Difference between revisions of "Os11g0136400"
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Revision as of 21:14, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0136400 |
|---|---|
| Description |
Major facilitator superfamily MFS_1 protein |
| Version |
NM_001072221.1 GI:115484054 GeneID:4349712 |
| Length |
8714 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0136400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:1662619..1671332 |
| Sequence Coding Region |
1662619..1662628,1663073..1663157,1663481..1663524,1664168..1664256,1664345..1664389 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctgcaggcgacgctgcgacgccattgctggtgctggagacggcgtaccaataccatgagggctgccccgcctgcgccgtggagcgcagcaaggcggtcaacccgggcatcccctacatgcgcttcttccacatctggatcatcatcctcgtctcatgtttgccaatatcatcgttatttcccttcttatacttcatgataagagacttgcatgttgcaaaaagagtagaggacattggattctatgcaggttttgtagcatactacaaccgggctttacaggcttatgccgttgaagtttgtcgaccagagcatcaatccattggattgtcattggttagcacatcatgggcaataggtctcattgttgggccagctatcggtggatatcttgcacagccatcagaaaaatatccaattctatttccagcaaactcattatttggaaggttcccatattttctaccttgtttatgtatatcgatcttctgcttcgttattctcataagttgcatttggctcccggaaacactacataaacatgcaacagaaagaaatggagattgtaaaattggatctttgagtacacatttggttgactccgaagagtttgtcaagcaacacactggaccagctaaagataagagcttatttaaaaattggccattaatgtcatctattgttctcttctgcattgtctcctttgatgacatggcttacacagagatattttctctatggtctgaaagtgacaaacaatttggcggactaaatttctcgtctgaggatgttggtcaagttcttgcaattacaggtgctagcatacttatataccagacatttatctacccacatattgtgaaagttctaggaataatcaacacttctcgggttgcagtaattctttctatggcaattctttgtagttatcctcctatgacatatctctcaagaccttggttgtccatagtagtaaatattgcatcgatgcttaaaaataactttgtggttactatcaatacatgctctttcattcttcagaacaactctgtgccccagcatcaaagagcaaccgcaaatggcttagccaccactttaatgtccttcttcaaggcatttgctccagcaggagcaggcattctgttttcgtgggcacaaaaacgccaacatgcatttttctttccaggtgaccaaatggtgttcttcattttgattattattgaatttttggaactcatttggaccttcaaaccatttctggccgtgccatatggctattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAGDAATPLLVLETAYQYHEGCPACAVERSKAVNPGIPYMRFF HIWIIILVSCLPISSLFPFLYFMIRDLHVAKRVEDIGFYAGFVAYYNRALQAYAVEVC RPEHQSIGLSLVSTSWAIGLIVGPAIGGYLAQPSEKYPILFPANSLFGRFPYFLPCLC ISIFCFVILISCIWLPETLHKHATERNGDCKIGSLSTHLVDSEEFVKQHTGPAKDKSL FKNWPLMSSIVLFCIVSFDDMAYTEIFSLWSESDKQFGGLNFSSEDVGQVLAITGASI LIYQTFIYPHIVKVLGIINTSRVAVILSMAILCSYPPMTYLSRPWLSIVVNIASMLKN NFVVTINTCSFILQNNSVPQHQRATANGLATTLMSFFKAFAPAGAGILFSWAQKRQHA FFFPGDQMVFFILIIIEFLELIWTFKPFLAVPYGY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8705..8714#8176..8260#7809..7852#7077..7165#6944..6988#6153..6260#5984..6069#5182..5269#3755..3955#3489..3564#3360..3409#3207..3269#3051..3127#2496..2556#2032..2072#1..160#atggctgcaggcgacgctgcgacgccattgctggtgctggagacggcgtaccaataccatgagggctgccccgcctgcgccgtggagcgcagcaaggcggtcaacccgggcatcccctacatgcgcttcttccacatctggatcatcatcctcgtctcatgtacgtacgcgcctcctatcgatcactgcttcatttatactcctacgtgttcatgcatgcttcgcttcctgcttgactgcctctccaatctccttattattcatgttatattcgaaaaagctaatggacgagcgctcgcgttcacccacccccacgcgatcagtttactctgaccaatcccatgccacgcgaagtataggtggccaaatggaccgcccggctcggcacggcccaagcacggccgtacctcggccgaggtcagtcgggcaagcacggcccaacctatatgttaggccgtgtcgtgccagctcacgggctgcacacacgtcccaggcacaaccctataagactcgggccatgccggtccagccggaaggcacgacaaaccatcgtgtttcttcatagaataagtctatttttcatccctcaactctttgggttgtcttatatgactagaaataagtctattttgtattacacctctcttttggcattgccttatattgttgattaagtctattttggatccctatactattttcttctatcgtgccgtgccgggccggcccaccgtgccaaggcatcggcctaggcatggcccaactatcgggccatgccgacacggacttgacaccagtcaggccatgccgtgcttaggcccagcaaaatggccgtgtcttcggccaggccatcgggccccgggccatatggccatctataacgtgaagcgtgatattctctttggctctaatacgaatatagccacttcttccattttaggctagtccttttccttttaggctttactctttcccatttaattttatttgaccaagttgaattttaggtgagaccaaccagttaggcctcacaacccgcatgcatgatttttctttttttattctatgaattcatttaaatttgtatatatgatacaaactttatacgtatgaagtttctatacataaagtttctatgtataaaatttactacatattattttttgggacagattaacatgtcgttgaattcagttgaaatctatgtttataaaaaattacatgcacaaatttctatataaaaaatttctctttctatatatgtatatatattttagacatgtaaagtctatatataaatatattttctttactgggccatgttgcttttgttgggctgaattctagaaaagagagaaaaagatgcacgtggaagcctacgagcgtggaaacatgaccgagaaatctgagtcgtcgcgctcgcgccttagcaaatccatcttaggtgtgtaaacgtgatcgtgcacaccgtggacccatggttgctcaagtattagacggaccctattatgtttgcatatccattttttttcatttcctccagcattgcaaaatgtgaatgctttatcagtcatttctagttcacctgaatttatcttatagaggattattttgtactacctctatttttttctttttatatagatgactcagttggcttttggcataatgtttaatcattcgtcttattcaagaatttagtataaatatgaaaaaaatatgagtcatataaattttattaataagagaaatggtcaaatgtcacgttaaaagttaaaaaaataaagggagtattagtgtctaaaattaagggggctaaaaggaaagttctagcttgtaaccgttggtcgaactattgaagcaaaattctaaattgttgtttcttgcatctcttttgcatctttatttatcttgtcattagcttagctcgttccattgatgcgggcttgtgagcctttcatggtagatttttaacctttcatccttacaatattttttttattgaatttcatccttataattgaatttcaggtttgccaatatcatcgttatttcccttcttatacttcatggtatgtatttatgattgtaaaatttacaatagcaccaaaagatgctctacattgtataagtttcagtgtaaattagctgtttctatttctcattagcggaatttgtaccttgcataattttatcatttggtttcgtgaaatgatattcatcattcatgtagcaattcaaatttctctagtttccatttatattaactagtttttgtagtcttggaaacggaaataacagtaaagttaccacctaattcctaattcttcaagctatgtatagtcatatatatgttgctatgtatactcatactcatatgttttggctaatcattgtttgaataaaaggtaagctcatagtttaattctcttcttcacaataggtaagagattataacatttatttttattgtatatttctcttgtccacaacagataagagacttgcatgttgcaaaaagagtagaggacattggattctatgcaggttttgtaggtaagcgattataatgtctgtaataccaaaggtcatgcttttacttagtagtgacaaatgtttttttacacccatttatctatcgcaaacatgacatattataattctcaacatattaggtgcgtcatatatgtttggtagagctttaacttccactgcttgggggatggtagcagatcgtattgggaggaagcctgttatcatttttggaattttttcagcttaagtaccttttagttcagttccgattgaaccaagttagtaattacttgtattaccttatttatatccacctatgattactttaccttgtgttgtgaaatcagatttgtattcaatactctctttggactaagtacacactattggatggcgataactacacgatttcttataggttcattgaatggcttacttggaccaataagagtacggtgattaaattatctaaattcatatttgctattcactattgaaatactataactatctagcatactacaaccgggctttacaggcttatgccgttgaagtttgtcgaccagagcatcaatccattggattgtcattggtatactacaaagttctataatattttttactatagttatattgcactttacattatgacactctttttttatgattaggttagcacatcatgggcaataggtctcattgttgggccagctatcggtggatatcttgcacaggtatcctactaaattttaataccatatgagttgggtgcatgcttaaacaatgcattgacgctattatgatgcttttatttcatttgacagccatcagaaaaatatccaattctatttccagcaaactcattatttggaaggtatcgttgttataggaaatataattgttctagatggtataactccttaaatgactgattcttgaaaatctttccttaggttcccatattttctaccttgtttatgtatatcgatcttctgcttcgttattctcataagttgcatttggctcccggtatgtgcacaactagctaattttattcttattgatattaatttgggcacacataattcttgtttttatgcttctcttagctaaaatttatcttaactactaaaatacaaaagttaattaatattttgctaatactttcaggaaaataatgtgttttcatttcaaaataatgtgtttcataaaatttcaggaaacactacataaacatgcaacagaaagaaatggagattgtaaaattggatctttgagtacacatttggttgactccgaagagtttgtcaagcaacacactggaccagctaaagataagagcttatttaaaaattggccattaatgtcatctattgttctcttctgcattgtctcctttgatgacatggcttacacagaggtatgtaccaactatgtctagactaatggtgtagtatttcctagctaaatgagtccagatgtttgaataattgaggaaaagttgccatgttttgggaaatatcgattaaacacttcacccaattacaaaactagggtatagtgttatcactataaataatgcttctatgtttatgtaagagagacttaatttacttcgaaagggccacatgattatttaatcattataaaataatgtttgaaatatcataaatatttaattgaaatatctatttctcaccatgcatcaactagatcctaatacatttttattatttatacaatcatttttgtgttatatagacttatatgttgaacaagtaataatttaattttgtagatgttgtcaaaaaaattgttgatgagacacatcccatcttcatccccagccatgtgtataacaagataataacatttagttgaaggacacacacttattagttcatggaaaacaatgaagcacatacaagttttattataacatataaatttaatcaacagaggtaacctacatgcataattgctatcatttctttcttttacttgcaagttgtgaacctacatatgttctaccaatacgccttgaggcccttgaacatgctcgtcctaggggagtgcccccaaagaactatttagtaacattaaatattttctatttatattggtgcttaacattcagtcaaacttttaaaactacatcattgattttattttataacaagtttataaaaactattaagtttataatactgtggaagtgcttttaaaggcaactctacacataccatatttgtttttttataatgaaccatttgagaaat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