Difference between revisions of "Os01g0848200"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0848200

Description

Similar to Delta 1-pyrroline-5-carboxylate synthetase (P5CS) [Includes: Glutamate 5-kinase (EC 2.7.2.11) (Gamma-glutamyl kinase) (GK)

Version

NM_001051337.1 GI:115441044 GeneID:4324853

Length

9810 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0848200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:38186881..38196690

Sequence Coding Region

38187014..38187130,38187800..38187871,38187971..38188074,38188155..38188257,38188345..38188506
,38188631..38188908,38192016..38192166,38192383..38192547,38192665..38192742
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,38193621..38193724,38194023..38194098,38194542..38194692,38194834..38194902
,38194996..38195062,38195213..38195283,38195497..38195575

Expression

GEO Profiles:Os01g0848200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggggagaggagggatcggcggcgcggggctggtggcggcggtcgcgaaggcggacgtggagaacaccgactccacccgcggcttcgtcaaggacgtgaagcgcatcatcatcaaggtcggcaccgctgttgtgactgggccgaatggccggttggctatgggcaggctcggtgctctgtgtgaacaggtgaagcagctaaattttgaggggtacgaggtgattctggtcacctctggtgctgttggtgttgggaggcagaggctcaagtaccggaagctcgtcaatagcagtttcgctgatctgcagaacccacagatggacatggacgggaaggcctgcgctgccgtcggtcagagtgtgctgatggcgatctatgacacgttatttagccagcttgacgtaacatcatctcagcttcttgttacggatcgtgattttatggatccaagttttgggaaccagctccgcgagactgttaattctctgttagatctcaaggttataccagtatttaatgagaatgacgccatcagtaccaggaggcaaccatacgaggattcatctggcatattctgggataacgatagtttggccagactgttagcgcaagaacttaaagctgatctccttatcatgctcagtgatgtggaggggctctatagcggtccacctagcgatccacaatcgaagattatccacacatacgtccatgaacaacatgggaagttaattagctttggggagaaatctcgtgtgggaagaggtggaatgcaagctaaagtagcagctgcttttactgcttcatcaaaaggaatacctgttgtaattgccagtggatttgcaatcgatagcattattaaggtcatgcgaggagagaaaatcggtacgcttttccatagggaagcaaaccagtggggttgttccaaggaagcaacagcgcgtgagatggccgttgctgcaagagattgctccagacatctacagaaattgtcgtctgaggagcgtaagaagattttgctagacatcgccgatgctctagaagcaaatgaagatctaattacatccgagaaccaagctgatctggatttggcgcaagatattggttacgataaatcattggttgctcggatgaccataaagccaggaaagataaaaagcctcgcaggatcaattcgtgaaatcgctgatatggaggaccctatttcccatacactgaaaagaacagaggttgctaaagatcttgtttttgagaaaacatattgcccattgggtgttctcctaattatttttgagtcccgtcctgatgccttggtacagattgcatctttagcaatccgaagtggaaatggtcttctcttgaaaggaggaaaagaagctatgagatcaaacacaatactgcataaggtcataactggtgcaattccagatgttgttggtaaaaaacttattggcctagtgaaaaacaaagatgaaattgctgatttgctcaagcttgatgatgtgattgatcttgtaataccaagaggtagcaataagctcgtttcccagatcaaagcagcaaccaagattcctgttcttggtcatgctgacggtatctgccatgtttatattgacaaatcagctgacatggacatggcaaaacgtattgtattggacgcaaaggttgattatccagcagcgtgtaatgccatggaaacgttacttgttcataaagatctgaacaggacagaaggccttgacgatttattggtggagcttgaaaaggaaggggtagttatctatggcgggcctgttgcacatgacactttgaaactaccaaaggtagattcatttcatcatgagtataactcaatggcatgcaccctcgaatttgttgatgatgtgcagtcagcaattgaccatataaatcgctatggaagtgcacacacagattgcattatcactactgatggaaaggcagcagagacttttctacagcaagttgatagtgctgcggtattccataatgcaagcacacggttctgtgatggggctcgctttggtctaggtgctgaggttggcataagcacagggcgcatacatgctcgggggcctgttggcgttgatggactcctaacaactcgatgcattttacgaggaagtggacaagtagtgaacggcgacaagggagttgtttacacccacagggagctccctttgcagtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGRGGIGGAGLVAAVAKADVENTDSTRGFVKDVKRIIIKVGTAV VTGPNGRLAMGRLGALCEQVKQLNFEGYEVILVTSGAVGVGRQRLKYRKLVNSSFADL QNPQMDMDGKACAAVGQSVLMAIYDTLFSQLDVTSSQLLVTDRDFMDPSFGNQLRETV NSLLDLKVIPVFNENDAISTRRQPYEDSSGIFWDNDSLARLLAQELKADLLIMLSDVE GLYSGPPSDPQSKIIHTYVHEQHGKLISFGEKSRVGRGGMQAKVAAAFTASSKGIPVV IASGFAIDSIIKVMRGEKIGTLFHREANQWGCSKEATAREMAVAARDCSRHLQKLSSE ERKKILLDIADALEANEDLITSENQADLDLAQDIGYDKSLVARMTIKPGKIKSLAGSI REIADMEDPISHTLKRTEVAKDLVFEKTYCPLGVLLIIFESRPDALVQIASLAIRSGN GLLLKGGKEAMRSNTILHKVITGAIPDVVGKKLIGLVKNKDEIADLLKLDDVIDLVIP RGSNKLVSQIKAATKIPVLGHADGICHVYIDKSADMDMAKRIVLDAKVDYPAACNAME TLLVHKDLNRTEGLDDLLVELEKEGVVIYGGPVAHDTLKLPKVDSFHHEYNSMACTLE FVDDVQSAIDHINRYGSAHTDCIITTDGKAAETFLQQVDSAAVFHNASTRFCDGARFG LGAEVGISTGRIHARGPVGVDGLLTTRCILRGSGQVVNGDKGVVYTHRELPLQ</aaseq>

