Difference between revisions of "Os10g0575800"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
(Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os10g0575800| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001072015.1 GI:115483625 GeneID:4349490| Length = 9866 bp| Definition ...")
 
Line 1: Line 1:
 +
Please input one-sentence summary here.
 +
 +
==Annotated Information==
 +
===Function===
 +
Please input function information here.
 +
 +
===Expression===
 +
Please input expression information here.
 +
 +
===Evolution===
 +
Please input evolution information here.
 +
 +
You can also add sub-section(s) at will.
 +
 +
==Labs working on this gene==
 +
Please input related labs here.
 +
 +
==References==
 +
Please input cited references here.
 +
 +
==Structured Information==
 
{{JaponicaGene|
 
{{JaponicaGene|
 
GeneName = Os10g0575800|
 
GeneName = Os10g0575800|

Revision as of 21:13, 22 July 2012

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os10g0575800

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001072015.1 GI:115483625 GeneID:4349490

Length

9866 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0575800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:23378242..23388107

Sequence Coding Region

23379424..23380062,23381403..23381615,23382317..23382510,23382677..23382821,23383056..23383130
,23383477..23383635,23383721..23383900,23384011..23384498,23384630..23384993
,23385066..23385198,23385278..23385417

Expression

GEO Profiles:Os10g0575800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008403:23378242..23388107 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008403:23378242..23388107 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>tggttgcaggaatgcttatgtattctggcatgtgatgatgcagcatctgtgtctgaggctgcgcaagactctcttgattatcttttcattgagggtgagagagttctaacagaagatgatgtttctgatatttttaccaggtttgttgaaaagttaccacaaatggtacttggtagtgaggagaccactgctatttcgcatgctagaagactactagctctaacttattatgcaggccctcagtttttggcaaattatcttcaccgttctcctgttgttgcagctcgtttatttgactgtttgggtttatgtatcagtcaaagttcacaattttctggttccatggacaagctaattgtttcaaagccactgtctgttggatatctattttctgttgctgagttaaaaagtggtgcctatcctaaagatgaaaactatggttttcagcatgccatgcctgcatcaacagccaccaaaatatctgttatccatgataatggtttgccaaatacaacacatagttcagttgactatgagttaccccatgtacctccatggtttgttcacgtgaatagtcagaagctttattttgctcttgctggaattgttaggcttgttggtctatcggcagtttcaggcgaagaaaccagtgcatcactgtctctctttgttgatatcctacttgatcagttcaggaggttgagcactgagctgcggagtggtgggcagaggtggtacatgaaaagtgatgctgggcaaacactacgccaggcaagctctgctgtttgcatgctcaatgagctcatatatggtctatctgatcgttccctcagtatatgtttacaaatattcaacaagaactcagcacagatgataggagcacctggtcaaaatgatcagttaactgcttttggccagaataatggaggcactaacagaaatatttggaagatcagtgagcaaatgggcacgaaaaaccacattattcattgtatcggaagtattctgcatgaatatatggcaccagaagtttgggatcttccaacagaaccggactctgaactatccctaacagagttgaatattcccttgtatttctttcgtgatactgctgcattgcaccaagtaatgattgaaggaattggagtatttggtgttgtgcttggccaagattttgcaagtagtggatttatgcactcttcactttatcttctgcttcgaaaacttatcagctcaagtgtacagataagaattgcttcagatgctgtcttaagagcactcgctgctgctggaggttactgttcggttggtcaatttgttgtggcaaatgccgactacattgttgactctctttgcagacagttgcaccatttggatctcaatccccacgtccctgatattcttgcttctatgctgtgttatattggtgcttctcgtgacattttaccattcctggaagaaccgatgcgtgctgtttcttcagagctggaggttcttggtaggcatgatcacccgcatttaactgttccatttctgaaggctgtttctgaggttgctaaggcatctcgacatgaatctgttagtttgccagatgaggtggaatcattctttatgaaggttagatcggaaggtgaagcaatccaaagtttgatagagaagagaagggatacctgtgcaatgcctgaaagaatggatgttgatgctcagcctgattttatgggattagaatattgggaggatctactttgcaaactaaatgagatgagaagatacaggagaatagtaggatctcttgttggctcttgtgtagtagcttccactccacttctatcttcaacaaaagaagcagcttgtcttgtggcccttgacattgtagagaatgctattatgtctatagccaaggttgaggaagcctataagtgtgaaagtcgatgcaaagcagttattgaggagacaattcaattattatcagtggatgaacttcatgatgacatggatgctgcagaagatgttgatgagaatagactactcccagctgtgaacaagctatggccatacttggttatttgtcttgggaacaaaatctcagtgtctgttgtcagaaaatgcacagaggtgttaagtaaagtcattcagatatctggaggcgatttttttgtacgccggtttcataaggatggatctgttatttggaggttgctaaccttatctcccttccaacgaaaaagaatggcactgatggatgagaaagctattattttaccatataggaatacctcacttacatccgaggagcctatggctgagatatccagccaaaagattcagattgcagtgctggacatgctcgctgaaatatcttccaacaaacgaagtgctattgctctgggaagtgtactaaagaaggtttgtggacttgtggtgggaattgcctatagtggtttgatcggcctgcgagaagctgctataagggcattgacgggaattgcttctattgattctgaccttgtctggcttcttatggccgatgtgtattattcattgaaccaaagggatattcctttaccacctaaacaagatctagtggagctgtctgaccttttgccccctccaatgtcatcaagagagtatctctttgtgctgtatggaggtgagggtgttagatgtgatatagatccttcatctgtacgtgaggttttcaaaagtatgcaggatacagtcttaacatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>WLQECLCILACDDAASVSEAAQDSLDYLFIEGERVLTEDDVSDI FTRFVEKLPQMVLGSEETTAISHARRLLALTYYAGPQFLANYLHRSPVVAARLFDCLG LCISQSSQFSGSMDKLIVSKPLSVGYLFSVAELKSGAYPKDENYGFQHAMPASTATKI SVIHDNGLPNTTHSSVDYELPHVPPWFVHVNSQKLYFALAGIVRLVGLSAVSGEETSA SLSLFVDILLDQFRRLSTELRSGGQRWYMKSDAGQTLRQASSAVCMLNELIYGLSDRS LSICLQIFNKNSAQMIGAPGQNDQLTAFGQNNGGTNRNIWKISEQMGTKNHIIHCIGS ILHEYMAPEVWDLPTEPDSELSLTELNIPLYFFRDTAALHQVMIEGIGVFGVVLGQDF ASSGFMHSSLYLLLRKLISSSVQIRIASDAVLRALAAAGGYCSVGQFVVANADYIVDS LCRQLHHLDLNPHVPDILASMLCYIGASRDILPFLEEPMRAVSSELEVLGRHDHPHLT VPFLKAVSEVAKASRHESVSLPDEVESFFMKVRSEGEAIQSLIEKRRDTCAMPERMDV DAQPDFMGLEYWEDLLCKLNEMRRYRRIVGSLVGSCVVASTPLLSSTKEAACLVALDI VENAIMSIAKVEEAYKCESRCKAVIEETIQLLSVDELHDDMDAAEDVDENRLLPAVNK