Difference between revisions of "Os02g0795600"
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GeneName = Os02g0795600| | GeneName = Os02g0795600| | ||
Revision as of 19:24, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0795600 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF239, plant domain containing protein |
| Version |
NM_001054920.1 GI:115449210 GeneID:4331004 |
| Length |
12537 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0795600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:34702573..34715109 |
| Sequence Coding Region |
34702573..34702580,34702786..34703062,34703834..34703884,34704466..34704630,34708545..34708691 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:34702573..34715109 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaaagcaaacaatgtttttcaagtgactctcctcttgtcatatcttcttctaactattggaggaaaagagctcaaatctataaacagtagagaaaaagctaatgaaagcctcacaagtccacaagttaatatcactattcaggcacaagatggagacatatatgattgtgttgatgtgaatctacagacaacatttaaacatccggtgttcaaagaccataaaattcagatggaaccaagctcttttccagtagggttggatattaaatcgccattagaaggtgcagtcttgcaagcacatctgtctaccttcgactgtcctataggaacaattccgatactgcacaacaacaacatggacaacacaattctacaacgaattggcgagttggctagcaatgagtcacgaatgctgggggccggaattgaatactgggatgaggtatacggaatacggggatcaatatatgtctacgacccaaaggtgaagaaagatagtcaggaccttactgcatcatggatacaaattagtaacttgccaaaagctgcggttggagttgggataggtgttgggtcttgtgtgtctccaagccttagtggtgataactttgctaggttccatatattctgggtaaggcatatgatgggccagaaagaatctatgatggaccatgataatgaagaactgaaaaaaggctgcgttgatcacaattgtcctggtttcgtgatccaaagactgaaaactggtggttggcatatggttcaaacaatacaccaatcggatactggccaagttcacaattctcttacctcaaagccaaagatggaacctagttctttcccgatagggatggatatcaaatcgccattagtaggtgcaatctcgcaagcacaattgtctaccattgattgccccattggaacaattccaatagtgcgcaacaacaatttggccaacatgatggtacaacgtattggcacactggctaatgatgatttaccaatgctgggagcaggaattgaatattgggatgagatatatggcatgcaggcatcaataaatgtctatgaaccaagtgtgaagaaagatagcaaagatgttagtgcatcatggatacaaattagtgttgtcccaaaaggtaccaacggaattggtataggtgctgggtcttgtgtatatccaagaagtggtgatagctttgctaggttccatattcgttgggataatgaagaattgaacaagagttgcagtgatcacaattgccctggtttcatgcaagttagtcacagtgttggtcttggaggaagaatcaatcccatatctgtctataatggaccacaatatgtaataaatgttcttatttttaagatggaaccaagctcttatccattagatcttgatatacaatctattctgtcatccaatatctcagaatcaaatttccccgacatcaagtgcccaaccggaacaattccgatactgcgtcacaatagctcagaagcacatatgcctaatggtggttcacaagaagaggtatggccaagttttagtggggacaactttgtcaggtttcacattcgttgggaccgaaagactaaagattggtggctagcacgcctagacaagagcagtgccattggatatcgaccacttggatattggccgagtaagctctttgacaccctacaagagaaggctacatatgcattttggggtggatgggttcgtggaccaactgtttcattagatcctccaccaatggggagcggccatttcgccaaagaggggtataggaaagccgcacttgtgaagggtatcaggatagccaacaaggacaacaactttgtcaatccaaacgttgagatataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MKANNVFQVTLLLSYLLLTIGGKELKSINSREKANESLTSPQVN ITIQAQDGDIYDCVDVNLQTTFKHPVFKDHKIQMEPSSFPVGLDIKSPLEGAVLQAHL