Difference between revisions of "Os10g0474300"
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Revision as of 21:10, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0474300 |
|---|---|
| Description |
Peptidase, trypsin-like serine and cysteine domain containing protein |
| Version |
NM_001071372.2 GI:297610647 GeneID:4348880 |
| Length |
5642 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0474300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:18103355..18108996 |
| Sequence Coding Region |
18103355..18103445,18103553..18103606,18103698..18103840,18103989..18104273,18104345..18104478 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:18103355..18108996 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:18103355..18108996 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctgcttgttgtatgtcacgtggctgctatcctaaatcctatttcgggattgatctcatccgtcggatctcaagtcaaaccaatctgagccatccatcccgtggacccgttgaccacctctgtggacgtgattcatggactgcaaagaccctgagaaacgaggcacagattgattgcacaagaggtgtgagtagggagcaaagagccataaacagaaggaacaaacttgattcctcattgctttcaagtaggggtgatgacaagaaagacaagccaagccgcggcttaaaaaatatgagaaaatatcaagagattcggaaggcagtggctaattattacaacaatctgtgtgctatagaggaggaacgattcgacaaagatcttcgtgatcgagaagtttcgagcattgcttttgaagagaaatcatttggccatgttgtcaatcccggtcaacaaacttatcgaatcagtgctaatgttgatgtagatttgtctaccattgttgtctcccttgctttgtttgatggagataagatgttatttgcatgctcgggaatacctctaccagatgggacaactagagaacacctaacgagatttgtgacatcagctgctttggttagagtattcgacgagaagagaaatagagatgataaattgagggttgcagtgcgccttcctaataatagaattactgatgggttcttaggactatatgaccatgatattgctattgtcacgtgctttgggctcatagaggtccgtcctataagttttaaggcctgtcctgatggtattcaagcactagttgctgggcgtgccttcgagtcaggcaatttaatggctatggatggttttgttcgctgcaacaacacctgggttccagatagtcaagatatctctaaggctgtacttggagggccgcttcttggaaaggataagggatttattgggatgaactttagcatttgccatgatgatgatggaactttgacatatgctttcctaccaacgaaattgcttcggaagcgtttggagcattttgggatattgaatcctaaacatctccacttccgaggatattcgttgcctaaaggtgtatcaagcataataccttcaggatttatgaaaactatttaccggttaaaatcctatgggtatcccatgccaccaccacttgtgcttgaattgaatggggaattgcttaatcattttgaagaacgctttggtgaattacttgcatggaaagggtacccttatggtgatccagccaagtcttgtaggaatcgtgtctggtatcaacttccgaaagaagttgtgacaaatatatctcgtcgtgttgtctcccttgcatcattcaatggtttcgtgaggttttttgcatgcacaggcttgattataaagtggcatggaagcaaagctacgcgcactgtcatcttgacttcagcaagtttggtcaatcgttgtaatgatgacaagattgatagtaacctgacgattgaggtgtttctcccaccgaaccaacgttgttgtgggacattggaattctataatttaaactataatattgctattgtcagtctcaagaagaatttcaatgctgttcgcctagaagatatttttagtaaaacggtgcaagagccatctgaaaaagtagtagctataggacgtgacactagacttggaccattgatggccacaattggtaatgtgaagcgtggtaaaaagggatgcaaacttgactgcaaagatcttaagctgtccacatgtaaaatcaagaaggctgggattggaggccctcttattaattttgatgggagttttgttggcatgaacttctatgatggaagtgaagcaactcctttcctaccaaggcataagattgtcgaagttttaagcagagtgaatgatttaccatcagaaagtggatgtaacaatcctatgcccatagatatcggtgagggaacgaagaaaaacaggtggcctgtgcccgagccatactggtatcatggttcgcttgatgtagataggtcttatgtacccaagtgtattggaaggcgtctccagtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAACCMSRGCYPKSYFGIDLIRRISSQTNLSHPSRGPVDHLCGR