Difference between revisions of "BGIOSGA034139"

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Revision as of 17:42, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA034139

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034139, complete gene.

LocusTag

OsI_35826

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA034139-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA034139-PA

Length

11756

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:8937761..8949516

Sequence Coding Region

8949388..8949516,8947460..8947648),complement(8946220..8946333,8944671..8944793),complement(8944471..8944590
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,8938214..8938297),complement(8937761..8937877

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:8937761..8949516 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTCTTATATATATGCAAAAAGATTTATTGGGCCAATAACTCCAACTATACTGGCACTAAGAGAAGAGCTCTATGATGTACCATACAACAAGATCAATTGGAACAATGCTCGCATTTCTTGTTGCAAGGACGACATTATTTATCCTCCTTCGTGGTTCCAAAACATTGCTATGGCTTCTTTACATAAATTTATGGAACCACTATTTAATATGTGGCCAATGAACAAGCTAAGAAAAAGAGCTTTGACCAACCTCATGGATCATATTCACTATGAAGATGAAAACAGCAATTATGTGGGTTTATGCCCAATTAACAAGGTATTAAATATGATTTGCTGCTGGATAGAAAATCCGAACTCCAATGCATTCAGACGACACCTTCCAAGGATTCATGATTTCCTATGGCTTGCAGAAGATGGAATGAAGTCAAAGGTGTACGTTGGTAGCCAGTGCTGGGATACTGCCCTTATAGTTCAGGCCTACTGCTCAACCGGCCTTACCCAAGAATTTAGTGAAACTATCAAGAAAGCTCATGATTTTATAAAGAATGCGCAGGTAACCAAGAATTGTCCTAATTACAAAAGATATTACCGTGAAAGGTCAAAAGGTTCATGGACATTATCAAATGGAGAAAATGGATGGCCTATTGCGGATACTCTTGCCGAATGCCTTAAGGCGGTGTTGTTGTTATCAAAGATTCCACCAACCCAAGTAGGAGATCCAATTCAAGAACAAAGGTTGTATGATGCTATTGACTGCCTACTTTCATATGTGAACAAGGATGGCACTTTGTCCTCTGCAGAATCTAAGAGAACAACTCCATGGGTGGAGTATAGGAGTGAGCCAATAATGGTTGAGATTAAGAGCAGCGGATCCGAAGGAGGAATCACCTTCACCGTACCTCTGGAGATGGAGACGATGTGGTGGTGCTTTACAACTGATCATGTTAGCTCCGATGGTCCCAGAGTGACAATAATAACTTGCCAGGTCATCATGCCACCAGCTAAAAAGTTCATCAACCCTTCCGAGAGTTTCCGGAACATAATTGTGGATTACCCGTACGTGGAATGCACATCATCACTAATTCAAGCCTTGATACTGTTTAAAGGCGTTCATCCTGGATACCGCCGTGAAGAGATAGATAGAATTATCAAAAATGGTGTGTTGTTCATCGAGAAAAAACAAAAAAATGATGGATCGTGGTATGGATCTTGGGCTGTCTGTTTTACTTATGCTACCTTCTTTGCTATAAAAGGACTGGTTGCGGCAGGAAGAACATTCCAAAACAGTTTGTCTATTAGGAAGGCATGCAACTTCTTGCTGTCAAAGCAGCTAAGTACTGGTGGATGGGGAGAGGATTACCTCGGTTGTCAAGTTGAGGAGTATATTGACAGTGGGAGGCCTCATGTAGTTCACACTGCGTGGGGAATGTTGGGCTTAATATATGCTGGACAGGTTGAATTAGATCCAGCACCATTATACCGTGCGGCCAAAGAATTAATCAACATGCAGCTGGAGACAGGAGAATTTCCACAACAAGAAATTCTTGGGAGCTTCAATTCCTCCCTCTTCTTCAATTACACAAACTACAGGAACTTGTTCCCAATCTGGGCCCTAGGAGAGTTTCACCGCCGACTTCTAGCAAAAAGGGCTTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSYIYAKRFIGPITPTILALREELYDVPYNKINWNNARISCCKDDIIYPPSWFQNIAMASLHKFMEPLFNMWPMNKLRKRALTNLMDHIHYEDENSNYVGLCPINKVLNMICCWIENPNSNAFRRHLPRIHDFLWLAEDGMKSKVYVGSQCWDTALIVQAYCSTGLTQEFSETIKKAHDFIKNAQVTKNCPNYKRYYRERSKGSWTLSNGENGWPIADTLAECLKAVLLLSKIPPTQVGDPIQEQRLYDAIDCLLSYVNKDGTLSSAESKRTTPWVEYRSEPIMVEIKSSGSEGGITFTVPLEMETMWWCFTTDHVSSDGPRVTIITCQVIMPPAKKFINPSESFRNIIVDYPYVECTSSLIQALILFKGVHPGYRREEIDRIIKNGVLFIEKKQKNDGSWYGSWAVCFTYATFFAIKGLVAAGRTFQNSLSIRKACNFLLSKQLSTGGWGEDYLGCQVEEYIDSGRPHVVHTAWGMLGLIYAGQVELDPAPLYRAAKELINMQLETGEFPQQEILGSFNSSLFFNYTNYRNLFPIWALGEFHRRLLAKRA</aaseq>

Gene Sequence

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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA034139