Difference between revisions of "Os10g0563200"

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Revision as of 21:13, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os10g0563200

Description

Armadillo-like helical domain containing protein

Version

NM_001071931.1 GI:115483457 GeneID:4349398

Length

7629 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0563200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:22682905..22690533

Sequence Coding Region

22683412..22683588,22683913..22683997,22684185..22684406,22685495..22685670,22686738..22686801
,22688040..22688134,22688513..22688600,22688710..22688837,22689496..22689627
,22689729..22689809,22689896..22690054,22690152..22690532

Expression

GEO Profiles:Os10g0563200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>cctgataaggttgtgaaggagaatgaggtgttcaatgaatgtaactggaagggcaaagacaatgcacttggtgatatgatgagctggctcgagtggatcctgtcgcagacacttctacggatagcggagtccaacccgcaaggaatggatgacttctggctgcagcagggcgcagatatgctgctgagtttggtgaagagctctcaggaggatgtacaggagcgtgcagctaccacacttgctacgtttgtggttattgatgacgagagcgcgaatgtggatgctgcaagatcagaggcagtgatgcgtgttgggggcattccaatgctactggaccttgcaaggtgttcaagggagagtgcacagtcagaagcagcaaaggctattgccaacttatcggtgaatgccaaggttgcaaaggcagttgcagacgagggaggtatcacaatactaaccaatttggccaggtcaatgaatcggcttgttgctgaagaagctgctggtggcctttggaatctctccgtgggtgaggagcacaaggcagccattgcagcagctggtggtataaaggctttggtcgatctcatactccgctggcctgctgggactgatggagttcttgaacgtgctgctggggcacttgcaaacctagctgctgatgacaagtgtagcatggaagttgcaaaggctggtggtgtccatgctttggtcatgcttgctcgatcatgtaaacttgagggtgtcctagaacaggctgcaagggcattagctaacttagccgcacatggagataacaacaataataatgccgctgtgggtcaggaagcaggggctcttgaggcattagtgcagctaacaagctctcaaaatgagggtgtaagacaagaagctgctggtgctctgtggaatctgtcatttgatgatagaaaccgtgaaggcattgctgctgcgggtggcgttgaagctttggtttcacttgcacaagaatgtttgaatgcttcggaaggccttcaggagagagctgctggcgcattatggggactatctgtttcagaagctaacagtatggcaattggacaggagggtggtgtcgcacctttgctcacactggcacaatcagatgttgaagatgttcacgagacagctgcaggggcactatggaatcttgctttctattctggtaatgctctctgtattgttgaagaaggtggggttcctattctagtgcggctttgctcatcatcagggtcaaaaatggcacgtttcatgtctgcgctagcccttgcttatatgttcgatggaagaatggatgaggttgcattggttgggacgtcatcagagggcagttccaagagtgttaatgttgagggagctaggagaatggctttgaagcatatacagacttttgttctgacattttcggacccacaagttttcactacggcttccacctcctcagcctcagcagcactatctcagattgctgatgcagtgtttatacaagaagctggacacctgagatgcagtggtgccgagatcgctagatttgttgccatgctccggaatcctgcatcaattcttcgcgcttgtgctgcctttgcccttcttcagttcacaatccctggaggtcggcacgcagtgcaccatgcgggtctcctgcagaaagcaggggcagctcgagtcttgcgcgcagcagcagcagccacgaccgcttctatcgaagccaaagtctttgcaagaattgtcctcagaaatttggaacaccatcagacagggacttcaacatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>PDKVVKENEVFNECNWKGKDNALGDMMSWLEWILSQTLLRIAES NPQGMDDFWLQQGADMLLSLVKSSQEDVQERAATTLATFVVIDDESANVDAARSEAVM RVGGIPMLLDLARCSRESAQSEAAKAIANLSVNAKVAKAVADEGGITILTNLARSMNR