Difference between revisions of "BGIOSGA027240"
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Revision as of 17:06, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027240 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027240, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1212_C09.3 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027240-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027240-PA |
| Length |
13611 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:13276275..13289885 |
| Sequence Coding Region |
13289847..13289885,13284500..13284631,13283324..13283441,13282711..13282791,13281744..13281847 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:13276275..13289885 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:13276275..13289885 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCATCACCGTCACGTTTTCCATCTTCGTTCCCATTTGAGATCATGGAGAGTAGTTCTTCAGATGTTCAAATGTCACATTGTGCTGAGGACTTGAATAGTGAGAGTACAATCGAGATCAAAATAAAGACATTGGATTCTCAAACATACAATTTGCGTGTCAATAAACGCGTGCCAGTGCCTCTGCTAAAGGAAAAAATTGCCACTGTAACTGGAATATTGTCTGAGCAACAACGTCTGATTTGCCGTGGGAGAGTTCTAAAGGATGATGAACTCCTCTCTGCGTATCACGTGGAAGATGGCCATACATTGCATCTCGTGGTTAGACAACCAGGACAATCCGCTACATCAGGAAATGCTGGAAATGAAGGTACCACATCAAATCCCGCTCGTCGTCGTGGTCCCACTATGACTCGCAGTATTGTACTTGAGGCTATTAATGTGGGTCAGGGGAGTGAACTCAGTGTTGCACAGAGTGGACCAGCACCTTCTGATGCCAGACCTTCAGAAGGTGCACAATCTTCAACGCAAAATGGTGTCAGGGCTGTACTTGATCAAATGCCGGTTCCACCACTTTTCCAGTCTGAAACGTCAGTTGGGTTATCAGAACCAAACGTCATTCCTGATTCGTTGACCACAATTTCTCAGTACATTAACTTTTTGAGAGACTCCTTTAGAAGGGAAGGCTTCCTCGAAAATGGACAAACTCTGAATAATGCTGACCATGGAACTGCAGGAAGTGCCCATGGAGGTGGTACTCAAAATCATGAAAGCCAGCCTGATTCAGCTTCGGCGCATGGGCTTCCTACTGCAGCATTGCTTGCTGAAACTATGCACTCTACTAGACAACTTCTTGTTGAGCATGCTGGAGCATTGCTATCTCAACTACCAAATCAGCTAGGAGATATTGTGAATGTAACTGATGCTACAACACGGAGGAACCTTCAAAACAGTGTAGTCAGATATGGAGTTCTCATCCAATACCTTGGTTCATTACTTCTAGAACTTGGCCGCACGACAATGATGCTGCGTATAAATCCTGCAACTGTAGGAACAGGATCTGTTCAAGTGGGCCCAATATTTTCTAGTCTTACTTCACATCGCTCTGTTCTGCACCCAAGAGATATTGACATCCATGTCCGCACGAGTGGGTCTGTGTCTTTAACTGGTACTAACCCACCTGAGCGGGTTGAGGAACATCAAACACAAGATCGTACAGATAGAAGTGCAAATGCTTCACCTGCAAACAGTAGTGAAGCATTTGCCAGGGGTTACAGCCGAATTCAACAAAGAGCATACACTAACGCTCAAGTTGCCCATAGTGCTAATCAGATACCGAATCCACAGACATCTCAGTATCATGAAGCAGGTACTCTAGGATCTCCTGTTGATATCAATGCAGAAAACGGCACTCAGACTTCCCCTGGGGAGCAGAATGGCCAGGGGCCTTTTTCTCAGTTGATGGATAGTATCCCTTGGATTGCATCACTCTTTTCTGGGGAAAATTCTCGAGTAAATGGCGCAAATCAGCATGCACCGGCTTCTGCTGAGCAGGTAGATGGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCTAGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGTGCCTCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCCTTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGAGCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCTAATTCTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASPSRFPSSFPFEIMESSSSDVQMSHCAEDLNSESTIEIKIKTLDSQTYNLRVNKRVPVPLLKEKIATVTGILSEQQRLICRGRVLKDDELLSAYHVEDGHTLHLVVRQPGQSATSGNAGNEGTTSNPARRRGPTMTRSIVLEAINVGQGSELSVAQSGPAPSDARPSEGAQSSTQNGVRAVLDQMPVPPLFQSETSVGLSEPNVIPDSLTTISQYINFLRDSFRREGFLENGQTLNNADHGTAGSAHGGGTQNHESQPDSASAHGLPTAALLAETMHSTRQLLVEHAGALLSQLPNQLGDIVNVTDATTRRNLQNSVVRYGVLIQYLGSLLLELGRTTMMLRINPATVGTGSVQVGPIFSSLTSHRSVLHPRDIDIHVRTSGSVSLTGTNPPERVEEHQTQDRTDRSANASPANSSEAFARGYSRIQQRAYTNAQVAHSANQIPNPQTSQYHEAGTLGSPVDINAENGTQTSPGEQNGQGPFSQLMDSIPWIASLFSGENSRVNGANQHAPASAEQVDGRNHGAPEVSGVSDEGLRFASLVRQIMPFISQVESHHQSASAVSSSTPSQAAHGNLNTARAGPSHSRSSHQHNRDPVDGPNSKRQRTSE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..39#5255..5386#6445..6562#7095..7175#8039..8142#8362..8502#8593..8677#8761..8942#9707..9875#10555..10650#11374..11506#11640..11728#12753..13093#13165..13271#13599..13611#ATGGCATCACCGTCACGTTTTCCATCTTCGTTCCCATTTGTATGTGGAACCCACCTGTCATATTCATCTTCTTCCTCATCCCCCTTTATTTTCTTCATTCGATCGAGTTGTTGGCACAAGGTGCGTCAACAACTGACAGAATGACGCTTCCTTGGGCCACTTGAGCAACAATTGTGGAGGCAAGACACGGACACGCGGTGCTGTAGGTTCGTTATTACTCGCATCTTCTCCTTCATCATCTCGAACTAACAGAACAGCTTCAACAACAACTGTAGACATGAAATCAACAATGAGCCAATGACAAGCAGTGCATGTGGAGAAATAACAATGCATGGATCTCAATCACCGAACCTAGAACAAGAGGACCCCCCCCCCCCTCCAACCTATACACATCGGAGGCGAAGGTAGTGTCGCCTCTATCGTCGACCTCCTCGGCTCCTCAGCGGGAATGTCTTCCCGCTGCGGTCCTCCCCTCAGTTGGTGCCATCCCATCGTTGCTATGGAAGCGAGGAGTCCGAGTCTGAGCCGTCGGAGCTGGAGCCCGAGGCATCCAAGCTGGAGATGGACTCGATGAACGCGATGCGGGCGAAGGACGGCAACATGATGAAGCAGGAGGGGCACACACCCTGCGCGTGTGCGATGGCCACCAACTCCGCCACCTGAGGAAACACGTGTAGGCACTTCGGCGTCTCCACTACCCAGCCAGTCCAGCCACTCACCTCACCCCCGAGGCCTAGTGCTTCCTCCGCATCGTCGACGAAAGTAAAGTGAACTCAAAATAAAGTGAACTGAGTCCTGCTAGTTGCACAAAACATGTACTCCTTAATCACAGTTAAATAAAAAAATAAAAAGTAGTACATTTAATATGAAAATCATCTCTAAACCTTAATTGGTGAAATAAGTATTAAATCACAAATTATAAATGATGCAATTTATAGAAAATACGCTAAAATAAGACTTGGTTAGGCCAGCAAGGCTATAACATTATTCATGTTACCCAAAACTCAAAACACTTAGGCTGTGTTCATTGTTTTGAGTTGGGAACTCATTCCCTAAGCACGGAAAACGGAGCAACATATTTTCTATGATTAATTAAGTATTTACTAATTTTTTAAAAAATGGATTAATATGATTTTTTTAAGCAACTTTCTAGAAACTTTTTGCAAAAAAGTGACGTTTAACAGTTTGAAAAGTGTGCGCGTGGAAAACGAGTGAAGTGGGTTGTTATAGTTGGGGAAAGAACTCAGCTTTAGTACATTTAATGCCTCTCAAGTTGTTATAACAAATTATCAACATAAAGCACATCCCAATTTGTAAAATATGTAGAAAATTCATATTACCTCCAAATCTTGTGAACTCAGTTTTGTTAGGTTAAGAACTATTATCTTTCTTTAACAAGAACATAAAGTAACACATTCTGTACAAATAAACACCTAAAAATATAGGGAAATTACTAACATTGGACACGCTACAAATTGTAAAATACATCAGAAAATCATACAAACTCCAACAATTATGAAACCAAATGGGTTAGTCTTAGAAAACAATTATCTTGACCTCTGCAAAGTCAACTTTAACCAAATCACCTATAAAAAGTATTTCACGACACTACCTAGATAAATAATATATTCCCTCCGTCCCAAAATATAAACATTTTTAGGCCTTCTTTGTTTAGATTTATAAGCTAACTTATAAGCCAAAATGTCTAAGCCTAAACAAACAAGCAGCTTATTCATTTGGCTTTTTTGAAGCCATAAGCCACTCTAACACTATTAAGCCAAAAGCTAGGTTGGAGAAGCTTTTTTGACTTATGTGAGGTAGATGTATGACTCAACTACTAAACTTAGGACATTAAATCCACCGGCTTATAAATCATATAAGCCAATAAGCTGACTTAAAGTCTAGGCCAATAAGCCTAAGCCTAAACAAAGAGGGCCTTAATAGTGTTAGAGTGGCTTATGGCTTAAAAAAAGCCAAATGAATAAGCTGCTTGTTTGTTTAGGCTTAGACATTTCGGCTTATAAGCTGGCTTATAAGTCTAAACAAAGAGGGCCTAAAATTGTTTATATTTTGGGACGGAAGGAATATATTATTTATCTAGGTAGTGTCGTGAAATACTTTTTATAGGTGATTTGGTTAAAGTTGACTTTGAAGAGGTCAAGATAATTGTTTTCTAAGACTAACCCATTTGGTTTCATAATTGTTGGAGTTTGTATGATTTTCTGATGTATTTTACAATTTGTAGCGTGTCCAATGTTAGTAATTTCCCTATATTTTTAGGTGTTTATTTGTACAGAATGTGTTACTTTATGTTCTTGTTAAAGAAAGATAATAGTTCTTAACCTAACAAAACTGAGTTCACAAGATTTGGAGCTAATATGAATTTTCTACATATTTTACAAATTGTGATGTGCTTTATGTTGATAATTTGTTATAACAACTTGAGAGGCATTAAATGTACTAAAGCTGAGTTCTTTCCCCAACTATAACAACCCACTTCCCTCGTTTTCCACGCGCACAATTTTCAAACTGCTAAACGTCACTTTTTTACAAAAAGTTTCTAGAAAGTTGCTTAAAAAAATCATATTAATCCATTTATTTAAAAATTAGTAAATACTTAATTAATCATAGAAAATATGTTGCTCCATTTTCCGTGCTTAGGGAATGTGTTCGCAACTCAAAACAATGAACACAGCCTAAGTGTTTTGAGTTTTGGGTAACATGAATAATGTTATAGCCTTGCTGGCCTAACCAAGTCTTATTTTAGCTTAATTGGAGCTATAGCGTATTTTCTATAAATTGCATCATTTATAATTTGTGATTTAATACTTATTTCACCCATTAAGGTTTAGAGATGATTTTCATATTAAATGTACTACTTTTTATTATTTTTATTTTACTGTGATTAAGGAGTACATGTTTTGTGCAACTAGCAGGACTCAGTTCACTTTATTTTGAGTTCACTTTACTTTCATCGACGACGCGGAGGAAGCACTAGGCCTCGGGGGTGAGGTGAGTGGCTGGACTGGCTGGGCAGTGGAGACGCCGAAGTGCCTACACGTGTTTCCCCAGGTGGCGGAGTCGGGGGCCATCGCACACGCGCAGGCCATGTGCCCCTCCTGCTTCATCATGTTGCCACCCTTCGCCCGTGTCGCGTTCATCGAGTCCATCTCCAGCTTGGATGCCTCGGGCTTCAGCTCCGACGGCTCAGACCCAGACTCCTCGCTTCCATAGCAGCGATGGGATGGCACCAACTGAGGGGAGGACCGCAGCGGGAAGACATTCCCATTGAGGAGCCGAGGAGGTCGACGATAGAGGCGACGCTACCTTCGCCTCCGATGTGTATAGGTTGGAGGGGGGGGTCCTCTTGTTCTAGGTGCGGTGATTGAGATCAATGCATTGTTATTTCTCCACATGCACTGCTTGTCATTGGCTCATTGTTGATTTCATGTCTACAGTAGTTGTTGAAGCTGTTCTATAAGTTCGAGATGATGAAGGAGAAGATGCGAGCAATAATGAACCTACAGCACAGCGTGTCCGTGTCTTTAATTGTTGCTCAAGTGGCCCAAGGAAGCGTCATTCTGTCAGTTGTTGACGCAACTTGTGCCAACAACCCGATGGAATGAAGAAAATAAAGGGGGATGAGGAAGAAGATGAATATGACAGGTGGGTTCCACATACAGATGGGAAAGAAGATGGGAAACGTGACGGTGATGCCATGGTTTCGATTTTGTAAAAAAATGAGTTGCACGGCTACGAATAGATGAATTGTAATGGCATTTATCTAAATAGACACATTTGCAATGGCATGAATCAAATTAACCCAACTTTTTAGGAAAACGCTGGGGATCAGGAGCCCGACGGTGCCAGAAAAATTGGCCCCCTCACGCGCGCCTCCGCCTGGCTCCCACGCCTCCCCAACACTAGGGCCCCATTACAACAAATCCCCCACATATTACGGAAACGCCCTATTAAGGGAATTCGTTTCATTTTTTTCCACTAACAATGTTTCAGCTAGTGTACTCATAATGTTTCACTATGTATAGATAAAATGTTGCAGTGAATTGGAACATTCTGGGGATATGCTGAAACATTGTTTTTATATAGGGTGAAACAACGCTTGATTTTTTTTGGAAACCATTGTTTCATACGTTGTAGCAAAATATTTCATGAGATGATTTGGTTGTGTTTCAGCTTTTTAAAAGACTGAATTTTTTTGATTTGTGGAGTGAAACATGTTCGATCTACTTGGTGTTCAAAAATCGGGTGCCCGATTGAGAGGCACCTCCACTTTTTAAGGAGCTATTTGTAAAATAATTTTTTAAAAGGACCTAGAGGTGAACAATCCATGGCTAAACCCACCGCGCGGGGCGCGCCCGCAGCGAACCAGGCGCGCATTAGGCGCCCCCCGAGTTTCTCCCTTCCCTTGTTGGCGTAAAAGAAAAATCTCCCCGTCTCGTCTCCTCCGCTCCTTGCGCCATCTCGCGGCTGAACAGGGGAGGGGGAGGGGCGCCGATCTCCATCCGACGAGCAGAGCAGGGGAGGGGAGGGGGATCCTGGTGAGCATCCACATCCTCTTTCTGATTCATCTCTGTCCCCCACCGGTAGTACTTTTGTCTGGAATTTGCTTGCGTTAACCCTAGCTTCTCTTCTAGATCTGGAAGAAGGGATTAAGAGAAGCATTTCTTAATTCCAGAACCTTAATCTTAATACAAGTAACAGTTTGTTTGTTCCCCTAAAAGTTTGGGGGTTCAGTACTGAACCCCCATGTCCCAAGTTGGATCCGCCCCTGTGGGGAGATTGAATGGTGCCCT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