Difference between revisions of "BGIOSGA031240"
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Revision as of 17:27, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA031240 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J033116N09, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA031240, complete gene. |
| LocusTag |
OS09G0555200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA031240-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA031240-PA |
| Length |
13611 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:20829937..20843547 |
| Sequence Coding Region |
20829937..20830013,20830600..20830684,20830757..20830877,20830956..20831080,20831652..20831696 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:20829937..20843547 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:20829937..20843547 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTGGCGGCGTCCGGGAGGGGAGGGAGATTGAGATGGCGCCACGCCGGGCGACGATTTTGCTGGGGCCGATAGGGATGGAGGAGCCAAGTCTTGAGGTGAAAATGCCTGAAGCTGATCTGAAGGCCGTCAAATTCAGCCTCATGACCAGTTCAGACATGGAAAAGTTAAGTAGTGCGAGTATTATTGAAATGTGTGATGTGACTAATGCCAAGTTGGGATTACCAAATGGTGCACCACAGTGTGCAACCTGTGGATCGCAAAGCGTACGTGACTGTGATGGTCATTTCGGTGTTATTAAGCTGGCAGCAACCGTGCATAATCCATGTTTTATTGAGGAAGTTGTCCAGTTGCTGAATCAGATATGTCCAGGCTGTCTCACTCTGAAGCAAAATGGGGACACAAAGAAGACTGATGGGACAACAATTCAGACAACTTGCAAGTATTGCTCAAAGGATGGAGCAAAACTTTACCCTAGTGTAATCTTTAAGATGCTAACAAGTCCAAGAGTAACACTATCCAGGAGTAAACTTCACCGTAACACTAGTGTGATGGACAAAATTTCAATTATCGCAGAAGTTGCTGGTGGGGTGACACATAATTCCAAGAACAAAGCTCCCCATGAAACCCTTCCCCAAGATTTCTGGGATTTCGTACCTGATGATAACCAACCACCTCAATCCAATGTGGCTAAGAAAATATTGTCACCATACCAAGTCTTTCACATGCTAAAAAACCTTGACCCTGAACTTATCAATCAGTTATACTCAAGAAAGTCAGATGGTGAAGACCCTACATCTCCAGATACATATGGAACCAAATGGCTAAAAGACATCATTCTCAGCAAAAGATCCGACAATGCATTTAGGAGTATAATGGTTGGGGATCCAAAAATTAATTTAAATGAAATCGGTATTCCTACGGATTTAGCTTTGAACTTGGTTGTTTCTGAGCAAGTTAGTTTTTACAACTTTGAAACCATAAATTTAAAGTGCAACTTGCACCTTCTTACCAAGGAAGTACTGCTTGTCCGTCGAAATGGGAAGCTTATTTTTGTTCGGAAGGCAAACAAGCTGGAAATTGGTGATATTGCCTATAGACTATTGCAGGATGGTGATCTTGTTCTTGTTAATAGGCCACCTTCAGTTCATCAACATTCTCTCATTGCCCTATCTGCAAAGCTTCTGCCAATTCAATCTGCTGTGGCAATCAACCCTCTGTGCTGTGACCCTTTCAAAGGAGACTTTGATGGGGACTGTTTGCATGGATATGTACCCCAAACCCTGCAATCAAGAGTTGAGCTTGATGGGCTAGTTAGTTTAAGCGGCCAAATGTTAAATGCTCAAGATGGGCGAAGTTTGGTGTCATTAACACATGACTCCCTAGCTGCTGCACATCAGTTAACAAGTGCAGATGTTTTCTTGCAGAAAGCTGAATTTCAACAACTTCAATTGTTATGCTCTTCTATCTCACCGACACCAGAGCCATCAGTAGTTAAATCTGCAAACTTTCAAGGTTCTCTTTGGACTGGTAAGCAACTATTTGGTATGCTGCTACCTTCTGGTATGAATATCAGTTTTGATCAGAAGCTACACATCAAAGACAGTGAAGTGCTTACCTGCTCATCAGGGTCTTTTTGGCTACAGAACAACACATCTAGTGTTTTTTCTGTCATGTTCAAAGAGTATGGTAGTAAGGCTCTTGAGTTCCTTTCTTCCACCCAAGATGTACTATGTGAATTCTTAACCATGAAGGGTTTAAGTGTTTCCCTGTCAGATCTCTATCTATTCTCAGATCATTACTCAAGGAAAAAACTAAGTGAGGAAATTCATCTTGCATTGGATGAAGCGGAAGAAGCTTTTCAAATCAAGCAAATATTGCTAAATACAGTTTCGATACCAAATCTGAAGCATTATGATGGACCTGATAATCTATCAAACTCTCATGGACAATCTGATTTTACTCAGGTCAGTCTGCCCATCATTAAATCTTCAATCACAGGATTTAAGAGTGTCTTCAATGATCTGTTGAAGATGGTACTTCAACATGTGAGTAAAGATAATTCAATGATGGCAATGATTAACTCTGGGAGTAAAGGTAGTGTTCTGAAGTTTGTCCAGCAGACTGCATGTGTTGGTCTTCAACTTCCAGCGAGTACATTTCCCTTCAGAATTCCTTCGGAACTATCATGTGTTTCCTGGAATAGACAAAAATCTCTCAATTGTGAAATCACCAACAACACAAGTGAATGTATGGCAGGCCAAAACATGTATGCTGTGATCAGAAATTCTTTTCTTGATGGACTAAATCCGTTAGAATGTCTACTACATGCTATATCTGGCAGGGCAAATTTCTTTAGCGAAAATGCTGATGTTCCTGGGACATTGACGAGGAAACTAATGTATCACCTGAGAGATACATATGTTGCTTATGATGGGACTGTTAGAAGTTCTTATGGGCGGCAAATAGTTCAGTTTTCTTATGATACTGCTGATGGCATGAACAATGATCATGATCTTGAAGGTGAACCTGGTGCCCCTGTTGGCTCTTGGGCCGCTTGTTCCATTTCAGAAGCTGCATATGGAGCTTTGGATCACCCAGTTAATGCTTTAGAGGATTCCCCTCTTATGAACTTGCAGGAAGTTTTGAAGTGCCATAAGGGTACAAAATCTGCAGTTCATACTGGTTTGCTTTTCCTATCAAAGTATCTAAAGAAGTATAGATATGGTTTTGAGTATGCATCGCTAGAAGTTAAGGATCATCTAGAGCTAGTGGACTTCTCTGATTTGGTTGACACGGAAACAATGAAGATAAAAAGGTTACGACTGGGATTTATTGTAAGAGAGCTCATTGACCAATACAATGCCTTAAGAAAAAAGTTGAACAATACGATACCTTCAGTTTGTATTTCATACAGCAAATGTTCTGTAGGCAACGAGTGTGTCAAGAATAGGAGCTGTTGCATCACTATGGTAGCCCAGGTGGAATCCAACTCCACGTCTCAATTGGACATTATCAAGGAAAGAGTGATTCCGAGCATCCTGGCCACACTATTGAAAGGATTTTTGGAATTTGAGAATGTTAAGGTCGAATGTCAACAGGATAGTGAACTTGTTGTGAAAGTCGGTATGTCTGAGCATTGCAAGACAGGCAAGTTCTGGGCGACACTACAAAATGCTTGCATACCAATAATGGAGTTGATTGATTGGGAACGGAGCCGACCAGAGAGAGTATATGATATTTTCTGCTCATATGGCATAGACTCAGCATGGAAATACTTTGTTGAATCTTTAAGATCAACAACAGATGCTATTGGAAGGAATGTCCATCGACAGCACTTACTGGTTGTGGCAGACTGTCTGTCTATAAGTGGGCAGTTCCACGGGCTAAGCAGTCAAGGTTTAAAGCAACAAAGGGCTTGGTTATCAATCTCCTCGCCATTTTCGGAAGCATGCTTTTCTAGGCCTGCATATAGCTTTATAAATGCTGCAAAGCGAGATTCAGTGGACAATCTCTCTGGTGCTCTAGATGCAATTGCCTGGGGCAAAGAACCTTGTGCTGGGACATCAGGTCCTTTCAAGGTTCTATACTCCGGAAAGTCACAAAAGACAAAACAAAACAAGAATATCTATGACTTTCTACATAACCCCGAAGTTCAGGCTTTGGAAAAGAATTTTATGGATACCTACAAACAAAGGACTGAAAAACCTTCCAAGCAGAGATCAGCATTCAGTTCTAAAGGCAATGCTACCATCAACGGTGGTACCATATCTGTCAATCAGAAGTTTCTTGATTCTAAAGTTGGCATATGGGAGAACATCATTGACATGCGCACTTGCTTGCAAAATATGCTAAGAGAGTACACATTAAATGAAGTTGTCACGGAACAAGATAAATCATGCTTGATAGAGGCGTTGAAATTTCATCCTAGAGGATATGACAAGATTGGTGTGGGGATAAGAGAAATCAAGATTGGAGTGAATCCTGGTCACCCGAACTCAAGGTGCTTCATTGTACAAAGGAGTGACGATACTAGTGCAGATTTCTCTTACAACAAGTGTGTCCTTGGTGCTGCAAACTCTATCTCACCTGAACTTGGAAGTTATATTGAGAAGATACTATCTAATAGAGCAATTCGGCCACATCAGTTGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGGVREGREIEMAPRRATILLGPIGMEEPSLEVKMPEADLKAVKFSLMTSSDMEKLSSASIIEMCDVTNAKLGLPNGAPQCATCGSQSVRDCDGHFGVIKLAATVHNPCFIEEVVQLLNQICPGCLTLKQNGDTKKTDGTTIQTTCKYCSKDGAKLYPSVIFKMLTSPRVTLSRSKLHRNTSVMDKISIIAEVAGGVTHNSKNKAPHETLPQDFWDFVPDDNQPPQSNVAKKILSPYQVFHMLKNLDPELINQLYSRKSDGEDPTSPDTYGTKWLKDIILSKRSDNAFRSIMVGDPKINLNEIGIPTDLALNLVVSEQVSFYNFETINLKCNLHLLTKEVLLVRRNGKLIFVRKANKLEIGDIAYRLLQDGDLVLVNRPPSVHQHSLIALSAKLLPIQSAVAINPLCCDPFKGDFDGDCLHGYVPQTLQSRVELDGLVSLSGQMLNAQDGRSLVSLTHDSLAAAHQLTSADVFLQKAEFQQLQLLCSSISPTPEPSVVKSANFQGSLWTGKQLFGMLLPSGMNISFDQKLHIKDSEVLTCSSGSFWLQNNTSSVFSVMFKEYGSKALEFLSSTQDVLCEFLTMKGLSVSLSDLYLFSDHYSRKKLSEEIHLALDEAEEAFQIKQILLNTVSIPNLKHYDGPDNLSNSHGQSDFTQVSLPIIKSSITGFKSVFNDLLKMVLQHVSKDNSMMAMINSGSKGSVLKFVQQTACVGLQLPASTFPFRIPSELSCVSWNRQKSLNCEITNNTSECMAGQNMYAVIRNSFLDGLNPLECLLHAISGRANFFSENADVPGTLTRKLMYHLRDTYVAYDGTVRSSYGRQIVQFSYDTADGMNNDHDLEGEPGAPVGSWAACSISEAAYGALDHPVNALEDSPLMNLQEVLKCHKGTKSAVHTGLLFLSKYLKKYRYGFEYASLEVKDHLELVDFSDLVDTETMKIKRLRLGFIVRELIDQYNALRKKLNNTIPSVCISYSKCSVGNECVKNRSCCITMVAQVESNSTSQLDIIKERVIPSILATLLKGFLEFENVKVECQQDSELVVKVGMSEHCKTGKFWATLQNACIPIMELIDWERSRPERVYDIFCSYGIDSAWKYFVESLRSTTDAIGRNVHRQHLLVVADCLSISGQFHGLSSQGLKQQRAWLSISSPFSEACFSRPAYSFINAAKRDSVDNLSGALDAIAWGKEPCAGTSGPFKVLYSGKSQKTKQNKNIYDFLHNPEVQALEKNFMDTYKQRTEKPSKQRSAFSSKGNATINGGTISVNQKFLDSKVGIWENIIDMRTCLQNMLREYTLNEVVTEQDKSCLIEALKFHPRGYDKIGVGIREIKIGVNPGHPNSRCFIVQRSDDTSADFSYNKCVLGAANSISPELGSYIEKILSNRAIRPHQL</aaseq> |
| Gene Sequence |
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