Difference between revisions of "BGIOSGA028211"
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Revision as of 17:11, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028211 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028211, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28276 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028211-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028211-PA |
| Length |
21535 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:8037683..8059217 |
| Sequence Coding Region |
8037683..8038291,8039384..8039449,8039583..8039756,8039845..8039975,8040098..8040174 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:8037683..8059217 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:8037683..8059217 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCCCCTCGCCGGTAGCCGCCTCGGCGGCCCCCGTGCAGGTGCGCTGCGCCGGATGCCGTGGCGTCCTCGCCGTGGCCCCCGGCATGACCGAGTTCATCTGCCCCAAGTGCCGCATGGCGCAGCGCCTCCCCCCCGAGCTCATGCCCCCTTCCCCGCCCAAGGCCTCCCCTACTCCGCCGCCTCAGCCACAGCCTCATCCTCAGCTTCAGCCGCCGCCTCCTCCTGCTCCTCTCCCTCCCCCTTCCCGCCGCTCCGCGCCGCGAGCGCAGGGCGTGGACCCCACGAAGATCCAGCTGCCGTGCGCGCGCTGCAAGGCCATCCTCAATGTGCCCCATGGCCTCGCTCGCTTCCGCTGCCCCCAGTGCGACGTCGACCTCGCCGTAGACCTCTCCAAACTCCGCAATTTCCTCGCCACGGCCGGTCCAGGCTTCGCCCCTCCGCTTCCGCTTCCGCCGCCGCCACCACCGCCGATGCCGCCCATCCCGCTGCCGCACATGCCCTTCCTCCCGATGATGCCACATGTTCCGGTGCCGATGCCGCCGATGGCATCGCCCGCTGAATTGCCCGAGGAGATTAATGAGGTTGCAGTTGATGTTGAGCGCGAGGAAGATGAAGGTGGTACTGTCGGGGAAACTTTTATGGATTACAGGCCTCCCAAGCTATCTCTTGGTCTTCCTCATCCAGACCCTGTGGTAGAAACTTCATCTTTGTCTGCAGTGCAACCTCCTGAACCTACATATGACTTGACTATTATGGATGAATTGGATGAGACCAAGGTGTTATCTTGCTTACAAATTGAAACGATAGTGTATGCTTCTCAGAGGCACCTTTATCATCTGCCTACTGGTGCTAGAGCAGGTTTCTTTATTGGCGATGGAGCTGGTGTTGGTAAAGGCCGAACGATTGCTGGATTGATCTGGGAAAATTGGAAACAGGGAAGGCATAAGGCATTGTGGATTTCCATTGGTTCAGATCTGAAATATGATGCTCGCAGAGATTTGGATGATGTTGGTGCAAAATATGTGGAAGTGCATGCTTTAAATAAGCTACCATATTCTAAGATAGACTCTAAGGCCGTTGGAATCACAACTGGAGTTATTTTTGTAACTTATAGCAGCTTGATAGCATCCTCTGAGAAAGGCCGTTCCCGTTTGCAGCAATTGATAGAGTGGTGTGGGTCTGAGTTCGATGGTCTTCTGGTGTTTGATGAGTGCCACAAAGCAAAAAATCTGATTCCTGAGGCAGGGAGCCAGCCCACTCGAACTGGTAAAGCAGTTCTTGAGATCCAGGTGCCGAGGTGGCAGAGAGCACCGGACAGGTCCCCACGGCTCTTCACGAAGGCGATCCTCGCCGCGTCAGGTGCCGAGGTGGTCGGCGGCGGGGAGGTGGAGAGCGTCAGGCGGCTGCTCGCTCCTCGGTCCTCGTTTCTTCGTCGCCTAGGGACTCCTCGTGGAGATGGTCGGCGGTGGCGCGAGGTGGAGGGAGACATAGGTGTCGTGGACGAAGAGCGCCAGAAAGGGAGGCGGCGGCGACTGCGGTGGTCATGTCCATTGACAGCCGTGCTTGTGGTCGCCGCTGTCAAGCCATCGCTGTCTCAGGAAATGTTACCTGAAGCTCGGGTGGTTTACTGCTCAGCAACTGGTGCATCAGAGCCTCGAAATCTGGGTTATATGGTTCGCCTTGGTCTCTGGGGAGATGGAACATCATTTCAGAATTTTCAGAAATTTCTAGGTGCTCTTGAGAAAGGTGGTGTGGGTGCTCTTGAACTTGTTGCTATGGACATGAAAGCCAGGGGTATGTATGTTTGCAGAACGCTAAGTTATAAGGGTGCTGCTTTTGCTACCGTGGAAGCTCCTCTAGAGGAAAGAATGATGAATATGTATAGGAAAGCAGCTGAATTTTGGGCCGAGTTGCGTGTTGAACTCCTTTCAGCAATTGAATATTATGCAGAAGACAAGGGCAATTCATCTCAGATTTGGCGGTTATACTGGGCCAGCCATCAGCGTTTCTTTAGGCATATGTGTATGTCGGCTAAAGTACCTGCTGTTGTGAGATTAGTGAAAGAAGCCTTAGCAGAAGAAAAATGTGTGGTGATTGGTCTTCAAAGCACTGGAGAAGCTCGAACAGAGGAAGCTATCAGTAAATATGGTGTTGAAATGGAAGACTTTGTTTCTGGTCCAAGGGAGTTGCTTCTTAAGCTGGTAGATGACAATTATCCTTTGCCTCCGAAACCTGATTGCTTTCAACAAGTAGGTGATGAAAAAGTTGCAGAGGTTCAGCGTAAGCGGCACTATGGACCTGATGTATGCTTTAAAGGACGAGCTAGGAAACTCGCAAAAATGGAAGATGAAAGTGATGATGGAACTGATGAATATTCTCTACTTAATTCATGGATTGATATCCTCGGCAAGGAAGAACTCCCTGAGGTCGCCAAGGACTCGAGCGTGACATCGGGCAGGTCCCGCGTGTTGAGCCGCGACGCGAGTAGGGGCTCACGGAGGAGACAGAGAAGCTGCAGCACAATGGCGGGGTGCGATGTGGCAGCGGACGCAGTGAGGAAGGAGTTGAGCATCAGCGGCGACGGCGGATTGGAGAGTGTTGATGGGAAGGACAACAAGCAGCGAGTGAGGGATCCGACGCTGCTCGTCGATCGGGCTGGCTCGGCGACGGGGAGACGCAGGGGCAGCGGACTTACTCTCATCGGCAAGGCGGACCCAGGGGACGGGCTTGGCAACGACGATGTGCGTCACCTTCGGCTGGAAGCAGAGTCAGACCATGAATCAACAGAGTCTGAAGAGGAATTCAATATGTGTCAGATCTGCAACACTGAGGAGTTGAATGCCATTTTAGGAGAAGACGATGTTGCTCCATTGTACTGGTTGCGCCGCACATGTTCACCCTGGTTGTCTGATTCCTCCTTGGACTGGTATGACACTGCAGTGGAAAGAAAGTCGAATATTTTGCAGATTATTCGTTCCTTGGATTTGCCTAACAATCCTCTAGATGATATCATTGATCAGCTAGGTGGTCCTTACAATGTTGCAGAAATAACTGGACGTCGTGGTATGCTAGTAAGAGCATCAGATGGAAAAGGTGTTGTTTATCAAACACGGAACAAGAAAGAAGTAGCATTGGATATGATTAATATTCATGAAAAGCAGCAGTTCATGGATGGAGAAAAGCTTGTTGCAATAATATCAGAAGCAGGATCAGCTGGTGTTTCTCTACATGCTGATCGAAGGGCGAAAAATCAGTTGAAAGTGGCTAATACAAGGCTTCTTTTTACAAATCTTGGAGGTGAAAAGCGATTTGCATCTATTGTGGCAAAGAGACTGGAGTCTCTTGGAGCTTTGACACAAGGAGACCGAAGAGCTGGACCATCACTTAGTGCTTTCAACTATGACAGCACTTATGGAAAGAAAGCCTTGATGATGATGTACAGAGGAATACTGGAACAGGATGGTCTTCCAGTTTTGCCTTCAGGATGTTCTGAGGATCAAGCTAGCCTCCAAGGATTCATCACTAAAGCAAAAGCTGCTTTGGTGTCAGTTGGAATTATCAGGGATGCGCTAATGTGCAATGGAAAAAATGGAGGAAAGCTTACTGGTAGGATTTTTGATTCTGATCTGCATGACATAGGCCGTTTCCTCAATCGCATTCTAGGCTTGGCTCCAGACATTCAGAACAGGCAGCTATTTGATCTTTTCACAAGTATACTTGACATAGTCATTCAGAATGCACGAAGTGAAGGACAGCTTGATTCCGGTATTGTTGACATCAAAGCAAAAAGTGTTAAAATGAAAGAATCACCGAAGACTGTTCATGTTGATAGCTTGTCTGGTGCTTCTACAGTGTTATTTACTTTCACAATCGACCGTGGATTTACTTGGGAGTCGGCAAATGCAATACTTGAAGAAAGGCAGAAAGATGGAGCTGGTTCTTCAGATGTTGGATTTTATGAATCCAGAAGAGAATGGATGGGTCGAAGGCATTACATGCTAGCATTTGAAGGCTCAACAGAAGGAATGTACAGAGTAATCCGTCCTGCTGTTGGAGAAGCTTTAAGGGAAATGCCTTTGGTTGAACTTAAAAGCAAGTACAGGAAGGTTTCATCAATTGACAAAATTGGCAATGGTTGGCAGGAAGAGTATGATGCATCATCCAAGCAGTGTATGCATGGACCCAAATGCAAACTTGGAAGCTATTGTACAGTAGGCAGAAGGTTACAGGAAATCAATATTTTGGGTGGTCTAATACTTCCTGTCTGGGGCATAGTAGAAAAGGCCCTAGCTAAGCAGGTTCGACAAATTCACAAGAGGATACGTGTCGCTCGCTTGGAGACAAATGATAATGAGCGGATTGTTGGACTTATGATTCCAAATTCAGCTGTGGAATCAGTATTAGAAGGTCTGCAATGGGTGCAGGATATTGACGATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGGGGGGGSPSPVAASAAPVQVRCAGCRGVLAVAPGMTEFICPKCRMAQRLPPELMPPSPPKASPTPPPQPQPHPQLQPPPPPAPLPPPSRRSAPRAQGVDPTKIQLPCARCKAILNVPHGLARFRCPQCDVDLAVDLSKLRNFLATAGPGFAPPLPLPPPPPPPMPPIPLPHMPFLPMMPHVPVPMPPMASPAELPEEINEVAVDVEREEDEGGTVGETFMDYRPPKLSLGLPHPDPVVETSSLSAVQPPEPTYDLTIMDELDETKVLSCLQIETIVYASQRHLYHLPTGARAGFFIGDGAGVGKGRTIAGLIWENWKQGRHKALWISIGSDLKYDARRDLDDVGAKYVEVHALNKLPYSKIDSKAVGITTGVIFVTYSSLIASSEKGRSRLQQLIEWCGSEFDGLLVFDECHKAKNLIPEAGSQPTRTGKAVLEIQVPRWQRAPDRSPRLFTKAILAASGAEVVGGGEVESVRRLLAPRSSFLRRLGTPRGDGRRWREVEGDIGVVDEERQKGRRRRLRWSCPLTAVLVVAAVKPSLSQEMLPEARVVYCSATGASEPRNLGYMVRLGLWGDGTSFQNFQKFLGALEKGGVGALELVAMDMKARGMYVCRTLSYKGAAFATVEAPLEERMMNMYRKAAEFWAELRVELLSAIEYYAEDKGNSSQIWRLYWASHQRFFRHMCMSAKVPAVVRLVKEALAEEKCVVIGLQSTGEARTEEAISKYGVEMEDFVSGPRELLLKLVDDNYPLPPKPDCFQQVGDEKVAEVQRKRHYGPDVCFKGRARKLAKMEDESDDGTDEYSLLNSWIDILGKEELPEVAKDSSVTSGRSRVLSRDASRGSRRRQRSCSTMAGCDVAADAVRKELSISGDGGLESVDGKDNKQRVRDPTLLVDRAGSATGRRRGSGLTLIGKADPGDGLGNDDVRHLRLEAESDHESTESEEEFNMCQICNTEELNAILGEDDVAPLYWLRRTCSPWLSDSSLDWYDTAVERKSNILQIIRSLDLPNNPLDDIIDQLGGPYNVAEITGRRGMLVRASDGKGVVYQTRNKKEVALDMINIHEKQQFMDGEKLVAIISEAGSAGVSLHADRRAKNQLKVANTRLLFTNLGGEKRFASIVAKRLESLGALTQGDRRAGPSLSAFNYDSTYGKKALMMMYRGILEQDGLPVLPSGCSEDQASLQGFITKAKAALVSVGIIRDALMCNGKNGGKLTGRIFDSDLHDIGRFLNRILGLAPDIQNRQLFDLFTSILDIVIQNARSEGQLDSGIVDIKAKSVKMKESPKTVHVDSLSGASTVLFTFTIDRGFTWESANAILEERQKDGAGSSDVGFYESRREWMGRRHYMLAFEGSTEGMYRVIRPAVGEALREMPLVELKSKYRKVSSIDKIGNGWQEEYDASSKQCMHGPKCKLGSYCTVGRRLQEINILGGLILPVWGIVEKALAKQVRQIHKRIRVARLETNDNERIVGLMIPNSAVESVLEGLQWVQDIDD</aaseq> |
| Gene Sequence |
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