Difference between revisions of "Os02g0770700"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os02g0770700

Description

Peptidase C50, separase family protein

Version

NM_001054787.1 GI:115448944 GeneID:4330866

Length

7939 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0770700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:33386074..33394012

Sequence Coding Region

33386554..33387062,33387919..33388006,33388513..33388752,33389581..33389974,33390120..33390366
,33390454..33390683,33391136..33391191,33391271..33391462,33391642..33391744
,33391846..33392089,33392680..33393304

Expression

GEO Profiles:Os02g0770700

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgtatcagtctgccctggataaactgaacggcaccaaattggaatctcctgttgactcatatgataagcttaaaactacttgcattatctgcagcaaatatgggaaagaaccattagctgcaaatgatggagtgttaccttcatgtactgtatgtgcaaattttagtcaggcttccggtgatcactcgaatgagtttacggcattaaaatttctgaaacataaggattctgaatgttgtccaccattggatgttaaagttaaaaggacaaccagaaattcatcacgtttagctaaagaacagaatgtggaagctcatgtaaaaactaggacgcgctctagtaagcgaactgctcatatgaaaggtgaaaaggcttcaactgagctacactgtaagaatggcctatcttgcagcgataatctgtccacagatactttggtccgtggaaaagcaaactgtatccttgatggcgttgaccagagcatagattacacatgcagtatatttggatgttggaattgcctttttgtgaatacactcaactctgggtccatccagaatattttgcaattcagatgggattgtgtttggcatcacaaccatgtgtctatcctgttaaaaatagcaaaagccttgggtgctcatggaggattgcatggagctcataaaattcataatatctattggcagtgcatatcattgttgtactttagatcccttcctcaggattgttatagaacttatgagcataatttatttggactaatcatggatcagagcactggtgattttcttatttcagagagggcagaaatattatatagtatgagtttgtttttgctcaagggcttcctttcagaacagtcaagggacatatgctgccgcttctgcagtgtacaaatgtctgatgttgttccttggttgctgaaagcttttgtgctgtccagagagaatccctcactttttcaggaggtttgcaggctacttgcatgtatattcttacttgcaacgattgattccacggctcaattacctttatactccagtggatctctctctttgaatcattgggctgcatactttcatcagaattctgttggaacctatctcgattgccagtactttgctggcttaaaatcattactcagaaaaaatgactcgaaggccgctcttgaagatttttcaaatgcgtcagatgagagtctctcaaagtttttcaggttttcatcagcagacataggacatcttgagatacatataaaagaattcttccataagcttcctgatgtaccaattgtgtgcattagcatgcttgaaggtgattttgtgaatgttcttggggaaattcttcttctcccttcttattttcctgcttggatgatgctttcgaggtttgattcaacaaacaaacctattacaatgcttttgccagtggatgctatttctaaagaaacccaacatgaagattcctgtaccaaagaactggacaatctaatgagagccacagataagaattggcagtgcccttggggctacactataatagactacgtggctcctacttttagaaagatacttgaggagaactttatttccctctctagtgcaaccctcactctgaatgatggacaagcaaaccatgtaaagtggtggtcacatagaatgaagctcaacaaccaccttgataagatgctgaaagacatggaggaatcatggctggggccatggaaatgccttctcttggggtatgatttaactgaccaacacattgaggaagctctgacaaacctgattgctggtctggaatcagaattcaaatttgaagtaaatccagtgctcatcaaggtcatccttggtggtgctatgtcagtggatgaagtgcaggactgtgtttcccaacttatatcgtataaaggatattttggccgaggagggtgttgtgggaaagacagacttagagccttatcttcttgctgtattgagtctgaagctctggagacagtcgaatgcttaataaaaagtacagtgaatgagctgattgaaccagttgatagagatccagtcatttttgttctggacactaatgtgcagatgcttccttgggaaaacttgcctgcactaaggaatcaagaaatttatcgcatgccatcaattggaagtgtctttctagctttgactagaagtaataattattggaaagatgcccgtgttatagctcctccttttcctgtcattgaccctttcaacgcattttatctgttgaatcctagtggagacctgagcagtacacaagaagaatttgatcagatgtttaagaactacgaatggaagggaaaggctgggtatgctccaacagctgaagagctggtgttggccttgaggaatcatgatcttttcctttattttggtcatggaagtggaactcagtatgtctctggaaaggaaattgagaaattagataattgcgcagctgctcttcttatgggttgcagtagtggaacattgcgttgcaaagggtgttatgctcctcaaggagcccctttatcatatttatctgctggttctccagctgttatcgcaaatctctgggatgtgtcagataaggatattgatcgattcagcaaagcattgctcggttcatggttgcaagagaattttgtagcggccaaaaattgctcgaagtgttgccagctaacacgagaatttgaatccatgaccattgctgtggagggtaatggcaggccgaggcgaagaggcacacgagggaagaagtccgaacgaatgaataactgtagtaagcgttgcacttgtggcaacaggcgagtagcttcatatttaagtgaagctaggcgtgcttgcaggcttcctcttatgatcggtggatctcccgtttgctacggtgtgcctaccatcattaggaaaaagtaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MYQSALDKLNGTKLESPVDSYDKLKTTCIICSKYGKEPLAANDG