STFDCPIGTIPILHNNNMDNTILQRIGELASNESRMLGAGIEYWDEVYGIRGSIYVYD PKVKKDSQDLTASWIQISNLPKAAVGVGIGVGSCVSPSLSGDNFARFHIFWVRHMMGQ KESMMDHDNEELKKGCVDHNCPGFVIQRLKTGGWHMVQTIHQSDTGQVHNSLTSKPKM EPSSFPIGMDIKSPLVGAISQAQLSTIDCPIGTIPIVRNNNLANMMVQRIGTLANDDL PMLGAGIEYWDEIYGMQASINVYEPSVKKDSKDVSASWIQISVVPKGTNGIGIGAGSC VYPRSGDSFARFHIRWDNEELNKSCSDHNCPGFMQVSHSVGLGGRINPISVYNGPQYV INVLIFKMEPSSYPLDLDIQSILSSNISESNFPDIKCPTGTIPILRHNSSEAHMPNGG SQEEVWPSFSGDNFVRFHIRWDRKTKDWWLARLDKSSAIGYRPLGYWPSKLFDTLQEK ATYAFWGGWVRGPTVSLDPPPMGSGHFAKEGYRKAALVKGIRIANKDNNFVNPNVEI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>12530..12537#12048..12324#11226..11276#10480..10644#6419..6565#6083..6295#5245..5430#3398..3494#2566..2618#2230..2487#1312..1497#794..880#1..144#atgaaagcaaacaatgtttttcaagtgactctcctcttgtcatatcttcttctaactattggaggaaaagagctcaaatctataaacagtagagaaaaagctaatgaaagcctcacaagtccacaagttaatatcactattcaggtatgagaaataattctttttctttctttctttctttctgagtttgggggggggggggggaggggttgtatatttggcatccttgatgacaaacaagaggaaatatcaagagtaaattatattggtgatatacaaacttatcaggtatgtgcaatttactacatgaacttgtaaaatacttgttttggtgtatgaacttgttggatgggtgcaaactaagaccaaaaggacatgtcatggccaattctatcaagttagatgctggttaggataggacgtgcacacgtgaggtgagcatgaaacatactatatttgtaaacttggtttatactttattattctttgttctaccccttgtatcatttctcggtttttttatatcattctccgtgcaatcgttataggccttattaaaccattttagtgaaaatatgcatgtttatgtagcattcttctcaagtacatatttatgtagcattctaatcaatacttaaattagcaagaatagtcttgttatgttcttttggccttcgttcgcacgcacctagttcatttaccaaaatgaatgttttacgagttcatgcactagattacacccacctaacaaattcatatacagctaatacgatttactcaaaaatcaaagtaggcacaagatggagacatatatgattgtgttgatgtgaatctacagacaacatttaaacatccggtgttcaaagaccataaaattcaggtaagccactttcataaacatgagatttgctttcatatggtgggtcaatttattttttttaagtttaaatgcaaaaaacaatatttttaggttctttcatattcatgattatatgatacatactgcgtaggctgaaaactgtaggcaaactcatcatagcaaaattctttctattggtttgtattcatggtaggccatagcttgcttctagattgttctaagaatcaacctttatgcactccctacactttttgccttaacataaaaaaggaaaattatgacttcttttttgtatatatggcccataatatatacacgcagaaactgcactttggaatcattggagcactttgttaggtagatatctatttaagtagtcgtgcgttgcgaatcatttattatatggtgataaagttttacatgtcaaatagatggaaccaagctcttttccagtagggttggatattaaatcgccattagaaggtgcagtcttgcaagcacatctgtctaccttcgactgtcctataggaacaattccgatactgcacaacaacaacatggacaacacaattctacaacgaattggcgagttggctagcaatgagtcacgaatgctggtaagtttttttagttaaatgcttgaactatatactaacgaaaggctgactgtgacaatatagacttttgtatggaactgtcccatgaattgcatatggcatttaacagcacaactagtgtccctgttcataacctaattacaacgtatgatcattttcaaatcaatctttcagtgctgacatcaaaattctcggcgagagatatagtaagacaagatatgcgcaatgttcccactgtaagaacaattataaataaaacaagacattcagagagatccccccccccaaaaaaaactctctcaattttaagaaataagtaactagttttaaatttgaaactttgatggttttttaacaagatattcgatcaaatgaataatatttcaataatactaaagggatttgaaatcagtttattgtacccaattactaatacttcttgggaaggtttatccacgttggtgctagtcgatagcactaagtgaatgaaatttctatgtaataactcattagaattatatatatgtatttatgatgtgtgaaatctgtctagtagcattgaaacatgcataaattggaagataatatccaacacgggaatgactacaaacccaggccccacattgtcttacttgcactggatatgccgatggaacattcaacttgatcatttggtctttgcaattattgttatttttatttgcaagaataaatgattatttttgcttgtagggggccggaattgaatactgggatgaggtatacggaatacggggatcaatatatgtctacgacccaaaggtgaagaaagatagtcaggaccttactgcatcatggatacaaattagtaacttgccaaaagctgcggttggagttgggataggtgttgggtcttgtgtgtctccaagccttagtggtgataactttgctaggttccatatattctgggtaaggcatatgatgggccagaaagaatctatgatggaccatgtaaattagccaactcagatattataaatataattcgttttgattccttattgaccctggaataaatatttatgacaggataatgaagaactgaaaaaaggctgcgttgatcacaattgtcctggtttcgtgtaagttagtcgcaatgttggtcttggaggaagaatccatcccatctctatctataatggaccacaatatgtaataaatgttcttatttttaaggtgttattatattcttaaattttgtatgattggttatataggttctatgtctaatcgtgcaatttatgtaatttattattgctattttttttgtttttcaaaaactaagcaactcatagtttttatagcaatccccttccctatcatctcctagccaaatattttatcttagtgcatgtaaagaaaattaatttattaaaaactaagcaactcatagtttttatagcaattcccttccctatcatctcctagccaaatattttatcttagtgcatgtaaagaaaattaatttattaaaaaggaactttgatgttatagtttcattaaaataagataaattacataattgcatacccagattgagaattgtaacataatgcatgcccagattgagaattgtacgatatttgtgctcgatcaacatggaaactcaggtttgactatatatgtagacttgatatatcaataataagtcgagtaagaacaatctaaactatattaatttccttttgaaattagtatgattacaatgaccacataaataaaactagtccaaactagttcaaatcaagacgaattaattacagttttttagtttgattacacaaacatatcaatattcaatgccaaatattactttagaatttgcattaagtatttgttgtctaatcttgacatgttttaggatccaaagactgaaaactggtggttggcatatggttcaaacaatacaccaatcggatactggccaagttcacaattctcttacctcaaagccaaaggtgattatgcattttggggtggatatgttcaaggtccgatagctgcttcagaccctccacaaatgggaagtggccatttcgcttctgaaggatttggcaaaacaacttttattaggaatattcaagttattgaagacaagaataacaagctggttactccaaacattcgtgattctgatcctttttctagtgatccaaaattatacagctatgatggttatggacttaatgataatggtatgcatgtatactatggtggcccaggcaagtatagctaaatggtgttatgtgctttgcaaactgtaacaacataatcttttgtgttggaaataatgggattaaaggttacatacatggcatgacaacacaatgcatgcatcctcttgtttcttcaataatcatgatttcttgtaatagttaaaatgaagagatgctcattgtcccaaagaagcaaatggaacttaataacacatagctagcatattccttctgccattgatgtgttgttggcagaggtaggagtatgataactgtagaggaggctcctccaactgtctaaccggtagctcccattttccatgaccaagaagctggcttgtcggagccaagcttgggagcatccataacgcagggttgtaggaaacccatataagtttgttggttgttgtagaacttcaagacgactttcccctattttcttcgcttaatgctaccaatcttatcaataaatgaggtcttgtttttaacatgtttaggcaggaaggtcatttatacatttatataatactaattaggtggaagtagtcatgcctgtgcaaatatgagatggctcttactctaccatatcttgtgcaattaatactgggattgttctatgtaataaatgtattgtacatctgtcattaattgtaatgtattacatcttaaatgatagccagtgaaacctttcctatataatggtctaaatgctatgaaacaaaccactcaagatttccaccatgaaaggaaacaatgtttctcaactggctctcctcttgtcatatcttgttctaactactaggggagaagagctcaaacccattaacaatggagaaaatactagtcgaatcctgacaactttacaagttaataagactattcaggtattagcaagtatacctttttccgagatacatttagtgatcctttgatggctaacaagcacagagaaacattaaagtaggtagaagatggagacatatatgattgtgtcgatgtgaatctacaaccatcattgaaacatccattgttcaaaggacataaaattcaggttagccactttcataaagatctgattttctatcacat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