Difference between revisions of "BGIOSGA030138"
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Revision as of 17:21, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA030138 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030138, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_30582 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030138-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030138-PA |
| Length |
12316 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:4129943..4142258 |
| Sequence Coding Region |
4142224..4142258,4141697..4141910),complement(4140826..4140942,4139875..4139967),complement(4139627..4139801 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:4129943..4142258 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:4129943..4142258 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCATAACAGCTTATGTGTCTTCAAATAAACAGCGTTTCATGAATCAGTATTTTCTTCTAATCGCCTGCCTTCAGTTATGGTCAAGTATCACACCTGTTAGTCCTGCAACTACATGGGGTCCACTTGCCATCATCTTCATAGTTTCAGCTTCAAAAGAGGCTTGGGATGATTACAATAGGTACCTTTCAGACAAGAAAGCAAACGGAAGGGAAGTTTTGGTGGTAAAGGATGGCAACCATAGACAGATCAAAGCACAAGATATCCATGTTGGAAATATAGTGTGGCTTTATCAGAATGATGAGATACCATGTGATCTTGTTCTTATAGGAACTTCTGATCCTCAGGGCATCTGTTATGTTGAGACAGCTGCTTTAGATGGTGAAACTGACTTGAAAACAAGAATTGTTCCTTCTATCTGTGCTAACCTTTCTCCAGATCAATTAGGCAGAGTCAAGGGTGTAGTTGAGTGCTCCAACCCAGATAATGACATAAGAAGATTTGACGCTAACATGCGCTTGTTTCCTCCTATCATTGATAGTGAAAAATGTCCTTTAACTATCAATAATACTCTTCTTCAATCATGTTACTTAAGGTACACAGAATGGGCGTGTGGAGTTGCAGTTTACACAGGCAATCAAACAAAATCTGGAATGAGCAGGGGAACCGCAGAGCCCAAGCTCACTGCTGCTGATGCAATGATAGACAAACTCACTGTTGCAATATTTATGTTCCAAATTGTTGTTGTTCTTGTTCTGGGTTTTGCTGGCAATATCTGGAAGAAGAACCAGGGTCTTAAGCAATGGTATCTGCTGTATCCTGTGGAAGGACCATGGTATGATTTCTTGATTATACCATTGCGCTTTGAGCTATTGTGTTCAATAATGATTCCTATTTCAGTGAAGGTAACTCTTGATCTGTCTAAAGGTGTATATGCAAAGTTCATTGACTGGGATGAACAAATGTTTGATCGGGAAACATGTACGCCTGCTCATTCAGCTAACACAGCTATTAGTGAAGACCTTGGACAGGTTGAGTACGTTTTGAGTGACAAAACTGGAACGCTGACAGAAAACAGAATGATTTTCAGAAGATGTTGCATAAGTGATATTCTGTATGGAGAAAACAATGAAGATGCTTTAAAAGATGCCAGACTTCTAGATGCTGTTTCGCGTAACGATCCTGATATTGTCAAATTTCTCATGGTGATGGCTCTTTGCAATACAGTTGTTCCTATCAAAAGCAATGATGGTACTATAACATACCAAGCACAATCACAAGACGAGGAAGCTTTGGTCACTGCTGCATCAAAACTAAATATGGTGCTTGTGAGTAAAGACAGCAACACTGCTGAGATTTCTTTCAACGGTTCTAAGTTCTATTATGATTTGTTGGATATTTTGGAGTTTACTTCCGATCGCAAAAGAATGTCTGCTGTGGTAAAGGATGTCCAGAGTGGGAAGATCCTTCTTCTTTCTAAAGGAGCTGATGAAGCTATTCTTCCTCGTTGCCATCAAGGACAGCAAATTAGAACCTATCTTGAGACAGTAGAAATGTATTCTCAGTTGGGCTTGCGAACATTATGTTTGGGATGGCGTGAATTAGAAGAAGATGAATACAAAGATTGGTCCAAAACATTTCAAGATGCTAGCTGCTCCTTGGAGAACAGGGAGCGTAAAATTGCCGAAGTATGTCACCGTTTAGAGCAAGATCTTCAAATTCTTGGTGTTAGTGCCATAGAAGACCGTCTCCAGGACTCAATTCTTGTATCACTTTCAGAGCCGAATGGTCAATTGTTGTCTATCAATGGAAAAACTGAACACGATGTATTAAGAAGCTTAGAGAGGGCATTGTCAACAATGAAGTCTATGTCGGTAACAAAGGATTGTGCATTTGTTTTGGATGGATGGGCACTTGAAATAATTCTAAAGCATTCCAAGGAGTCCTTCACTAAGCTGGCCATGTTGTCAAGAACAGCGATATGCTGTCGAATGACACCCTTGCAGAAAGCACAGCTTGTTGGGCTCCTGAAATCTGTCGGTTACCTAACTCTAGCAATTGGTGATGGTGGTAATGATGTAAGAATGATTCAAGAGGCAAACATTGGAGTTGGGATTAGTGGTAGGGAAGGGCTACAAGCTGCAAGGGCTGCTGATTATAGCATTGGAAAATTCAAGTTTCTCAAAAGGTTGATACTTGTCCATGGTCGATATTCATACAATCGTACGGCATTTATTTCACAGTACTCCTTCTACAAGTCACTCTTGATATGCTTTATACAGATTCTTCTTCCTGTGACGACTATAATTTTTGACAAGGATATCTCTGAGGAAACAGTACTGCAATATCCCCAGATTTTACTCTATTCTCAGTCTGGAAGGCTTTTGAATCCAACTACATTTGCTGGATGGTTTGGACGATCGGTTTACCATGCACTTGTTGTATTCTTAACTACAATCTGTGCATATTCTGATGAAAAAAGTGAGATTGAGGAACTCTCCATGGTTGCGCTATCTGGATGCATTTGGTTGCAGGCTTTTGTTGTGACACTGGACACAAACTCATTCACTTATCCGCAAATCATTCTCATATGGGGAAACTTTATCGCCTTCTACATGATCAACTTAATAGTCAGTGCGGTACCAACACTCCAAATGTATACTATAATGTTCCGCCTGTGTAGCCAACCTTCGTACTGGATAACCATGGGTCTGATTGTTGCGGTAGGAATGGGCCCGGTGCTGGCTTTGAGATACTTCAGGAACATGTTTCGACCTAATGCCATCAACATACTTCAGCAAATCGAGCAATCCAATGGACATACCCATACCACCAGAAATATGGAGTCACGGATCATATCTGCTGGCAGTTATCTCACCCATTTACTAGCCGATTCGCGTCGCAACAGGGGCGCTACCTATCAGCCTCTTCTTTCAGATTCTGTAGCATCTGACGGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAITAYVSSNKQRFMNQYFLLIACLQLWSSITPVSPATTWGPLAIIFIVSASKEAWDDYNRYLSDKKANGREVLVVKDGNHRQIKAQDIHVGNIVWLYQNDEIPCDLVLIGTSDPQGICYVETAALDGETDLKTRIVPSICANLSPDQLGRVKGVVECSNPDNDIRRFDANMRLFPPIIDSEKCPLTINNTLLQSCYLRYTEWACGVAVYTGNQTKSGMSRGTAEPKLTAADAMIDKLTVAIFMFQIVVVLVLGFAGNIWKKNQGLKQWYLLYPVEGPWYDFLIIPLRFELLCSIMIPISVKVTLDLSKGVYAKFIDWDEQMFDRETCTPAHSANTAISEDLGQVEYVLSDKTGTLTENRMIFRRCCISDILYGENNEDALKDARLLDAVSRNDPDIVKFLMVMALCNTVVPIKSNDGTITYQAQSQDEEALVTAASKLNMVLVSKDSNTAEISFNGSKFYYDLLDILEFTSDRKRMSAVVKDVQSGKILLLSKGADEAILPRCHQGQQIRTYLETVEMYSQLGLRTLCLGWRELEEDEYKDWSKTFQDASCSLENRERKIAEVCHRLEQDLQILGVSAIEDRLQDSILVSLSEPNGQLLSINGKTEHDVLRSLERALSTMKSMSVTKDCAFVLDGWALEIILKHSKESFTKLAMLSRTAICCRMTPLQKAQLVGLLKSVGYLTLAIGDGGNDVRMIQEANIGVGISGREGLQAARAADYSIGKFKFLKRLILVHGRYSYNRTAFISQYSFYKSLLICFIQILLPVTTIIFDKDISEETVLQYPQILLYSQSGRLLNPTTFAGWFGRSVYHALVVFLTTICAYSDEKSEIEELSMVALSGCIWLQAFVVTLDTNSFTYPQIILIWGNFIAFYMINLIVSAVPTLQMYTIMFRLCSQPSYWITMGLIVAVGMGPVLALRYFRNMFRPNAINILQQIEQSNGHTHTTRNMESRIISAGSYLTHLLADSRRNRGATYQPLLSDSVASDG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..35#349..562#1317..1433#2292..2384#2458..2632#2768..2934#3140..3244#4011..4108#4205..4347#5443..5539#5625..5734#5850..6014#6625..6779#6916..6996#7894..8022#8489..8620#9523..9676#10544..10661#10860..10952#11067..11118#11613..11740#11811..11961#12068..12316#ATGGCCATAACAGCTTATGTGTCTTCAAATAAACAGTATGTCACTAGGTTTAATTCCATTAGATTTGCAAGAATCGTACTAACCATAATAGATCAAACCTCCTGGGCAATTCATTTACTGGAGTTCATCCCCTTTGTAGTTTGTACTATAGATCTCTGTTCTGCACCATGAGACCCAGCTGACTAGCACTTCTTTAGGATTTTGTCAAAATATCTGCAGGGCCTTAGTGCTTATGTTTTGTTTATTAACCGTGAATCCATTGGTATATCTATGCTAAACCACTTTTCTTCTTTATGCGTGTCATAGAGATATCGATTTTAATTATAACCCATTTCTTTGAATATTCAGGCGTTTCATGAATCAGTATTTTCTTCTAATCGCCTGCCTTCAGTTATGGTCAAGTATCACACCTGTTAGTCCTGCAACTACATGGGGTCCACTTGCCATCATCTTCATAGTTTCAGCTTCAAAAGAGGCTTGGGATGATTACAATAGGTACCTTTCAGACAAGAAAGCAAACGGAAGGGAAGTTTTGGTGGTAAAGGATGGCAACCATAGACAGGTTTTTGTTTTCTCTGTTATATTTTCTGTTTTTTAAAACCGTAGTGAAACTTTGTCTAAATCTATTGTAAGTTTACATCAATATTTGAATTCATTATGTTATTGCTGGAAAGTCATTTGTCAGCCATGTGTTTTCACTTGTCTAGGTGAGATCTGCTGCCTGAAGGCATTGTATTTGATATTAGTTGGTGTTATATGAAAAAGGAAATTCTATAATTCCTTATTTGCTTATGTTTTCAACACCGTACTCCAAAAACTGATAAGATGGAAACCCTACATGTTACTTGCTGTTCAGTTCGCATTAAAAATAACATGAAAGATAATGGAACTCGTGAATGGCATTGTTTAGTCTCGTTCTATTTGGAGGTTGTAGTAGCAAAACTTATCTGAGAGCTCAGTTTACTCAGCCTTTTTGCATGATCTGCTGCCATAATAACCATTCAGTGGCTAAACTGTATTGATCGTATTTAGGTAAATAAAGCCTTAATTCTTGTAACCATTTTAAATTTGCAAATTCATCTTTATTGACACTTGTATACCCATTGATACATTTTAAGTACCAATCAGTATCTGCAAATGTAAACTGTAATTAAACCTAGGAGTTGTTGATACTGAGAAACGCTAAACATGTATGCAATACGGAGTTTTAATGTGCATGATATTCTTCATTTGCCAGAAGTATTACATTTAGGAGCACTTGAATTTACACACTGAACATGTAATTGTCTAATAATCAGATATTTACATGCTTTTAGATCAAAGCACAAGATATCCATGTTGGAAATATAGTGTGGCTTTATCAGAATGATGAGATACCATGTGATCTTGTTCTTATAGGAACTTCTGATCCTCAGGGCATCTGTTATGTTGAGGTAAATGAAGTTATTCACAACTAGCAGTTAATAACTTGCATTCTTCCTATGTTTATTTCCTGGACCTATAGGGATTAATAATAGTAGCATGTGGGATGTCCATAACCATGTTGTTAGTGTATTCGCTTGAAATGCTTGTACATGGCAACACATCAGAATATTGTGGAATGTGTACTTTACATATATTGACCATACACCGGGGCATATCCTGTACAATAATAACAGGCAAAATGATCTTTGTGCTAAAAGCAGCTAGATCACAGACCTGAGATTTTATTTCTACATGCTCGCTGTTCAGTGGGTTAGATGGTGCAGTTGTGCAAATTTAGGGACTTAATACTGTGCCTTATCTCAGGAGAAATTAACCTTCACAATTCTTGCAGTAGTTGATTTGGCTGTAGTGATCAGTGCACATTTACCAGATTTCAATGGATTGGCGTATTTCTTATACAGCGTGGCTTTATAGTGGTTTCTTAGAAGCACTTCTATTCTTCTATATATGAATGCGTTAATTAACCGATGGCATTCCTTATATTTTATTAGTATCTAACTATATTTTCGCAGCAATCAATACCAAATTGTTCTCAGTTTGTCAAACCCAGAGCATATGATATATGCAAAATCTCTTGCGGTGTCACTCCTTAGTAGATGAGAAACTTGACATGATGAACTTCCTTGCATTTATTTTTATCCTTGATCATATCTCTTTGGCTTAGGTGGTGGATTTATGTTGGTTTACGTGAACAGTGTGTTTTTTCAGATCCTTAGTTTTACCTAATGCTATCAGAAATATATAATTTTCTTTGGCTGCCGTAAATCAAGCTAATTCCAAATTATTGTTCCAATATTTTACTCCAGACAGCTGCTTTAGATGGTGAAACTGACTTGAAAACAAGAATTGTTCCTTCTATCTGTGCTAACCTTTCTCCAGATCAATTAGGCAGAGTCAAGGTGAATCTTTCTTCTACTTTCAATTCGTTTTGTTCTCTTGCACCTTTCTGATTGTACCCCTCTGAATTGGCAGGGTGTAGTTGAGTGCTCCAACCCAGATAATGACATAAGAAGATTTGACGCTAACATGCGCTTGTTTCCTCCTATCATTGATAGTGAAAAATGTCCTTTAACTATCAATAATACTCTTCTTCAATCATGTTACTTAAGGTACACAGAATGGGCGTGTGGAGTTGCAGTTTACACAGGTATACCTAGAACTTGAAGATACTATGCTTTTGTCTAGATCATTGATGATTTGCTTGCTCTAAAATGTATCTTTTAGTATTTGTGTACAGAAGACACCATGTAACGCATGGTTTACCTCCTAAATCATTTTCTAGGCAATCAAACAAAATCTGGAATGAGCAGGGGAACCGCAGAGCCCAAGCTCACTGCTGCTGATGCAATGATAGACAAACTCACTGTTGCAATATTTATGTTCCAAATTGTTGTTGTTCTTGTTCTGGGTTTTGCTGGCAATATCTGGAAGAAGAACCAGGGTCTTAAGGTGATATTTCTTCCTGAATTCTGATAACCATTGTCCTGTATTAGAAAAATCACTGTTACTTTCATTCATATTATGTTGTTGTGTTGTAGGCTTGTAGCTTCTTGAAGGCTCTTCTGTTATATTTTATAATTTTGAACTGTTATGGATTGCATGTAATGTTATGTTATTCCTGTTCTTGATCTGGTTATTTTCTTCCTTTGCATAGCAATGGTATCTGCTGTATCCTGTGGAAGGACCATGGTATGATTTCTTGATTATACCATTGCGCTTTGAGCTATTGTGTTCAATAATGATTCCTATTTCAGTGAAGGTATGCCTAATTTGAGTTATTGGTTTCACATGTGGTACTTGTTTTGAAGTATGCCATGCCGCGTACAATATGATGTTGCAGAAGTGATTTCTCCCCCAGTCCCCCCCCCCACATACATTAAAGGAAATATAAGAAGAATTTATTAATAATGTTTCGCCATGTGCATGATAGTGTAAAGAAAATAATATTTCCCTAGATATTTTTTTTACAAGTTCCTGTTTGTAACATGTGATTGAACATATATAATTGATGGCCAATTCAACTCCAGTACCTTGTTGACTTCTTTGGCAGCGGGGACCTCCTCTAGATAGCCACCTGTTGAGCCCTGTACTTGCCTGCAAGCCTTGTTTGAAAAACCTCAGATGCTCACAGCCTGGAGAAATCAGTAAACTATTGAGATAGCATGATATCGTGCTAATTATACACTGATGTAGATGTTCGCTATACAATGGTCACTGGGAAGTGATTGTTGTCGATTATTTGTTAAAGGGACTTGACAAGGGTATTCTTCACCCCCCCCCCCCCCCCCAATGCATCATATGGATGAAGCGTGCCAGAACGTCTACACTGAACAAACACATACAATCCAAATTTTTTTCCCGTTGTTGGATACTTGGTTTGATTCTAGACAATCCATTTATCCATGTACAAGAAGTTAGACCAGGCAGTGAAAACAAGCTATTTTTAGTGTTCGGTTATGTTCTTGACAGTATTTCCTGCAATCCTTGTAATTTTCAAAATGTTTTTTTTTATGCACTGGTTGTAGGTAACTCTTGATCTGTCTAAAGGTGTATATGCAAAGTTCATTGACTGGGATGAACAAATGTTTGATCGGGAAACATGTACGCCTGCTCATTCAGCTAAGTATGTGGCATGTTATTTCCATATGTGTGAATTTAGATTTTTCATCCAACCTAGCTATTTATTTTTTAGTACAGCTTACATAAGTGTCTCTTTCAGCACAGCTATTAGTGAAGACCTTGGACAGGTTGAGTACGTTTTGAGTGACAAAACTGGAACGCTGACAGAAAACAGAATGATTTTCAGAAGATGTTGCATAAGTGATATTCTGTATGGAGAAAACAATGAAGATGCTTTAAAAGGTTATCCACTTGTGTTCTAGCTAGCAGCAGAAATTCTCTTTTCTCTGGGCTTAGGCCCTGTTTGATTCAGCTTAGGATTATTATAGTCTGGATTATTAGGAGTAAGCTGAAACAAACAGATAGCTTATTATGATAGATTATTATAATCTATAAGCCAGATTACTATAATTTGGTAAGCCACTCTAAAAGTGCTTTCTTTAGATTATTGGGTGGCTAACAGCTAACAAACAAATAATAATCCAGAGAAACAAACAGCTAGCAGCTTATTCTGTATTGGCTTATTATAATTCAGCTTATAGTAATCTAGTTCTATAATCTAGATTACAATAATCTTAAGATGAAACAAACAGGGCTTTAGTGTGATACAATGTTATTTGTTCA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