Difference between revisions of "BGIOSGA027646"

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA027646

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027646, complete gene.

LocusTag

OJ1349_D05.121

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA027646-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA027646-PA

Length

11866

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:3040941..3052806

Sequence Coding Region

3052591..3052806,3052399..3052491),complement(3052137..3052220,3051771..3051943),complement(3050768..3051041
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,3042497..3042603),complement(3041992..3042110,3041790..3041867),complement(3040941..3041174

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:3040941..3052806 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:3040941..3052806 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCTCCACCTCCGCCGCCACATCCGCCGCCCCATCCCGCGGCGGCGCGCGGGAGTGGCGCACGGCGCTCCTCACCCTCCGCGACGAGTCGGTGGTCTCGCCCTCCCCACCGGCGCTCCTCGCGCTCCTCCGCCGCGTCCTCCTCCTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCCCGCCGCACTCCCTCGCCGCGTCCGCCGCCGCGGTCTCCGCCCACGAGGTGGGCTCGGATGTGGCGTTCCTCGCGGAGACGGCCGCGGCGGTGTCCCCCTGCGACGGCGCCGATGATGTGCTGCGTGGCGTTTGCCATCTGAGGCTGGGAGTGTTCTCAGTACGGTTGTATCACTTTGATGTTATCTCAAAAAAGAATTCAGATGGGAGACCATTAGCACAAAATATTCATGATATCATGTACAAAACAAATATGGAGATCGACTCGTCTTGTTTACTGGCAATGCTGAAGTTTCTTGATGTTCTTATGCAATGTTCATTGGAGGGTTCATGTGGTAAGGGCCTCTCTGTTAGGAAAACCGCATTGGACACTGTATCTGAATGTTTACAGATCCTCAGGTTTTTGAGCAAAGATTTTGGCGGAAGTACTTCTTTACCTGAGAATGCACATTTGCTTCGAGTGCTCATCTCAATTGTATCATGCTTGCAATCTGAGCTGAACCTCACAGATAAACCTAATGGTGCTGGTTTTTCTTCCCACACATTTGGACCAATAAATAATAAGAATCCAAATATCTGGGATATGGAAATCTCTGCATTTTCCATGATTGAAGATGCACTATCTAAGATAGCCTCAAGTTTATCAGAAGATTTGTGGCAGTCCATTGTTGAGGTTTTGAGGAAGGTGATGGATTTTTTGACAGCAAGGAACTTTATCATAGAGAGTAGCACTATGTCAAGATTTTATACCTCATTTCTTCGTTGTCTGCATTCTGTTCTTTCAGACCCCAAAGGCCCACTTTCAGCACATGTACCAGGTTTCGTTGCGAACTTGCAAATATTTTTCATGTACGGGCTAAGGTCATCTTCACCACCTGTGATAACTCCAATGGAATATAAAATGGATACAAAATCCAATGCCGGACGATATAAACCCCCTCATTTACGTAAAAGGGGTGGAAAGGGAAATGATTCGTTCGATGGTCGAAATTCTGATAGTGAATCCTCTCGATATGATTTAAGCTCATCAGATTCAGATATGAGTGATAGCGATGGATATGCAAAAACTGGAGATCGTTTCCGAAGTTCAAAGGCTAGATTAGCTGCCATCCTTTGCATACAGGATATTTGTCGTGCTGACCCAAAATTACTTACTTCACTATGGCCATTACTTTTGCCCGAGAGTGATGTTCTCCAACAAAGAAAATATCAAGCTACTCTGATGACATGCTTGATTTTCGATCCTATAATAAAGGTGCGTATTGAGGCAGCATCAACCATTGCTTCCATGCTGGAAGGACAAGCATTAGTTTTGACACAAGTTGCCGAGTACAAGGAGTCATCAAGACGGGGATCTTTCACTACGCTATCTTCTTCACTTGGTCAAATTCTTATGCAGCTGCATACAGGAATGTTGTATTTGATACAGCGTGAAACTCAAACTACTTTGCTTTCAGCATTGTTCAAAGTTCTCATCCTTTTGATATCTGTTACACCGTATGCCCGCATGCCGAAGCAGTTGTTGCCAACTGTAATCACAGATATGCGCAGGAGATTGTTGGACAGACACTCAAATAAGAATGAGCACTATGCTTTGCTGCATTTTCAAAAGAACCACCTTCTTCAAATGTTTTTGAAGTTCTCACTCAAGATGGATGTGCAGGAAATACATGTCAGTGTGAGATTTGGAGCTCTCCAGGTGTTGAGATCAGCAGTTCATAATTATCCAAGCTGTGCAAATATCATTTGGGCAAAAGTTCAATACATTGTTCTTGATTTATTGCAAATGCAAAGCTTGGAAGACCAAAGAGATGCTAATTTTGGGCTTCCTAAAGAAGAATCATCAATTAAAGGAAGATGTCTTGTGGCTGCCATTAAGGTAATAGATGAGTGTCTGCGTGTTTCATCTGGATTCAAGGGAACAGATGACCTCAAAGAATATAGATTGCAAGATATTCAGCAAATTTCTGATTGTACCATAAACAAAACTATCAAATCTGCGCCTCACTTTGAGACTGATGTTCCTGGACCATCACAAAATTTTACTTTGGACATAACTCTCGGAACTAATCGTTGGATTGAGGTGATAGAAAGGCTTCTCCCTCAAGGATTATCACATGGCTCTGCTACGGTCAGGACAGCATCACTGACATGTTTCGCGGGCATGACTTATGATGTTTTCTTCTCCCTGCCAGAAAACAAGAGGGATTATGTGACGTCCTCATCGATTCATGCTGCATTGAGTGATACAGCTCCTGCTGTAAGGTCTGCTGCATGTAGAGCCATTGGTATTGTTGCATGTTTCCCCAGCATACTGTCAAGTCCTAGCCTACCTGGCAAGTTCATAGATGCCATTGAGTTTAACACACGGAATTCATCAACTCCAGTTCGTATCACTGCATCATGGGCCTTGGCAAATCTTTGCTCTTCTATTCGTTTTAGAGCATTAGATACCAATCCCTCTGCAGGTGTACTAGATAAATCAGCCATATCATTGCTGGTTGAAATTGCTTTGCGCCTTGCTAAAGATGGTGAAAAGGTAAAGTCAAACGCTGTTAGGGCTCTTGGATACCTTTTAAGATTTATCAGATTCAATAATCATTCTGACACAGTTGATGACCCAAGTAATTCCGTTCTCTGTGGAGATCCTGTCTGGCTTGAAAGGATGGTACATGCTTTGATGTCCTGTGTGACAACAGGAAATGTAAAGGTTCAATGGAATGTTTGCCATGCTCTTAGCAACTTATTCATGAACGACACCTTGAGACTTCCAGATATGCCTTGGGCATCAAGTGTTTATAGCATACTTCTGCTACTACTCCGTGACTCAAACAATTACAAGATAAGGATGCATGCAGCTGTTGCCTTAGCAGTTCCAGTCTCACGGCTTGATTATGGTAGCTCATTTCCAGATGTTGTTCGAGGAATCGAGCATGTTCTTGAGTCATTGAGTTCCAACAGTTTATCATCACCTTCAAATTTCAAACATAAAGGCAACCTTGAGAAACAGGTTACATTTACTGCTCTTCATTTGTTTAGTTTTGTTTCACCAAAAGATGATCAAAGCCTGAGAGATTTTCTTATCAAGAAAGCATCCTTTCTAGAAGACTGGCTGAAGTCATTGTTCTCATTGTTCAATAATGTTGAGGACCAGCCTTTGGCAAATGAGGCCATAAATGACGAGGATGGTTTCAGCCCAAACGTGGCACAAAAAGCTATGTTGTCTTCTGCTGTGAAGTCCTTGCTCGACATATATACAAGTGAAAATCAGCACACTGTTGCTCAGAGATTTGAGCAATTGGCAAGAAGCCTAGAATTATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASTSAATSAAPSRGGAREWRTALLTLRDESVVSPSPPALLALLRRVLLLSAAAAAPPHSLAASAAAVSAHEVGSDVAFLAETAAAVSPCDGADDVLRGVCHLRLGVFSVRLYHFDVISKKNSDGRPLAQNIHDIMYKTNMEIDSSCLLAMLKFLDVLMQCSLEGSCGKGLSVRKTALDTVSECLQILRFLSKDFGGSTSLPENAHLLRVLISIVSCLQSELNLTDKPNGAGFSSHTFGPINNKNPNIWDMEISAFSMIEDALSKIASSLSEDLWQSIVEVLRKVMDFLTARNFIIESSTMSRFYTSFLRCLHSVLSDPKGPLSAHVPGFVANLQIFFMYGLRSSSPPVITPMEYKMDTKSNAGRYKPPHLRKRGGKGNDSFDGRNSDSESSRYDLSSSDSDMSDSDGYAKTGDRFRSSKARLAAILCIQDICRADPKLLTSLWPLLLPESDVLQQRKYQATLMTCLIFDPIIKVRIEAASTIASMLEGQALVLTQVAEYKESSRRGSFTTLSSSLGQILMQLHTGMLYLIQRETQTTLLSALFKVLILLISVTPYARMPKQLLPTVITDMRRRLLDRHSNKNEHYALLHFQKNHLLQMFLKFSLKMDVQEIHVSVRFGALQVLRSAVHNYPSCANIIWAKVQYIVLDLLQMQSLEDQRDANFGLPKEESSIKGRCLVAAIKVIDECLRVSSGFKGTDDLKEYRLQDIQQISDCTINKTIKSAPHFETDVPGPSQNFTLDITLGTNRWIEVIERLLPQGLSHGSATVRTASLTCFAGMTYDVFFSLPENKRDYVTSSSIHAALSDTAPAVRSAACRAIGIVACFPSILSSPSLPGKFIDAIEFNTRNSSTPVRITASWALANLCSSIRFRALDTNPSAGVLDKSAISLLVEIALRLAKDGEKVKSNAVRALGYLLRFIRFNNHSDTVDDPSNSVLCGDPVWLERMVHALMSCVTTGNVKVQWNVCHALSNLFMNDTLRLPDMPWASSVYSILLLLLRDSNNYKIRMHAAVALAVPVSRLDYGSSFPDVVRGIEHVLESLSSNSLSSPSNFKHKGNLEKQVTFTALHLFSFVSPKDDQSLRDFLIKKASFLEDWLKSLFSLFNNVEDQPLANEAINDEDGFSPNVAQKAMLSSAVKSLLDIYTSENQHTVAQRFEQLARSLEL</aaseq>

Gene Sequence

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