Difference between revisions of "BGIOSGA027201"
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Revision as of 17:06, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027201 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027201, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28757 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027201-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027201-PA |
| Length |
25072 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:14867837..14892908 |
| Sequence Coding Region |
14892846..14892908,14892556..14892768,14892275..14892448,14892127..14892228,14890559..14890663 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:14867837..14892908 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:14867837..14892908 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCCGCACCGGCGGCCGCCGCCGCATCTTCGACGGCCTCCCCATCCCAGCCGACAAATCCTACCTCAAGGAAGGGCTCTCGCGGATTGACGAGGGGTGGGCGGCGGCGCGCTTCGACTCGCTGCCGCACGTCGTGCACATCCTCACCTCCAAGGACCGCGAGGGCGAGATCCAGTTCCTCAAGGAGCAGAGCGACCTCATCGAGGACGTCGTCGACGAGGTCGTCCACGCCTACCACCATGGCTTCAACAAGGCCATCCAGAACTACTCCCAGATCCTGCGGCTGTTCAGCGAGTCTGCGGAGAGCATCACCGGGCTCAAGGGGGAGATGGCCGAGGCCAAGAAACTGCTTGGGAGGAAGAACAAGCACCTCGGGCAGTTGTGGTACCGCTCCCTCACATTGCGCCATGTGCTCTCCCTTCTTGATCAGGTGGAGGATGTTGCCAAGGCAGATGTAATTTGGAAACTGTTTGCCAGAAAAACTGTTGTTAGTTTCTATCGATATTTTTCAAACTTTGTGTATCAAATACGTGTTAGCAAATATGAAAAGGTTCCTGCTCGAATTGAAAACTTGATGGCAGAGAAGCAGCTCTATGCTGCAGTGCAGCTGCATGTCCAGTCAATGCTGATGCTAGAGCGAGAAGGCCTTCAAGCGGTAGGTGCTCTTCAAGATGTTCGCTCTGATCTCGCAAAGCTGCGAGGTGTACTATTTTATAAAATTTTGGAAGAGCTGCATAGTCATCTATACAACAATGGAGAATACAGCTCGGTGACTTTAAGCATGGTTGATAATGAAGAACTACCAACATCTACGGCTACTGGTCGATTAGTAAACAGCATGCAACCTCTGTCCAGGAGAACTAGGTCAATTAAAGGTGATAATCACTTTGGTGCGTCAGCAGATGGGATTCCTAAAACCAGTTCTGTTGGAGGTTCTTCATTTGATGGCCCAGATGATGATAGTAGCATAGACATGCATGAAAGTGATGGTGGGCGTAGTCGGAGGGATTCCAAAAGTATTTCTCGGGAAGTGCCAATTTTCCTTTCGTGTGCTACACCAGATGAGTTTCTTGAATCAGTGACAAAGGCAGATGCTTCTCTCAGTGTGAAATACTTGAGAACATTGGTGCAGTGCTTATCCATGCTTGGAAAGGTTGCGGCTGCAGGAGCTGTGATATGCCAAAGAGTTCGCCCTACAATCCATGATGTTATCACCTCAAAGATAAGAGCCTACTCTGAAGAAACTTCAAAGTCCAATGTAAACAAAGCTGCAAATGAAAATTCTGATGTGTCACACTCAAATGGACGTGCTGCTCGTTACCAACTGCTCAAACAGAAGACGAAAAATGGTGCATCACTAATGGCAAGTCAACTAGTTGTCAGTCCCATCTCTCCAGCTATGGCACCCACTGGAGATGCTCAGTGTGCAGCTAGTCAACTTCTTAGTGCAATATTTGAATGCCTGGTAGACATTCTTGAGAACCATATTACTGTTGGAGAGCTTCTTGAACAGAAATCATCAACTGAAGTTGATAATGCAAACACTCCTCACATGGCAAATGGGGATGCAAGCTGGAATCCAGATTCTGAATCTTCCCAGGCTACTGGTGGTTTTACTGTCGCATTCTCTTTGTCAGTTGTGCAGAGTGAATGTCAGCAGCTTCTGTGTGAAATTTTGCGGGCAACTCCAGAGGCTGCTACTGCTGATGCAGCTGTTCAGACAGCTAGGCTTGCAAATAAGGACCCAGTGAAGGAAAAGAGGGATGGATCAGAAGGCCTTTCTTTTGCTTTTCGCATTACGGATGCAGCAATCACTGCGCCAAACGAAGGTCAAGGATGGCGAAGAAACTCAACAGTACCACAAGAAGGCTATGGAACAGCAAGTGTCATACCTGACCAAGGGATTTTCCTTGCAGCATCAGTTTACCGTCCTGTATTTGAGTTTATGAATAAAATTGGACTGATGCTTCCGCAGAAATATTGGCAACTTGGGAATGATGGGCTATTGGCTTTTGTGAACAACTTCTTGAAGGAGCACTTCTTGCCAGCAATATTTGTAGATTACCGAAAATGTGTTCAACAGGCTATATCTAGTCCAGCCGCATTTAGACCGCGTGTCCATGCAACCTCAGTGTATAGTCCATTAGTCGAAAATGGGCGTCCTGTACTACAAGGGCTTTTGGCTGTCGATATAATAGCCAAAGAGGTACTTGGATGGGTTCAATTGATGCCGAACTATGCCACTGAGCTTGTTGAGTATGTTCGCACATTTTTAGAACGTACACATGAAAGATGCCGTGCATCCTATATGGAGGCTGTCCTTGAAAAACAAAGTTATATTCTCCTCTCAAGGAATGATGTTGAAAGTTTAATGCGCTTGGATCCAGCAAATCTATCTTTACAAAATTCTTTTGGTCAACTTGACCACAGTATTCCAGATGCAGAAGCTGTAGAAGTAGAGATTGAACTAAGTGATCTCCTATTGGATATGTGCCCAATAAAACAGGAAAACTTGATCCATGATGACCAGAAATTGATACTGTTAGCATCTCTTAGTGATTCATTGGAATATTTAGCGGATTCAGTTGAAAGGCTTGGAGAGTCATTCATTAATTCATCTACCATGTTGGAGAACAAAAATCACATCCACCAGGGTCGCCATACTCGCTCAACTAGTGCAATTCCGAAAAGCCTTGCATCACTTGCTAATGAGTATAGAAGGCTAGCAATTGATTGTGTCAGAGTCTTGAGATTGGAAATGCAATTAGAAACTATATATCACATGCAGGAAATGACGAAAAGAGAATATGTAGAAGATCAAGATGCTGAAGATCCTGATGATTTCATCATCTCACTAACAACTCAGATCGCACGTAGGGATGAAGAAATGGCTCCTTATATTGCAGAATCTAAAAGGAATTATGTATTTGGTGGGATTTCTAGCGTTGCTGCTAATGCATCGATAAAGGCACTCGCTCAGATGAAGTCGATCAATTTGTTAGGGGTCCAACAAATATGCAGAAATTCTATAGCACTAGAACAGGCTCTGGCAGCCATACCCTCAATTGACAGTGAAGCCGTCCAACAGAGAATAGATCGTGTTCGGACATTCTACGAACTCTTGAATTTGCCTTTCGAGTCTTTGCTTGGATTTATTGCAGAACATGAATATTTATTTTCTGCAAAAGAATACTTGAGCGTGTTAAAGGTCAACGTTCCTGGAAGAGAGATGCCAATGGATGCTGAACGACGCATCTCTCAGATTTTGGGCCATTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSRTGGRRRIFDGLPIPADKSYLKEGLSRIDEGWAAARFDSLPHVVHILTSKDREGEIQFLKEQSDLIEDVVDEVVHAYHHGFNKAIQNYSQILRLFSESAESITGLKGEMAEAKKLLGRKNKHLGQLWYRSLTLRHVLSLLDQVEDVAKADVIWKLFARKTVVSFYRYFSNFVYQIRVSKYEKVPARIENLMAEKQLYAAVQLHVQSMLMLEREGLQAVGALQDVRSDLAKLRGVLFYKILEELHSHLYNNGEYSSVTLSMVDNEELPTSTATGRLVNSMQPLSRRTRSIKGDNHFGASADGIPKTSSVGGSSFDGPDDDSSIDMHESDGGRSRRDSKSISREVPIFLSCATPDEFLESVTKADASLSVKYLRTLVQCLSMLGKVAAAGAVICQRVRPTIHDVITSKIRAYSEETSKSNVNKAANENSDVSHSNGRAARYQLLKQKTKNGASLMASQLVVSPISPAMAPTGDAQCAASQLLSAIFECLVDILENHITVGELLEQKSSTEVDNANTPHMANGDASWNPDSESSQATGGFTVAFSLSVVQSECQQLLCEILRATPEAATADAAVQTARLANKDPVKEKRDGSEGLSFAFRITDAAITAPNEGQGWRRNSTVPQEGYGTASVIPDQGIFLAASVYRPVFEFMNKIGLMLPQKYWQLGNDGLLAFVNNFLKEHFLPAIFVDYRKCVQQAISSPAAFRPRVHATSVYSPLVENGRPVLQGLLAVDIIAKEVLGWVQLMPNYATELVEYVRTFLERTHERCRASYMEAVLEKQSYILLSRNDVESLMRLDPANLSLQNSFGQLDHSIPDAEAVEVEIELSDLLLDMCPIKQENLIHDDQKLILLASLSDSLEYLADSVERLGESFINSSTMLENKNHIHQGRHTRSTSAIPKSLASLANEYRRLAIDCVRVLRLEMQLETIYHMQEMTKREYVEDQDAEDPDDFIISLTTQIARRDEEMAPYIAESKRNYVFGGISSVAANASIKALAQMKSINLLGVQQICRNSIALEQALAAIPSIDSEAVQQRIDRVRTFYELLNLPFESLLGFIAEHEYLFSAKEYLSVLKVNVPGREMPMDAERRISQILGH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..63#141..353#461..634#681..782#2246..2350#2703..2812#4149..4316#4747..4885#4981..5087#5529..5827#5919..6085#6964..7079#9284..9351#11599..11711#11800..11849#13436..13536#18228..18340#18421..18528#20605..20796#22067..22152#22700..22895#22980..23057#23472..23573#24443..24517#24681..24776#24850..24899#24985..25072#ATGAGCCGCACCGGCGGCCGCCGCCGCATCTTCGACGGCCTCCCCATCCCAGCCGACAAATCCGTAAGCGTCCCCTCCTCCCTCTCTTGTTATCCTGTGCCTCTGGGCGGCCGGAGGAGCCTGAATTGTTGTCGTTGCAGTACCTCAAGGAAGGGCTCTCGCGGATTGACGAGGGGTGGGCGGCGGCGCGCTTCGACTCGCTGCCGCACGTCGTGCACATCCTCACCTCCAAGGACCGCGAGGGCGAGATCCAGTTCCTCAAGGAGCAGAGCGACCTCATCGAGGACGTCGTCGACGAGGTCGTCCACGCCTACCACCATGGCTTCAACAAGGCCATCCAGAACTACTCCCAGGTCCGATCCCCCTCCCATTCTTGCCCGTATTGTGGTCTCGTTTGGTTTAATGATGAATATCTTTGCACTGTGCGGTGGGCTATGTATATATATATATATATATATAGATCCTGCGGCTGTTCAGCGAGTCTGCGGAGAGCATCACCGGGCTCAAGGGGGAGATGGCCGAGGCCAAGAAACTGCTTGGGAGGAAGAACAAGCACCTCGGGCAGTTGTGGTACCGCTCCCTCACATTGCGCCATGTGCTCTCCCTTCTTGATCAGGTGGAGGATGTTGCCAAGGTCAGTGCATACGCTTCACCTGTTTCAATCATTCATTATGTTTCAGGCAGATGTAATTTGGAAACTGTTTGCCAGAAAAACTGTTGTTAGTTTCTATCGATATTTTTCAAACTTTGTGTATCAAATACGTGTTAGCAAATATGAAAAGGTTAGTCTTATAACAACCAGTTTTTTTGGGAGAATTGTCAACTAGCTACCTATAAGGGTCTCAACTCTGAAAACTGGGGGATGGAGCACTCGCCCTCTAATAGCAACGGCAGGGTTTCTCCCTGTTGGGCTAATACAGGCTTTAGAGGTTTAACCCTAACTTTTGATATTCATGAATTGATCCCTAATAGAGTACTTGGGTAGCCAGCCACGAAACTATTCTCTAATATTATAGGAACAATGCAATCTCTATCTCTAGTTTACTAATAAACCTCATCTCTTTTCTAACTAAATAATGTCTCTACCTTTATTTGAATTATTATTCCTATACTATCCTGCCTAACTTGCCACATACACTAGCCTATGACCATAATAGCATCGAACAATTGTTCTGCCAAAATACCTTAGTGCTGATGCTATCCACTCTAGCTAACTAGCATAACTAAATGTTAGCCTTCTCAAAACTCCCACAAAAACATGTTTTGGGTAAACAATTTAGCAGTGTTCTAAAAGTCGGCGCTAGGTGCCCTGTTGTTGTCGCGATTAGTCATTAGATGATGAGCAACCTTGGGTGCTCTTGTGTTGCTATTTTGGTGTTATATTGTCTAACTTTTATGTACATACCTGCTAATTTCTTGGGCTTTGCCGGTTGATCTGTTCTAACCTCCTAGGTGCCCGGTAGGTATCGCCTAGGCAAGGTCCTCTAGCACCAGGCGCCTTCTTGAACCATGCAATTTAGTTGCTATTTATTGTTATTTATGCTGTTGGATGCTCACATGTAAGTTGGATGGTCAAATAACTTTCACCCGGTATAATAAAACTCTGTTAAAAATGTGTTTTTGAGGATGAGGCTCTTCGTTTGAGCTATATGTCCCTCTTTTTTTTATGCAAGTATTCTACCAGTAGATTCTGTTTATATTATTATGTACTAGGACATTGAAAGTAGGATCTTATAAACAGGTTATTATTTTAACATTTACGAGAACCACATTAAAGCTCATCACTTTGGTATACCATGTTGTTTTTATGCATGAATCTGAATTGATTTGCATGTATTAAAGCTGAAAAACTGAATCTCATTAGTTGTATGATCTAATAATTAGCAGGTCAAGATTATATAGTAATTTGGGAATTCATTGTTTCTTGCTTTCATCTAATTGATATGCTGTTCACCTTATAAAGCTATGCAGTCAGTCCAAACAACCATTAAGCAATTTAAATAGCATTGTTATCTCTAAGTGGTTCAGGGCCAAAAAACATTGAATTAACTAAACAATAGCTACGACCCGATCTGTTGTAGGACTGGTTGGATGTCTGGATATGGTTAGCAGACTGCAAGGTTGCTTTATTCCTTTGCACATGGCAGCTCCTTTTATCCTTCTTGTTTCAATGTCTGACCTTATCTTGCGAGTTCACAAATTTTAAGAAATTGTTATATCCCTAATAAATTGGTGAATCCAGCAGGTTCCTGCTCGAATTGAAAACTTGATGGCAGAGAAGCAGCTCTATGCTGCAGTGCAGCTGCATGTCCAGTCAATGCTGATGCTAGAGCGAGAAGGCCTTCAAGCGGTTAGTATTAATATACATTTCTTGTGATAAACAGGCTACTATTACCATTTGCACCATGCCTGTGATAATGCAGTGTGTGCACCATGTGCCAGAGTTTAGAAGGCGATAATGTTCTTTTTCTCTAACCGGGTTAAGTAGAGATTCCTTGTGACGGTGGATATTTCTTTGTTTTTTTCTCTCAAAGTGAGGATGGAGTGTATTTCAGAGGTTGATTAACTTAATTATTTGTACGTACCATCTTGGCTTTGTTTCCTATATGCTGTACCTTGAGATGGCTATTAAAGCTATCATGAGCTGAGTGCGTATTATTTCTTTGATGATAGCAATATCACATACTAATAAAGTTTTAAAGGTAGGTGCTCTTCAAGATGTTCGCTCTGATCTCGCAAAGCTGCGAGGTGTACTATTTTATAAAATTTTGGAAGAGCTGCATAGTCATCTATACAACAATGGAGAATACAGGTACGTTCTTATGTCGGATTGTTCTCATTTTGTTATAACAAATTGCGGTGTGTGTCAACTTGCCAATGTGTGCGATTCAGTAGGACTTGCAAAATGAGCAACCATTACAACTACTGATGAATGGGTTGATTTAGGACAATAACTTTAGAATTGAGCAATCCAGTACTACATGGTTATTGGGTGCTATATTGTACAATGGTTTGCAAGTTGAAGAATCTAGTACAACATTTGTGTGAGTAGGCTTGGATGTGCCATATAGGATAATTGGCCATGCCAATAAGACACACGGGTGAGTTGGTTATGTGAAGCACACAGTGTGTCAGATATCGTCACCTACCGTTGCAACTTGTTACCGCCATGCTGTGTCATGAAGGGCAACAATCAAGAGGCGAAACATAATATGAAAAACTGAAATAAAACCTACATGCCATTTTGTATATTAATCAAATCTATGGTAATGTGGCTTGGTAACCTATTTGGCTGTGCCTAGATGACCTCCTGACAATATACCGCTCATCAACTTGTACCTGGATTGTTCAATTTTCATGTTTGTGTATAAACTTTTAGCACTCGCCAAGTTCTTGTGATCACTCAATTTTTCAGTTCATGTAGCTAATTATACCCATGCAACAAGTTGTTTTACTAGTGCTTCTTCAATTTTTGGGCCATTTTGGTTTGATGCCCCACCAAAATTTTGGTAGTTCGAAAGTCTGGGCATCTTTTGGCACTACCGAAATTTGGTAGGGTGAAGTTGCTCTGATCTAATACATGGTGTTGGGAAAAATTGGCACCAATCCAAACATGTAGAAAAGTTCTATTGAAAGTGCCAAAGATTTGGTAGGGCAAATTTTGGCACCAAACCAAAACAGCCCTTCAAGTTCTCATACTAATGAAGCGGCACCTGCTTTTCAAGCTATTGTACCCATGGTGCAATTTACTGTCTTTCTTTATATGCTTGCAGTAACTATGAACTTGCTTATAATGGTGTGAACACCAATGACTATGTATTGTGCTGTGCAAATATTTTTTTTCCTGTTCACATCTTGTTAACTATTCTGGCATTGGTCACATCTGTTAAGTATCATCACTTTATTTGTCTTACTACATGTGTTGCTCTTTTGGTAATTATCAGTTTGTCACACTTATATTCAAGTTATTATCACTTTTCGATGTTGGTTTGACAACTCTCAATGGTCACAATATGCGTTAAATGATTATCTCTTTTAAATGTTGGCTTGCTAACTATTTTGCTAATGCCACTGCATGTTTCATATGCTTATTTCCTAAAATTCTGTCTCTGATCAACTACTGTTTATTCCAATATTTCTTTGTCCAGCTCGGTGACTTTAAGCATGGTTGATAATGAAGAACTACCAACATCTACGGCTACTGGTCGATTAGTAAACAGCATGCAACCTCTGTCCAGGAGAACTAGGTCAATTAAAGGTGATAATCACTTTGGTGCGTCAGCAGATGGGATTCCTAAAACCAGTTCTGTTGGAGGGTAGGTTCAACTCCCTATCTGCTTCCATGTAAATATGATAATGATTTTGTTTATCTCAGTGCAGAAGCAGATTTCGGCTACTTCATATTGTGCTCAGAGGTTTTGAATTTTGATGCATCATATGACCTTGAATATCTGCTACATGCGAATAGTACTGTTTTTGAAACTAATGCTTGACAAACACATATATGACCTTTCATCACTTAAAAGTTTAGCAGTACAACCTTATGCATGTAACAGGTGCGCGGAGTTGTTTTAAGCTATCCCTATTGTTTTATCTTGTGGGGTTTCTTTGACAAATTACATTAATCATTACTTCTTTTTTCTATGATAATGAATTACTCATAATCATATAT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