VLPSCTVCANFSQASGDHSNEFTALKFLKHKDSECCPPLDVKVKRTTRNSSRLAKEQN VEAHVKTRTRSSKRTAHMKGEKASTELHCKNGLSCSDNLSTDTLVRGKANCILDGVDQ SIDYTCSIFGCWNCLFVNTLNSGSIQNILQFRWDCVWHHNHVSILLKIAKALGAHGGL HGAHKIHNIYWQCISLLYFRSLPQDCYRTYEHNLFGLIMDQSTGDFLISERAEILYSM SLFLLKGFLSEQSRDICCRFCSVQMSDVVPWLLKAFVLSRENPSLFQEVCRLLACIFL LATIDSTAQLPLYSSGSLSLNHWAAYFHQNSVGTYLDCQYFAGLKSLLRKNDSKAALE DFSNASDESLSKFFRFSSADIGHLEIHIKEFFHKLPDVPIVCISMLEGDFVNVLGEIL LLPSYFPAWMMLSRFDSTNKPITMLLPVDAISKETQHEDSCTKELDNLMRATDKNWQC PWGYTIIDYVAPTFRKILEENFISLSSATLTLNDGQANHVKWWSHRMKLNNHLDKMLK DMEESWLGPWKCLLLGYDLTDQHIEEALTNLIAGLESEFKFEVNPVLIKVILGGAMSV DEVQDCVSQLISYKGYFGRGGCCGKDRLRALSSCCIESEALETVECLIKSTVNELIEP VDRDPVIFVLDTNVQMLPWENLPALRNQEIYRMPSIGSVFLALTRSNNYWKDARVIAP PFPVIDPFNAFYLLNPSGDLSSTQEEFDQMFKNYEWKGKAGYAPTAEELVLALRNHDL FLYFGHGSGTQYVSGKEIEKLDNCAAALLMGCSSGTLRCKGCYAPQGAPLSYLSAGSP AVIANLWDVSDKDIDRFSKALLGSWLQENFVAAKNCSKCCQLTREFESMTIAVEGNGR PRRRGTRGKKSERMNNCSKRCTCGNRRVASYLSEARRACRLPLMIGGSPVCYGVPTII RKK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6951..7459#6007..6094#5261..5500#4039..4432#3647..3893#3330..3559#2822..2877#2551..2742#2269..2371#1924..2167#709..1333#taatggtgccgaagcagaagttttgttacgaacaggaaaggatatatcacaatttcaaggattgccggtttttggtgtccttttcgcatcagctttaggtatgtgtgtttatatacttccttatcaattttaggtctgtgcgtatatatatacttttacatcagtgttacgaagatcaaagaggcactattacttgtaatttagttttggcacttcataagttatgaaaaggacctcttgggacttctccaaagatagtactacctccgtttcaggttataagactttctaacattgcccacattcatataaatgttaatgaataatgaatcttgacacatatatatgtctagattcattatatatgaatgtgggcaatgctagaaagtcttataatatgaaacggaggaagtatacaacagttgtacatattgcttttggtggtttttgcgtcatttgtccttctgcctcatgttgcctgattttttaggtcaaatataccgcaagagacagcaatgggacaccgcagagggcgagcttaaatatgccagggatcttcttgcacaaaatgctacattcatttcgtgcaagctctgcaagttaactctggatatatcacttgatgtgcaagctggagatctattttggagtctatatgagaaagactttcagaaacagtcagcaggcaatttgtctaatgctctaggcatgtatcagtctgccctggataaactgaacggcaccaaattggaatctcctgttgactcatatgataagcttaaaactacttgcattatctgcagcaaatatgggaaagaaccattagctgcaaatgatggagtgttaccttcatgtactgtatgtgcaaattttagtcaggcttccggtgatcactcgaatgagtttacggcattaaaatttctgaaacataaggattctgaatgttgtccaccattggatgttaaagttaaaaggacaaccagaaattcatcacgtttagctaaagaacagaatgtggaagctcatgtaaaaactaggacgcgctctagtaagcgaactgctcatatgaaaggtgaaaaggcttcaactgagctacactgtaagaatggcctatcttgcagcgataatctgtccacagatactttggtccgtggaaaagcaaactgtatccttgatggcgttgaccagagcatagattacacatgcagtatatttggatgttggaattgcctttttgtgaatacactcaactctgggtccatccagaatattttgcaattcagatgggattgtgtttggcatcacaaccatgtgtctatcctgttaaaaataggtacttttctctatttatgctccttattatgtgtgttaaacaaataaattgcacacttgacgtaataacatgtgcgcaactaagggcttcacaatttgcgcataaattacgtgtatgttttcaggtttttgctagtttattttcgatatatttcatgtttaatcatttatttactattattttttagtaacatgctataacattcaagaggatacctttattatggaagacccatggaccagtccagtttttcaattttgtatacctggcttttgagcagttctctgttgaacagcaggagtgcagttatttctgtgaaatgctgttggtttacacatatgagatgggaaatcctcttttagctccaaatgatattcatataaagttaagtttatttatacattcgaagagattgttacgggtgaacatcaaatgatcttttgctactgtgaaatgcattgaatcatgtgatggtgacagatatagtccttttgtttaagaagtctgattgaattttattcattactaaattcctatataatatattcatatagtttttttttctcacttctgagtgttgtattttacagcaaaagccttgggtgctcatggaggattgcatggagctcataaaattcataatatctattggcagtgcatatcattgttgtactttagatcccttcctcaggattgttatagaacttatgagcataatttatttggactaatcatggatcagagcactggtgattttcttatttcagagagggcagaaatattatatagtatgagtttgtttttgctcaagggcttcctttcagaacagtcaaggttatttcattgtcttgctatagtatcagtcacatatccacattgcaattgtagcgcttcgtgaaacttgtgtaagttgttttcatttcatctgtcttcagggacatatgctgccgcttctgcagtgtacaaatgtctgatgttgttccttggttgctgaaagcttttgtgctgtccagagagaatccctcactttttcaggaggtctgtgatttcctttagtcatgtttccatgcagtataatgttttaaatgctcattgcatattcttaattttatcatctctgagtgcctgctgagttcaggctatagtttccttccgtcttcaagtatatgttttactgttgatggttcttgtgttgaaatccaactctcttggttcaggtttgcaggctacttgcatgtatattcttacttgcaacgattgattccacggctcaattacctttatactccagtggatctctctctttgaatcattgggctgcatactttcatcagaattctgttggaacctatctcgattgccagtactttgctggcttaaaatcattactcagaaaaaatgactcgaaggtttgtacgtaattcactgctaaatcaacacattccttttcatgtactatttatctttaatttttaccctgcatttcaggccgctcttgaagatttttcaaatgcgtcagatgagagtctctcaaagtttttcaggttcaaaatgtttatgtagtaaattagccaaatcattatttgtcattgtataggggaaatatcatgtgaaaacgagctaagtgttggaaactcgtgaaaatcatatctaaaaagctttgtaaattaatgaaaaaattattagagataggtgtacctatgaaatacactcaccaaattcaagtccaaactcaacttcattcgagagaaacaaaaataacaaatttcagttgaatagtgtcctgttactattcacccgaaatttgttctttttttactcccaaataaagttgagtttgaacttgagatttggtgagaatgtatttcatatctacacctatctctagtaatttttcatgaatttacaaaacttttaggtatgattttcaagagtttaacacttagctcatttttaccggatttgtcctccatggtcatatttaaatttctctcaggttttcatcagcagacataggacatcttgagatacatataaaagaattcttccataagcttcctgatgtaccaattgtgtgcattagcatgcttgaaggtgattttgtgaatgttcttggggaaattcttcttctcccttcttattttcctgcttggatgatgctttcgaggtttgattcaacaaacaaacctattacaatgcttttgccagtggatgctatttctaaaggtttgttgattccatattaaaattgcatagcttactcttagtatttcttttgtgttttttttttctcacatggctgttgcttggcagaaacccaacatgaagattcctgtaccaaagaactggacaatctaatgagagccacagataagaattggcagtgcccttggggctacactataatagactacgtggctcctacttttagaaagatacttgaggagaactttatttccctctctagtgcaaccctcactctgaatgatggacaagcaaaccatgtaaagtggtggtcacatagaatgaagctcaacaaccaccttgataagatgctgaagtaagatttcttatgttatggcaaaacttgaaaattgattccacaagatgtattcctaaaaaaatgtttgaattttctgttgttgagatggatcatatttttaataactttttggttctggtatgttatgttcttttttgaacagagacatggaggaatcatggctggggccatggaaatgccttctcttggggtatgatttaactgaccaacacattgaggaagctctgacaaacctgattgctggtctggaatcagaattcaaatttgaagtaaatccagtgctcatcaaggtcatccttggtggtgctatgtcagtggatgaagtgcaggactgtgtttcccaacttatatcgtataaaggatattttggccgaggagggtgttgtgggaaagacagacttagagccttatcttcttgctgtattgagtctgaagctctggagacagtcgaatgcttaataaaaagtacagtgaatgagctgattgaaccagttgatagagatccagtcatttttgttctggacactaatgtgcaggtgagcaataagatggccagattgtgaactatgtttactgtgtgggttagtacatgtgcgtagatatttcttcgagtccttgagatagtgttatggatgttttccttgactgttcggtctaatggtaggaatagatactgtggattcgatatcatttgtctcaagcctgtgttggtccaggtctgtggttgtatttaatatgaatatgaatattaaacataaccacaaatatcttaaaactgtcgcaacagcttggcacttacagttgttgaatttactgcatcctttgttgattaaaaaaagaataaatttcagaaaacgccatgctttatggttggagttgtacaaaaccttaggaactattactagcatagctccatagccctggatattatggtcctaaagtttcacaaaatcccacccctatacatgca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External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0770700, RefSeq:Os02g0770700