Difference between revisions of "BGIOSGA033912"
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Revision as of 17:41, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA033912 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033912, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_36272 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA033912-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA033912-PA |
| Length |
15864 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:15321845..15337708 |
| Sequence Coding Region |
15337689..15337708,15336985..15337057,15336796..15336876,15336635..15336704,15336492..15336556 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:15321845..15337708 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:15321845..15337708 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTCAGATTGCTACAGTTTATTAGGAGTTGAGTTGGGAGTCCTCGATGATCTGGTTTGGAAGAATGCAGCAGCTGATTTAGTTGCAGAGGTGGTTTGGAGCCATGGAATTTCTCTGTTGCATGACCTAATCCCCTGCCTTGTGTGTCTATCAGCAAAGCGTGCTACTGAGACCGAGTTAGTCTGCTTTATTCTGAAGTCAATTTCTGATAATCGAATTGCTCATGTTTCACATTTTGGAGGTGATAAAGGCGAACTGCTTTCCTTATCTGAGTTCCTTCCGCAGATTTTGCCATTCATTTCCTCTTTGCTTGAGAAACACGTTGGAGCTGTTTTGGGTGAAAAAGAGAAGTGTCAGGTGGAAGTAGCTGAGGAACATGCATCTGTAGTAAAAGCTGTCCTAGATGCAGCCATTACATATGCAGGGTGGGCTCATGTTGTTGATCTGGGGAAGCACGGTCTTATTAAGGGATGTGGATGCCTACTTTCTTGCAATGATTTCTGTGTGCACGCATTGCAGTTTTTCAAACTTATATTGCAGAGGAAAAGACCTGTTTCTATTGCGGTTGCAGATCATGATTTTGCAGATTATCTATTATGTCCACATACTACATTTCATTATGTGCAAGCTTTACATGGTGCATTGAGTATCTCTGCTAGTCCAAAGGATTATTGTAGTAGTTCAAGCAGCTACAGCAATATCTCTGGTACAGTATCCCAGAATACTAGTGTGCAGAAGAGACTGAGCTGTGAAAGCAGCAGCAACAACAAAAGTAGCACTGCAGTCGTAATGAGTTCTCCTGATTCCTGTATCACTCTCAGCACACAAGTGGAGGGTAATGATTGTGAATTAGATCTCCAGGGTAATGATGGAGCTAGACGATCAAACTCTTTCCACCACGTGGGCTGTCTACTCCTTGCAGAGCAGAATCTTATATCTGAAGCATTCCTTATTGTGTCATCCTGGTCCAGGATTCAGCAATACAAGGAAGTTCTTACTTGTATACTCAGTCCTCTTAGCAAAATTTGGACCCAGCCAGAGTGGGAAAGTAAATACACACATTATGCATGGTGCCTCACATGTCTATTTTCTAATAGACAGTTTGTGAAGAATGTTCATGATGTGGTGAAGTCATGGGAAGGGCAGCTCAAAAGGAGAGCAGAAGAGTCTCATGCTATCCAAATGCCCGATAAATACTCATACCTTCAATGCGTACATGCCCTCTGGAATCGAGAGATTACTTTTGATCTATCAAAAAAGCTTGCAAAAGCTAAAAGATTTGGGATCGATGAGGAGGAAGGTTTCCAAGAAATTGAGATGAGACAATGGCTACAGGATATCCGAGAGAGTGGATATCTTTTACTTAATGATTGTCTTGGGAGGTTAAGGATGAGTCTGTTTGGGTACTTGGTTGATGGTGAAGCAGCCACCAAAGCTATCCCCTTCTGTCGTGCTTTGATCCACCTTGCAGGTGCTGCAAATGATGATAAGCTTAGGGATTTAGTGAAGGAACAAAAGGAGATTGAAGATGCTGCAGATAGCTTTACATGTTGGTTGGTAAAGCAAAAGGAAGATCTCCATGCTAAGGCATGTTCTGCTCCTCCAAAGGAATTTTTTGGCCAAACACAACTAGAATGGAATTGGGAGCTTGAAGATGAATTTCGAAGATATCTTCCAGTTTATTTTGATACAATGCAAGAAGTGGATGCAATGGTTGACTGTTTGGAGGTTGATTTTTTTGACCTGGAAGTTCTATATAAGAACTTGAGGCCTGAATTTAGATCCAAGTATGCTATTGACAGTAGCAAGCACCCCCATCTAAGGATCATGTCAAATATGCGAGAACGGAAATATTATTCAATGATCAGTGCAAAACATCACAAACAAATATGTGAAATTCTTGGAGAACTCATTACTTTGAAACCATATATCAAGGGCTCTGACCATTATTATGAAATTGTTGAACGTATTGGAGAAAAAATTGAGATACCATCCAGGATCTTTGACCGTGATGATGCGAAAAAGTCCATCCGTGTCCTCCTTCAAATCTTACATTTCTGGGAACCTCAGTTTCATCCTCTAATACGGGAGGGTCACAAGGACTTCCTTTTAGACATAGCCAGGCGGTTGGCCAAGGCAAAAGCAACAGAATATTCTGAGCCATTGATACCACAAATGGAGGATTTCTTGCCACATTTACAACCTTATGCATTCGCATTTATTGTGGCTACGCTAAAAGATCCAATGGTGAGGGATGAAGGGTATGTCGATGCGTTGGTGAGGGCGTCGCTTCATTTTATCAGGAAGGATTTCCCTCATGAGGTCCGGGGACATGGCGTCAGATTGCTACAGGTGGATGGGAGATTCAGAGCGGCGGACAACTCCGGGAATAGACAGGAAGGAAGGGTAGCTGGATGGGTTGCTAGTTGTGAGCTTGTGTGTGCGGTGTGGAAGACAATTTTATTAGGAGTTGAGTTGGGAGTTCCCGATGATCTGGTTTGGAAGAATGCAGCAGCTGATTTAGTTGCAGAGGTGGTTTGGAGCCATGGAATTTCTCTCTTGCATGACCTAATCCCATGCCTTGTGTGTCTATCAGCAAAGGGTGCTACTGAGTTGCTTGAGAAACACATTGGAGCTGCTTTGGGTGAGAAAAGCGTCAGATGTGGATGCCTACTTTCTTGCAATGATTTCTGTGTACACGCATCGCAGTTTTTCAAACATATATTGCAGAGGAAAAGACCTGTTGCTATTGCCGTTGCAGATCATGATTTTGCAGATTATCTATTCTGTCCACATACCACATTTCATTATGTGCCAGCTTTACAGGGTGCATTGAGTATCTCTGCGAATCCAAAGGATACAAGTAGTAGTAGTTCCAGCCGCTACAGCAATAGCTCTGGTACAATATTCCAGAAAACTAGTGTGCAGAAGAGACTGAGCAGTGGAAGCAGCAGCAGCAGCAAAAACAAACGTAGCACTGCAGTCGTAATGAGTTCTCCTGATTGTGAATTAGATCTCCTGTTATTGGGGAATGATGGGCATGACAATGATAGTAGAGATAACATGCTGGATGCCGCAGACCCAAGAATGGGTAATGATGGAGCTAGACGAGCAAACTCTTTCCACCACTTGGGCTGTCTACTCCTTGCTGAGCATAATATTATATCTGAAGCATTCCTTACTGCGTCATCCTGGTCTAGATGTGTCATCATGATTCAGCGATACAAGGAAGTTCTTGTATACTCAGTCCTCTTAGCAAAATTTGAACCCAGCCAGAGTGGGAAAGCAAATACACACATTATGCATGGTGCCTCACACTTCCTTCAATGTGTACATGCCCTCTGGAATCGAGATATTACTTATGATCTATCAAAAAAGTTTGCAAAAGCTAAAAGACTTGGGATCGATGAGGAGGAAGGTTTCCAAGAAATTGAGATGAGACAATGGCTACAGGATATCCGAGAGATTGGGTTCGAGACCTGCTCCCATATCTTCTATGGTTGCCCCTACACTCGGGAGGTCTGGGGGCTGGTCAGGGGTCGTGTCGGCCTTCTTTACGCAGCACCGGATGATGTCTTCTCATCCTGGTGGTGTAAAGTGCGAAAGGCAATCGCCAAAAAGGATAGGAGATCTTTCGATGCGGGCGACATTTTGGTGACCTGGCTGATTTGGAAGGAGCGCAATGCGCGTGTATTTGAGGGTCGAGCCTGTTCGCCTGTCAACCTTTCTGCAGCCATAGAAGATGAATGGAGAACTTGGATTGCAGCGGGCTTGATTGTAGCTTCGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASDCYSLLGVELGVLDDLVWKNAAADLVAEVVWSHGISLLHDLIPCLVCLSAKRATETELVCFILKSISDNRIAHVSHFGGDKGELLSLSEFLPQILPFISSLLEKHVGAVLGEKEKCQVEVAEEHASVVKAVLDAAITYAGWAHVVDLGKHGLIKGCGCLLSCNDFCVHALQFFKLILQRKRPVSIAVADHDFADYLLCPHTTFHYVQALHGALSISASPKDYCSSSSSYSNISGTVSQNTSVQKRLSCESSSNNKSSTAVVMSSPDSCITLSTQVEGNDCELDLQGNDGARRSNSFHHVGCLLLAEQNLISEAFLIVSSWSRIQQYKEVLTCILSPLSKIWTQPEWESKYTHYAWCLTCLFSNRQFVKNVHDVVKSWEGQLKRRAEESHAIQMPDKYSYLQCVHALWNREITFDLSKKLAKAKRFGIDEEEGFQEIEMRQWLQDIRESGYLLLNDCLGRLRMSLFGYLVDGEAATKAIPFCRALIHLAGAANDDKLRDLVKEQKEIEDAADSFTCWLVKQKEDLHAKACSAPPKEFFGQTQLEWNWELEDEFRRYLPVYFDTMQEVDAMVDCLEVDFFDLEVLYKNLRPEFRSKYAIDSSKHPHLRIMSNMRERKYYSMISAKHHKQICEILGELITLKPYIKGSDHYYEIVERIGEKIEIPSRIFDRDDAKKSIRVLLQILHFWEPQFHPLIREGHKDFLLDIARRLAKAKATEYSEPLIPQMEDFLPHLQPYAFAFIVATLKDPMVRDEGYVDALVRASLHFIRKDFPHEVRGHGVRLLQVDGRFRAADNSGNRQEGRVAGWVASCELVCAVWKTILLGVELGVPDDLVWKNAAADLVAEVVWSHGISLLHDLIPCLVCLSAKGATELLEKHIGAALGEKSVRCGCLLSCNDFCVHASQFFKHILQRKRPVAIAVADHDFADYLFCPHTTFHYVPALQGALSISANPKDTSSSSSSRYSNSSGTIFQKTSVQKRLSSGSSSSSKNKRSTAVVMSSPDCELDLLLLGNDGHDNDSRDNMLDAADPRMGNDGARRANSFHHLGCLLLAEHNIISEAFLTASSWSRCVIMIQRYKEVLVYSVLLAKFEPSQSGKANTHIMHGASHFLQCVHALWNRDITYDLSKKFAKAKRLGIDEEEGFQEIEMRQWLQDIREIGFETCSHIFYGCPYTREVWGLVRGRVGLLYAAPDDVFSSWWCKVRKAIAKKDRRSFDAGDILVTWLIWKERNARVFEGRACSPVNLSAAIEDEWRTWIAAGLIVAS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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