttgtgaatttgcaatgatcagcaccacaagtgtacagagtgctgcagcagccattgtatagtcaattttgctcctctgactgctgtacttttattacagcgatagttaaaaagcacaatctgtccatgagattattagagttaacaaaggctattactcttgtttgtgttgccatttctacctattcttgttgcccccctcctgccagtccttagatcatttcccttttcccttgtttttaaggtgacctttcaacacaaaggatttgaagaaactcggcgtcttggactcaggaatgaaacagaacaggta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