Gene Sequence

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gataagaaaagaatcaaagcaggagtacgtccacctatttggacttgtattctagtacttgatcagtgtcgtccgtttgatctagcagttgttttctattcagacttctattatcaaagttaatctacaccatcaaattctagtcccagtataatctaacggtctagatttttcttttttctccgattaacgtgggaatttctagcccccacagcgaacgtggtgcctcctttcaaagctgttttaataatataatagatttcaagttgtcagtaagacagtaagtaggaaagcttgtgtgtattttcccaacagcagtcttgtgattcaactctgctttctaactatttttattatccatgaagtggatttgcaatcgatagcattattaaggtcatgcgaggagagaaaatcggtacgcttttccatagggaagcaaaccagtggggttgttccaaggaagcaacagcgcgtgagatggccgttgctgcaagagattgctccagacatctacaggtattctttcctttcacttccttttgtgaaggaatcaggcaatgcaattttcaagctataacttcaaaaaacaatcaaataattgcgtgttttcttcatgtcatattaaattattacaaaggcatgtcgtcgtctttaagtagtataaatatcaatattgtttattttcttgctgcctttgctaactacttgtgttgcatgtggtcacctaaacagaaattgtcgtctgaggagcgtaagaagattttgctagacatcgccgatgctctagaagcaaatgaagatctaattacatccgagaaccaagctgatctggatttggcgcaagatattggttacgataaatcattggttgctcggatgaccataaagccaggaaaggtaggccagatacatgtgccatcttctgagcggtgtcatctttaagttcattatttgttgaagtgattcttggctgttgtatgaaatgtcctcactatatttaatatctattcgaagataaaaagcctcgcaggatcaattcgtgaaatcgctgatatggaggaccctatttcccatacactgaaaagaacagaggtgaatgcatataccctattctaaaatccaaacacgatgtgataagtactacaatcaatcaatgtgataagtactacaatcaatcatagcttcatgtgatttgtaaccaatgaaggacttgttttgtaggttgctaaagatcttgtttttgagaaaacatattgcccattgggtgttctcctaattatttttgagtcccgtcctgatgccttggtacaggtaaaatgatttttttagttggaaagaaactgtatcagttaactacaaagcaacgttatttatcatattaacataacattgtacagattgcatctttagcaatccgaagtggaaatggtcttctcttgaaaggaggaaaagaagctatgagatcaaacacaatactgcataaggtattatgtacttaactaactgatttagtagtaatgattaatgaagcaatagtaggcttcagtaataccaacatgctgtcttttattaggtcataactggtgcaattccagatgttgttggtaaaaaacttattggcctagtgaaaaacaaagatgaaattgctgatttgctcaaggtgagtatgtaaagtgattctttgggtgataaatttaagaatttaatctaaaccagaagtactctgtgcagcttgatgatgtgattgatcttgtaataccaagaggtagcaataagctcgtttcccagatcaaagcagcaaccaagattcctgttcttggtcatgctggtaagcttgtttttgttattgaattcttgtcactaaatattactagtatgataatggttatttattttgcataaactaagcataatacatttcctttttttattatgatatacattgaatgaatgttttttttcttctacagacggtatctgccatgtttatattgacaaatcagctgacatggacatggcaaaacgtattgtattggacgcaaaggttgattatccagcagcgtgtaatgccatggtacttctctaatttacaaatttattagcgtgtgcccatatggtgatacctctctatttattgtacttttttttaaaaaaatgtatattacgaattgtatgtgtgttctacatcgttgctggccactcatgctaacttacaagtattgttgtcgaacttctggctaaaagcaatagttcactgtggaagatgccattctattcaagtctaactttctatatttgtccacttaatttatttcttggaaaattttatcatttgagcacagatatctaaatattttttatattctgtgcaggaaacgttacttgttcataaagatctgaacaggacagaaggccttgacgatttattggtggagcttgaaaaggaaggtaaaatccacacccttgtagttgaagtattgcagccatttgtatcttgacatgtgttctgcaaaaagtgctacttcctccgtttcacaatgtaagtcattctagcatttcccacattcatattgatgttaatgaatctagacatatatatccatctagattcattaatattaatatgaatgaggaaaatactataatgacttacattgtgaaacggagggagtattttattttattatgagaaatgatgaacagttatgtagctcaacatcaaagatttgatgttcttaattactttcaatgcttctcaagggagcatattacagattttacttattatgttgcagtcaatccaaaattgctttgcaacacgagttcttgtgcaaatcagcaaaaggggatcagaagagcactaatggattttaattgatgtcatgttgcaggggtagttatctatggcgggcctgttgcacatgacactttgaaactaccaaaggtagattcatttcatcatgagtataactcaatggcatgcaccctcgaatttgttgatgatgtgcagtcagcaattgaccatataaatcgctatggaaggtatgcagtttttctccatactatatcctcatcactttttttttttggaagtatgcagtttttctccttactatatccccatcatttcttttttttttttttgaactaaacttgattgtgttaaatatatgttcatttcagtgcacacacagattgcattatcactactgatggaaaggcagcagagacttttctacagcaagttgataggtgtttaactaatttcctttgcacaactattatgtttgccgcttttagtacataccttaattaatggagttattcttctataaattgcaacagtgctgcggtattccataatgcaagcacacggttctgtgatggggctcgctttggtctaggtgctgaggtatgtcctttaaatttgtatcactttataacttggacattttcgttaactagttatcaaaaaaaaatagttatcgaaaatatatgttgttactattgaatggtcagcgtttcattcagtcccctattttctttcctttatcaaatataggttggcataagcacagggcgcatacatgctcgggggcctgttggcgttgatggactcctaacaactcgatggtagggttatcatgccatattgtcttcatgtccaaacattaaggacaatactattgtgcaagatgttttctgcatctagcattttatcatcatacaatattttttcagctaaatgttattatcatactaaacagatggaaaaaatcagtagttttgtatttactactagtatcttcatgtaatatgtgtgcattggtttttcgttatatatagcattttacgaggaagtggacaagtagtgaacggcgacaagggagttgtttacacccacagggagctccctttgcagtgaggtaggtagtgttcttttattttgaaagatggcatactactgattactaaccttcaacatctctggtttcaggtgaagtggcttgtgaaggagctgttgtagagcaattttttgcagacgctcaccgtgctcctccttgagagctgcttctcttcatgacatgcaatgggagcacgaaagcatgtcaaagcaggaagtaatgaagggcgaagtaggtcagaaacttatagtactatgtactatggtgttgctacgtagttgtgtggtattccttattattcattgtaccatgaataatttatgccaatgtcgtagtagctacatgtaactatattggctttcatggacacgtctatggtactagatgtaaaactgctagatggctttagatgaacatctcagatttattttccatagaatgcacatatgaaagtacctgagcgtggcgacgctggtgctttccatgataaagatctggctggtgtagggcggtctgctgctgaagccggagacatgcacatcgcagaagcctaatcatcagactggagcctcaactgaaccatcccgtatctgatctgtttagataaagacagttatattagaaatcgccaataagtctcggacgaaaattcccagcatttcacaacttaagaagttcagaattctagcagctattcgtaatgcatcccattgcagtattgcataacaaattacagagatgaatatcaatctcccagctcagggcctctaaccatgacagatggtagatactctcgtatcagtgtcaacattaggtggggatattacaatattacatccatgtctggtatccacagtaccatcaccattccaaatgtgtcaggataccgttactactactgatgtgttaaacagggatccatcacaaatgtatcaaaattgtctggcagagattccaattctctccaaacaaacaactcagcaatcttttgaggtacctcctgaaagactgagtcatgatggctagtctaatcaatatgttaggctatacaacaattcctacgtcttcagtggttattctgtataaatcagtaaagctcccaaaaaacattaatagagtccgcagcatcttcacc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0848200, RefSeq:Os01g0848200