Difference between revisions of "BGIOSGA033133"
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Revision as of 17:37, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA033133 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033133, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0026O12.16 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA033133-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA033133-PA |
| Length |
11754 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:16653114..16664867 |
| Sequence Coding Region |
16653114..16653242,16654186..16654263,16654366..16654428,16654706..16654753,16655073..16655219 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:16653114..16664867 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:16653114..16664867 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGCGCAGGCCACGGCGGCGGTGAAGGAGGCGCTGGCGGCGCTGTACCACCACCCCGACGACGCCACGCGCACCGCCGCCGACCGGTGGCTGCAGCAGTTCCAGCACACGCTCGACGCGTGGCAGGTAGCTGACAGCTTACTTCATGATGAAAGTAGTAATATGGAGACTCAAATCTTCTGCTCTCAAACCCTCAGAAGCAAGGTACAAAGGGACTTTGAAGAATTACCTTCAGAAGCTTTCCGTCCGTTACAAGATTCTCTATATGCATTGCTGAAAAAATTTAGTAAAGGACCACAAAAAGTTAGAACACAGATTTGCATTGCAATGGCTGCTCTTGCGGTGCATGTACCTGTAGAGGACTGGGGAGGTGGTGGGATTGTGAATTGGCTAAGTGATGAAATGAACTCTCAACAAGACTTTATCCCAAGCTTCCTTGAGCTGCTAACTGTTTTGCCACAGGAATGTTCTAGTCATAAAATAGCAGCTCGTCCTGAAAGGCGCCGACAGTTTGAGAATGACCTTCGTTCATCAGCCGAAGTTGCACTTAGTCTATTGACTGCTTGCTTGGGTATTGATCAACTGAAAGAACAGGTTCTGGAGGGTTTTGCTTCTTGGCTTCGTTTTTGTCATGGGTTCTATAAAAACAAAGTGCAGTTTCCAGTTACTTCCGAATTGATACATTTTACGGTATCTCGAGAATCTAATGGCATCACCGAACAGCTTCCACTGATTCAAGTTCTCATTCCTTATGTTATGGGTCTTAAGGAGCAACTCAAAGATTCATCGAAGGATGAAGAAGATGTAAAAGCTATTGCCCGTTTGTTGGCAGACATGGGTGATTCTTATGTTGAGTTGATTGCAGCAGGTTCTGATGATGCCATGCAGATAGTGAATGCATTACTGGAAGTTACTTCTCATTCAGAATTTGACATTTCCTCCATGACATTTAATTTCTGGCATCATCTTATGCGTAACCTGACCGATAGGGGTTCGTACGCATCATATGGATCTGAGGTCTCAATCAACACTGAGAGGAATAGAAGATTGCAGCTATTTCGTCAACCTTTTGAAATTCTTGTTTCTCTGGTAAGTTTCCGAGTTGAATATCCTGAGCTCTACCACACCTTTTCGGAGGAAGACCAAAGGGATTTCAGACATTCCAGATATGCGGTTAGTGATGTATTACTTGACGCAACTGATGTTCTTGGAGGTGATCCGACGCTGAAAATACTTTTCACGAAGCTGATCCAGGCATGTGGAAATGGACAGAACCAAAAATGGCAGCCTGTCGAGGCTGCGCTGTTCTGTATACAAGCCATTGCTAAGTCAGTCTCAGTTGAAGAGAATGAAATACTACCACAGGTCATGTCACTGCTTCCCAGCTTTCCTCATCAAGAACAGTTGCTGCAAACAGTTTGTTCACTCATTGGAGCATTTTCAAAATGGATTGAAGCCGCACCATCTGAACTGTTGATACTACCACCTCTGGTTGATATTCTCAACAAGGGTATGAGTACATCAGAGGAAACAGCTGCAGCTGCTTCTGTGGCATTCAAGTATATATGTGAAGACTGTAGGAGAAAGTTCTCTGGTTCGTTGGATGGCCTTTTCCAGATTTACCAAATTGCATTAAGTGGAGTTGGTGGTTACAAAGTTTCTTCAGAGGACTCATTGCATTTGGTTGAAGCCTTAAGTGTGGTTATCACGACTCTCCCACCAGACCATGCTCAAAGAGCATTGGAATTAATCTGCCAACCAGTAATTAATCCCTTGCAGGAAATAATCCAGCAAGGAGATACAGTGCTTCAGCAAGTTCCTGTTCGGCAATTAACCTTGCATATAGACCGATTATCATGCATTTTTAGCAATGTGAAACTTCCACAAGTAGTTGCTGACGCTGTCAATAGATATTGGCCAACATTGAAAAGTATTTTTGATCAACGGGCATGGGATACACGGACCATGGAGTCACTATGTCGTTCTTGCAAATTTGCTGTAAGGACATGCGGGAGGTTCATGGGATTCACCATTGGTGCAATGCTTGAAGAAATCCAAACTCTGTATCAGCAACACAATCAGGCTTGCTTCCTTTACTTGTCGAGTGAAGTTATTAAGATATTTGGGTCCGATCCAGCATGTGCAAACTATCTTGCAAGTCTGATTCAGGCACTTTTTGGCCATACAATACAGCTCCTTCGGACTATTCAGGATTTTACAGCTAGACCGGCATATCAGCTGCATGCATTGCTTCCTGCTCAGCATAAGCATGTCATTCGTTACTGTCCAGCATTCATTTGTCACCTACAGCAGATGTTTCCAAGCATAGGTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEAQATAAVKEALAALYHHPDDATRTAADRWLQQFQHTLDAWQVADSLLHDESSNMETQIFCSQTLRSKVQRDFEELPSEAFRPLQDSLYALLKKFSKGPQKVRTQICIAMAALAVHVPVEDWGGGGIVNWLSDEMNSQQDFIPSFLELLTVLPQECSSHKIAARPERRRQFENDLRSSAEVALSLLTACLGIDQLKEQVLEGFASWLRFCHGFYKNKVQFPVTSELIHFTVSRESNGITEQLPLIQVLIPYVMGLKEQLKDSSKDEEDVKAIARLLADMGDSYVELIAAGSDDAMQIVNALLEVTSHSEFDISSMTFNFWHHLMRNLTDRGSYASYGSEVSINTERNRRLQLFRQPFEILVSLVSFRVEYPELYHTFSEEDQRDFRHSRYAVSDVLLDATDVLGGDPTLKILFTKLIQACGNGQNQKWQPVEAALFCIQAIAKSVSVEENEILPQVMSLLPSFPHQEQLLQTVCSLIGAFSKWIEAAPSELLILPPLVDILNKGMSTSEETAAAASVAFKYICEDCRRKFSGSLDGLFQIYQIALSGVGGYKVSSEDSLHLVEALSVVITTLPPDHAQRALELICQPVINPLQEIIQQGDTVLQQVPVRQLTLHIDRLSCIFSNVKLPQVVADAVNRYWPTLKSIFDQRAWDTRTMESLCRSCKFAVRTCGRFMGFTIGAMLEEIQTLYQQHNQACFLYLSSEVIKIFGSDPACANYLASLIQALFGHTIQLLRTIQDFTARPAYQLHALLPAQHKHVIRYCPAFICHLQQMFPSIG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..129#1073..1150#1253..1315#1593..1640#1960..2106#3019..3150#3660..3700#4360..4388#5726..5853#6677..6752#6869..6989#7058..7157#7251..7332#7424..7506#8736..8846#9018..9069#9462..9617#9889..10012#10107..10188#10266..10354#10429..10503#10599..10653#11238..11357#11432..11524#11632..11754#ATGGAGGCGCAGGCCACGGCGGCGGTGAAGGAGGCGCTGGCGGCGCTGTACCACCACCCCGACGACGCCACGCGCACCGCCGCCGACCGGTGGCTGCAGCAGTTCCAGCACACGCTCGACGCGTGGCAGGTCTGGGCGCCTTCCCCCTTCCCCTTCCTCGAGCCGAATCGTCTCGATCTCGCACCTGTTTGGGGTTCGTTAGTTGTGTTGGTCCTGATGAGATTTTGGCTGCGGTCGTGCTGATTCCGCAGCGGGGTTGTTGTGGAGGGGGCGTTCTCTGGCCCTTGTTGTGTGTGTGTTGGGGGGTGGGAGGGGGCATTGCGATCTGATATTTGTTGGAGCGGACTTCTGTTCCGCTGGTTAGGTGACTGATTGCACATTGTATTTGGTTTCTACGTTTGAGGCTACGGTTGATGCATTAACAGTCTGGCGAACTTAGGGTTAGAGCTTAATTAGCAGCTTTATTAGTATGTTGAATCATGAAGTACCTTTCAAACTAGATTTTATTTTGGATACCGAGCGTAGATCGTGGCATATTTGCTGGGAAATCGAGTTCAGCATCGTGGACTTTTATGCAAGTTGGATGAGTTAAAGCTTGCTAGTGTTTGATGCAAACTTAGGTTCGTTCTCAGTTCTCACCATTGGGTTGTGCTATGATGTGTGGCTTACCAATGTGGCTACACAAGCTTATGGACTGGCTGCCGAAGTGAAACATGGAGGATGATGAAATCAGCATATAGATTTTCGGCGCATGGATGTGTATATTTGTGACTCGAAGAGAATTCCTTAGAATTTTTATGCTCCCACTCACCTTTTTAATTTTGTGTTATTAAATTTTATCATATTCCTTATTTAACTGTTTTACTGTAGGTGTAGTGCGTAACTGTGTACTCCTAGTAAATTTAGAGGCCCCCCTTTAAAACTCTCTTCTCTTCAGTGTTTGGCAGATCCCTGTTTCCCCCTGTTACAGTGACATCTTGTTTGTGTTTGCGGATGCTGTTCTTTTAGTAAATTTATGGATGCTAGTTAACTTGATGACATCCAAATATATTTTTCTATTTTTAATTTGCAGGTAGCTGACAGCTTACTTCATGATGAAAGTAGTAATATGGAGACTCAAATCTTCTGCTCTCAAACCCTCAGAAGCAAGGTAAATAAATTGATATGTATCACTGCTTCTCTTCTAATTATTTAAAAAACTCTGAAATTGGTCTAATTCTTCCTGTTGTCTTTTAAATTATCCCAATACCAGGTACAAAGGGACTTTGAAGAATTACCTTCAGAAGCTTTCCGTCCGTTACAAGATTCTCTATATGTAAGCACCAGTTTTTGAAGTTCTTGCTTTTCTTTTCTTATTAGCATATTATAATCAGTTCAACTAAATGTTGTATCAAGTAGAATCAGTCTTCTATTTGGCTGCCATTTCTGTTTGATAATAGGCGTTATTTCACTTGCTCAAAATAAAATAAAACCAATTTTTCAAAGTTATGTCATGTCATGTTCAGTGATGGATTTGTTTACCTTTAGTAGTAAGATTTGGATAATCTTGTGAAGATCTTGTTTTGTTTCATTTAACTGTGATGTATCTGCAGGCATTGCTGAAAAAATTTAGTAAAGGACCACAAAAAGTTAGAACACAGGTAATCTATACTACCTCCATTCCTTTGTACTTGTCATTTAGGATATTGATACAATCACCAGTACACAATTTTGACTTATACCTTTTGTAATTATATACTCACAGCATACTAAAAATATAATCATATTAGTAGCAAAAAAAAATATTAGTAGCAAAAAAATCTTAATACGGTCGTGTATATTAGTAGCAAAAAAAAATATATCAAAGTTTGATTGCACACATTCTAAGACCACATTTATTTGAGTATATAGCTTGTAATTAAGCAATCAATTTTGTATTTCACAGTTATAATGGCAAACTACCTTTTGTGCCATCTTCAGATTTGCATTGCAATGGCTGCTCTTGCGGTGCATGTACCTGTAGAGGACTGGGGAGGTGGTGGGATTGTGAATTGGCTAAGTGATGAAATGAACTCTCAACAAGACTTTATCCCAAGCTTCCTTGAGCTGCTAACTGTTTTGCCACAGGTACATACATGTCTAGCCTCATATGGACTCCTATCATATACCCTATTGTTTCCATGTCGCTGAGTTCATCCTATCTTTATAATCCTATATAGGAGTGAACAGTTTTACTTCAAGTCTGTCCTGTAGTTTGGTTAACTCATATAGAAGTACCATGAATCCTTCTGACACTGAAGGATTTGTGTTAAAGAAAGCTGAAATATGATCTCAATGCCTTGTAAAATGTGTGCTATTATATTTTGTGCACAGGAAGCACCAAAGTAGTACCATTTTTGTGGTTATTGTCTTGAGTAAAAGAAAATGAGTTGAAGTAAAACAATTCATTTTTTTATTGTCCTTTTGCCATTTCCAAAAAAAAGAGAGATATTTTAGTAATAGTAGATTGTACATACTGATTGATGCTATTTCTGAATAATAAGTTAGACTTTTGATGAATCACATTAATGACTTTTGACATATTTTCTAAATATTATGAACCTGTAGCCAGATATCTATTTTAAATCACATAAGTACTATTATGCTTGTAATTTTGCCATGTGCATATATGATCATGCTTGAATTTAGAGTTATGTACACCAGCTACCATGGTTCAAGTAAGCGCTAGACATTAGAGGGTCAGTGAGGCCGGTGCCTAACGGTAGGAGCGTCTAGTTGCTGCCGCCAAGGCGCACCTAGGTCCCAGGACCAACTTGGCTAGGGACTTTGAAGCAGTTAGCGAGCATATATGACATAAAAGAAACTGTTCACCATTTATATTGCAAAACTAGATCCCCCAATGCAGAGCAGCTGCATAATGCACCATCAAATGCCAAATTGCTGCGGCTACTTGGTGCCTAGAGCCAATTTTTAGGACACTGCCAGCTACTCAGATTTCTAAAGCATATTCTTCATTTTTCTTCAATGATGTCCTTTCAGGAATGTTCTAGTCATAAAATAGCAGCTCGTCCTGAAAGGCGCCGACAGTTTGAGAATGACCTTCGTTCATCAGCCGAAGTTGCACTTAGTCTATTGACTGCTTGCTTGGGTATTGATCAACTGAAAGAACAGGTCAATTTCCTTCTCTTCAAGATTGTTTTTCATTGGCACCTTAGGAGCTTAAGTGGCAAAGAAAATATTTTAAGTTTGCATGTTAGGATAAATATTTTAAGCTTGCATGTTAGGATCTCTTCAGAGATAACAGGCAGTTTATTCACTGCAAAGTTATTCATAACTCATCTCCTGTGAAGCATCTATTACCACATTTCATTGGTTATATTATGACAGATGACATCCTAGGCTAATAGAAAGGTTTGACTGGAGGGCTGGTTTATAATGTGCTATTCTCATTATCTTGGTATATGAGAATGGTGCTATTTTATGTTTCATGTCAATTTCATATTCCACTTTAATATACTTAGATAGTGAGAAACATTCAGCCTTTCCAGACAGCAATATCACATTCAGGCATGCTTTAATATGCTTGATCTCAACCCAAAAATGCATAAAACCTGCAATCTGTAAACATAAATCAATTTATGTGAGGTTTATCTGTAGCTAACCTGATTGTTCCTTTTCAGGTTCTGGAGGGTTTTGCTTCTTGGCTTCGTTTTTGTCATGGGTATGCTTATTGGACTTTAATCTAATAGCACTCTATTCCTTTATAATGTAGCTTTTGTAGTACATTGAACATTTTCTATTCTTTGTAAATATTAAACAACTGCTTCATGACAGTATTGGCCTCAGGAATTTACTGAGTTATTCTTTCTGCCAGAATCTCCGCATCTAATCTTGCTTCGCTTCCTTTGGTCTATACGGCACTTTCTTCGTTGAACTCTGACCAATTTTTGGAGGCAGCTGTAAATGGTACTGATTGTATATGATCAAAATTTCATTGTATTTTACTTACCCATCATCCGTTAGTTTATCATCACTTTCTCTTCATGTTCTTTTCAATTGATCAGTTTTTAGTACATTATTGTTACGATAGTTATGTTGATCTCAGTAACATTTTTAGATTTTGTTTCTGTTCACTTGCTGCAGAATTGAGTCTATGCAGGCCAATTTGCAGTGATGTTGTGTAATTCTTGACAATTCTGATGTCAAATTCGTAGATAGTTTAAGTTCAGGAATAAGGAATATTGTATACTCACATTTGGATGTTAACCAGCAATTAACTCTGGTATAACTCATAAAAAGGGAGCTTTCACAGCACAGTACAAAAAGCGTACCAGATTTCAGGTTTTGACATGTTAGTGTTCATGTTTCATGCTTCAATAGGTTCTATAAAAACAAAGTGCAGTTTCCAGGTGTTGACCATAGACAATGCGAGAGGCTTTATTAGGCTTCAACAAGAGTTTCCAAAATTTCAATGTAGTTCTGAACAAGGTCTAATAAAAAGATCAAATCCTGGTGCAGACTTCTAGAGGGTAGTGTAAATGGGTTGGTGTTAGTGCATGCTTAGGCGCTATGGCGATGAGGCCAATGGCGGTGACATAAGTGTCAACCCAGCTATAGGTGGCAGTAATGTTGTTTGGAGGGAGGTGGTGACAGTTGGGGTTTGATGTGCACTGTGTCTTTGATGCAGCACCAATCCATACGGGGGGCTGCCATACTGGCCT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