LWPYLVICLGNKISVSVVRKCTEVLSKVIQISGGDFFVRRFHKDGSVIWRLLTLSPFQ RKRMALMDEKAIILPYRNTSLTSEEPMAEISSQKIQIAVLDMLAEISSNKRSAIALGS VLKKVCGLVVGIAYSGLIGLREAAIRALTGIASIDSDLVWLLMADVYYSLNQRDIPLP PKQDLVELSDLLPPPMSSREYLFVLYGGEGVRCDIDPSSVREVFKSMQDTVLT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>8046..8684#6493..6705#5598..5791#5287..5431#4978..5052#4473..4631#4208..4387#3610..4097#3115..3478#2910..3042#2691..2830#gtgggtgtcgtcttctccagaggaacgaaacgaaacctgaggaggtctctcgagttgtcgactcgcagtcgcaccaacgcagcagcagcaactcgactgtagtccttgcgctacctcccgcagccaagcttcctcgccgtcgccacctccgagatggagatggaggctgctgctgctgcggccgcggcggcctccgacgaaaccctagccgccatctttgctcagctcaagccccacaccgtcaccctcctcgacctcatccgcacccgcaccccggcctccaagtccgccgcggcttcctccctccgcgccatggcctccttcctccgctccgcccccgccccggccttgcagctctgcttcgagtacccactcctctcctctcctctcccccgccccaagtgtctgcgcgtgttggtttttgtttatttggttggttgtgctaatgtatggcttgtttggtgctgtgtggggtgcctagttacaccgtgtttccattgctcctgctcctggatgctgcggtgcaatgcaggaaggaagccaatgcgtcaggggagctcgacatctctgatgccatcgccgaaggcggtcttgcgtgcctagaggtgctccttaccaaatgccgcctcacctcggtcaatcaggtgcttcatttttttttctctgcttccgtatacctgatgattctctagtttaatattctatcatctccaactagaacctgtacacattagctgcattagtaataacttgttaaccaatctgtgtattattttatctgacaattgatctcgaacaactgaggacagtatgaaaccataatttcctgtgtgctgtgtagctcatggcaggcagaacttttctgaaatcctggatcctaatcttaatgagtctcatcacatatttgacatgagtttctttttgtttgccttactagatggttgcattgctaaagaagttaactttcggggcaatgctttcaccttcggaggcttcagaggaattccgccaaggcatcataagatgcttcagagccatgattctgcagctacacccatgcttggaccgctcttgttcttgcaaacaagcaactgcattgtctacagccctatcttttacaagtttggaagttggcactatagttaccccaaaatactcggcacaaccagaagagtgcttgcttgcgttcctccagtcccaaaacgcttcagctgctgtggggcactggctttcactacttctccaggtacatcattcatttacttttatcttctgattcacttgatttttcttttcttttattgtctttttggttgatatgacacctttcactttcagtcatcagaacttgaggcatcaaggggtcaccgtggcagtgcagatgttagaaaagaatcactgattacactgcgtgttcttattggcaaggtgagaagttttttgcaagcaacacatggatgggtcactagccaagacacttgtgttgttcaggaaatgcttaatcataatgtcgattagcatttttctttgctgtcatttctcctgcagaactgtaaagccatgaaaagatgaaggctaaaaaaaaccagcagtatctgtttagctgttgcattggcataatgaccaggctttttttttgttctttttgagaggatgacaaggctagttgttttactctttttttttttaaaaaaagagagaataaaatatattgaactgatgttagatacaccaaccttcagagatgatagatacccagtttcctctgattcatagcaagaatcagcctcactgtttttcttagtatatccattatctttctttagggcatgatacctctgtgtaaaagcatgttacagaggttttagttttctctggggcatgactccttccgaggctattattttgttttcccattgtacaaacaattcagtaaacttactcttcttgtttaggtaggttctgcggatgcacttgcctttttccttcctggacttgtcagtcgtcttggaaaggttctttacacatctaagaatatgataagtggtgctgctgggagtgctttgagcattgaacaagctgttcttggattgaccgaggccttgatcgtagtcctaaatgacaaggagaatttgagtgaacttgatatttccagcgttgagaatgtggctctttgttctggtggcaatagttctagtgaacatgtattgcagatgcttcgccaattaccggccaaaactttatctaagcagatcggcagtggtgaagctacagaagatgtgaacgctgatggcagtaaaacctctgctgatagaagagaactgcatgttaaacggacaaaaaaatggcttgaggaaacagctaataatgttgataaattactctctgcgacatttccacatgtatgccagtatttttcttctctgttatttttatttagtgtttgagtggttatttggaccatcaaaagtgaatattagagctatttttttttgcagctttctattcattcatctgagaaagtaaggaggtcggtggttaatggtataagagtccttttgtccagctgcagctatacactaaggaaaagcaagatgttgcttgtggtaagtacacatatgatattttatcacttgttgaggtgttgtgcctagaattatgctatatgtttatttttaacttctcaaagatggttgcaggaatgcttatgtattctggcatgtgatgatgcagcatctgtgtctgaggctgcgcaagactctcttgattatcttttcattgagggtgagagagttctaacagaagatgatgtttctgatatttttaccaggttcgttctattttactctgtgttaacaacacaagtgatagtttgggtaaagttctcaaccatttgacatgtaaaacaggtttgttgaaaagttaccacaaatggtacttggtagtgaggagaccactgctatttcgcatgctagaagactactagctctaacttattatgcaggccctcagtttttggcaaattatcttcaccgttctcctgtaagttatctacatcccttttgttggatcaatgattcttttgcttttaactttatcctgttccactttcaggttgttgcagctcgtttatttgactgtttgggtttatgtatcagtcaaagttcacaattttctggttccatggacaagctaattgtttcaaagccactgtctgttggatatctattttctgttgctgagttaaaaagtggtgcctatcctaaagatgaaaactatggttttcagcatgccatgcctgcatcaacagccaccaaaatatctgttatccatgataatggtttgccaaatacaacacatagttcagttgactatgagttaccccatgtacctccatggtttgttcacgtgaatagtcagaagctttattttgctcttgctggaattgttaggcttgttggtctatcggcagtttcaggtactttctcgactatgttgtatgcctgccaacattatcatttagggttaatctcagtcttgcattttgtatccagtggtgccacgtatggtacttgaatcttatgttttggttgcttttgatgatactaggcgaagaaaccagtgcatcactgtctctctttgttgatatcctacttgatcagttcaggaggttgagcactgagctgcggagtggtgggcagaggtggtacatgaaaagtgatgctgggcaaacactacgccaggcaagctctgctgtttgcatgctcaatgagctcatatatggtctatctgatcgttccctcagtatatgtttacaaatattcaacaagaactcagcacagatgataggagcacctggtcaaaatgatcagttaactgcttttggccagaataatggaggcactaacagaaatatttggaagatcagtgagcaaatgggcacgaaaaaccacattattcattgtatcggaagtattctgcatgaatatatggcaccagaagtttgggatcttccaacagaaccggactctgaactatccctaacagagttgaatattcccttgtatttctttcgtgatactgctgcattgcaccaagtaatatgcacttacaatttgccagttggtctttcaaaagttctccttttgcttgttctgttctggactgtcttgtttgctcaagctcaatttttgatcttttttatcaggtaatgattgaaggaattggagtatttggtgttgtgcttggccaagattttgcaagtagtggatttatgcactcttcactttatcttctgcttcgaaaacttatcagctcaagtgtacagataagaattgcttcagatgctgtcttaagagcactcgctgctgctggaggttactgttcggtaatacatggccttatttcttgcaagtttttttttccttatcttctggactttgcatttatgttttttcttcctccctgtacaggttggtcaatttgttgtggcaaatgccgactacattgttgactctctttgcagacagttgcaccatttggatctcaatccccacgtccctgatattcttgcttctatgctgtgttatattggtgcttctcgtgacattttaccattcctggaagaaccggtatgatgattagggtggctatgaatctcagaatcagaaatatccatttaatccattctttgtatattccttttttaaaaaaacagtcttgttgtaagagaagtgcccaacatctgttgttctaattgctgaaccagtcaaattggttggcccttatttgctctgaaaagtggaaacacttatttttacagagcactttaaaatatatggctaagaggatgtaattagtatggggtagaaaggggcaaatgttatcctttaatcggaacaaattttgatgtccttttgcacttgaagcaggtgccttttttgtaatgtctgtgtcaatacatttttattcttgcagatgcgtgctgtttcttcagagctggaggttcttggtaggcatgatcacccgcatttaactgttccatttctgaaggtactaaaaaataaagttttgataagtgataacatgttgtatctgtctattgttctactttaaggggatttgaatttctcgctggtctgatcattttaactctcatttcttagattgctaagttgatcttttacaccaaggataactttattggggtcatattttgtttacgctttacttaaattacccgtctaacagagccagttttcccctttcttttttgggtttctctaggctgtttctgaggttgctaaggcatctcgacatgaatctgttagtttgccagatgaggtggaatcattctttatgaaggttagatcggaaggtgaagcaatccaaagtttgatagagaagagaagggatacctgtgcaatgcctggtaatagcttgataagtttaataattaattacaatatcttctacattaggtagcaatataataattatggaagtaaatattgcatgcatctcctgttctgacttctctatgcaatattttattcgtgtagtccctatctcataacctctctttgcgattgcatcagaaagaatggatgttgatgctcagcctgattttatgggattagaatattgggaggatctactttgcaaactaaatgagatgagaagatacaggagaatagtaggatctcttgttggctcttgtgtagtagcttccactccacttctatcttcaacaaaagaagcagcttgtcttgtggcccttgacattgtagaggtattgttcccctgctaatgtagacaaggttttggttccatttcataagatattttacttgcaatgtcaatataattctcctacaacttcgtctaacaatagtttttggtcatcttttcatggcgttccaaatacttcttttttcaaaaaatgatattatgatatcttgacctatcttccattatttctcacaagaaatgtcaagctctaaagtatttcaactaggaagaaaatttcttctaattctggtgaaatagggagcattttttttattttgtactgttttcatccttaccaaaatttggcgacgtgacaatccaaacgtcccaaatgactttccataccaaaatttggtgattcaagaaagttacctaacaggacaccaaaaattgttaaggcatcaaaacaaacataccttcacacacctctagcttagcaaaagttggcaatgccacagagcattgccaaaatttggtatggttaaatttggcatcaaaacgaacatgcccatagcccttatatctccatttctgttgtcatttggtagtaaataaaaggaaaaggtatgctgcatttatgctaacactttaatgctaattataaggaataattgcttgagttcttttcattcatcctggcatgaagttcgctatgagcctatgatagacgaagttacattaaaaaaaaattcctttgtccagaatgctattatgtctatagccaaggttgaggaagcctataagtgtgaaagtcgatgcaaagcagttattgaggagacaattcaattattatcagtggatgaacttcatgatgacatggatgctgcagaagatgttgatgagaatagactactcccagctgtgaacaagctatggccatacttggttatttgtcttgggaacaaaatctcagtggtacaatttcttgcatgctgttaatcattggtttgcaacaaaaagattgttagctttcttttctctcttttttttatttaaacagatgcttacattcattcattggtgttggtgtttcatgtctcacttgcacgaaatgaatattgagggctcttgatctgtagagcatctgaaaccataacacgatcaatatagagaacatcaaaactcctgccttttccttttaacaaagggttaattggatacataccattaaaaaatttctagttttgaaatatgccactggtattcatgtatttggaaatatgccattataatttcacacaaattcaatatttgttaccataatcagacattggactttgggagttggagttgactgtaccatagtttctttttaagttcgtaattttcttttcactgtttactttgttggattagaagggtcctatagttgcttgtgaatccaggtacttttgtgtgatcaaactcaaatactttaccaatacttccattatcccgtgacatgttagtatgttactactcccgccattccacattataagacattttggcatctctatccctcgtctagattcactaacatttatatgaatttagacacatatatgaaggtacatacatgaacccatgcatgaatttattcaaaacccaaaacatcttataatgtgaaacataggaagtaattgttattttggggcctgtcctcattcagtaacttcacctcttaaatgacacctaggcatttctagatcttgtttgatgacttgccatggggagttgatccataatccaatgcctcaatatatttgcatctctgtgagatacaagtttgcataagaaattccgaagtaaacagattacaactatattcagcattttcagaacagaacatagtgctgccagacctttttccatgttcttgatcatctttattgatcaataatcagatggatgcaatacatgttgctgagtatttaggtatacaatacgccccaaacaccacctgaagttgcaaccttataactttgtcatatactgattcttcttatcactcgtacacttgttgccatcgttgagggtttaattggttcttctgtcataaaataaaatgcttttggactgactagtctaaaaacagtgtgcatgaagtgggccctatacaattttttttggaaaacatgtatcaggaatatgctaaaatagggagttttcattttcttgttgtttactttgtatgcatgcttttgatctatttttgccttgttggttccttctgtatgttatccttatagcttacattattatggtatttgcagtctgttgtcagaaaatgcacagaggtgttaagtaaagtcattcagatatctggaggcgatttttttgtacgccggtttcataaggatggatctgttatttggaggttgctaaccttatctcccttccaacgaaaaagaatggcactgatggatgagaaagctattattttaccatataggaatacctcacttacatccgaggagcctatggctgagatatccagccaaaagattcagattgcagtgctggacatgctcgctgaaatatcttccaacaaacgaagtgctattgctctgggaagtgtactaaagaaggtttgtggacttgtggtgggaattgcctatagtggtttgatcggcctgcgagaagctgctataagggcattgacgggaattgcttctattgattctgaccttgtctggcttcttatggccgatgtgtattattcattgaaccaaagggatattcctttaccacctaaacaagatctagtggagctgtctgaccttttgccccctccaatgtcatcaagagagtatctctttgtgctgtatggaggtgagggtgttagatgtgatatagatccttcatctgtacgtgaggttttcaaaagtatgcaggatacagtcttaacatgaaatctggtaaagcacaaagctcaggcatgttatggttaaaggtttttcttatttggttcatttctttattttacagtaccactgtgtatttcaggtctgttgaatatgcctccctgactccctgctgtcaccttggcaccttcctgagggacttgtgtcatgctgaggtcactgtgataaaatgttatatcggcactgtcaaagggtaatatgccatgcaaattaatgtttagcaaatgagaaaaaataaatacctacatcaacaagggtctagtggtaaaagctaatgcttgcagtgaatttcgagtcatatattattgtttttgtgatttcatttaatctctattcgggaactactactgctgaaccgctgattccattgctaagcatcactgttaagaggatatgtacgtttagcccatttccaaattgtttcctttttggaaccctatgcttaaatttccagacatgaacatggcaacactatgttcctttttaatagttaattaatatgcaaaaaaaaagaaagttacctaacagatgttgtgtgtagcgttaacatattttcaaggaatatcctatctttaacatgaatacatgatgaatagtcatttttatcatgtcagtagacattttaatatcatgcatttgtgtctttacttggggtctaattggcctattctttacaaaaatgcaggattcatgatgaaagataatccagagctacagaaaaacattcctcaaacggggttggttgatttgggcagaagcttgcggacttgcggccttgcctttgatgcaaatgttgctatgttgtctgccgtctgtatgtattttcatgtttggttccccttgagttttggcagtagcatggtaataacagtagaagtagaactctagaagtcaagacctcaaggtacagttatctgcaatttagtcagaagagaggatcagaggagcgataaggagaagtcgctcgtctttaaagatctggacctgttcttttagaggatacggaatggggttcttttgatagaatgttttatgtaattacatggttgaaggaaaaaggtaaaggtcattcgactgtacacctgcctagatacgaagtgtgtcaagctcaagcaccaatcatttgttaagatgtgaacatttggcaaaaagcttatatacagttgatcc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0575800, RefSeq:Os10g0575800