Difference between revisions of "BGIOSGA030083"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA030083

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030083, complete gene.

LocusTag

P0645D04.24

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030083-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030083-PA

Length

10583

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:5524768..5535350

Sequence Coding Region

5535102..5535350,5533035..5534108),complement(5531559..5531656,5530439..5530613),complement(5529067..5529868
,5527440..5528416),complement(5526307..5527358,5524768..5525563

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:5524768..5535350 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:5524768..5535350 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGAGGGGGAGCTGGGGCAGCAGACGGTGGAGCTGGGCGCGGTGGTGCGGCGGGCGGCGGAGGAGTCGTACCTCTCGCTGCGGGAGCTCGTGGAGAAGTCGCAGGACGAGGGCGAGGGGAAGGGTGGCGCCTATGGCGCGCGGCAGCGGTCCGACTCCGAGAAGAAGATCGACCTGCTCAAATTCATCGCCCGCACCCGCCAGCGCATGCTCCGCCTCCATGTCCTTGCCAAATGGTGCCAACAGGTTCCATTGGTTAATTATTGTCAACAGCTTGGATCAACTCTCTCCAGCCATGAAACATGTTTCACACAAACAGCTGATTCGCTGTACTTTATGCATGAGGGGTTGCAGCAAGCTCGAGCTCCTATGTTTGACATCCCTTCTGCTTTAGAAGTCATGCTTACAGGGAACTATCAAAGATTGCCATTATGTATAGAAGATATAGGAAGCCAAAATAAACTTTCTCCGGATGAAGAGAAGCGTGCTTTACAGAAGTTGAATGCAAGCGTGCGGTACAAAGTTCTTGTGACTCCAAGACCCAAAGAAGTTTCTAATGTTTCAGTAGCTGATGGAATAGCTGTTTTTCGTGTGGATGGAGAATTTAAAGTTCTTCTTACACTTGGTTATCGTGGCCACTTAGATTTATGGAGGATTTTGCATTTAGAGGTACTTGTTGGTGACAAAGGCGGGCCTATTAAGCTAGAAGAGAGGAGGAGATTTGCACTTGGTGATGATATAGAAAGACGAATGGCAGTTTCTGAGAATCCCTTCATGGTGCTGTATGCCATACTTCATGAGTTGTGCATCTCACTTGCTATGGACACTATCATTAGGCAGACCAATGTTCTTCGGCAGGGAAGGTGGAAAGATGCAATAAGATCTGAGCTTGTCTCAGATAGCACCACAGGGCAAACTGGGAGTGCTCCTCTAATGCAGCTTGGTCAGGATGGGGAATATGATTTGAGTGGTTCTAGGATACCTGGCCTAAAAATAAATTACTGGCTTGATGAAAAAGCTGGTGGCTCAGCAGAATCTGATTCATCACCATTTATCAAAATTGAGGCCAGGCAAGACATGCAGATAAAGTGCCAGCATAGTTCGTTTATACTTGATCCTTTGACGGATAAAGAAGCCAATCTTTCTCTTGATCTGTGTTGCATTGATGTTGAACAGCTCATTTTGAGAGCAATTGCTTCTAATAGGCACACTCGTCTTCTTGATATCCAGAGACAGCTGTCCAAAAATGTTCAAATTTCTCAGTCACCAAAAGATGTTATCCTCAAACGAGATGTTGAAATAGCAAAGGACCCGGTGAAGAAAACAGAGCAAAAGGATTTTGCAGATTGTTGTGGAAATGAGGTGCTTCAAGTGAGGGCCTATGGTCAAGCATATATTGGTCTTGGAATAAATATCAGGAGCGGTCGCTTCCTCCTCCAGTCGCCGGAAAACATCTTACCCCCTTCTGCACTGCTAGATTGTGAAGAAGCTCTAAATAAAGGGAGTATTACAGCTACTGATGTTTTTGCAAGCTTAAGAACCAGGAGCATCCTCCACCTATTTGCTGCTACTGGAAGTTTTTTTGGCCTTAAGGTTTATGAGAAGTCTCAAGGTACTCTAAAGATTCCAAAGGACATATTGCATGGTTCAGACCTGATGGTGATGGGATTTCCACAGTGTGCAAATGCCTATTATCTATTGATGCAACTTGATAAGGACTTCAGGCCTGTTTTTCATTTGCTTGAGACACAATCTGATGCAAATGATAAGACAAACACAAATGCATGCACAAAGGAAGCTTTGAGGTTTAATAAGATTGATATTGGACAGATACAGATTAGTAAAAGTGAATCGAATACAAATATGTTTGATGCGAAGCTGCATGCCCTACAGAATATAGGGAATTGTGATGACGTAATGGAAAATAGACTCCCCATTCAAAGTGGCATTGAGCCTCTTCCACTGCTGCCTGCTTGTTCACCATCGTTCTCTTCTGTTGTTGATGAAGTTTTTGAATATGAACACGGGGCTCTTGCTGTTCCAAACCATTCTTTGCCGCAAACTACTTTGCAGTCTACCTCTCATCCAGGTTCTCTTTCTGTTGGTTTTCAAGGAGTAGGTACTAGAGCTAATGCATCAATTGAAGGGGCCTCATCAGCTTACAGTGGATCAAAATTTTCTCCCGGGGTTGGTTTGAACAGTTATTTACCAAGTAATTTGAGACATGTACAAAGTACAAACGCCTTTTCCTCAAGCACTGTAACAAAATCATCTTCAATCAAGTTGCCAAGTTCTAATTCTAATCATGAACTGAGCTCATTGAGCTCTCCAACTGAACATGTGATTGCTGATGGAAGTAAATCACTTCAGCTCGTCCCTGCAAGCAAGATTAATGGATCAATCAACCTTATCACTATGGGCTCTGATGGTGCATCTAGAAAGCGTTCTATTTCAGATTTATTTCTGAACCTCCCTTCATTGCAAGGATTGAAACCCAGTAGCCCAAGGAAGCGAAGAAGAATATCAGAATCAATGGAGAGTTGGTCTCCTTTGCAAGCATATTCATCAGACTCACAATCAAGAACAAGCCTCACCTACGGAAATATTCTGGCTGAAAGAAATAATTGTGTCCCAGCAACTACATATGCTTCGGTGCTACTACATGTCATAAGACACTGTTCATTGTCCATTAAACATGCTCAAATAACTGCCCAGATGGATTCTCTTGCCATTCCATATGTTGAAGAAGTGGGCTTACGATCACCATCCTCTAATCTTTGGCTAAGGTTACCTTTTGCTCGGGATGATTCTTGGAAACACATATGCTTACGCCTCGGCAAGGCTGGAAGTATGTCTTGGGATGTTAGGATAAACGATCCACATTTTAGGGAACTCTGGGAGCTAAGTACAGGAAGCACCACAACCTCATGGGGTGTTGGTGTTCGTGTCGCAAACACCTCTGAGATGGATTCGCATATCTCTTTTGATGCAGAAGGTGTTATTTTAACTTACAGCAATGTTGAACCAGACAGTGTTCAGAAGCTTGTGTCAGATCTACGAAGGCTTGCAAATGCCCGTTCATTTGCCCGTGGAATGAGGAGATTGATTGGTGTCAAACTTAATGACAAGCTAGATGATGATCAGACATCTACGGATATAAAGACGCAGCCTGTTAATAAGGGTAATAGTGATGCTGCAGACAGGCTATCCGAACAAATGAGAAAGACTTTCAGGATTGAAGCTGTTGGCTTAATGAGCTTGTGGTTCAGTTATGGCACAATGCCTATGGTACACTTTGTTGTTGAGTGGGAAAGTGCTAAGGGAGGCTGCACAATGCATGTTTCTCCTGATCAGCTTTGGCCACACACAAAGTTTTTGGAGGATTTCGTGAACGGTGGTGAGGTAGCATCCTTCCTGGACTGCATTCGGCTGACAGCAGGGCCTTTGCTTGCCCTTGGGGGTGCAATTCGTCCAGCAAGAATGCCTGTAACGGTTTCTTCTGGATACAACTCCATGCCAAAGCAGATGAACAACATCCCCACCCAGGGACCATTAGCAAATGGTTCATCATCAACAACCATGCATCACGTACCTTCCCCCGCAAATGTTGCTGCCACCCATTTGGGAAGTCATAATCTCCACACTGCTGCGATGCTTTCCGCTGCTGGACGGGGTGGGCCTGGACTTGTTCCTAGTTCTTTGCTGCCCTTTGATGTTTCTGTTGTGCTCCGTGGGCCATACTGGATACGCATTATATATCGGAAGAAATTTTCTGTTGACATGCGCTGTTTCGCTGGGGATCAGGTTTGGCTACAACCAGCAACTCCTCCTAAAGGAGGACCTCTGGTTGGTGGATCGTTGCCGTGCCCACAATTTCGACCATTCATAATGGAACATGTTGCTCAGGGTCTAAATGCTCTTGAACCCAGTTTCATGAATGCTACACAGGCCGGTGCGCATTTAAATAGCAGTGCTGGAACTCTGCAACCTGCACCCAATGCAAATCGTGTAAACGCGACTCAAGGTATTGGTATGTCCAGGCCTGCTTCTGGAGTTGCTAACCATGTAGCAGCCAATTTGAGTCGAGCAGGTAATGCCATGTTGGCCTCTTCAGGACTTGCTTCAGGGATTGGTGGGGCCTCTGTGCGACTAACATCTGGAGCTAACCTCCCTGTTCATGTGAAAGGAGAGCTGAATACAGCTTTCATTGGGCTTGGGGATGATGGTGGCTACGGTGGTGGTTGGGTTCCTTTGGCAGCTCTCAAGAAGGTTTTAAGAGGGATCCTCAAGTACCTTGGAGTTCTATGGTTGTTTGCACAATTGCCTGAACTTCTGAAAGAGATACTGGGGTCGATTTTGAAGGAAAATGAGGGTGCTCTCTTGAATTTGGATCAAGAGCAACCTGCACTCCGGTTCTATGTGGGAGGTTATGTATTTGCAGTTAGTGTTCATCGGGTTCAATTGCTTCTACAAGTTTTAAGCGTCAAGCGATTCCATCACCAGCAACAGCAGCAGCAAGCTCAGAACAGTGCACAGGAAGAGCTAGCTCCACCTGAAATCAACGAGATATGTGATTATTTCAGCAGGCGTGTTGCCTCTGAACCATATGATGCTTCCAGAGTTGCTTCATTTATCACTTTGCTTACACTACCGATTTCAGTGCTGCGAGAATTTTTAAAACTAATTGCTTGGAAGAAAGGTTTCTCCCAGGCTCATGGGGACATGGCCACTGCTCAGAGAGCCCGGATTGAGATTTGTCTGGAAAATCATTCAGGATCAGTTTCAGATGATATCACAGAAAGCACTTTGGCTAAGAGCAATGTTAAGTATGATAGAGCCCACAGTTCTCTAGAGTTTGCTCTGACCTTTGTACTTGATCATGCTCTCATTCCTCATATGAATGTAGCTGGCGGAGCTGCCTGGCTTCCGTATTGTGTATCCGTACGACTAAAGTATTCTTTTGGGGAAAGCAACCATATAGCATACCTTGCAATGGACGGTAGCCATGGTGGCAGAGCTTGCTGGTTGCAATACGAGGACTGGGAAAGATGTAAGCAGAAGGTCGCCAGGGCAGTGGAGACTGTGAATGGCTCTGTTGCGGTTGGAGAATCAGGCCAAGGAAGATTGCGAATGGTCGCCGAGATGATCCAAAAGCAACTTCAGCTCTGTCTTCAGCAGCTGAGAGATGGTCCTCTTTCTGCTGGCTCAACTGCATCATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAEGELGQQTVELGAVVRRAAEESYLSLRELVEKSQDEGEGKGGAYGARQRSDSEKKIDLLKFIARTRQRMLRLHVLAKWCQQVPLVNYCQQLGSTLSSHETCFTQTADSLYFMHEGLQQARAPMFDIPSALEVMLTGNYQRLPLCIEDIGSQNKLSPDEEKRALQKLNASVRYKVLVTPRPKEVSNVSVADGIAVFRVDGEFKVLLTLGYRGHLDLWRILHLEVLVGDKGGPIKLEERRRFALGDDIERRMAVSENPFMVLYAILHELCISLAMDTIIRQTNVLRQGRWKDAIRSELVSDSTTGQTGSAPLMQLGQDGEYDLSGSRIPGLKINYWLDEKAGGSAESDSSPFIKIEARQDMQIKCQHSSFILDPLTDKEANLSLDLCCIDVEQLILRAIASNRHTRLLDIQRQLSKNVQISQSPKDVILKRDVEIAKDPVKKTEQKDFADCCGNEVLQVRAYGQAYIGLGINIRSGRFLLQSPENILPPSALLDCEEALNKGSITATDVFASLRTRSILHLFAATGSFFGLKVYEKSQGTLKIPKDILHGSDLMVMGFPQCANAYYLLMQLDKDFRPVFHLLETQSDANDKTNTNACTKEALRFNKIDIGQIQISKSESNTNMFDAKLHALQNIGNCDDVMENRLPIQSGIEPLPLLPACSPSFSSVVDEVFEYEHGALAVPNHSLPQTTLQSTSHPGSLSVGFQGVGTRANASIEGASSAYSGSKFSPGVGLNSYLPSNLRHVQSTNAFSSSTVTKSSSIKLPSSNSNHELSSLSSPTEHVIADGSKSLQLVPASKINGSINLITMGSDGASRKRSISDLFLNLPSLQGLKPSSPRKRRRISESMESWSPLQAYSSDSQSRTSLTYGNILAERNNCVPATTYASVLLHVIRHCSLSIKHAQITAQMDSLAIPYVEEVGLRSPSSNLWLRLPFARDDSWKHICLRLGKAGSMSWDVRINDPHFRELWELSTGSTTTSWGVGVRVANTSEMDSHISFDAEGVILTYSNVEPDSVQKLVSDLRRLANARSFARGMRRLIGVKLNDKLDDDQTSTDIKTQPVNKGNSDAADRLSEQMRKTFRIEAVGLMSLWFSYGTMPMVHFVVEWESAKGGCTMHVSPDQLWPHTKFLEDFVNGGEVASFLDCIRLTAGPLLALGGAIRPARMPVTVSSGYNSMPKQMNNIPTQGPLANGSSSTTMHHVPSPANVAATHLGSHNLHTAAMLSAAGRGGPGLVPSSLLPFDVSVVLRGPYWIRIIYRKKFSVDMRCFAGDQVWLQPATPPKGGPLVGGSLPCPQFRPFIMEHVAQGLNALEPSFMNATQAGAHLNSSAGTLQPAPNANRVNATQGIGMSRPASGVANHVAANLSRAGNAMLASSGLASGIGGASVRLTSGANLPVHVKGELNTAFIGLGDDGGYGGGWVPLAALKKVLRGILKYLGVLWLFAQLPELLKEILGSILKENEGALLNLDQEQPALRFYVGGYVFAVSVHRVQLLLQVLSVKRFHHQQQQQQAQNSAQEELAPPEINEICDYFSRRVASEPYDASRVASFITLLTLPISVLREFLKLIAWKKGFSQAHGDMATAQRARIEICLENHSGSVSDDITESTLAKSNVKYDRAHSSLEFALTFVLDHALIPHMNVAGGAAWLPYCVSVRLKYSFGESNHIAYLAMDGSHGGRACWLQYEDWERCKQKVARAVETVNGSVAVGESGQGRLRMVAEMIQKQLQLCLQQLRDGPLSAGSTAS</aaseq>

Gene Sequence

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