Difference between revisions of "BGIOSGA030915"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA030915

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030915, complete gene.

LocusTag

OSJNBA0054F02.17-1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030915-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030915-PA

Length

11063

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:16048500..16059562

Sequence Coding Region

16048500..16048554,16049517..16049690,16050536..16050717,16051153..16051258,16051549..16051625
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,16059512..16059562

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:16048500..16059562 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:16048500..16059562 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGCTGAAGCCCGGGATGTCGGCCCTCGTCACGGGCGGCGGCTCCGGCATCGGGAAAGCACTTTGCATTGCTCTTGCACAGAAGGGTCTATTTGTGACAGTTGTTGATTTCTCTGAAGAAAATGGAAGAGAAGCCGCTTCATTAGTTCAAAATGAAAATAAAAAGTTTCACGGAGATCTTAAAGTTCCAAGTGTTATGTTTATTAAATGTGATGTTACTAATGCAGGTGATCTTTCTGCTGCCTTTGGAAAACATGTGGACACATATGGTGGACTAGATATTTGCATCAATTGTGCTGGAATTGCCATCAAGACACTAGTTTATGATGATAGATCTGATGGAACTAGCACATGGAGGCATGCTGTAAATGTGAACCTTGTTGCTGTTATTGATGGTACTCGCATTGCAAGTCAAATTATGCGATCTGGGAAGAAGCCTGGTGTCATAATAAATATTGGTTCAGCCGCAGGCCTTTATCCTATGAACTTTGATCCCATATATAGTGGAACAAAAGCTGGCGTTGTTATGTTTACAAGATCACTTGCTCCATTGAAACGCCATGGTATACGTGTCAATGTACTCTGCCCTGAGTTTGTTCAAACTAATATGGCAGAGCAACTAAGTCGTCGAATAATAGATGTAACTGGTGGATATATAAAGATGGAAGACATTGTTAATGGTACATTTGAACTTATAAAAGATGAAAGCAAGGCTGGTGCTTGCCTTTGGATAACTAAACGAAGAGGGATGGAGTACTGGCCAACACCAGAGGAACAAAGAAAGTATATGCTCAATCTTCCCAAGTCAAAAAGGATGTTAACACAAAATACCTTTTCGACTGTCCAAACTCCTGAGTTCTATGAGAAGATAGTTGTTCACACACTTAGCCATAATTTTCGCGATGCTACAAGACTTGAACGTGTGCGCTTGAGATTGCCGGTTGAACCACACAATGCTCTGGTCAAAATAATATACGCTGGTGTAAATGCTAGTGATGTTAACTTCAGTGCTGGGCGTTATTTCAGTGGTGGTGCTAAAGAAACTGCTGCACGCCTTCCGTTGGATGCCGGTTTTGAGGCTGTGGGCATCGTTGCATCTGTTGGAGATTCAGTGAACCATATTAAAGTTGGCAGTCCTGTAGCCCTTATGACTTTTGGGGCCTATTCTGAATTTACTCAGGTTCCAGCCAAGCATCTTCTTCCGGTGCCAAGACCAGATCCAGAGGTCGTTGCTATGCTAACATCAGGATTGACTGCTTCAATTGCCCTTGAGAAGGCAGGCCAAATGGCATCAGGGCAAGTTGTTCTAGTTACAGCTGCTGCTGGTGGAACAGGACAATTTGCTGTGCAGCTCGCAAAACTAGCAGGCAACAAGGTTGTTGCCACATGTGGTGGCAAATGTAAAGCTGCACTTCTGTCTTCCTTAGGAGTTGATAGAGTTATCAACTACCAAAATGAAAAGATCAAAGATGTTCTGAAAAAAGAGTTTCCAAGAGGAGCAGATATCATATATGAATCGGTTGGTGGGGAAATGTTTGACTTATGCTTGAATGCACTTGCAGTCCATGGACGCCTTATTGTAATTGGTATGATCTCCCAGTATCAAGGAGAGCATGGATGGAAGCCACGGAACTACACTGGACTATGTGATAAGATTCTTGCTAAAAGTCAAACTGTGGCTGGTTTTTTCCTAATCCAGTATGCTCACTTGTGGCAAGATCATCTTGACAAACTTTTTGACCTGTATGCCTCCGGAAAGCTAAAGGTTTCCCTTGACCCGAAGAAATTCGTGGGTGTAGCTTCTGCGCCTGATGCGGTAGAATATCTTCATTCTGGCAAGAGTGTTGGCAAGGTTGTTGTGTGCATTGATCCGTCATACAGTCAGACCCTTGCTAAGCTATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MELKPGMSALVTGGGSGIGKALCIALAQKGLFVTVVDFSEENGREAASLVQNENKKFHGDLKVPSVMFIKCDVTNAGDLSAAFGKHVDTYGGLDICINCAGIAIKTLVYDDRSDGTSTWRHAVNVNLVAVIDGTRIASQIMRSGKKPGVIINIGSAAGLYPMNFDPIYSGTKAGVVMFTRSLAPLKRHGIRVNVLCPEFVQTNMAEQLSRRIIDVTGGYIKMEDIVNGTFELIKDESKAGACLWITKRRGMEYWPTPEEQRKYMLNLPKSKRMLTQNTFSTVQTPEFYEKIVVHTLSHNFRDATRLERVRLRLPVEPHNALVKIIYAGVNASDVNFSAGRYFSGGAKETAARLPLDAGFEAVGIVASVGDSVNHIKVGSPVALMTFGAYSEFTQVPAKHLLPVPRPDPEVVAMLTSGLTASIALEKAGQMASGQVVLVTAAAGGTGQFAVQLAKLAGNKVVATCGGKCKAALLSSLGVDRVINYQNEKIKDVLKKEFPRGADIIYESVGGEMFDLCLNALAVHGRLIVIGMISQYQGEHGWKPRNYTGLCDKILAKSQTVAGFFLIQYAHLWQDHLDKLFDLYASGKLKVSLDPKKFVGVASAPDAVEYLHSGKSVGKVVVCIDPSYSQTLAKL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..55#1018..1191#2037..2218#2654..2759#3050..3126#3827..3914#4662..4851#5692..5818#5923..6003#6154..6255#6381..6476#6618..6692#7085..7204#7658..7786#8101..8178#8669..8755#10840..10926#11013..11063#ATGGAGCTGAAGCCCGGGATGTCGGCCCTCGTCACGGGCGGCGGCTCCGGCATCGGTGAGGATCGATCGCCTCTTCCCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTGCGCGTCCACGGTTCACGAAAGCCCCTGGTCCTGGGGTCTGGACGCGCCTTGCTGTTTGTACGTATTGCTGTTGGATGGGATTGGGTGATGCTTAGTTTGTCCATGGCTCGCGCGCTGGTCGGTCTGATTTTGTGCCCCAATCATCAGTTCATGATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGCGTGTGTTTTCTAAATTCTAATGGTGCGAGAAATGGGGGAGGAGCGGCTAGTTATGCGGGGTGGTACTTGGGATCGGAGGTGAACAGGTGATGATGGTCCATTGATCCCTGTGATGGGTGCCTTTCTGGAAAGCGCTGTATGATGGTTGTAGCATTATTAGCAAACGGAGGAGGTTGAGGGCTTGTACTTGTAATGCTTATGGTTCAATGGTTGTGTTAGGCAGGGTGAAAGTGAACTTTGAGCGACACACCGACGCAATAACTTGTTGTGTATGATTGTTATGCCCCGTACATAATACTACGGAGGAATTAGTCTAGTAGCTAGCAGAGTACCTCACATTTCCCCTTTCTCTTTTCGTTGTCCCTGAAACTGAAAGGATAGCGGGCACCCGGTATGCTCCTGCTGGCAACTGTCAGCATGTCACTTGTATTGTTGTACTCTGATTTGGTACCTTGTATATGCTGTCATTTGTATGATGAATATAAATGAATCCCTGCTGTTTGTTCAGTATCAGTGTCAAATTTGAGCAAATAAATGTGTTGGGGAAATGCAACAACTAGTATTTAAGTCCGCACTCATGAAGTTTGCTACTAGGATATATTTGCTGACAACAAGTATCTTCTCACATTCATGATTTAATTGGTTTTCTGCAGAGTAGATGAACACTTCCAGCATATTCTTATAATGCATTGACTGAATATTCTTTTAAAATTTTCCAGGGAAAGCACTTTGCATTGCTCTTGCACAGAAGGGTCTATTTGTGACAGTTGTTGATTTCTCTGAAGAAAATGGAAGAGAAGCCGCTTCATTAGTTCAAAATGAAAATAAAAAGTTTCACGGAGATCTTAAAGTTCCAAGTGTTATGTTTATTAAATGTGATGTTACTAATGCAGGTAAGAGTCTTGATAAGGACAATTAATTTGTTTGTGTACCTCGTTTTCGAGACCACACTTGTAGCTGTTTTCCTGGTGCTAAATGCTTTGATAACAATCAACACACATGTCAGAACTAAAGTAATTTAAAAACTTGGCAGATATCAAAAGACTGGCGAAGTGTGATAATTCTTTAGAAGCCAATTGTAACATAGTGTTTTTTACATAACATATAATTCTTTGACTTCTAAGTACTACTACGTACTAGCTAAAATCTGTTCTGAAACGCTAATTTAAAAGGCATCCCTGCAGTGTTTCAGAAGTATGATAACTATGATTTAACACCTAATGATTAACATGGTATTGCTTCCTTTTGGTTTTAAAAAGTACTCCCTCCATCGCATAATATAAGGCGCCCACGCATTTCAAGATTCCACCTTCAAAACATTTTGACCAATATTTAGTATAACATGAATTGAATTTTACTTGCTAAAAATTATATCATTGGATTGACATTTGAATTTACTTTCATATGGTTATAGTTTTGTTACTACAAACCTTATAATATATGAGAAATTATAAAACAAAGATTAGTTTTGGAGACCGTGTCAAGTTTGACAATGCCTTATATTATGGGATAGAGGGAGTAACATATTTCTATTAGCTATGCCTTATTTGTACCATTTTTCTGTGTGAGAGAGCACCAAATCCTTTGTCTCGTTGGACTGGAACTCAGGATTTCTTGTTGTAATTGTATTGTTTTGATTTATTTTATCATTGGATTTCCAATTGCATGTAGTATAGTTTCAACTGTTAACTTAAATCACAATCATGAAAAAAATGTGCATTTATTTTATCATATGTAGGTGATCTTTCTGCTGCCTTTGGAAAACATGTGGACACATATGGTGGACTAGATATTTGCATCAATTGTGCTGGAATTGCCATCAAGACACTAGTTTATGATGATAGATCTGATGGAACTAGCACATGGAGGCATGCTGTAAATGTGAACCTTGTTGCTGTTATTGATGGTACTCGCATTGCAGTAAGTCTATCAGGAACTGGTTGAATATAATTCACTTAAACAGTTACTGCTAGACCAAGTGATTGATGCCTGTCTACTATGTTTGGATGTATTAACATATGATTAGGAATGGCACATATGGTTTTTGTATCTGTTGATCCATTTGTGGAATACAGAAGGGGGTTATTGTTTTTTCTTTCTTTATTTATTTTCATCTATTATTATCAGAGGAAGTTAAGTGGTAATAGACTTTCACAATGTAACCTGTCCATAGAGTTTCTTTGAGAGAATGAACTAGAGTAGCATTTTGGATCAATGACAATTGACAAATCATGCCAATTATTGATATTTGGATTCTTCGTTGTGCATTTCTTCTCAACAACTAATATGTTTAGGATGCTATTTTTTTTAGTTCATGCAAGCACCATATATACTTACAGTTATTTTTTTCACCAGAGTCAAATTATGCGATCTGGGAAGAAGCCTGGTGTCATAATAAATATTGGTTCAGCCGCAGGCCTTTATCCTATGAACTTTGATCCCATATATAGTGGAACAAAAGGTGCATATACAATCACATATATAATTCTTATTTTTTGGGCAGAAGATTGCTGTTGCAATGAAAGTCCAACTTGGATTATAATTTGATCATTTATTTGTGAAAAATAATATGCATGCTAACTGTTTATCTAGATGGTTCAAGATACTTTGCAATTACAACTTGTACATGATCCACATGTTGATAAAGATATATGGCCAACTGTATTTTCCAATATTAACTCCACATTCATTTTATATTGTCAAATATGTTTTTCACGCTATGCCACTGTGATCGCAAATATTGTATTTCAGCTGGCGTTGTTATGTTTACAAGATCACTTGCTCCATTGAAACGCCATGGTATACGTGTCAATGTACTCTGCCCTGAGGTATGAATATATTACATAACTAGAGGCAAATATGAAATATTTATTTATTTTTGTCATTTCTGACTCATAGTATTCCAGCATATGTATTCTGTCCAAAACTTGTGAATTTGCTGATATGTTTGGTAGTATATCAGAATATTAACTTGATGATGGTACAACAGACAGCACACCCAGCTGTGCTCTCTGTTACATAAGTTCTTATTACATAGAAATATTACTAGAATGATCACATAAAGCTTTCCATAGGGCCTCCTCTACTATTTCTTAGAAAAAGAAAGACGAAAAGTGATTGGTCACTACTTGGATTCTCAAGGACCAGGAGCAGATATCCTTATGACCATCCGTGCACCCATTAAAATTGCAAGCCTTATATAACTCTCATTTTTAGTTGTGGTAGAGTTGTATGAACATGTAGTATTGTAGTTGAGCTCACAGGTAAAATTAACTAAGTGGGCAAAAGTTGATGATAATTGCATATGAGAAAAACCGTGGATATCTGGAAAGAGTTGATATCTGCAACTTGATAATTTCCAGATTGCAGAATCTCCAAGTCATAAATTCACATGGCTTCAAATTTATCCTAAACAAACTGTTCTATGATTCTATCATTGTCTCATTATCAAACGCTGGATGCTGTGAAGGCAATGATGCTCCATGATCATTATCAAACATGATCTATTTTATGGTTTGTTATGTGCAGTTTGTTCAAACTAATATGGCAGAGCAACTAAGTCGTCGAATAATAGATGTAACTGGTGGATATATAAAGATGGAAGACATTGTTAATGGTATGTTTCTCTTACCTTTTTGAGCAGTAGGTACGTCTGTATGTGTGTTCTCCACTTTTAACCTTGTGACCATAATTTGTGTGTCACAGTTTATACAGGCATGTTCAACATTCTGATGAATAATTCTATTGCTTTTGTTGAGATGGAATGCTTTACTTGTTGAATCAAATGTAGACATCTGCGCACATTTAGCTATGTAAAAGATATGTGATTCCATTATTTTGATTTGAGCAAAGACATAAAGTTTGAGGTCTATAAACTTCCATGAGTATTTAACTTTAGTCTCGGAGCTTGAGAGCTATTCAACTAGGTCCTTCAACTTATAAAATCAAGTGATATCATCACTACTTTGTTCGCATACCCATTGATAACCATATGAGCAACTGAATGTATAAATTTCCGCAATGAAAGGAGATCACAAATATGCGATAGACTTTACTGGCATGCAAATATCTAAAACCTGATATCCTGGTCTGTAAAATGGACATAGCTTTTCTTGGGATGGATCCATGTGCCTATGCCAAATGTCCCTGTCAGGTTGGTATTGTGTTTGACGGGACTCGACTAGTTGACCTCCTTATACCACTGAATGTGTTTAGGGACCTAAGTTCTCAATCCTAGGGGGTCAGGTAATACACCTATGCAATTTTAGTTATCTACTGTGGTATTTTAACCCCTATTGATGCATACCTCTTGTTTACCCTCTCTTTTGGTTTGCTGAAAAGAACCCATTTTTATTTGGATTAGGTACATTTGAACTTATAAAAGATGAAAGCAAGGCTGGTGCTTGCCTTTGGATAACTAAACGAAGAGGGATGGAGTACTGGCCAACACCAGAGGAACAAAGAAAGTATATGCTCAATCTTCCCAAGTCA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA030915