Difference between revisions of "BGIOSGA028482"

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA028482

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028482, complete gene.

LocusTag

P0683E12.22-3

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA028482-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA028482-PA

Length

14943

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:16168086..16183028

Sequence Coding Region

16168086..16168495,16168585..16168681,16169352..16169408,16169582..16169712,16171273..16171369
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,16181595..16183028

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:16168086..16183028 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGATGTCATCGGACGACGACCTTGAGCCGCAGCTCAAGGCGGTGGAGAATTACTACTTCGTTGACGACAACGATGTGCCGGTATCCTTCGATGTCCTGCCGTTCCAGTTCGATGCGGCCGAGGGGGTCGCGTCGTTCAAGAAGGATGTGTACCTGCGGGGGTTCACCGACGGCGGCCTCCAGAAAGTCTACAAGCAGGTGGTTGCCTGGAAGCTAGTCCTAGATGGAGACTCGCCTGAGATCGCGGTGCTTTCGACGGAGGGCAGTTGGATTGCCCTGCTGAAGCCGAGGCCTAGCTACGAGGAGACCATCCGGTCTGTACTGATCACTGTCGAAATGCTTCACTTCGTCCGAAGGAGGCCAACGGATTCCGAGAAAGACATGTGGGATCACCTCTATGGGGTTTTTGAGAGATTTGTGGTTAGGCCCTTAGAAGATGACTTTGCTAATCATCAGAATTTAATAAAACTCTTTGCTCAGAGGGACCCAGATTTAGCAAATTCACAGGTTTTGCAAGTCTTCATCAAAGACAAGATTATGGAAAAGACCAATGAGGTAGCTCAGGAGGAGATAGTTGAAGAAGGCATTCCAGATGTACCAAGCAATGATGATGATGATGATGAAGAGGATGAGGAGGATGGAGATTCGTTTGATTCAGTTTGTGCTATCTGTGATAATGGAGGGGAGCTGTTATGCTGTGAAGGTCCGTGTATGAGGTCCTTCCATGCAAAAATAAGAGATGGTGAAGATTCTTACTGTGCAACCCTAGGGTACACAAAGGCAGAAGTCAAGGCACTAAAAAATTTTGTGTGCAAGAATTGTGACCATAAGCAGCACCAATGCTTTGTCTGTGGAGAGTTGGAGCCTTCGGATGGGCCAAATGCCAAGGTATTTCTCTGTAATAATGCAACCTGTGGGCATTTCTACCACCCAAGATGTGTTGCGCAATTGCTTCATCCTAACAGCAGAAATGAGGCTTCCGAAATGGAGAAAAAGATTATGGCTGGGTTTTCATTTACATGCCCTGTACATTGGTGCTTTCATTGTAAAGGTCTAGAAGACAGGACTCAAGAACCACTGCAATTTGCTGTTTGCAGACGCTGCCCAAGATCGTATCATAGAAAATGCTTGCCAAGGGAAATTTCCTTTGAAGATATTAACACGCAGGGCATCATAACCCGTGCATGGGAGCTTTCAAAAAGAATTCTGATCTACTGCTTGGACCATGAAATAGACCTTGATATTGGAACACCACCCAGAGACCATATAAAGTTTCCTCATGTTGAAAAATCAGCTTATTCTGCAAAGAAGAAAGTCAAAGAATTAGCTGAGAAGAAAAGACGGATTTGTGATGATTCATATGTTTCTGAACCTTTACAGAAGCGCGCAAAGTTAAATGAGAAGTTTAATGCAAAAGGTGACAAATCTAAAAAAGCTGGTGTGAAAAGTGAATTTGAGGAAGTTCTTGAATCTGAAAAGAAAAAAACAAGGAGCCTGAAAAAGAGAACACAGCCTGAAGAACCTTTGGTTGAGTGTGCTGCTGCTGCTGCTGCAAACAATGCAAATCGACCTGTGAAAGAACGAGAAAAAGAATTAGGGACTTCATCGTTGGATATGGGGAAGATACCTCTTAGCTCTTTCCCTATTGTGGATAGTGAAACGGAGAAGAGGATATCAGCTTTGGTAGAAAAGGAGGTCTCTTCCTTAACAGTGGCTGATATCTCTAGAAGGTGTGTCATTCCTTCAACTTATGCATGCTCTGGCCGGCAGATTGACAAAATTGTTGTACGAGGCAAGCTTGAGCGTTCAATTCAGGCAGTGAAAGCTGCTTTAGAAAAACTGGAAAATGGAGGCGCTGTTGATGACGCTAAAGCAGTATGTGAATCTGAAGTTTTGAGGCAGTTAACAAGATGGCATAATAAGCTCAGAGTTTACCTTGCACCTTTCATTCATGGCATGCGCTACACGTCTTTTGGACGCCATTTTACAAAGAAGGAGAAGCTCATTGAGATTGCCGAGAAGCTTCATTGGTATGTGCAACCTGGAGATATGATTGTGGATTTCTCCTGTGGTACAAATGATTTCAGTCAATTCATGAAAGAAAAGCTTGATAAAGTTGGCAAAAGATGCAACTTCAAAAATTATGATGTTATTCAACCAAAGAACTCTTTCAGTTTTGAAAAGAGGGACTGGATGACTGTCCGCCAAAAGGAACTGCCACATGGATCTAAACTGATCATGGGCCTTAATCCTCCTTTCGGACCAAAAGCAATGCTTGCAAACAAATTCATTGACAAGGCGTTGACCTTCAAGCCAAAGCTCATCATATTAATTGTTCCCAAGGAGGCTGAAAGGTTAGATCGAAAGCAGCAACCTTATGATTTGGTATGGGAAGATGATCAAAGACTTTCTGGGAAGTCATTCTATTTACCTGGTTCTTTGGATGTGAGTGACAAACAAATTGACCAATGGAACAAATCTCCACCCCCACTCTATTTGTGGAGTCGCCCTGATTGGACACAGAAGCACAAGAGAATAGCAGAACAGCATGGGCACACCAAAGCCAATGTTTTCTCCCATAATGAAGAAGATTTGGTTTATCTTTTTGAGGATAGAGCTACACAGAATCATGATGTCAATAATAAGAACTACACATCTGGAAACGGGAACTTCACTGCTGAGAAACCAGTACAAGCAGACGCCTTCCCTCCAGAAAAGCTAGTAGAAGTTGCATACGAGGAAATGAAGGTTGCTTCTAACAGAAGCAGTATGTATCAATCAGATCAAATTAGTGTTCATGATGAGAGAGATGCACATTCTGACTTGCCGATGTCTCGGCACAACAGTATGAAAGCAAAAGAGGTTTCAAATAGCTCAAGAGACAGAAGGAAATCAGATAAGACAGGACATGAAGCAGATTCCGATATGAGTATCTTGCCCTCAGATTCCAGGAATTTTCTACACAAATCAGGCAACCTTGAACCTCCAATATCAAGTAGAAGTGGATATACCTCGGAGAGGTTGAGATATCATGATAATCATTTCGATCATCTTGTAGGAGAGCACTCATCATCTAGCCTTCAGATGCCAATCTTTGAGGACAGCTATTTCAGATCTGTGAATGAATATGGAGTTGCATCTGTAGAAAATAACATTGCCCTTTCGACTGATAATGTTGGTGCCGGCTCAAGGATGTATAGTCCTGATCCAGAGCTGAACGGGTATGCTGTTGATCCTACTGTTAATGCTTATGGTTCAGTATCTGGTGGAACCGGTGGCAGCTTTTACAGGAGGCAGAACCTCGAGGATTACACCATGGACAGTAGTGAGTCTGCTCAGATGAATCCAGTTCCTGGTAGAGATGTGCAGGAATATGCAAGAACATACTATGGACACAACAGGGATGAGGTTCCCCAAACAGCAATTAACACACCTTCCATGGATATTCGAACACACATAAGAATGTACGGCAGGCACATCAGGGATGATCATACCCAAACAACCATGAACCCACCTGCCAATGATATTCGGGCACAGATAAGAATGTATGGTCAACACGCTACCTCCGATCACCAGCATGCAAGTAGATACTCTTCTGGGTCTCCAGATGCTAGATTTGAGCAGCAACCTTCTTTCACTTCATATGGAATGCCTTCTTTGGGTTCGACAGGGAGGTCGATGATGGATAGGTATAGTCCCTCCATTGATGAAACAAGCTATAGGACTGGCCAAAGAGGCCCATACAATGCTTCTGACTTTCGGAGGGATCGGCATCCTGATGACATGAATTTTGCTCCCCATAACCAGTATCCATACCCACATCCAGGTTCCTCTGGTGGCTGGCACGACTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MMSSDDDLEPQLKAVENYYFVDDNDVPVSFDVLPFQFDAAEGVASFKKDVYLRGFTDGGLQKVYKQVVAWKLVLDGDSPEIAVLSTEGSWIALLKPRPSYEETIRSVLITVEMLHFVRRRPTDSEKDMWDHLYGVFERFVVRPLEDDFANHQNLIKLFAQRDPDLANSQVLQVFIKDKIMEKTNEVAQEEIVEEGIPDVPSNDDDDDEEDEEDGDSFDSVCAICDNGGELLCCEGPCMRSFHAKIRDGEDSYCATLGYTKAEVKALKNFVCKNCDHKQHQCFVCGELEPSDGPNAKVFLCNNATCGHFYHPRCVAQLLHPNSRNEASEMEKKIMAGFSFTCPVHWCFHCKGLEDRTQEPLQFAVCRRCPRSYHRKCLPREISFEDINTQGIITRAWELSKRILIYCLDHEIDLDIGTPPRDHIKFPHVEKSAYSAKKKVKELAEKKRRICDDSYVSEPLQKRAKLNEKFNAKGDKSKKAGVKSEFEEVLESEKKKTRSLKKRTQPEEPLVECAAAAAANNANRPVKEREKELGTSSLDMGKIPLSSFPIVDSETEKRISALVEKEVSSLTVADISRRCVIPSTYACSGRQIDKIVVRGKLERSIQAVKAALEKLENGGAVDDAKAVCESEVLRQLTRWHNKLRVYLAPFIHGMRYTSFGRHFTKKEKLIEIAEKLHWYVQPGDMIVDFSCGTNDFSQFMKEKLDKVGKRCNFKNYDVIQPKNSFSFEKRDWMTVRQKELPHGSKLIMGLNPPFGPKAMLANKFIDKALTFKPKLIILIVPKEAERLDRKQQPYDLVWEDDQRLSGKSFYLPGSLDVSDKQIDQWNKSPPPLYLWSRPDWTQKHKRIAEQHGHTKANVFSHNEEDLVYLFEDRATQNHDVNNKNYTSGNGNFTAEKPVQADAFPPEKLVEVAYEEMKVASNRSSMYQSDQISVHDERDAHSDLPMSRHNSMKAKEVSNSSRDRRKSDKTGHEADSDMSILPSDSRNFLHKSGNLEPPISSRSGYTSERLRYHDNHFDHLVGEHSSSSLQMPIFEDSYFRSVNEYGVASVENNIALSTDNVGAGSRMYSPDPELNGYAVDPTVNAYGSVSGGTGGSFYRRQNLEDYTMDSSESAQMNPVPGRDVQEYARTYYGHNRDEVPQTAINTPSMDIRTHIRMYGRHIRDDHTQTTMNPPANDIRAQIRMYGQHATSDHQHASRYSSGSPDARFEQQPSFTSYGMPSLGSTGRSMMDRYSPSIDETSYRTGQRGPYNASDFRRDRHPDDMNFAPHNQYPYPHPGSSGGWHD</aaseq>

Gene Sequence

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