Difference between revisions of "BGIOSGA029964"
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Revision as of 17:20, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA029964 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029964, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_30929 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA029964-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA029964-PA |
| Length |
14154 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:8720141..8734294 |
| Sequence Coding Region |
8734014..8734294,8728192..8728312),complement(8726639..8726723,8726350..8726403),complement(8726193..8726269 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:8720141..8734294 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:8720141..8734294 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGACGACGTCGACGCCGGCGAGATCTACGTGGTCGACCGGCGGCGAGAGGAGGGATCGGCGTCGGCGGCTGCGTTCTCGCGGTCGCCGTCCACTGGGAGGGTCGACGACGACGATGATGACCTGCTCACCTACGGCCGATCAGCCCGCCGGATGGCGGCGCTGCCGGCGCCGGCCATGCCGGAGGGCACCGAGCTGCGGCGACCAGTAGGCGGCGACGTCGTCGGCGACGACGACTACCTCCGCTTCCTCTACAAGTTCAAGGAACGTTTCGATCGGGTTGGTATTAAACTGCCGACAATTGAGGTGAGGTACAAGAACCTGAATGTAGAAGCAGAGTCATATGTTGGCAGCAGGGGCCTTCCCACCATTCTCAATACCTATGCCAACATATTGAAGAATGACCTTGCTATTAGGTTCTCCTGGCTCTGGAAAAACATCACTGTTGTTGGCCTTGGCTGGAACACTCCCATCAACCGTAAAATTCGTGAGACAATCAATTTCTCTGCAAAGTGTCAAGGAGTTGGCCATCACTATGATCTGTTTCTAGAACTATTGAGAAGAGAAGAGGAAGAAAACATTACACCAGATCCTGAAACTGATATATATTTGAAGGCAGCTACAACAGGAGAGGAGAAAGCTGAGATAGTTACAAATCACATACTAAAGATTTTGGGGTTGGATATATGCGCCGACACAATTGTAGGTGATAATATGTTGAGAGGCATATCTGGAGGGCAAAAAAGGCGACTAACTACAGCCCCTAATGTTGATTCTGCAGCTGAGATGCTTGTCACACTAGGACGAGCTCTTTTCATGGACGAGATATCAAATGGACTTGATAGCTCAACAACATTCCAGATAGTGAACACCATCCAACAAACCATTCATGTTCTTGGTGGAACAGCTGTCATTGCTTTGCTACAGCCTGCACCCGAGACATATGAATTATTTGATGATATAATTCTCCTCTCAGATGGTCAAGTTGTCTATAGTGGCCCTCGTGATCATGTGCTTGAGTTCTTTAAATCGTTGGGATTCAAATGCCCAGAAAGAAAAGGTGTAGCTGACTTCTTGCAAGAAGTTACATCAAGGAAAGATCAGAAACAATACTGGATACATGGCGATGACACATATCGATATATTCCTGTTACAGTGATTGCCGAGGCATTTCAGTGTTTCCATGTCGGCCAGGCAATAAGAAGTGAGTTGGCAATCCCATTTGATAACAGCAAGAGCCATATTGCAGCGCTGAAAACATCAAAGCATGGTGTCAACTTGAAAAAAATACTTAAAGCTAACATTGACAGAGAGATATTGCTGTTGAAAAGAAAATCATTTCTATATATATTCAATGCACTTCAGTTAACACTGGTGGCGATAATTGCAATGAGTGTCTTTATCCGTACAAATATGCATCATGACTCGATAGAAAACGGGAGGATGTACATGGGAGTGCAGTTCTTTGGTACGTTGGCAATAATGTTTAAAGGGTTGGCAGAAATGGGAGCAGCTCTTGCAAATCTCCCAGTTTTTTTCAAGCAAAGGGATCTACTCTTCTATCCAGCATGGACATATTCCTTGCCATCATGGATCATTAAGACTCCAATCTCCTTCCTTAATACAATAATTTGGGTCTCCATAACATACTATGTTATTGGATTTGATCCAAATATAGAGAGATGTTTTAGACAATTCCTTGTGCTTTTTGTAATGTCCGAGGCAATATGTGGACTTTTCCGTTTCATTGCTGCTCTTACAAGGCATCCAGTTGTTGCAAGCACCGTGAGTGAATTCTGTATACTAATAGTTATGGTTTCAAGCGGATTCATCCTATCAAGAGATGAAGTTAAAAAATGGCTGATATGGGAGTACTGGACATCACCCCTGATGTATGCACTAAATGCCTTAGCAGTAAATGAATTCCTAAGTCCCAGCTGGAATGAGGCACTACCTCGTTTTAGAGAACCACTCGGAAGGTTAGTTCTGGAATCTCGTGGGGTTTTCCCAGAGGCCAAATGGTATTGGATTGGTCTTGGTGCCTTGCTTGGATATGTGCTTCTGTTCAATATCCTCTACACCATCTGCCTCTCAATTCTCACATACGCTGAGGGTGGCAACAATGATGAAGCAACTTCAAGCAATGCAAATCATAATTCTAGTCCAGCCAGGAAAGGAAGTATCCTGCCTTTTGTACCCGTTTACATGACATTTGAAGATATAAGATACAGTATAGACATGCCAAAGGCACTGAAAGTACAGGGTATGGCAGGGAGTTGGTTGGAACTACTGAAGGATCTTAGTGGTTCATTTAGGCCAGGAGTGCTTACAGCACTTATGGGTATCAGTGGTGCAGGCAAGACAACATTGTTGGATGTGTTAGCTGGGAGGAAGACCAGTGGACACATACATGGTAATATTACTGTATCTGGCTATCCGAAGAAGCAAGAAACATTTTCTCGAGTTTCAGGATATTGTGAACAAAATGATATCCATTCACCAAATCTAACTGTCTATGAATCCCTTATGTTCTCAGCATGGCTTAGATTACCAGCCGAAATTGATTCTATGGCAAGAAAGAGATTTATTGATGAGTTCATGGAGCTTGTGGAGCTCTTTCCCTTAAAAGATGCATTGGTTGGATTGCCTGGCTTGAGTGGATTATCAACTGAACAAAGGAAACGGCTAACAATAGCAGTGGAACTAGTTGCGAACCCATCTATCATATTCATGGATGAACCAACATCTGGACTTGATGCACGAGCAGCAGCCATTGTCATGAGGACAGTAAGGAATATTGTGGACATGGGAAGAACTGTTGTTTGCACAATCCACCAACCTAGTATTGATATATTTGAATCATTTGATGAGTCTATTGAAGGTGTCAGGAAGATAAAACATGGCTACAATCCTTCAACATGGATGCTGGAAGTGACTAGTACATTGCAGGAACAGATAACTGGGGTTGACTTTACTCAAGTATACAAGAATTCTGAACTATATAGGAGGAACAAAAATTTGATAAAGGAGTTAAGCACACCCCATGACGGTTCAAGCGACTTATTGTTTCCAACTAAATATTCACAGTCCTTTGTTATACAATGTTTGGCTTGCCTCTGGAAGCAACGTTTGTCATGTTGGAGGAATCCTCCATATATTGCTGTGAATTTCTTCTTCACCGTTGTAATTGCACTATTGTTTGGAACAATGTTCTGGGGTGTTGGTAGAAAAAGGGAAAGAGCATCTCACATGTACTCGCCTTTGCCATATGCCTTGGGGCAGAGAATTCCAATATGGTGGAGATGGTACTATTGGATTTGCCCTGTTGCATGGACAATCAATGGGTTGGTTACTTCACAGTTTGGGGATGTAGATGACAAGTTTGATAACGGTGTGCGTGTATCTGACTTTGTTGAGAGCTACTTTGGTTACAATCTTGACTTGTTATGGGTGGCTGCTATGGCCGTTGTGTCATTTGCAATTCTTTTTGCCATCCTTTTCGGATTCTCACTTAAGCTATTCAACTTCCAAAAGAGATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDDDVDAGEIYVVDRRREEGSASAAAFSRSPSTGRVDDDDDDLLTYGRSARRMAALPAPAMPEGTELRRPVGGDVVGDDDYLRFLYKFKERFDRVGIKLPTIEVRYKNLNVEAESYVGSRGLPTILNTYANILKNDLAIRFSWLWKNITVVGLGWNTPINRKIRETINFSAKCQGVGHHYDLFLELLRREEEENITPDPETDIYLKAATTGEEKAEIVTNHILKILGLDICADTIVGDNMLRGISGGQKRRLTTAPNVDSAAEMLVTLGRALFMDEISNGLDSSTTFQIVNTIQQTIHVLGGTAVIALLQPAPETYELFDDIILLSDGQVVYSGPRDHVLEFFKSLGFKCPERKGVADFLQEVTSRKDQKQYWIHGDDTYRYIPVTVIAEAFQCFHVGQAIRSELAIPFDNSKSHIAALKTSKHGVNLKKILKANIDREILLLKRKSFLYIFNALQLTLVAIIAMSVFIRTNMHHDSIENGRMYMGVQFFGTLAIMFKGLAEMGAALANLPVFFKQRDLLFYPAWTYSLPSWIIKTPISFLNTIIWVSITYYVIGFDPNIERCFRQFLVLFVMSEAICGLFRFIAALTRHPVVASTVSEFCILIVMVSSGFILSRDEVKKWLIWEYWTSPLMYALNALAVNEFLSPSWNEALPRFREPLGRLVLESRGVFPEAKWYWIGLGALLGYVLLFNILYTICLSILTYAEGGNNDEATSSNANHNSSPARKGSILPFVPVYMTFEDIRYSIDMPKALKVQGMAGSWLELLKDLSGSFRPGVLTALMGISGAGKTTLLDVLAGRKTSGHIHGNITVSGYPKKQETFSRVSGYCEQNDIHSPNLTVYESLMFSAWLRLPAEIDSMARKRFIDEFMELVELFPLKDALVGLPGLSGLSTEQRKRLTIAVELVANPSIIFMDEPTSGLDARAAAIVMRTVRNIVDMGRTVVCTIHQPSIDIFESFDESIEGVRKIKHGYNPSTWMLEVTSTLQEQITGVDFTQVYKNSELYRRNKNLIKELSTPHDGSSDLLFPTKYSQSFVIQCLACLWKQRLSCWRNPPYIAVNFFFTVVIALLFGTMFWGVGRKRERASHMYSPLPYALGQRIPIWWRWYYWICPVAWTINGLVTSQFGDVDDKFDNGVRVSDFVESYFGYNLDLLWVAAMAVVSFAILFAILFGFSLKLFNFQKR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..281#5983..6103#7572..7656#7892..7945#8026..8102#8232..8285#8608..8698#8745..9067#9163..9444#9560..9876#9962..10122#10239..10342#10415..10571#10882..11024#11144..11476#11575..11865#12167..12300#12839..13066#13302..13350#13897..14154#ATGGACGACGACGTCGACGCCGGCGAGATCTACGTGGTCGACCGGCGGCGAGAGGAGGGATCGGCGTCGGCGGCTGCGTTCTCGCGGTCGCCGTCCACTGGGAGGGTCGACGACGACGATGATGACCTGCTCACCTACGGCCGATCAGCCCGCCGGATGGCGGCGCTGCCGGCGCCGGCCATGCCGGAGGGCACCGAGCTGCGGCGACCAGTAGGCGGCGACGTCGTCGGCGACGACGACTACCTCCGCTTCCTCTACAAGTTCAAGGAACGTTTCGATCGGTACGTAGGGCACATGCAATCCCAACTTGTTGAAATGAAATTAATTCGCCTTCAATTAATTATGAATACCACATTAAAATTAGCCGATCTTATAGTGGACTGTTTGTTTACTTGGTTAATATGCACCGCATCTGTCATGTGGAAATCTTAAAGCAGCAAAGCTCTGATCCCCATCGCCTTCACAAACTATATGCAGCAAGGAGTAGACTCGTAGTGGAGGACCTGCACTACTTAAAAAATGATTTTCGCACGCACGAGACTTTTTCTTTTCACATGTGGCCTAAAAGAAAAACCAGCTAGAAAGATGGCGGAGGTCGCTTTTAAGTTCATAGACCATATGTGAAAACTTATTTGTACTTAGAAAACCACCTCTGGAAATCTATATATTTGCACAAACGGTTTTCCAAGGGAACCACCAAGGGTAATTATCTTTTTTAAGGCAAGCCTTTATGAAGCAACTTCCCATCAGGGGCCCAATCGGAGAGATAAATTAGGCGCCGTCTATGCCGTCCGATCGACTCTGTATGCACAATCGAAGGGACTTTTCATGTTTTCTAGCGACTTTGCTACATGCAGCTAGGCTGCTAGGGTGTACTCCCTCCCTCCAAAAAAAAAATTAAATCTAGTGTTGGATGTGACACATTATAATACAGTAAATTCGGATAGAGGTATCTCCAGATTTATAGTACTAGGTTGGTTTTTATGGGACGGAGGGAGTAGCTACTAGGGTGGCTACCACTATAAGAGATCTTATGATAGGTGACGTTTCATTTACGTCATACAAACTGCAAAATTTGTCACGTTTAAAAATTTGTGACATTCACGTCGAAAATTCGTTCGTCACCTATCATGCGTCTCTAATCATGTTCTAATATGAAAACTTACTTTTTTCGTCATTGATCTAGTGGCGATCCTTCTTTCGTCATTAAGTTTATGACGTTCATTTTTGTCATTATCAAACCTAGAAAACGTCATAAAATACATCATAGACTATCGAAGGCCTTATAGTAAGCAACCTATTTATGAGCCAAGCCCAATTATAAACCTAGTTAGATTTAGACCAAGCCCATTTAAGGCATAGCAATTTACAAATTATTTTTAGCCCAATTATATTATATTCATTTGCATTTTCATCCCAATTTGTCTCATCACAATAAAATTTTGAAAAAAAAACATATATGCACCTACTCACTCCGTTTCAGGTTATAAGATGTTTTGACTTTGATCAAAGTCAAAAAGTCAAACTGCTTCAAGTTTAACTAAGTTTGTAGAAAAAAAACCTATAAACTTAGTCAAATTTAAAGTAGTTTGATTTTGACCAAAGTCAAAATGTCTTATAGCCTGAAATGGAGGGAGTAACTTTTTCATATAAAGTCGGATGAATATGAACTTTATATCAAAATTGTAGGTTTTTGACGAGATCTAAAAGTTTATAAGTTTATAGTTGACATTGTTTTCATTTGAGAATGTTTAGAGGCCCAAATATTTATTATAACATCTTAGACTTATTACAAAATATCAGATCTATGTTTCAACCGACCTTAGATGAAGATGTGATCTATATAAAAGTAATAGAGATCGGCTAGATCTACAACTTTTTACTTGATCATTTTTTTTCATTTAAGATCATTTAGAGAACCAAATAAGCATTACAAATTTAGAAGTAGAGGGGAGAGAGGCTGATTAGACTTAGCAGGGCTGCGGCTGGCAGTGGGCTGCTGCTTCCTACTCTGGCGAAGTGACTAAAACTGAACTTTGGTTGAATGATGTAAAATAGACTCATCGGCTTACGTTTAGGGGAGAAAGGAGGGATACGAGATAGACTTTACCTGGCTGGGCTATAAGCCTGCGCAGTGATGGGTAGGAGCTGGGCTGCTTTTGGCCCAAATATAGGAAGATGGCTTTAAATGTTTTTTTTCAATTTAAATAATGACGGAAATGATGTTAGTATTATTAAAAATAATTCTTTAGCTCCGAACATTTCAAGAAAATTTAAGAGAGCATAATTAATTATGGATAAATTATTAAAACTTCCAAGTCATAGTTTACTAGGTAAAATTTTATTTCCCATATCAACTTCACTTGTTAAATTATTGCACTTGTCAATAATTATTATTCCTGATTCTAAAATCAAATGTAATAATTATTAATTAAATATTAAATTAAATAAATTTTAGTGTGTGACATGAGTTGAATGTCCACTTTCAGACAATAGTATCCGGGAAAAAAACTTCATATTATTGGCATTCACTTCATAATATAATGGTTGGGCCAAATACGTGGCGCCTCAAATATCCTTTCTTTTAAAAAATTAATAAAAATATGTTTATGACAAACAAACATTGTCATTAACTTATGACGTTTGCTGGTTAGCCTCTTGTGACAAAACAACATTCGTCACGAACTCACGATACACTGTTTGGCCAGTTTATGACGATTTGTCCTTGGTCTCGATGACGAAAACCTCATTTTTGTCACAAAGTCACGCTACCCATAGCTGAACGTCATAAATCAAAATGAAATTATGGCGAATAGCTCCAATGTCACAAGGAGTTCGTCACAGAAGGTCATATCTCTTATAGTGTACTAGGGTGGTAGATCTGCACACTGCCCAAGAGATATATTAGCAAAATATTTCAAACTTCAAAATATTTTTTCTCATAAAATAATCATCCAATTTATGATTTGATTGCACCATTAAATTAGTTGCAATTAAATCTTTAGAATAAGACCACACCTGATTATATTTCGTTAAAAACTATTTAGCTTTTTTAATGGATTTTTAAAATGTTGCACTTGTTTTTATTTAAATGTCTCAATGACCTCAAATATTGCACATGATGTTTTTTTAATGTTTCCATCAGTATTTTATAATGTTTGAACAAATACAACTTAATGTTTCACATATGACATAAAAATGTTTCAACAATGTCAAGCTTTTGCAAATATGGATCTTTTATATTTTTTTAATGTTTCACTCCTTGGGACTCAATACTTCATATAAGTGGTTGCTTGTGTTGCAGCCAATATTTTATTAATGTTGCATTTCTTTGAAACATTTTATACGCTGAACGAAAACAATTTTCTATAAGCAGTGAAACAAAATTCAGTTTTGCTGAAACAATATTTACTCAAACATTGTAACAACACCAAGTGTAACATTAGAAAAATACACGTTGCAACATTGAGAACTAAGAAATGTGCAACATAGTCGGATTCCAGCTAAAACATCCACCTATCACGCGTGAAACATTAAATTTCAATGGATGAAACATATATAATTTTTTATTAGAATATAATCATGTGATATTTTGTTTTAAAGATTTAATTGTAAGAAATACGATGGTGCAATTGGAACTAGATCGCATGAGTAGTTTAGAAGAAAGATCGTTTCAAATGTTAAAAATAGAGTAGATAAGAGGAGGAGCACAACTCCACACAGTGGAGGGCTTCTTGTAGTGTTGCATATGGGCGCTGAGTATATGGCCGCCCAATCTCTCAGCGCTGGATTGGGCGCTCGATAAGAAGCAATTTCCAAGTCTTTAAGAAAACTGTATATACAGGTCTTTTTTTTTAATTGGAAGTGGGGTGATTTTTACCGGCAATGCAGAATCTTGTAGAAGTCAAAATTAAACTTGGTGAAAAATGAGAGCAATACTATTTTTAAAAAAGATCTTGTAACTTTTTCATAACAAGTTGGATTACATAATATTTTATATTGGCTATCAATGCTATCTACAACTTTCAACTGGTTTTTCTTTTGAGATCATTTAGGCCCCAGATATTTATTAAAAGCTTGATTTTTTGAGTTTTCCAAACAACCTTGAATGGAGATATGCAATCTATAACAACATTGTAGAGGACAACGGTATTTACAACTTTGTACATATGAGATTGTTTAAGTGTCTAAATATTCGTTACAAGCTCTAATATCTACTTTTACTAGTGAGTTTTTTACGATGTCCAAACATTGATGATTTATTTGAAATTTGATTGAGGTGAACCAAAGTTTTGTGAGAACATTATAATTTTACATTTATGCTAGTATTCGAAATATGAGATACCATATACTTGTGTACTAAGATTGGCGACACCCATATACCAAGTCATGATACCAAGTCTTCCTATGGAATCAAGGCTCGTACGTATGGCAAAAGTCCTGAGTTAATAAGAAAGGAATCTCAAAAAAGAAAAAAAAGAATTGAGTCCTATTTGGGCCCTCGAAGTAACATGGATCGTATCTAAATTTGCACAAAAGGACACCCGAGGGTATAAATACAAGGTCTCATGAGGGGGACATGAAACGAGGCCAGCACAAGCCTTCAAAGCCAAGACAACCCGTGAGAGGTACAAATCAATACAAGCCACCTCCAATCTCAAAAAGTTACTTCCCAAGAAAACCGATAATAGCTAGCCATCGACCACATGAACGAGCTTCACACACATATATTGGTAGATTATATTAGGTTT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