Difference between revisions of "Os10g0446200"
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Revision as of 21:09, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0446200 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001071250.1 GI:115482243 GeneID:4348750 |
| Length |
9648 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0446200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:16578484..16588131 |
| Sequence Coding Region |
16578619..16578787,16579310..16579368,16580261..16580369,16580820..16580929,16581354..16581422 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MAAARRAKVAAALGVVVWWWWWWAVAVVGCGAQPVVVGSYGQPR LWLKPYDWSYLRVELPPSFSSVTMDFATDRDIQREHLKDLPRRDLAIICLMNSNPPIP DISDSFLDTLLSNFLVVGSFGSTNNQSDLAQCIPFQKNTTIVLRNDQISPGIWYIGYF NGLGPARTQSKMISRGRARSVSTSITVEGCPTSALWGPYCNQTIEMISCSQSSGYNNS RNLMGLNIDKRKTLNTREHTRRINFLSQWNHLEEKGVGSNSTTYSRMDNSITCAISNG SLCLRQGDMKFYFLDVVDLALQFEITATNFGLAQRSSLICYLRYNAFPRRDLHDYSGD ISSAPLVLKLPNIGRWYIAIETVNITQMNSTASTPLLDTTCFSLEWQVTGCLNGKAGT NCSWEAYVLQRVPKRSPSVPFESYYVPSDGKASLEYSHFSLEQFLSNSSFEPFAWTYF FLDIPEGSAGALIHVQIKSDKELNYELYSRYGGLPSNESWDYYASRTSSSNGSVYFSL QNSTNSDMDLSIFYAKEGTWCFGVKHPSDKSNSQTYMSISLQGCHKNCNQKGACHSSI DESGLTFYSFCTCDRDHGGFDCNDELVSPNGHIWQSVFLIASNGAAILPAFWALRQKA FAEWILYTSSGISSALYHSCDVGTWCILSFRVLQFLDFWLSFMAVVGTFIYMATIDET SKRAMHTAVFILTALLAATGATRSANIGIVIAIGSLGLLIGWLLEFSTARRFVCWPWR INLNVPQSWPNLRSLFSNSLDLLNKRFRWFYLLLGFITLAFAGTSWKLESNRSYWVWH SLWHITIYTSSFFFLCSMRINTLTGPTLEEELNAIFFLTVCMHRPLQVGIYGFHDFWG VIP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>136..304#827..885#1778..1886#2337..2446#2871..2939#3053..3742#4007..4524#4620..4684#5905..5984#6789..6893#7924..8063#8152..8280#8798..8950#9081..9144#9294..9413#agtggcgccgcgtgggaggaaagcaaagcctcctcttcttcctctccccccctcgccgtcgtcgtcgatctccggagcagccgcggcgggagggttttaggttttagagcggtggtggtggtggtggtggagtccatggcggcggcgagacgggcgaaggtggcggcggcgctgggagtggtggtgtggtggtggtggtggtgggcggtggcggtggtgggctgcggggcgcagccggtggtggtggggagctacgggcagccgaggctgtggctgaagccctacgactggagctacctgcgcggttaggagccctggaatctctgctcgcggttgcggtggggtttgggtttgcttcggcttgagctccctcgtgtgattatcatgccgcgtgcgccttttccgccgtgatgatcgccgccgcgggattccgtttgtttttttttttggtcacgcttttgtgttgcggtttgggagattttgtgttcgtatttagagatttcttcccaggtggtggtgttcgtctcacttcccccctaaactagaagtgcgattttgagtggaattagctgctgcgactgctctaatttttgcttaagttaagtttgcttaagttaagttaattaagctcgctagatgctttgcttacctaggtaattaaagaagattggtgcatctaggctcggttgtgagttttcacatgcaacatgttcacctttaagcgtgcagcgaaaccacggattttgtcgcatctgtatttggatttcttttgtttttttgttttcatcttggatttaccctcatactttgctttcgttgctcgcagttgaattgccgccgtcgttttcttccgtcaccatggatttcgcgactgacagagacattgtaagtgaagattctggccttctgagaactatattttctgtctaataataaatacaatattctttttatagattcgttggtttatggatatgctagtattcttataatcagtgagcagtgtgggttttctgagttgacctggtagattgggccgtggttagtacaagaagtatctaaacattaagatattgtgacctgaacatttggtggcagtagtagttcattttgtcagctatccttggttggtatgaatatgctgattgttttgaagctaacttggggtatcattttgagtgtgaatttactaaggcatgatgtttttttttcgagtttcgagcacctccatggatgcaaggacatggtgttttcttctgttatggatgaaaaaaaaattggaaatccccattttttactttaaaaatattttcttttcatgatcttatcatcccatatgaaagtatgtgtgctgtaatgttcatattgattccccagaatctatacataacacaccacacagggattcatgtattcctttttggaaatagtatatcaagatagaggagcaagggttgatgaatatggtcttcatctaaaagtgggcaagcagcttgtttgtttaacctttactttccaaagaaaatttaggtggtacagcagtttagctcggtgccttctatgtgtagtgcagtgaaaagaatatgaaatgctgatcggtgagtagttatgtgtaatagagtgagctgcattattctgttttatgaactctttaacttgacgtagaacagcattttggtattgcatcatctgtttagtttatatctgactatattgtacagaagattgcacagttgacttatgtatagtttgtgcaatatttctttggaaaatacagcagagggagcacttgaaggatctgccaagaagagatcttgctatcatttgtttgatgaattccaaccctcctattcctgatatatctgattcttttctggacactttatgtgagtaccaaatacattgtcttatgtgatgattaacacctttgaggtcttaaataactttttgtataattgtattcagataatcctgcatgcatggttaattgcaagataaatttgttaaatgagtaatagatatacgatttaagaatattgtctttcaaattgggaatggagtatactatgtagttctcaacccaataataattagtgttatattttatatgtgaaaatccattacaattccttgcaaataaaagagaactgagaaaataaataaaccacatgacagataggcatgattaggagttcattagctccataaaaaaagttcattttgagggcatttttctagtgagttgttcttttggttcttcttattggatccttattatcaatgtttagataactttctgattaaaccaattttgacaggaaggttctttgttgcagtatcaaactttctcgttgttgggtcttttggcagtaccaataatcagtcagatctggcgcaatgcataccatttcagaaaaacacgacgattgtgttaagaaatgaccaggttaacaatcctgatgctgtaatttgtaaatcgatatgctgttcttacctttttacagtaataacagtcttagtagcagatttgacactgatgcagaagtgcacatcggtggttatcttgattgagttacaaatagttgtatgattacacgtaaactaataatgacatttggatccttataattgaaagtcaacttccacaccgcataaacctgttaggtctatttattgagttcttctgtgcccttagtgctggaattttctcaagtcaaatgattgattctgcccatacagttctatttacttgtgttatccattggccttatctgatcattaagtgcaagaaatgtattgttgtcccctgatgtaacagctccatcttccgttgtagcatcttatggtttgtcaaccattgttctgtgcagatatctccaggaatatggtacattggttactttaatggccttggacctgctcgcacgcaatcaaagatggtatgcctcatttctaactagggaatgtgtagtttactgcactatcatctattttatttttcagcatgaatgcatcaagcaaattttgaattgttgataatatacttctgcagattagccgaggcagggcacgttctgtgagcactagtataactgtagaaggatgtccaacttcagcactatggggaccatattgtaaccaaacaatagaaatgattagttgttctcagtcttcaggatataacaactcgagaaatcttatgggtttgaatattgacaagaggaaaactttgaataccagagagcacacaaggcgtattaattttctgtcgcagtggaaccatttagaagaaaagggagttggctccaacagtacaacctattcgagaatggacaactcgatcacttgtgccatttcaaatggctcattatgcttaaggcagggtgatatgaagttctacttcttggatgtggttgacctagcattgcaatttgaaattacagctacgaattttgggttagctcaaaggtcatccttaatttgttacctgcgctacaatgcctttcctcggagagatttgcatgattattcaggtgacatcagcagtgctcctttggttttaaagttgccaaatattggacggtggtatatcgctattgagactgtaaatataacacagatgaatagcacagcatcaacacctttactggatacgacatgcttctcattagagtggcaagtgactggatgcctgaatggaaaagctggaaccaattgctcatgggaggcatatgtgctccaggtaggatgagaagttatggaatttacttttgttatcgactgtagccacacatgttttgacctttcaatctccggtttctatgatgtgatgattttaaagttgaaataaaccaaacactttgctacccatgaattgccatctgactgattttgtagtttttccatcacaagttcttttttgtgctggcatctgcatgctttgttaggtaaaacctagtttctgcaaagacatctttattaattaatcactgttcttaaaatgcagagggttcctaaacgaagtccttctgtccctttcgagtcatattatgttcctagtgatggaaaggcatccctggagtatagtcacttctccctggaacaatttttaagcaactcatcttttgagccatttgcatggacttatttctttctggatattcccgaaggttcagccggtgcgcttatccatgtccagataaaatcagataaagaattgaattatgagttgtactcgagatatggtggtttaccatcaaatgagagttgggattattatgcaagcaggacaagcagcagtaatggctcagtatatttttcattacaaaattccacaaattcagatatggatctatctattttctatgcaaaggagggaacttggtgctttggtgtgaaacatccaagtgataaatcaaattctcagacgtacatgtccatatctcttcagggatgccataagaactgcaatcagaaaggagcgtgtcattcctcaattgatgaaagtgggctaacgttctacaggtaattccacaagatgtttccctatagcgtgaaaatatttgtttctctttttttgctctttgcgctgtaacgatatttttttcttcattttctagcttctgcacgtgcgatcgtgatcatggtgggtttgattgcaatgatgaattagtttcacctaatggtaaactccctcgtatttagtttctaaattttctcagctaatgcatactacagcagtagtagccctatttctgggtagaaatcacaaatgtatctaatatactccctccttcccaaattgatcatcatataagtttatgca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