Difference between revisions of "Os01g0375200"
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Revision as of 18:51, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0375200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase precursor (EC 1.1.1.25) (EC 4.2.1.10) (Fragment) |
| Version |
NM_001049613.1 GI:115436639 GeneID:4325444 |
| Length |
13322 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0375200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:15711627..15724948 |
| Sequence Coding Region |
15711628..15712004,15716996..15717101,15718269..15718487,15719506..15719852,15721045..15721108 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>attcggccattcccacaccaaaccaaccaaaaaccaaaaacccactcccacccacttcaccaacccacccccacccacccctcccctccacctgcgcccgcccgccaccaggctagacccagcctgaccaacccacccccactgcttgccgatcgctcgctcgctcgccggcgaaggacgaggggagagatgacgctcctgtgcgtgccgctggtgtcgcgcacggtggaggcgatgcaggccgacgcggcggcggccgcggccgccggcgccgacctcgtcgagatccggctcgacttcatcgaggggttccgcccgcgggagcacctcccgagcctgctccgtggctgccctctccctgccctcgtcacctaccgacccaattgggaaggaggccagtacgatggtgatgatgctacaagatttgaagcactccgtttagcaatggagttaggcgtagactatgttgatattgaattgaaggttgctgacaaatttatcagctttatttctggcagtaagccagagaagtgtaaacttattgtctcatcacacaattatgaaagtactccgtcctgcgaggagcttgcagatcttgtggctagaatacaagcagttggatctgacatagtgaaaatcgcaacaactgctagtgacattgctgatgtgtcacgaatgttccaagtgatggtgcactgccaagtgcctatgattggactagtgatgggcgaaaaaggtttaatgtcaagggtgttatcccccaagtttggaggatatctaacctttgggactcttgatgctacaaagatatcagcacctgggcagccaaccgtcaaagaactgttggacatttataatataaggcgtataggacctgatacaaaggttcttggtcttattgccaacccagtaaaacagagcaagagcccaattttgcacaataaatgtcttcaatctattggatacaatgctgtttatcttccacttttggcagatgaccttgctcgatttctcagcacatattcatctccggatttttcaggattcagttgctctcttcctttcaaagtggacgctgtacagtgttgccatgaacatgacccagttgctaagtcaatcggtgccataaacaccataattaggagaccagatggcaaactagtgggctacaatactgactacattggagcaatttctgctattgaggatggcataggaggcccaggatcaaaggatgctgccatctcacctttggctggcaggcttgttgttgttgtaggtgctggtggagctggtaaggcaattgcttatggggcaaaggagaagggtgcaagagttgtagtagcaaatcgtacctacgaaaaagcagtaagtcttgctgctgcagtgggtggtcatgccctgagattagccgagcttgaaactttcaggcctgaagaagggatgatccttgctaatgcgacatcattgggaatgtaccccaatgtggacggcacccctatcccaaagaaagcattaagcttctatgatgttgtatttgatgcggtatatgccccgaaagttacccggcttctacgagaagcagaagaatgtgggattaaagttgtcagcggtgtagagatgtttgtcagacaagccatgggtcagtttgagcatttcacaggtggtattgaagctcctgaaagcctgatgcgtgagatagctgccaaatacacataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>IRPFPHQTNQKPKTHSHPLHQPTPTHPSPPPAPARHQARPSLTN PPPLLADRSLARRRRTRGEMTLLCVPLVSRTVEAMQADAAAAAAAGADLVEIRLDFIE GFRPREHLPSLLRGCPLPALVTYRPNWEGGQYDGDDATRFEALRLAMELGVDYVDIEL KVADKFISFISGSKPEKCKLIVSSHNYESTPSCEELADLVARIQAVGSDIVKIATTAS DIADVSRMFQVMVHCQVPMIGLVMGEKGLMSRVLSPKFGGYLTFGTLDATKISAPGQP TVKELLDIYNIRRIGPDTKVLGLIANPVKQSKSPILHNKCLQSIGYNAVYLPLLADDL ARFLSTYSSPDFSGFSCSLPFKVDAVQCCHEHDPVAKSIGAINTIIRRPDGKLVGYNT DYIGAISAIEDGIGGPGSKDAAISPLAGRLVVVVGAGGAGKAIAYGAKEKGARVVVAN RTYEKAVSLAAAVGGHALRLAELETFRPEEGMILANATSLGMYPNVDGTPIPKKALSF YDVVFDAVYAPKVTRLLREAEECGIKVVSGVEMFVRQAMGQFEHFTGGIEAPESLMRE IAAKYT</aaseq> |
| Gene Sequence |
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