Difference between revisions of "BGIOSGA028866"

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA028866

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028866, complete gene.

LocusTag

OsI_29637

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA028866-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA028866-PA

Length

9513

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:25466180..25475692

Sequence Coding Region

25466180..25466229,25466819..25467317,25467886..25467977,25468555..25468719,25468801..25469188
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,25475298..25475402,25475651..25475692

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:25466180..25475692 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:25466180..25475692 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGACGGCGGTTGGGTCGCAGCCGCGCGCGGCCATGTGCGGTGCCAGCACATCGAAGATTTACACTCTGGAGAAAGTATATGGATTCAGATTAGTATGCAGAAGTGTGGTTGATCTGAGGAGTCAAAAATTTCATACACGTGTTTATAAGAGAAAGAGCTATTTCAGGAGTTCAGCATCAGAATGTGAGAAGATCATTCACAGTGCTAGATGGCTAGAATTTAGGAGACAGAGGGTAGCATTTCAGAGAACTAGAAGGACAATCCATCTTATTCCTTTGGCTTCTCAAGATGATAGCAGTGGTTTATCTGTTAACGGATCCCCACAAGTTGATTCGGCAAGCGAGATGGATGATATAAGGGTGAAATTGGTTAAAGCACTACAAAGCGAGGATATAAGCACTGGCCTTGTCCAATCAATACATGATGCTGCAAGATCTATTGAATTGGCTTTCTTAGATCACAGCAAATCATCAAAAAACTCTTGGTTTCCAAAGGAATGGCTTGGTGTGGATAACAATGAATGGATAAAACCACTCTCTTACCAGGCTGCTGTCGGTTCATTGTTGCAAGCAGTTATTGATGTTTCATCTAGGGGAAATGGCAGAGATAGAGATATCAATGTATTTGTTCAGAGGAGTTTATCCCGCCTACTTAGTTCTCTAGAGGGTGCTATCCAAAATGAGCTGTCGAAAAGGGAACCTACATTGTACCAGTGGTACTCATCTGATCAAAATCCTTTGGTTGTGAGAACATTTGTTAACTCTTTTGAAAACGATCCACGGTTTAACTCTGCAACAGCAATATGCCATGAACGCCAGCAAATGAATACTAGTGAAAGTGACCTTTCTCTACTTATGCTAGGTTTGACATGTCTTGCTGCTATCACAAAGCTTGGATCAACAAAAGTTTCTTGTCAGCAGTTCTTTTCCATGGTCCCTGATATCATTGGTCGATTCATGGATATGCTTCTTGAATTTGTCCCTCTAAGTAAAGCATATACCTTGACAAAAGATATTGGTCTTCAGAGAGAATTCCTTTGCAATTTTGGTCCTCGTGCTGCTGACCCTAAGTTTTCCAGTGATCGTGAAGTTGAGATATCGTTTTGGATTGATCTGGTTCAGAAACAGTTGCTACGGGCTCTTGATCGTGAAAAGATATGGTCAAGATTGACAACAAGTGAAAGTATTGAGGTTTTGGAAAAGGATTTAGCAATTTTTGGGTTTTTCATTGCTTTAGGCAGAAGTACGCAAACATATTTGTCTTCCAATCATCTTACCAATCTGGATGATTCAATCAATGATATTGTAAGCTCTCACCTTAACAAGCTTACAATCATCCAGGTAGTTTGCGAAGAGCTCGAGTGGCTTCCATTTTACAGTGGTGATGTGCCAGCTGCAACAATTGAAGGTAGAGAGGATGTGCATAAAGGAGAAATAATATCAAGAGTGCTAAATGTGTGCTCTTATTGGATGACTAGTTTTATAAAGTACAGCTCATGGCTTGAGAACCCTTCAAATGTAAAGGCAGCCAGATTTCTGTCCAAGGGGCATTCCATGTTGAGTGATTGCATGAAGGAACTGGACTTAACAAAGTATGATATGCCAAAAGACCAAACCTTTCCAGAAGCCAAAGAACACTTGGTTGCTAGGACAGAGCTAGCCTCTTTTGACAAGTCACTTGAAAGTGTTGAGGAAGCTTTGGTTAAGTTAGAAGATTTGCTCCAAGAATTGCATCTCTCCAGTTCCAACTCTGGTAAGGAGGATCTAAGGGCTGCATGTTCTGATCTTGAAATGATTAGAAGGCTGAAGAAAGAGGCTGAGTTTCTTGAGGCTTCCTTTCGAGCAAAAACAGAATTTCTTGAGGCTGATGCTAGTAGCAGACCATTATCTCCTGCTGTCGAGGAAGGCCGTGGAAAGACAGCTAGCAATGCTAATGAGAGCTCAACACCACAAAAACCAGCAAACAGAGTGGAGAACAAACGTCGTCCAATTTGGGACCTCTTTGGTAGGCCTTCTGGAAGGAGAGTTCAGCTTGTCCAACAAACTTCAGATCAAAATGTTTCTGTCGCTAATGTGGATAACAAAGACACACAATCAAATGATATCCTCCGGTTTGAACAGTTAAGACGTGAGCTGATTGAGTTAGAGAAAAGAGTTCAAAAGAGCGCAGATAATGCTCAAAAGGAGGAGACATATGTCGCAAATGAAACATTGGATTCTTCCGTGTCATCATCTCCTGTATCAATGCCTTCTGGTCCAGCTAGCAAGAAAGAAAATGTTATTACCAAATCAGTAGAGAAGGTTAAGGAAACCACGACGACTGTTGTGCAAGGGACACAGCTCTTAGCAATTGACACAGGAGCTGCTATGGGTTTGTTAAGAAGAGCTCTTATTGGGGATGAACTAACTCATAAGGAAAAGCAGGCTCTTCAAAGAACCCTGACAGATTTAGCCTCTGTTGTTCCTATAGGAATACTCATGCTTCTGCCAGTAACTGCTGTTGGGCATGCTGCTATTTTGGCTTTCATCCAGAGATATGTGCCTTCCATGATCCCATCCACCTATGCTCCAGAGAGGTTAGATCTCCTCAGGCAACTTGAAAAAGTGAAGGAAATGGGAGTTGCTGAAGGTAGTAGTGAAGAAATGGTAGAGGCTTGTTTTGGAACAAGACAGAAGATGGTTTCATTTCGTTTATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATAVGSQPRAAMCGASTSKIYTLEKVYGFRLVCRSVVDLRSQKFHTRVYKRKSYFRSSASECEKIIHSARWLEFRRQRVAFQRTRRTIHLIPLASQDDSSGLSVNGSPQVDSASEMDDIRVKLVKALQSEDISTGLVQSIHDAARSIELAFLDHSKSSKNSWFPKEWLGVDNNEWIKPLSYQAAVGSLLQAVIDVSSRGNGRDRDINVFVQRSLSRLLSSLEGAIQNELSKREPTLYQWYSSDQNPLVVRTFVNSFENDPRFNSATAICHERQQMNTSESDLSLLMLGLTCLAAITKLGSTKVSCQQFFSMVPDIIGRFMDMLLEFVPLSKAYTLTKDIGLQREFLCNFGPRAADPKFSSDREVEISFWIDLVQKQLLRALDREKIWSRLTTSESIEVLEKDLAIFGFFIALGRSTQTYLSSNHLTNLDDSINDIVSSHLNKLTIIQVVCEELEWLPFYSGDVPAATIEGREDVHKGEIISRVLNVCSYWMTSFIKYSSWLENPSNVKAARFLSKGHSMLSDCMKELDLTKYDMPKDQTFPEAKEHLVARTELASFDKSLESVEEALVKLEDLLQELHLSSSNSGKEDLRAACSDLEMIRRLKKEAEFLEASFRAKTEFLEADASSRPLSPAVEEGRGKTASNANESSTPQKPANRVENKRRPIWDLFGRPSGRRVQLVQQTSDQNVSVANVDNKDTQSNDILRFEQLRRELIELEKRVQKSADNAQKEETYVANETLDSSVSSSPVSMPSGPASKKENVITKSVEKVKETTTTVVQGTQLLAIDTGAAMGLLRRALIGDELTHKEKQALQRTLTDLASVVPIGILMLLPVTAVGHAAILAFIQRYVPSMIPSTYAPERLDLLRQLEKVKEMGVAEGSSEEMVEACFGTRQKMVSFRL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..50#640..1138#1707..1798#2376..2540#2622..3009#3080..3198#3299..3329#3480..3685#3775..3819#3925..4006#5014..5202#7305..7408#7475..7565#7903..8031#8231..8362#8585..8755#8978..9037#9119..9223#9472..9513#ATGGCGACGGCGGTTGGGTCGCAGCCGCGCGCGGCCATGTGCGGTGCCAGGTTGGGTCCCCCCCCCACCCCCATCTCCTCTCTCTCCTTCTGGCCGCGGTGCTGCGGGCCGATTCGCTGGTTTAGTCGTTGCCGTTTAGCTCGTGGGTGGATGGGTTGCGGTGGAATGCGCTGGTTGCGAGCTTGGATTGTGGAGGGGAGGGGTAGAGGTAGTAGGGTCGTTGAATTCGTCACTGGCTCACTAAGTTATCTGTGCGATTTCGGTTCGGGGGCGTGCGCCGCCGAGGGATTTCGTCAAATTTGGTGTTGTAGGTTGCCGTTTTGGTGATGGCGATAGCATTGCGGTTTTGACGGCCGGAGCTTTGACATGGCCAATTGAACTGGGATACTTTACTACTAGTAGTTTCCTCTTCTGTTCTGTTGAGGCTTGCAGTTATGCACACGGTGTGTTTCCCGTATTGTGCTTTCAGTGGCAATTTGACGGCGGATGCTTATTCCTAAAACAGTAGCTTGCCAGCGTTTCTTAAATTGTTTGCTACTGGTTTTGATTATGGAATAGGTTTCATTGTACAGTGAAGTTAATAATATTTTTCTTGCTGTTTCTTATTATAATGGATCAAATGGTTGAACGTGTTTGCAGCACATCGAAGATTTACACTCTGGAGAAAGTATATGGATTCAGATTAGTATGCAGAAGTGTGGTTGATCTGAGGAGTCAAAAATTTCATACACGTGTTTATAAGAGAAAGAGCTATTTCAGGAGTTCAGCATCAGAATGTGAGAAGATCATTCACAGTGCTAGATGGCTAGAATTTAGGAGACAGAGGGTAGCATTTCAGAGAACTAGAAGGACAATCCATCTTATTCCTTTGGCTTCTCAAGATGATAGCAGTGGTTTATCTGTTAACGGATCCCCACAAGTTGATTCGGCAAGCGAGATGGATGATATAAGGGTGAAATTGGTTAAAGCACTACAAAGCGAGGATATAAGCACTGGCCTTGTCCAATCAATACATGATGCTGCAAGATCTATTGAATTGGCTTTCTTAGATCACAGCAAATCATCAAAAAACTCTTGGTTTCCAAAGGAATGGCTTGGTGTGGATAACAATGAATGGATAAAACCACTCTCTTACCAGGTACAGGACTGAACTTTCTTCAGGCATATATCTGCCCATAAAATGATAGTGACCATTATTCATGTCATTGATTAAATAGTTTCTCTTGACTTTTCCCTTTTGGCCTTCCACGCAGAAAACTAGTATTGAAATTTTGTAAGCCAGATTTTATTGCATGCACCCTACTGTTTCCCTTTTTTTGTTTAGAAAAAGAAAAGATGATGTAGTCAGGATATCATCCATAGAGGTCTTATGAAATATGGATGCCTGTATAGATGAATATGTATGTTGAACTTGGTAAACTATTAATTGGTTAGCTTTTGTTCACCCCTTTTAGGATATTAGTAGTGCTACTCTGCCACCAGAGGAAGTGTTCTGCTCTGGTGTCTGGAGTATTATTTTCATATATGAAGATGCAGAGTCTTTTAATCAACTTAGAGCCAATCGCGGCAATTGAACCTTCTTTGAGTTGATGTTTATTAGTTCTCACACATAAATCTTCAGTAAAACAAATATTAGCTGTTGCGTTCTGAATTTTGGTGGCATGCAAACTTTTTATTGTCTGGTATCTAAAATAATCTGTTTGCAGGCTGCTGTCGGTTCATTGTTGCAAGCAGTTATTGATGTTTCATCTAGGGGAAATGGCAGAGATAGAGATATCAATGTATTTGTTCAGAGGAGGTCTGCCCTCTAGCACTTGCCTTGATTATCATGCCTAATTGCTGACATTATCCTTTTTCTCCTGGTGTGTTTTTAAGACTACAACTATCTATCATCTTGGAGCCAATTTTGCTTTTTAATACCTTAGAGAGCAAATGGTGTGTAATGTACATTTTATGTAGCTTCCTCTGTATATTAAGTTTTCTTGGAGCTAATTCCTGTCTCATAAGTTGCTTTCCATCTATAGCCTAATTATTAGAGAAATATATTCCTCCATTTCTTGACTGGTAGATTTCTTAAGTTTTAATGTCAATAAAACATATGCTGTCAGAAGAGCATGCAAATTAATTGATCCACTTGATTCATGGGAAAAAAAAGTTACTGCTAGAGTCTACAGGTTTCTGCTGTATTTGCATTTTTGTTGACCCAGAATGAGCCTTCTACTGGATTCAATAGTCAAGCTTACATGAACATAGTATTGACAGCATGATGAAGCCAAATCAGATCTAACCTCTATGTTGTACATAACAGTTCAATTTGTGATTATAGAACATGCCTCTTGGTCTCCTATTTAATCATATTTAATTTTCTGTTGCAGTTTATCCCGCCTACTTAGTTCTCTAGAGGGTGCTATCCAAAATGAGCTGTCGAAAAGGGAACCTACATTGTACCAGTGGTACTCATCTGATCAAAATCCTTTGGTTGTGAGAACATTTGTTAACTCTTTTGAAAACGATCCACGGTTTAACTCTGCAACAGCAATGTAAGTTGTTTACTTCTGTTGGGCTTCATTTGATAAATGAACTAATACATTAACGGATACCTTTTCTTTTGTTGCTTGCAGATGCCATGAACGCCAGCAAATGAATACTAGTGAAAGTGACCTTTCTCTACTTATGCTAGGTTTGACATGTCTTGCTGCTATCACAAAGCTTGGATCAACAAAAGTTTCTTGTCAGCAGTTCTTTTCCATGGTCCCTGATATCATTGGTCGATTCATGGATATGCTTCTTGAATTTGTCCCTCTAAGTAAAGCATATACCTTGACAAAAGATATTGGTCTTCAGAGAGAATTCCTTTGCAATTTTGGTCCTCGTGCTGCTGACCCTAAGTTTTCCAGTGATCGTGAAGTTGAGATATCGTTTTGGATTGATCTGGTTCAGAAACAGTTGCTACGGGCTCTTGATCGTGAAAAGATATGGTCAAGATTGACAACAAGTGAAAGTATTGAGGTTGGAACAAAAGATATTTCGTCTAGCTTTATGAATTCTCCTTCCAAAATAACTATTTTCCTTACTGCAGGTTTTGGAAAAGGATTTAGCAATTTTTGGGTTTTTCATTGCTTTAGGCAGAAGTACGCAAACATATTTGTCTTCCAATCATCTTACCAATCTGGATGATTCAATCAATGATATTGTAAGGTGTGAATGATGCGAATTTTGAATTGCCATTTGCTCGATGAAATTATGTTTCTGTACATAAGCTACAGTATAACTGTTTTCTTGCGTAATTATGATGTAGCTCTCACCTTAACAAGCTTACAATCATCCAGGTATCTTATTGGTGGGAGTGTGTTATATTATCCACAGTTGTCTTCGATTAGTTCTTATCAGCTGTATGTGGAGGTTAGTATGCAGGCAATACACCGAGCTCTCAATGCTATGCACCTTTTTTGTGTTTTTATGACCTTTTCACCTTCCAGGTAGTTTGCGAAGAGCTCGAGTGGCTTCCATTTTACAGTGGTGATGTGCCAGCTGCAACAATTGAAGGTAGAGAGGATGTGCATAAAGGAGAAATAATATCAAGAGTGCTAAATGTGTGCTCTTATTGGATGACTAGTTTTATAAAGTACAGCTCATGGCTTGAGAACCCTTCAAATGTAAAGGCAGCCAGATTTCTGTCCAAGGGGTACATCCAAATTCAGTCATGCTCTCTCACATTTTGCCGCAGATATGGATGCGAACCAACGTTTCTAATATATGGTCAAATTTTTGTAGGCATTCCATGTTGAGTGATTGCATGAAGGAACTGGACTTAACAAAGTAAACATATAATTCTGATGTTTATATTGTTATTTGTTATGTTACTTGGGTATATGTTTGTACAATTGTAAGAATATTATTATTTATCTGCTCATTCTGATGCAGGTATGATATGCCAAAAGACCAAACCTTTCCAGAAGCCAAAGAACACTTGGTTGCTAGGACAGAGCTAGCCTCTTTTGACAAGGTATCTGTTACATGATGCACTTTAACGTTACTAGTATTTCTTCTGGTTCTCACACATCCCAACAATAGTAATTCTCAGTACTGTTAGTTAAATTATTATTTTTTGTGAGGAGTTAGTTAAATTATTGTGCATTTGACATGTTCCAGATGATGTTGCTGATATCAGTGCTAAACTGCTAATTATATTATAGTTTCTTCATGGAACCTATATGCCAGTTTCAGAGGGAAGCGGTGGTGCATGTGTGTGTTTTGGGCTTTTCTTTTGGTGTTGTGGGAGGGGCTGGAGGCTGGGATGGATGGTGAGAGGCCTTATATTCTCATGGCTGTTGCCAGAATATTGGTGTGGACAAGAAATATGACTAGTGGACTTATGTTATTTCTCTGTAAGCAAACAATAAGATGTTAAGATTGCTTTCATGAGTAGCCCCTAATGAGAATATATAATATTTGGTGAAAAATAGCCTTGTTGGATAAGGGTAAACTGTGAAAGAAGCTCCAAGCAACTTGATGCACTGCTGGCACTATGCGAAACATCATTGCAGGCCTCATGCTGATAGTAACTCCCGGCCATAACACTATAAGCTCAGACATCAAATTCATTACGATGCAAGGCTGCACATGCAGGGAGATGCCACCGTCTCCTTTTGATATGCTTACACATTCAAAGCGTGACATGTATTAGATGTATTCTGAGATATGCAAGAGATGAAGGATTGATCCATTTAATGTATATCTGTTTACAATTAATAACTGTACAAGATCATATGTTAGATGTGTT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA028866