Difference between revisions of "BGIOSGA027214"
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Revision as of 17:06, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027214 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027214, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28732 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027214-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027214-PA |
| Length |
17440 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:14183874..14201313 |
| Sequence Coding Region |
14201166..14201313,14199048..14199144,14198831..14198927,14195000..14195161,14194666..14194872 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:14183874..14201313 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:14183874..14201313 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGTCGGCGCCCGACGAAGCCCAAGCGGGTGTCACCACCGGAACCGCCGATCATTCCTCCTGCAGCGGCGGCAAAGAGTTTCGGTTCATCCTGTCACAGGACATCAGCCTGCCGCTGTCGTTCCGCGTCAACCGCTTCGTGCCAGATCGCACCCTGTTGATTGAAAGAAGTGCTCCAGTGCTCTTTGTTGAGTGTACACTATACATTGATGGAGTACAGTTTGGATTGTCCACAAATACAAGGTTGAAATCTTTGGGATCACCATACTGCTGGAATGAGCTTGTAACATTAAGTGCCAAATACAGAGACCTAACGCCCTTCTCACATCTTGCATTCACGGTGTGGGATATGTCATCTGGTGAAGACAACATCTATATTGTTGGTGGAACCACTATATCTCTTTTCAATAGCAAAAACCAACTTAAAACTGGGAGGCTGAGGCTGAGAGTATGGCCCAATAAAATGGCAGATGGAAGTCTCTCCACCTCTACCCCTGGCAAGGTTCCCAAGACCAAGAGGGAAGAAATAGAGAGGTTGGAAAGGGTTGCTAACCAGTACATCAGAGGGCAGATACCACATATAGGTTGGCTAGACAATCTCATTGCAAATGCTGCTGATAAACTTGAGAAAGAGAGTGAGAGAACTGAAAATTTGCATTCTAGCCTTATTGTTGAACTATGCAGCTTTGAACACAGAGTTGTCTTTCAGGAATATGGAGCAAAGTTGCATACATCAGTCCCTTCATCCTTAGTGGATATATCTAAGAATAAACTTGTTATTGCATGTGATCCTGAGATTGGGCGAATCAATCCATCTGAGCATAAACACTCTGTGCTTGCTTGGAGCTTGGCTCGTGGAGTAAATGATAGAGAGATGAAGCCAAGCTCAGTTGACCGAAAGTTAATACAAAACATCCTCAAGTATCCACCCACACGCACTTTAAATGTGGATGAAAAGCAATTGTTGTGGAAATTTCGTTTCTATTTGACATCTGAGAAGAAAGCTCTTGTAAAGTTCCTCCTCTCTGTGGAATGGAGTGACATCCAGTTCATGGTTATAGAGATATATCGTTGTGCAAACACAAATTTCAGTACTATAGTCACAGCTACAGAAGCCAAACAAGCTGTTGCGTTGATTCCAAGGTGGGAATCTATTGATGTGGCTGATGCATTGGGGCTTCTTTCACCAGTTTTTCAAAATGAGGAAGTTCGTGCTTATGCTGTCGGCGTGCTTGAAAGGGCCAGCGACGAAGAACTGCAATGCTATTTGCTGCAACTTGTACAAGGCCTGCGGTTTGAAAGATCTGACAGATCTCGTCTAGCACACTTCCTTGTGAATCGGGCTTTGTCAAATTACGAACTTGCTAGCTTTCTTCGCTGGTATTTAGTTGTTGAGCTTCATGATCCTTCTCATGCAAGAAGGTATCTATGTACATATGAGATGCTTGAAGATGCTATAATGAGATCAGTACATAAGGAGGAAAATGGATTTCAAGTGTGGCAGAGTTTGATAGAGCAGGCAGAACTCACTGCTCAGTTACGTTCTATAATGAAGGAACTATCAAATGTCAAACATGACGCACAAACTAAAGGCAGGATATTAGAACAGTTATTCTCCGGAATTTTCAGTGAGCTTAAAAACTTCAGTGAGCCAATTCCATCTCCATTAACACCGACTGTCCTCCTTGACGGAATTGTGCCTGAAGAGTCATTGGTATTCAAAAGTGCTAATTATCCATTGTGTATAGCATTTAGTACTGTGAATGGGGGTACATCGAAAATGATTTTCAAGAAGGGAGATAATCTCCGCAAGGATCAGTTGGTTATTCAAATAATCTCTTTGATGGATCGGTTGCTCAAGTCAGATAATCTAGACTTACACCTTACTCCTTATCAAGTTCTTGCGACTGGTCTAGAAGAAGGGTTGGTTGAGTTTATTCCTTCAATTTCTGTTGCAAAGATTATACAAAAAACGGGCAGTATAGAAAGTTACCTACAAAAGTGTAATCCGGATGAAGATGGCCCTTTTGGTATAACTGCCCAATGTTTGGAAACTTTTATAAAAAGTTGTGCTGGCTACAGTGTCATTACATACATACTGGGGATTGGAGACAGGTGGCTGTGGTTAAAAGGGAAGACGCCGTTGGGGACCGAGGTGGCTGGATCGGGCTTAATGGTTAGATCCGCTGTACTTCTGGAATGCATTTTGGTTCGAATATGGCCCTTTTGGTTCGAAGAAAGCTATGAGTGCCATGGACAGGACAACGACAAGCTGGTTGGCAATGCTGGTACAGATGGGGCGCGGCGCTCAATCTGGGGCCTAAATGCTGCTGGATCTGAGGTGGCCGTGCCCGAATCTCACTTGCAGGGGCATCTTGACAACCTTCTCCTACAAGACGATGGAAGACTTTTCCATGTTGACTTCTCGTATATGCTTGGGGAACAACCACATCGATTTGCACCACCATCACCACCGATGAAATTGTGCAAAGAAATGGTTGAGGCCATGGGTGGTACTGAAAGTGAATACTATGCAAGATTCAAGTCCTACTGTTGCGAGGCATACAACATATTACGAAAGTCCAGCAACCTCATACTGAATCTTTTTTATCTGATGACTGGATCAAATATTGAGAGTATCACAGACAAAGGGACTTCTAAGCATGTGCTCAGGGTGGCGAGGAGGCAGAGCTTGAGCTTGACCACGTTAGCACATGGAGGAGGTGCTTGGGGGGCATGGCGGGAGCTGGAGCGGGAGCTTGAACTTGCAGCAGTTGGGGAGACGACGGGGGTCCAGGGGGAGGGGGGAAGGGAGGGCTCGAGTTCACTGACGCCTGGAGAAGGAGGCACTCTGGGATGTGGCGGGAAGCCAAAGCTCGACCTCGTCGGCGCATGGAGTGGGGCAGGCTCAGGGACATGTATGTGGCGGGAAGCCGAAGGTCCAGCTCGCCAATGCATGGAGAAGGAGGCACTTGGGGAGACGGAGTTCAACCTCACCGGTCGGGAGGCGGAGCTACAGCAAAATTTCCGGTTGGATCTAGACGACGAGGATGCTATACATTTTCTCCAGGGTCTTATCAACGAAAGTATCAGTGCTTTCTTCCCTCAAGTGGTTGAGACCATCCATCAATGGGCACAGTCTAGGCGTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSAPDEAQAGVTTGTADHSSCSGGKEFRFILSQDISLPLSFRVNRFVPDRTLLIERSAPVLFVECTLYIDGVQFGLSTNTRLKSLGSPYCWNELVTLSAKYRDLTPFSHLAFTVWDMSSGEDNIYIVGGTTISLFNSKNQLKTGRLRLRVWPNKMADGSLSTSTPGKVPKTKREEIERLERVANQYIRGQIPHIGWLDNLIANAADKLEKESERTENLHSSLIVELCSFEHRVVFQEYGAKLHTSVPSSLVDISKNKLVIACDPEIGRINPSEHKHSVLAWSLARGVNDREMKPSSVDRKLIQNILKYPPTRTLNVDEKQLLWKFRFYLTSEKKALVKFLLSVEWSDIQFMVIEIYRCANTNFSTIVTATEAKQAVALIPRWESIDVADALGLLSPVFQNEEVRAYAVGVLERASDEELQCYLLQLVQGLRFERSDRSRLAHFLVNRALSNYELASFLRWYLVVELHDPSHARRYLCTYEMLEDAIMRSVHKEENGFQVWQSLIEQAELTAQLRSIMKELSNVKHDAQTKGRILEQLFSGIFSELKNFSEPIPSPLTPTVLLDGIVPEESLVFKSANYPLCIAFSTVNGGTSKMIFKKGDNLRKDQLVIQIISLMDRLLKSDNLDLHLTPYQVLATGLEEGLVEFIPSISVAKIIQKTGSIESYLQKCNPDEDGPFGITAQCLETFIKSCAGYSVITYILGIGDRWLWLKGKTPLGTEVAGSGLMVRSAVLLECILVRIWPFWFEESYECHGQDNDKLVGNAGTDGARRSIWGLNAAGSEVAVPESHLQGHLDNLLLQDDGRLFHVDFSYMLGEQPHRFAPPSPPMKLCKEMVEAMGGTESEYYARFKSYCCEAYNILRKSSNLILNLFYLMTGSNIESITDKGTSKHVLRVARRQSLSLTTLAHGGGAWGAWRELERELELAAVGETTGVQGEGGREGSSSLTPGEGGTLGCGGKPKLDLVGAWSGAGSGTCMWREAEGPARQCMEKEALGETEFNLTGREAELQQNFRLDLDDEDAIHFLQGLINESISAFFPQVVETIHQWAQSRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
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