Difference between revisions of "BGIOSGA030393"
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Revision as of 17:23, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA030393 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030393, complete gene. |
| LocusTag |
OS09G0261500 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030393-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030393-PA |
| Length |
11464 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:4322296..4333759 |
| Sequence Coding Region |
4322296..4322502,4323396..4323498,4323874..4323997,4325628..4325743,4326048..4326152 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:4322296..4333759 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:4322296..4333759 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCTTTCTTATGTCATATTCCCTGGAGATTGTGTTGAGGTAAACAGCATTTATGGACTGTTTGAGGTATCCCTTTTGTGCTTAACTGCATGCATTTTGCTAACGTTTCCCCCCTTTTTTATGTTAGGCACATTCTATGGAAGATGCTTGATTTTACCAAACCTTTTAATCAAATATTCACTTATTTCAGGTACATTCCATGAGAGTGCCAAAGAATCTGCCGATGCTCGATGGAGGCCTGGGATGCAGGGGCGAGGTGGAAAAGGTGGATGGGGAAACTCTTCACGCCAGCTATCCAACTCCTCTGACATAACTGGGAGAAATGCTCCTGCTGAAAAGGAAATTGGAGTGAATCCAAACATGGACAAATGTAACAGCTCTGTACCTGTCAATCCAAACACAGACACCAAGACGTCTACTTCGATCTCAAGTTTGTCAGTTGGCCAATCCAATGGTTCATCAGAGCCTGTTGCTTCCATGGAGAAAAGTTCTCTTGCTATAGGTCAGTTGCAGATTTCAGATTCAAAAGGAATATCTGATTTGGAAGGCACATCTCGATCTTCTGGTTTGTCATCCACTGTGGTACCTTCTGGTAGTAGGCCATCTTCAAGCTGCAGTAGTCGTGCACAGCAGTTGAGCAGTGTACAGAAAGTTGTTCCAAATAAAGAATGGAAGCCAAAATCAACAAACAAACCAGCCCATGCTGAAAATGTTATATGTGATAAAGTGCCTGTTTCTGTGGAGACTGTTCCCCAGTCGATTCTAGTATCGGATTCCATCCATAAGGAAGATACCACTTCAGGAGTGGAGACAAGGCCAAGTGACATGCGCCTGTCTGACAAGCAGCATGTTATTATTCCTGATCACCTTCAGGTTGCAGAGTCAGAAAAATATGGGCTTAGTTTTGGCAGTTTCGGTGCCTGTTTTGAGCAATCTGCAAGCTTTTCAAAAGACACTGAAAGTGAGAAATGCTCTACACCTCAATGTGAATCGTCTCAGGAGGCAGATGAAGTTCTGGATGAACCTGCTGCAAGTCATCAGGGTGTGTCCTCAACTGTTGAAATGGCAGCTGAGTCAGATCTGCAGCAGCTGCCTGCTGAAACGGCAGATAATATTTTACCTCAGAAGGTTGATAGTTCCTCAAGTATTCCTGAAGTTGCAGAATCAGACCAATCAAACGATACAATAGCTTCACATGTACCTCAAGATTCAGTTGAAACTACTACACCTTACCCACCACAACAGTCGCATGGAGATCAGATTCCATCACTTGAAACTTCTGAATCTCAGGCACGTCTGGTACAACAGGTCAATGACTCTTCTGCAGGCTATTATACACAATTTTACCGACCACCTGCTGATTTTGATGGCCGTATCTCACCATTTACTGCTTCTGGAGCTGCTATCAAGTACGGAAACTTGTCGGTTATGCCCACACAAACTGGGCATGCCCAAGAGGGAATCAACTCCTTCGTGCTGCCTTCAGTTGGGTCTACTCCACTTGCCACCCCAACCCCTGGAGCCGTACCAAATTCTGTTGGTATTCCACAACAGCCACTTCAATTATTCCGCCAGCATTTAGGTGTTTTACCTCAATACCCACCAAATTATTTCCCATACAGTCAGTATCCACTCTATGTTCCACCACAACCCCTTCATTTCATGGTTCCTCAACCCCCTTCAACCGGAGGCATGTATCCACCTGTAAGTGCAGCTGTTGCACCACCAGGTAAATACCCAACCAATACATACAAGCCTGGTGCTAACAATGGAACCCAGACACATGTTGGAAACCATGGTGCATATGGAACATATGATTCTAGTCCGTCAATCTATACAAATAACACTATGGTGGCAAGTGGAACTTCTGTCGAGAGTGATGATATCAGTGGATCCCAATTCAAAGAAACCAATGTCTATATTGCCGGGCAGCAGAGCGAAGGCTCCGGTGTCTGGATTCCTGCCCCAGGACGTGATATTTCTGGTCTCCAGCCTAGCAACTATTACGGACTGCCTCTGCAGGGACAGCACCTGGCGTTTGCCCCTGCTCAAGCTGGTCATGGTACTTTTGGAGGGATATATCACCCGGCACAGACAATGGCTGGAGCCGCTGTTCATCCACTACTACAGCCACCTCAGGCCATTGCTGGGGTTGGTGGTGAAATGGTTGGACCACCTGCCAATGGTTATCAGCAGCCACAACGGGCTCAGATGAACTGGCCTAATTATTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDLSYVIFPGDCVEVNSIYGLFEVSLLCLTACILLTFPPFFMLGTFYGRCLILPNLLIKYSLISGTFHESAKESADARWRPGMQGRGGKGGWGNSSRQLSNSSDITGRNAPAEKEIGVNPNMDKCNSSVPVNPNTDTKTSTSISSLSVGQSNGSSEPVASMEKSSLAIGQLQISDSKGISDLEGTSRSSGLSSTVVPSGSRPSSSCSSRAQQLSSVQKVVPNKEWKPKSTNKPAHAENVICDKVPVSVETVPQSILVSDSIHKEDTTSGVETRPSDMRLSDKQHVIIPDHLQVAESEKYGLSFGSFGACFEQSASFSKDTESEKCSTPQCESSQEADEVLDEPAASHQGVSSTVEMAAESDLQQLPAETADNILPQKVDSSSSIPEVAESDQSNDTIASHVPQDSVETTTPYPPQQSHGDQIPSLETSESQARLVQQVNDSSAGYYTQFYRPPADFDGRISPFTASGAAIKYGNLSVMPTQTGHAQEGINSFVLPSVGSTPLATPTPGAVPNSVGIPQQPLQLFRQHLGVLPQYPPNYFPYSQYPLYVPPQPLHFMVPQPPSTGGMYPPVSAAVAPPGKYPTNTYKPGANNGTQTHVGNHGAYGTYDSSPSIYTNNTMVASGTSVESDDISGSQFKETNVYIAGQQSEGSGVWIPAPGRDISGLQPSNYYGLPLQGQHLAFAPAQAGHGTFGGIYHPAQTMAGAAVHPLLQPPQAIAGVGGEMVGPPANGYQQPQRAQMNWPNY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..207#1101..1203#1579..1702#3333..3448#3753..3857#5277..5658#6543..6807#7307..7465#10245..10721#11168..11464#ATGGATCTTTCTTATGTCATATTCCCTGGAGATTGTGTTGAGGTAAACAGCATTTATGGACTGTTTGAGGTATCCCTTTTGTGCTTAACTGCATGCATTTTGCTAACGTTTCCCCCCTTTTTTATGTTAGGCACATTCTATGGAAGATGCTTGATTTTACCAAACCTTTTAATCAAATATTCACTTATTTCAGGTACATTCCATGAGGTCAGAAGAAAGAGAGACAAGAAAAAGGAGGCAAGTATCATATCCTCCCCTCTCCCTTGCTTCTGTTGCTTTTTCTTTATCTTTATTTCATAAAGTTAAGTACTGGTGCAAATTATGTGTGAATTCAAAAATTAGATTTCATGTGAGAACATGTGGCCTGGTCCCAGTTAAATCAATGGCACATGAATGATGTTTTCCAACTTTGTGATCTTTGCAATGTACCCAAGCACTTACTTTTTTTTTTTTTTTCAAAATTAGACCTGCTATAGATATGTAAGTTCCAAATGGGTGGTCAGACTTGTGTTAGGTATATCTGGTCAGACACATTAGGTTGAGTCATATGCAAATGTAATTGATGTGCAAAGCTATGAGATGGAAACACCGTTAGAAGATGTTCAAGTGATATGACATGCTGGTGATGATAAAAGTTAGTTTGAGATCAGTATCAAATCGGCCAGCAGGACATGATTTGCAGGATACATACATCATATATTGAACATGTCAGAAAAAAACGAATACATATATGCTAATGATTGGCAACATGATATTTGTTAGACTACAAATTTGACACAACTAATTCTACCTAAGCTTTGGATATGGTTGAAAGAGTCTCCATAGCAATGTTGTTCAACGCAAATTTTTCTTATCATGTTGAATCTTTCTGTTCTTGTTCTCCTGATATGCATTCTGATTCTGACTTTCTTTTATTCTTGAGAAAGGAATCCTAAAATCTCGTCCCCTCTTTAAATACATTATTAATCAGTTATATTGGTTCATTGCCAATTCTAATTGCCACAATTATAGAATGCCATATAATCAATTGGGACATTTTTGTTTAAGTAACTTTCTGTTCTAAAGTGCCTGAATGTGTATTTTCCTGCTTTCTTGTATAGAGTGCCAAAGAATCTGCCGATGCTCGATGGAGGCCTGGGATGCAGGGGCGAGGTGGAAAAGGTGGATGGGGAAACTCTTCACGCCAGCTATCCAACTCCTCTGGTATGCATGGCATCTGTCTTCAAAAATGGAAGTGCTCTATCAAACCTATACTACATGTGGCATCCGTGTTGTGATACACTATGAGCAGCTCATGTTGCATTCTTGTAATCTTGTTTAATTTAAAGAGTGGTTTCTCTTTGATATCTGATGGATTTTGTAATATGTAGAACTGCCTGCTCATTATATGAATGTTACTGCCATTTGATTTTCTCCAACTTCTCAAATGCATGAGTAGATATAAGAGCTTAGTATATTGAATCAACGGGGGTTAAGTATCCTCTTGACATTTATAGCCACATGTTTTGTACCCACTTCAAGAGTAGCCTTTTAGTGAAACTTTATAACCATTTCATGTTTTATTCTGTGATACTTCAGACATAACTGGGAGAAATGCTCCTGCTGAAAAGGAAATTGGAGTGAATCCAAACATGGACAAATGTAACAGCTCTGTACCTGTCAATCCAAACACAGACACCAAGACGTCTACTTCGATCTCAAGGTATTTATAGTGCAAAAGATCTTCAGTCACATGATTATTGTTTTTACTAAATCCTGTTAACCTTGAGTCCCCTTTTTTTTTGGTATTTACATGCTGGTAAGGTATTTTTTTATTACTCATATTGGAAAGGATGTTAATTGGCCGGAGTTATTTGTTAATTGATTTTTATTCTTATTTGGATGTGGATTGTAGATGTTTTTCTTGACAAGATCATGTTTCTGCTTTACACTCCCATTTTTGGCTGGGTTCTTTGAGTGAAACCCATACCAAACTGTACTGCTAGTAGTATCTTTGTTGTGTATGTTCAGAAGCACTGTTTGTAGGTTACTTTCATGTGCTTTCTTGAAACATACATGTATTTTCTGGATTCCAACGAAAAAGTAGAACATATGTGTGTATCTGTTTATTCTTAAAACAGTGTGCCATGTGTAGTGTAGATTTATGTTATTCAGCTGCAGCAGAACATCAGTACGATGCTGTTCTTTTTTTCTTTTGGGAGGAATGATTAAGGAGCTGTAGTTTTGTGTCCTAGTATATGATTATGTTAGAAAATTGTAAAATTCTAAGAGGAATAGACCACCTAAATTTATGAATTGCTAGTTTTCTACATTGTATTCCAGTGGAGAGTATTTAGAGCAGGTACAATAGCAGGCTATAAGCCAGCTATAAACATATTTTAAAGAGATAAAGGAAAAGAGAGAAGAGTAGCAGGCTACAGATCTGCAGCCAGCTGCAGCACGGACTCCAAGGCATAATGTGTGTATGACAGGTGGGACCAGCTATTAATAGTATAGTAAGCAACTATTGTATGAAATAGCTATTACATTGGCTATAGATGATTTGGAGCTAGTAGTGGGCTATACTATTAAACTTGCTCTTATATTTCTTTTATTCTGATCTGGAGCATAGTGCAAAAAACCGGACCGGTGAGTAACCCGGACGATGCCTCGGTTCACCGGTCCGACGGTCTGACCGGTGAACCGCCGGTTGAACCGCGGTTCAATAAGTTATTATATATAACATGTATATCTCTAAAACAAAACGAAGCAAAGGTGGGATGGTTAGACCTACTCACTCTCAATGCGCATACCCAGGTTCGAATCCCCATTCCACCACCCTTTTCTATGCATTTTGTCAAAAAAACAGTCACGTGGGCCTGTAGGGCATGGACTGGGCCTTAACGTGGCCCATTAAACTCCTTAACTCCTTTGTCCGGTCCAACTGAGCCGGTTTAATGGCCGGTTTAGTCAAAACCCGCCCGGTTCAGCCGGTTCAATCCGGGTCGAATGCATGTCTGGTCTTTCAGTTGAACCGAACCGTGGAGGCCTCTGGTTCCGGTTTTTTCCGGTCGAACCGCCGGCCCGGTCCGGTTTTTTCCACTATGATCTGGAGTTTAACCAGAATTTGTGGCTTGATGTAAATATTTTTTTTTTTTACCGATGCTGTTTGACTGCATAGCCATTCTTCATTTACAACTTAGTTTCTTTGATTTACATTGTTTGATGGTTTCTTGGATCATTTGGTATTTGGAGTTTGCCAAATGGATAAAACATTGAGGTCCACTTATTTCAGTATTAGCTTATCCAATTAAAATGCACCTGTTTGGACATGCAACTGACTTCTTTACCAGTTTGTCAGTTGGCCAATCCAATGGTTCATCAGAGCCTGTTGCTTCCATGGAGAAAAGTTCTCTTGCTATAGGTCAGTTGCAGATTTCAGATTCAAAAGGAATATCTGATTTGGAAGGTAATCCAGAAAAGCTTGTCAATGGCTTAGGTCCAGATGTAAGACTATCTTTAATACAGTCAGCACCATCTATATCAGGGGAGTGCATACCAGCTTTGGACCCAGTGCTTACACCAGCCCCTGAAGTCCACGGCCACGGTGAGACTGTTTCCACCAAACATGCTTATGCAAGTCAGTTGGCAGCAGGAGAAAAGGTGGTTTCTAATGATGTATCAACGGCTTCACAAGGTACAATATTTGAGTTGGGAGTCTTGGGACTCTTTGGTTAGTGTTGTCATGTTTTTAACACCTTTTCATACTCTAGGCACATCTCGATCTTCTGGTTTGTCATCCACTGTGGTACCTTCTGGTAGTAGGCCATCTTCAAGCTGCAGTAGTCGTGCACAGCAGTTGAGCAGTGTACAGAAAGGTACTTGTCATTCTGAACTTCTAAATTTGGGTCCAATCCTTTGCACGTCACTGAAGCAAATGATATGTTGATGTCACTGTGTAGATTTTTATGATTGTTACCTTGCAATTGATGTTTGACCTTCCAAATGCGACACTAGGGCAAATGCATTATATCTGCTGCTGCTATTGAGCAGATAGCGGCTGCTACATGGCATTTAATATGTTAATATTCTGTGTTAGATTATTAATTGGATGTTTGGACATGTCATCAGGTTTTCACAATCATCAGTTCTAATGATTATAAAGTATAAAAGTTACCTTAGTAGACATTCAAAGCCTTCAAAACACGCATGGGGATTAGAGATGGCAATGGGAACCCATGACCCGACACCCGACGGGTTTTTACTCTATTATATGGGTATGGGTACCCGTTACCCGCACGGGTGTGGGCATGGGGACGATTTTGTACCCTCGACGGGTGTGGGTATTTAAGTGGGAATATTTAGCCATCATGGGTGTGGGTATGGGGCAAGGGAACCCGATGGGTATGCACCTGTTGCCATCTCTAATGGGGATGTACATAATTCAACCTGTTTGAATGCCATCATGCAGCAGGGAATACATGTGGCTGGCACATACTTACATCCATAATTCAAGCTGTTATGATCTGGCTCGCTCTATATTTAAGAGTAAATTGCATCGCCGGTACACGAACTAGAATCACAACTCTGTTGTCCATTGAGGATGCTTCCATGGTCATAGTTATTACAACATCTGTACTGGAAAAGAATAAAAGATTTGGTTCAGTATGGTACCTTGGTAGGATGTTTTTTTCTTTTGCTGATATTCCAGGGAGAATAAAATAGTTCATTCACATTGGTTCTAGGGAACTAAGGATTTGAATATTTGAATCCTGGTTCCTGTCTCGCACCCTTGCCAGATGACGATGAAAAACCAATTTTGCTGGCCCTTTTGTTGTACTAACTTATACATGAAATTGGCAACCTTCAACAGTGACGCTTAAACATTACTGGCTGT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