LVAEEAAGGLWNLSVGEEHKAAIAAAGGIKALVDLILRWPAGTDGVLERAAGALANLA ADDKCSMEVAKAGGVHALVMLARSCKLEGVLEQAARALANLAAHGDNNNNNAAVGQEA GALEALVQLTSSQNEGVRQEAAGALWNLSFDDRNREGIAAAGGVEALVSLAQECLNAS EGLQERAAGALWGLSVSEANSMAIGQEGGVAPLLTLAQSDVEDVHETAAGALWNLAFY SGNALCIVEEGGVPILVRLCSSSGSKMARFMSALALAYMFDGRMDEVALVGTSSEGSS KSVNVEGARRMALKHIQTFVLTFSDPQVFTTASTSSASAALSQIADAVFIQEAGHLRC SGAEIARFVAMLRNPASILRACAAFALLQFTIPGGRHAVHHAGLLQKAGAARVLRAAA AATTASIEAKVFARIVLRNLEHHQTGTST</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6946..7122#6537..6621#6128..6349#4864..5039#3733..3796#2400..2494#1934..2021#1697..1824#907..1038#725..805#480..638#2..382#tcctgataaggttgtgaaggagaatgaggtgttcaatgaatgtaactggaagggcaaagacaatgcacttggtgatatgatgagctggctcgagtggatcctgtcgcagacacttctacggatagcggagtccaacccgcaaggaatggatgacttctggctgcagcagggcgcagatatgctgctgagtttggtgaagagctctcaggaggatgtacaggagcgtgcagctaccacacttgctacgtttgtggttattgatgacgagagcgcgaatgtggatgctgcaagatcagaggcagtgatgcgtgttgggggcattccaatgctactggaccttgcaaggtgttcaagggagagtgcacagtcagaagcagcaaaggtaatgatgtccattttagctgaatccctggatctaattgccgatatctactatgtttggtattaccattttcttacagttgttaatgtgacttcaggctattgccaacttatcggtgaatgccaaggttgcaaaggcagttgcagacgagggaggtatcacaatactaaccaatttggccaggtcaatgaatcggcttgttgctgaagaagctgctggtggcctttggaatctctccgtgggtgaggagcacaaggttgtcactccttggatgctgaatactctgattgcaatgtctgatgtgttgctggtactaacaatatattgattattctttttcaggcagccattgcagcagctggtggtataaaggctttggtcgatctcatactccgctggcctgctgggactgatggagttcttgtatgtatctttgatacttctcaattttcagtaatttcaatgctgcttgctatccttttctggataataaattttttataacggttgctctttttctttaggaacgtgctgctggggcacttgcaaacctagctgctgatgacaagtgtagcatggaagttgcaaaggctggtggtgtccatgctttggtcatgcttgctcgatcatgtaaacttgagggtgtcctagaacaggtgagcgggtacatcatgtcgtcatgcttgtacgcattcgttctagtcagctagttataccatagctttttttgctagctctgataatacaactaacggtacaagatctacaaaataggaagcacgataaagacaaaacgggatgacctgtgcacatgctatctttattttatgcttgcatattgaactttatcctgccaaatgaggatctcttggttcacgcctacttcattgattaagcactgggtgcaacttttcatgcatggacttggatgattttttatatttatcagatcgctcaatctcatggcatgagccacgtggattcccaatttcctataagaaaggaaagtctgtacctgccatacttatctcaaatgatttgtcgggatgctgactggactcttaccatgtacatgtaattccaagatacagtttattctcaacttgcacaatctatatctgctttaaaacaattggatttgtcgtggagccacttaaaattgctattttcttatagtagcagtttgctgcgttttaagctctacaaataaatgctccatctaacttgctacctagtgctttgtcttttacatgctcacaatcactgtatatgtactgcatttactttctaatactatcactgttgttcatgtaggctgcaagggcattagctaacttagccgcacatggagataacaacaataataatgccgctgtgggtcaggaagcaggggctcttgaggcattagtgcagctaacaagctctcaaaatgagggtgtaaggtatacttctagctgatgtgctgttttaagttgcaacgcctgattttgccattaaattatactttatattatcctaatttaatattgtgattcctgtgcatttaattagacaagaagctgctggtgctctgtggaatctgtcatttgatgatagaaaccgtgaaggcattgctgctgcgggtggcgttgaagctttggtacgtgccccatttgtgctttaacacagctttgcatcctttgatcaacattgtattaagcagtacatctagttcagtaaatagatgcaatccctctataaagtttttcatatagcagttctgaataaaaatattggtctgtagaaacctctagttatttgattaattctgattgaacatattctcttgaatatgtttattagtactgtgttataccgactatcaactaaataataataaatcttctatgtttacccgtggaactggttctaggacacaatgttttaaagatcatttgtgtgtgctcctcccatcttttcataaatagacttaaataagctgtttatatttttcacatagatggctttcatattttaggtttcacttgcacaagaatgtttgaatgcttcggaaggccttcaggagagagctgctggcgcattatggggactatctgtttcagaagctaacaggtaacttcatatgcttgctcatgaactgaacttgcaccaactaccagattgacctatttttaagatattctttgtgacatgcctagctgatgaagtgtacaagttgattgtccataaacacttaaacttagtaatgcacttttttttttggaattagtgaaagctagcttagtgtcaatcaagaaaagtgtattaataatttaaaaaaacacttactctcctaagtcaaatttgaatccgttcacagttcacttttagatgtcatgcacagcaattgttaaaaattgcacattgtggtatgcctagattggtcctgagtttctatatttcctaacattcatatcagatagcttcacacatgatgaaaatatgctgatatcaaagttagttacacacttacacttaggctgagttcaggaggtggagttgggaactccacctccccacatgtaaaacagtgttgcccattaatgcatgattaattaagtattagcctaaaaaacttgaaaaatggattaatatgattttttaaagcaactttcctatagaaaactttttgtgaaaaacacaccttttagcagtttgaaaagcgtgcgcgcgaaaaaagggggaggtgagttgggaaagaaggggaaagaacacagccttaatgacagctgtgcctgcgctaaattcaggaccacacttgaacacttcaatctcgcactcaacttcaaagctcttgatggcttgatggatatagatggtggatggtttgcactgcatgcttattttgaattgcattatcttagcacacgatccactttaaccattttttttgtagattgcctcctatttccatagacttttttggtgaccctggtgttagatggtagtagcagggtgtggtctgttttgggttaataatatagctactggaaaattagtgctgatgaattccagatcatatgtgcaagcgatggatgaaatttttgtctggagggtaagtgtaggcacagtgtgaggcgagtgtctgataactgcctgtaaatgaatgaggagcgccccttttaggtcgcaacttgtaatcaattctctctctctctctctctctctccctagttggccttttttacagacttgctgcaataaagagaactgcatctctcgtctttccgtaccagataatttcctccatctatcgcttgttattcctttctccaacattcttgttgacaacttttatttgcctttttcagtatggcaattggacaggagggtggtgtcgcacctttgctcacactggcacaatcagatgttgaagtaagtttcatttacaattgtatattctttatgtctgatacatcatatattgatgtgcgaatacattctgttacttagggactccaaatcactttttttctttatgatagaccttctgcctggcacctggaaatattagttgctccatgccgtagtctgtcatatcttgagatacgtttgactagtattgtccatgaacaaacagacgagtttgttgaagtagctacttgattataagtaatttcatggttagtgcgccaccttcagcttgtgcttttacctaatgttctggttttatgaagctaccactcgtcgtgttattctttttgtacatgcctttcaggagttcaatgtagtatatgtattaaacttttttagtcaactttatatccagtggcgatgattcatggggatatatttgtaccctgattttatttatttatttatttattttgggcacaagatcaagtatatgcttttactaacatatacgcacatgtatgcaacttatatgtccaagtgactaaaaacattcatttatcttatcagatttaaacatccttaatccatttcaacttaatttgttgcttcatgccattgttttctaaccatgcctaggaaaatcctggctgtgccactgtttatataatgttattccagtttatataatattattccaattgcttgagagaacatattctgatggggaaaacatcatttatttgagtattaatattgtcctgctgcctgctgcaggcatgcaatttatttgttctctaatggtttgatagtactttgatctcacgtcaatttattctgtttgtttgttagagtgcacagcccagcccattgtttgataaagagggtagtttttctctctctttttaatatggtaacgggtgtaagttttttttgaaaaaaaaataaaattatggataaaacaaggaacgttggcattgacagttactgtagattgttatatctatcgttgggaataaatgttttatctgtcattgggaatgaatgctattccttactctagatatgacgactttctgtttattcag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External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0563200, RefSeq:Os10g0563200