DSWTAKTLRNEAQIDCTRGVSREQRAINRRNKLDSSLLSSRGDDKKDKPSRGLKNMRK YQEIRKAVANYYNNLCAIEEERFDKDLRDREVSSIAFEEKSFGHVVNPGQQTYRISAN VDVDLSTIVVSLALFDGDKMLFACSGIPLPDGTTREHLTRFVTSAALVRVFDEKRNRD DKLRVAVRLPNNRITDGFLGLYDHDIAIVTCFGLIEVRPISFKACPDGIQALVAGRAF ESGNLMAMDGFVRCNNTWVPDSQDISKAVLGGPLLGKDKGFIGMNFSICHDDDGTLTY AFLPTKLLRKRLEHFGILNPKHLHFRGYSLPKGVSSIIPSGFMKTIYRLKSYGYPMPP PLVLELNGELLNHFEERFGELLAWKGYPYGDPAKSCRNRVWYQLPKEVVTNISRRVVS LASFNGFVRFFACTGLIIKWHGSKATRTVILTSASLVNRCNDDKIDSNLTIEVFLPPN QRCCGTLEFYNLNYNIAIVSLKKNFNAVRLEDIFSKTVQEPSEKVVAIGRDTRLGPLM ATIGNVKRGKKGCKLDCKDLKLSTCKIKKAGIGGPLINFDGSFVGMNFYDGSEATPFL PRHKIVEVLSRVNDLPSESGCNNPMPIDIGEGTKKNRWPVPEPYWYHGSLDVDRSYVP KCIGRRLQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5552..5642#5391..5444#5157..5299#4724..5008#4519..4652#4264..4437#4113..4181#3942..4006#3231..3379#2831..3073#2565..2701#2259..2480#1993..2159#1..140#atggctgcttgttgtatgtcacgtggctgctatcctaaatcctatttcgggattgatctcatccgtcggatctcaagtcaaaccaatctgagccatccatcccgtggacccgttgaccacctctgtggacgtgattcatggtaaaacccggtctaccgcttgtctctatgacgaatggttcccacctatcacaagccctttctctctcctatcctagggcttacgtcatattcctccttttcagttctaaaataatcaaatatgatgttttctttacatgttttaattaattaaaatttcattaattcataagtaatttatacgaactcgaaatgagatcgttcaaatcacataattcatataaattcaacctctacccatttataaactttatttgtattgtttatttggttttattagtgttttttttctcattttacgttctaggtttagttttccgtcatttcggatgatcgttcgttctttggagaagctcctgaagatgaattgaagacgcttgtttgcaaggcaagtcacatagatctcaaaataccctttgagaatgttgaatctatgtttaaattctttatttcatttaaatatgcttttatttttgaatgtcattgggttgtctgagccttttccccatattatggccgaaggtaactttattatcctatgggtagtttgactagctgggccttatatactggtttagttagatatttagatgtaattgcttacccgtgctttgaaacattagcacactatggggataactaatgcttcactattacttaatgatggatatttaatggtagctcacgatggtcaatcgtgattggttaattagttaaatgccaattaaaacctaataatggtgggttgtgagcacatggttttgatggtcgtgcacatgacaattaagggccagttcacgagctactattgtgaagcattaactgtactaaccacaagccagcgtgggcaacgactggatacattatatagcatggttcattatggagtgccagagtgagaagttgtggagataagcccacgggattcgctggggagtttataccttggtctaaaggggagtctatgatccaggaaggtgcactgctttgaattgtgttatgcgaggtctcttgtcacagtcatgtttcgaggtaccgtggtggtactgagggcatggcaacatgttatggttctatgtcttgtgggtaaatttgtacacatctagccagagtaaaactattcaagtagccgtgtccgcggttatagggtgagcctaacaatgtttttcttgattagttccacactactcattaataataatgtgataaatgatgatactttggtttagctcctggtatgaaatggttagtccttggttttggagattgggtctgtcaaccgggcatggttgttcagttatggttgggcctatgcaacgggtatgttgtatagtgttggattaatactatttaattaattactctactgttttacatattctcaactctttgtcaaatgtttctttcgcaaatgaaccctatattatgtcatcctttgttatccctgtgcacttgcatacttgttgtgtggcctacggagtattcatatactcaccgtgcaataatcatcaaacctcagttggagaaaaaagatccataaaaagaacacttttggcttagatcccagtgagttgtctggtggagtggagttgaagcttcgctagattttcttttctgctgcagttttcttcgtggtgaggactaagtgcctcatatgtaagtatttaatcactttagttattatgatgaatctatatattataaattgtcagtttgtatacctcgggtgattcctggacgaggatttttaatacacaaattagtttggaaattacttgtgaattttcgggcgtgacacacatgcattatgatcaaaccttgactaaccatttgcatttcctttcttcttcaggactgcaaagaccctgagaaacgaggcacagattgattgcacaagaggtgtgagtagggagcaaagagccataaacagaaggaacaaacttgattcctcattgctttcaagtaggggtgatgacaagaaagacaagccaagccgcggcttaaaaaatatgagaaaatgtgcgtcattgattttgaattttttggttcttgtttttctggtacatgttgctctaataaaacactcatagttgtgtatacatcatgttcgttaatcagatcaagagattcggaaggcagtggctaattattacaacaatctgtgtgctatagaggaggaacgattcgacaaagatcttcgtgatcgagaagtttcgagcattgcttttgaagagaaatcatttggccatgttgtcaatcccggtcaacaaacttatcgaatcagtgctaatgttgatgtagatttgtctaccattgttgtctcccttgctttgtttgatggtgagtgcactccgatgcttatggattttcgtaatttgtatttagttgtcacttcttaattatttaaaccatgatcttgcccaggagataagatgttatttgcatgctcgggaatacctctaccagatgggacaactagagaacacctaacgagatttgtgacatcagctgctttggttagagtattcgacgagaagagaaatagagatgataaattgagggttggtgctgcaaatcattgtcctccattttgctggtttatttggccttcattacgccctccattttgctttatttatccaaactgattgtggccattgtatgctgatgtactgcttttatcactataggttgcagtgcgccttcctaataatagaattactgatgggttcttaggactatatgaccatgatattgctattgtcacgtgctttgggctcatagaggtccgtcctataagttttaaggcctgtcctgatggtattcaagcactagttgctgggcgtgccttcgagtcaggcaatttaatggctatggatggttttgttcgctgcaacaacacctgggttccagatagtcaagatatctctaaggtatgttgttataatctgtttgttacttttggtatgatggaaaacttgaattaaataattgcattaatattgatggtcttaaggtatcattgtttgcaacgaagtaaaaaaaaaacaatacattttttcctttatcctaccaatttgcttttgttaggctgtacttggagggccgcttcttggaaaggataagggatttattgggatgaactttagcatttgccatgatgatgatggaactttgacatatgctttcctaccaacgaaattgcttcggaagcgtttggagcattttgggatattgaagtatgtcttttacacatcctttatttgagttttttcttccccacttagcttattgatagctgttccaaattcgtctcatattccctttgtttaaggtaagccatttttatactaacaacattgggaccttaggagttttcacatggttatcttttgattctagcagcattggagccttcagagttttcacactgtaatctttggattgaaacaatttggattcttgatacctctaccttatggttaccaacatcggtgccacatgtcctttactaaattagtgcccatgcttaatgtatttcctaaatgaggaagtgtttaaactcaaaacaattcgttttggccatatggatagtgcaacttatatttcttacatttgaatatgctcagtcctctcatgtcttatgttgaatatttaatatcctgatttttttagtacatttttcataccttggttcctttcatacagtttggttcctgtgttggtatgactgtttttgcggttgggctagttcgtgtgtatttatttgtttgtcataacaagtgtactgtgttctctcagtcctaaacatctccacttccgaggatattcgttgcctaaaggtgtatcaagcataataccttcaggtgtgaacaatactgcgaatcatcattctaaatgttacctatgttctttattatgctaatgtcacatatcatctgagtactaataatgatctcctaattgcatcaggatttatgaaaactatttaccggttaaaatcctatgggtatcccatgccaccaccacttgtgcttgaatgtaagtcgttgcttttgatattgctttcatctcccttgtgcacttctttgtagttaatttctgatcttgtttctttaaccagtgaatggggaattgcttaatcattttgaagaacgctttggtgaattacttgcatggaaagggtacccttatggtgatccagccaagtcttgtaggaatcgtgtctggtatcaacttccgaaagaagttgtgacaaatatatctcgtcgtgttgtctcccttgcatcattcaatggtgattttgacagcaatatgttcattacttttctatgcaattttaccttcactaactaatgattaaagttgtaatgtgtaggtttcgtgaggttttttgcatgcacaggcttgattataaagtggcatggaagcaaagctacgcgcactgtcatcttgacttcagcaagtttggtcaatcgttgtaatgatgacaagattgatagtaacctgacggttggttctcctagtcatttatctttatctttattatatgattgctagctgaactcactttatgtttgcagattgaggtgtttctcccaccgaaccaacgttgttgtgggacattggaattctataatttaaactataatattgctattgtcagtctcaagaagaatttcaatgctgttcgcct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