Difference between revisions of "BGIOSGA034095"

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Revision as of 17:42, 22 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA034095

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034095, complete gene.

LocusTag

OsI_35916

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA034095-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA034095-PA

Length

15624

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:10613542..10629165

Sequence Coding Region

10629072..10629165,10627454..10627830,10627282..10627373,10627077..10627134,10625655..10625738
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Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:10613542..10629165 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:10613542..10629165 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGGATGCAAGTGGCAGGTGCTACTACTTTTAGTAAGAAGGGTAACGAGTTCATACACACTGCACTATTTTTGGTAAAAAGCATGGTCGCTGGGCATCACACGATGAGTGTTGCAACTGAAGCATGCCCTTCACCAAAGCTACACACAAGACTAAGGCTGTGGGAGTTTGCAGACCGTTACGTATTTGAACCAGTTGACGGTCTTGCTGATTTGTTCCTGTCAGTTGATCGGACAAATGGATCAATGAGTCTAGTGGAAGAGTTGCCACCTCGTGGTCCCTCTACAAATCCTAAAGTTAGAATAGTTTTTGGTGTGATTGGAGTGCTCAAACTTGCAGTTCGGTCGTACTTTCTTGTGATCACTGGCCGTGATTGTGTTGGATCCTACTTGGGGCATGCAATTTTCAAATTGACGGGACTAAAAGTTCTGCCATGCAATAACTCGTTAAATACTTCTTCTGCTGAGCAGAAGAAAATGGAATCAGAATTTTCGGAACTTCTGGATGCAGCAGAGAGGACTATAGGCCTGTACTTCTCCTATGATGTCAACTTAACACTAACTTCACAGAGGCTGCATGATCTAGGAGATCAGTTTAAGTCACTTCCACTTTGGAGACAGAATATTGCTAACACTGTGCCCATTGGTAATGATTCTACTAGCATCCTGCAAAATCTTCAAGCTTATCCTTTGGATTCTTTTAAGGCAGAACCAAGATTTCTTTGGAACGGTTACTTGTTGGAGCCTCTAATTGAGAACAAACTGCACCAATACTTACTACCAGTCATTCAAGGAAGTTTTCAGAGTATCCATGCAGAAGTTGGGTCAGAGAAGGTAAATGTGACCCTGATTGCACGTCGGTGTACACGTAGGATAGGAATTTACGAGCTGTTCTTTGTTGAAGGTACCCGGATGTGGAGGCGAGGAGCTGATCCAGAGGGTTATGCTGCAAATTTTGTTGAATCAGAGCAGATAATGCAATCGAAAGAATTTACAGCATCATATGTGCAAGTTCGAGGTTCTATGCCTTTTTTGTGGGAACAAATTGTTGATTTGACATATAAACCTAGTTTTGATGTTGTCAGAGTAGAGGAGGCGCCTCGTGTACTTGAACGGCATTTTCATGATTTACAAAAGAAATATGGAGCTGTCGTGGCTGTTGATCTTGTCAATACACATGGTGGCGAAGGTCGCCTGTATGAAAGATATGCAAAATCAATTGAGCCTATCTTGAGTGAAGATATAAGATTTGTGCATTTTGACTTCCATCAAATCTGTGGTCATATTCACTTTGAACGCCTTTCTCAACTGTATGATCAAATTGAGGATTATCTTAAGAAGCATAGGTACTTCCTTTTAAATAGTAAAGGTGAGAAAATGGAAGAGCAGACCGGAACCGTTAGAACAAATTGTGTCGATTGTCTGGATCGTACTAATGTAACTCAGAGCATGATCGGGAGAAAAATATTGGAAAGCCAACTGCAAAAAATCAGTGTTCTTGGTGACAACAATACAATCAGCGATTATCCGGCATTTGATGCAGATTACAAAGTTTTGTGGGCCAACCATGGAGATGCAATAAGCACTCAGTACTCTGGAACTCCTGCCTTGAAGGGAGACTTTGTGCGGTACGGAAAGCGAACTACACAGGGAATTTTAAATGATCTGTGGAATGCAATGGCTAGATATTACCTGAACAACTTTGCAGATGGTACTAAACAGGATGCCATGGATCTTCTTCAAGGACATCACATATCCTCAGTTAGTCGGGATATGCCAACTCCAACCAAAGGACTTATAGAGAATCACGCGTCCTTCCGCCTTGCTTTTGCTCTGCTTTTGGCTGCCGTGATATTCTTGATAATGTCACTGAGAAGAGCACGTAATGATGTTTTCCATTTGGTGCTGTCACTACTATGGTCTGGTTTTTGCTTTGGCATCACGCGTTATGTCAAAGCTAACGGACGGAAGTTCACGAACCGTCCTCGCTTTCACCTATCGCGCCATTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRMQVAGATTFSKKGNEFIHTALFLVKSMVAGHHTMSVATEACPSPKLHTRLRLWEFADRYVFEPVDGLADLFLSVDRTNGSMSLVEELPPRGPSTNPKVRIVFGVIGVLKLAVRSYFLVITGRDCVGSYLGHAIFKLTGLKVLPCNNSLNTSSAEQKKMESEFSELLDAAERTIGLYFSYDVNLTLTSQRLHDLGDQFKSLPLWRQNIANTVPIGNDSTSILQNLQAYPLDSFKAEPRFLWNGYLLEPLIENKLHQYLLPVIQGSFQSIHAEVGSEKVNVTLIARRCTRRIGIYELFFVEGTRMWRRGADPEGYAANFVESEQIMQSKEFTASYVQVRGSMPFLWEQIVDLTYKPSFDVVRVEEAPRVLERHFHDLQKKYGAVVAVDLVNTHGGEGRLYERYAKSIEPILSEDIRFVHFDFHQICGHIHFERLSQLYDQIEDYLKKHRYFLLNSKGEKMEEQTGTVRTNCVDCLDRTNVTQSMIGRKILESQLQKISVLGDNNTISDYPAFDADYKVLWANHGDAISTQYSGTPALKGDFVRYGKRTTQGILNDLWNAMARYYLNNFADGTKQDAMDLLQGHHISSVSRDMPTPTKGLIENHASFRLAFALLLAAVIFLIMSLRRARNDVFHLVLSLLWSGFCFGITRYVKANGRKFTNRPRFHLSRH</aaseq>

Gene Sequence

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