Difference between revisions of "BGIOSGA033912"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA033912

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033912, complete gene.

LocusTag

OsI_36272

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA033912-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA033912-PA

Length

15864

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:15321845..15337708

Sequence Coding Region

15337689..15337708,15336985..15337057,15336796..15336876,15336635..15336704,15336492..15336556
,15336227..15336390,15336076..15336147,15335958..15336000,15335550..15335825
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,15327777..15327881,15326780..15326886,15325710..15325782,15325525..15325605
,15325080..15325126,15324816..15324887,15324698..15324740,15324334..15324579
,15324131..15324199,15323466..15323587,15323253..15323358,15322807..15322958
,15321845..15322163

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:15321845..15337708 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGTCAGATTGCTACAGTTTATTAGGAGTTGAGTTGGGAGTCCTCGATGATCTGGTTTGGAAGAATGCAGCAGCTGATTTAGTTGCAGAGGTGGTTTGGAGCCATGGAATTTCTCTGTTGCATGACCTAATCCCCTGCCTTGTGTGTCTATCAGCAAAGCGTGCTACTGAGACCGAGTTAGTCTGCTTTATTCTGAAGTCAATTTCTGATAATCGAATTGCTCATGTTTCACATTTTGGAGGTGATAAAGGCGAACTGCTTTCCTTATCTGAGTTCCTTCCGCAGATTTTGCCATTCATTTCCTCTTTGCTTGAGAAACACGTTGGAGCTGTTTTGGGTGAAAAAGAGAAGTGTCAGGTGGAAGTAGCTGAGGAACATGCATCTGTAGTAAAAGCTGTCCTAGATGCAGCCATTACATATGCAGGGTGGGCTCATGTTGTTGATCTGGGGAAGCACGGTCTTATTAAGGGATGTGGATGCCTACTTTCTTGCAATGATTTCTGTGTGCACGCATTGCAGTTTTTCAAACTTATATTGCAGAGGAAAAGACCTGTTTCTATTGCGGTTGCAGATCATGATTTTGCAGATTATCTATTATGTCCACATACTACATTTCATTATGTGCAAGCTTTACATGGTGCATTGAGTATCTCTGCTAGTCCAAAGGATTATTGTAGTAGTTCAAGCAGCTACAGCAATATCTCTGGTACAGTATCCCAGAATACTAGTGTGCAGAAGAGACTGAGCTGTGAAAGCAGCAGCAACAACAAAAGTAGCACTGCAGTCGTAATGAGTTCTCCTGATTCCTGTATCACTCTCAGCACACAAGTGGAGGGTAATGATTGTGAATTAGATCTCCAGGGTAATGATGGAGCTAGACGATCAAACTCTTTCCACCACGTGGGCTGTCTACTCCTTGCAGAGCAGAATCTTATATCTGAAGCATTCCTTATTGTGTCATCCTGGTCCAGGATTCAGCAATACAAGGAAGTTCTTACTTGTATACTCAGTCCTCTTAGCAAAATTTGGACCCAGCCAGAGTGGGAAAGTAAATACACACATTATGCATGGTGCCTCACATGTCTATTTTCTAATAGACAGTTTGTGAAGAATGTTCATGATGTGGTGAAGTCATGGGAAGGGCAGCTCAAAAGGAGAGCAGAAGAGTCTCATGCTATCCAAATGCCCGATAAATACTCATACCTTCAATGCGTACATGCCCTCTGGAATCGAGAGATTACTTTTGATCTATCAAAAAAGCTTGCAAAAGCTAAAAGATTTGGGATCGATGAGGAGGAAGGTTTCCAAGAAATTGAGATGAGACAATGGCTACAGGATATCCGAGAGAGTGGATATCTTTTACTTAATGATTGTCTTGGGAGGTTAAGGATGAGTCTGTTTGGGTACTTGGTTGATGGTGAAGCAGCCACCAAAGCTATCCCCTTCTGTCGTGCTTTGATCCACCTTGCAGGTGCTGCAAATGATGATAAGCTTAGGGATTTAGTGAAGGAACAAAAGGAGATTGAAGATGCTGCAGATAGCTTTACATGTTGGTTGGTAAAGCAAAAGGAAGATCTCCATGCTAAGGCATGTTCTGCTCCTCCAAAGGAATTTTTTGGCCAAACACAACTAGAATGGAATTGGGAGCTTGAAGATGAATTTCGAAGATATCTTCCAGTTTATTTTGATACAATGCAAGAAGTGGATGCAATGGTTGACTGTTTGGAGGTTGATTTTTTTGACCTGGAAGTTCTATATAAGAACTTGAGGCCTGAATTTAGATCCAAGTATGCTATTGACAGTAGCAAGCACCCCCATCTAAGGATCATGTCAAATATGCGAGAACGGAAATATTATTCAATGATCAGTGCAAAACATCACAAACAAATATGTGAAATTCTTGGAGAACTCATTACTTTGAAACCATATATCAAGGGCTCTGACCATTATTATGAAATTGTTGAACGTATTGGAGAAAAAATTGAGATACCATCCAGGATCTTTGACCGTGATGATGCGAAAAAGTCCATCCGTGTCCTCCTTCAAATCTTACATTTCTGGGAACCTCAGTTTCATCCTCTAATACGGGAGGGTCACAAGGACTTCCTTTTAGACATAGCCAGGCGGTTGGCCAAGGCAAAAGCAACAGAATATTCTGAGCCATTGATACCACAAATGGAGGATTTCTTGCCACATTTACAACCTTATGCATTCGCATTTATTGTGGCTACGCTAAAAGATCCAATGGTGAGGGATGAAGGGTATGTCGATGCGTTGGTGAGGGCGTCGCTTCATTTTATCAGGAAGGATTTCCCTCATGAGGTCCGGGGACATGGCGTCAGATTGCTACAGGTGGATGGGAGATTCAGAGCGGCGGACAACTCCGGGAATAGACAGGAAGGAAGGGTAGCTGGATGGGTTGCTAGTTGTGAGCTTGTGTGTGCGGTGTGGAAGACAATTTTATTAGGAGTTGAGTTGGGAGTTCCCGATGATCTGGTTTGGAAGAATGCAGCAGCTGATTTAGTTGCAGAGGTGGTTTGGAGCCATGGAATTTCTCTCTTGCATGACCTAATCCCATGCCTTGTGTGTCTATCAGCAAAGGGTGCTACTGAGTTGCTTGAGAAACACATTGGAGCTGCTTTGGGTGAGAAAAGCGTCAGATGTGGATGCCTACTTTCTTGCAATGATTTCTGTGTACACGCATCGCAGTTTTTCAAACATATATTGCAGAGGAAAAGACCTGTTGCTATTGCCGTTGCAGATCATGATTTTGCAGATTATCTATTCTGTCCACATACCACATTTCATTATGTGCCAGCTTTACAGGGTGCATTGAGTATCTCTGCGAATCCAAAGGATACAAGTAGTAGTAGTTCCAGCCGCTACAGCAATAGCTCTGGTACAATATTCCAGAAAACTAGTGTGCAGAAGAGACTGAGCAGTGGAAGCAGCAGCAGCAGCAAAAACAAACGTAGCACTGCAGTCGTAATGAGTTCTCCTGATTGTGAATTAGATCTCCTGTTATTGGGGAATGATGGGCATGACAATGATAGTAGAGATAACATGCTGGATGCCGCAGACCCAAGAATGGGTAATGATGGAGCTAGACGAGCAAACTCTTTCCACCACTTGGGCTGTCTACTCCTTGCTGAGCATAATATTATATCTGAAGCATTCCTTACTGCGTCATCCTGGTCTAGATGTGTCATCATGATTCAGCGATACAAGGAAGTTCTTGTATACTCAGTCCTCTTAGCAAAATTTGAACCCAGCCAGAGTGGGAAAGCAAATACACACATTATGCATGGTGCCTCACACTTCCTTCAATGTGTACATGCCCTCTGGAATCGAGATATTACTTATGATCTATCAAAAAAGTTTGCAAAAGCTAAAAGACTTGGGATCGATGAGGAGGAAGGTTTCCAAGAAATTGAGATGAGACAATGGCTACAGGATATCCGAGAGATTGGGTTCGAGACCTGCTCCCATATCTTCTATGGTTGCCCCTACACTCGGGAGGTCTGGGGGCTGGTCAGGGGTCGTGTCGGCCTTCTTTACGCAGCACCGGATGATGTCTTCTCATCCTGGTGGTGTAAAGTGCGAAAGGCAATCGCCAAAAAGGATAGGAGATCTTTCGATGCGGGCGACATTTTGGTGACCTGGCTGATTTGGAAGGAGCGCAATGCGCGTGTATTTGAGGGTCGAGCCTGTTCGCCTGTCAACCTTTCTGCAGCCATAGAAGATGAATGGAGAACTTGGATTGCAGCGGGCTTGATTGTAGCTTCGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASDCYSLLGVELGVLDDLVWKNAAADLVAEVVWSHGISLLHDLIPCLVCLSAKRATETELVCFILKSISDNRIAHVSHFGGDKGELLSLSEFLPQILPFISSLLEKHVGAVLGEKEKCQVEVAEEHASVVKAVLDAAITYAGWAHVVDLGKHGLIKGCGCLLSCNDFCVHALQFFKLILQRKRPVSIAVADHDFADYLLCPHTTFHYVQALHGALSISASPKDYCSSSSSYSNISGTVSQNTSVQKRLSCESSSNNKSSTAVVMSSPDSCITLSTQVEGNDCELDLQGNDGARRSNSFHHVGCLLLAEQNLISEAFLIVSSWSRIQQYKEVLTCILSPLSKIWTQPEWESKYTHYAWCLTCLFSNRQFVKNVHDVVKSWEGQLKRRAEESHAIQMPDKYSYLQCVHALWNREITFDLSKKLAKAKRFGIDEEEGFQEIEMRQWLQDIRESGYLLLNDCLGRLRMSLFGYLVDGEAATKAIPFCRALIHLAGAANDDKLRDLVKEQKEIEDAADSFTCWLVKQKEDLHAKACSAPPKEFFGQTQLEWNWELEDEFRRYLPVYFDTMQEVDAMVDCLEVDFFDLEVLYKNLRPEFRSKYAIDSSKHPHLRIMSNMRERKYYSMISAKHHKQICEILGELITLKPYIKGSDHYYEIVERIGEKIEIPSRIFDRDDAKKSIRVLLQILHFWEPQFHPLIREGHKDFLLDIARRLAKAKATEYSEPLIPQMEDFLPHLQPYAFAFIVATLKDPMVRDEGYVDALVRASLHFIRKDFPHEVRGHGVRLLQVDGRFRAADNSGNRQEGRVAGWVASCELVCAVWKTILLGVELGVPDDLVWKNAAADLVAEVVWSHGISLLHDLIPCLVCLSAKGATELLEKHIGAALGEKSVRCGCLLSCNDFCVHASQFFKHILQRKRPVAIAVADHDFADYLFCPHTTFHYVPALQGALSISANPKDTSSSSSSRYSNSSGTIFQKTSVQKRLSSGSSSSSKNKRSTAVVMSSPDCELDLLLLGNDGHDNDSRDNMLDAADPRMGNDGARRANSFHHLGCLLLAEHNIISEAFLTASSWSRCVIMIQRYKEVLVYSVLLAKFEPSQSGKANTHIMHGASHFLQCVHALWNRDITYDLSKKFAKAKRLGIDEEEGFQEIEMRQWLQDIREIGFETCSHIFYGCPYTREVWGLVRGRVGLLYAAPDDVFSSWWCKVRKAIAKKDRRSFDAGDILVTWLIWKERNARVFEGRACSPVNLSAAIEDEWRTWIAAGLIVAS</aaseq>

Gene Sequence

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