Difference between revisions of "BGIOSGA000187"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA000187

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000187, complete gene.

LocusTag

OsI_05066

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA000187-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA000187-PA

Length

12237

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:44805621..44817857

Sequence Coding Region

44817684..44817857,44815381..44815468,44815215..44815282,44814752..44814802,44811811..44811921
,44811653..44811736,44811392..44811550,44811204..44811308,44811021..44811125
,44810101..44810241,44808365..44808469,44807505..44807618,44807201..44807416
,44806450..44806550,44805621..44805693

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:44805621..44817857 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:44805621..44817857 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCGCCACCACCTTATCTGCATCGTTGTGCGCATCCTCTGCACCCTCCTAGGCTTCGAGGCGGCCACCTTGGCGGAGCTCTACCCGGTGACATCCGGGCACGACGCGGCATCGTCCTTGGCCATCGACGCGCCTCCCGTCGATGGTCGGTGGCTCCCCATGCTCTACCCGACATCTCCAAAGAAGAAGTTAGTTAAACTCCCATCTGGTTCTAATGCTTCAAAGGTTACTGGACCAAAAGCTGGTCCAGATCAAATAGATGATACCTTGGAACATCAAGAAGAGGGAGTTGCTGAGGAAGACATGCAAGATAAACTTACAGAGCACTCTGTCTCCCAGAGGTTGCCATTAATCATTCCTGATAAAGTTCACCGTTCAAAGTACCTCCCTGCTACTGATGACATGCTGGCACTTGACATTGCTTATACCATTTACATGAAGTTTGAAGACCTTACAAGTGCTTTGCGGATTGCTCTGCTCCTTGACAACAAGTCGATACAATATATGAAGCAGGTCTACACCGCCACTGAGGATCTTCAGCCCAAAAAGCAGTTCTCATTCATCATTGCACGCCATGGTTTAGCCATGGAGATTGACAACGAGATAGCTGCTGATGACAATGATAAGGAGGGTTTGCAAGAAATCGTTAATAATACTAAGCTGAGTGAGGGGTACCTCACCCTTGCTCGAGATATTGAAGTCATGGAACCAAAATCTCTAGAGGATATATATAAGGTCCATTTAATTGATGGGGGTGGTGCCAGCTCCAGTCTTGATTCTGCAAGACAAAATTTAGCTGCAACATTTGTCAATGCATTCGTAAATGCTGGATTTGGCCAGAATAAGTTGATGACTGCTCCATCTGATTCATCCAGTAGCGGAGCTTCTGGAAACTGTTTATTCAAGAATAAGGAACATGGGAAAGCCAGCGCAGCAGCTAGCCTGGGAATGATTCTCTTGTGGGATCCTGATTCTGGACTTGCTCAGCTTGACAAGTACTTACATAGTAATGATGCTCATGTTGTTGCTGGAGCATTGCTAGGTATTGGTATTGTCACATGTGGTGTGAAGAATGATTGTGACCTAGCACTTGCTATTCTCATGGAGTACATTAACAAGGATGACACAAATATTCGGATTGGGGCAATCTTGGGTTTTGGTATTGCATATGCTGGTTCTCAGAAAGGGGAGGAGAGTGTAGAGGCTACGACAGAAGTTTCTAAAACATTTGACGAGAAGATAAGAAAGTACTGTGATGTAACACTTATGTCACTAGCATATGCCAGAACAGGAAACGTGCTCAAGGTTCAAAAGCTCCTTGGGATTTGCTCACAGCATCTTGAGAAAGGTGAAACCCACCAGGGGCCAGCTGTCCTAGGAATTGCGCTTATTGCAATGGCTGAAGAATTAGGAGCTGAGATGGCTGTACGGCCACTTGAGCGTCTTTTACAGTATGGCGAGCAGAATATTAGACGGGCAGTTCCTCTTGCTCTTGGCATACTCTGCATATCTAATCCGAAGGCTGCAATCATTTCATTGGGTTTGATTGGTGCTGGTACAAACAATGCATGCTTCGCAATCTTTCAAGTTACTATTACAAAGAAGCTGCACATCTGTTTTGTATACATTCTGCTGACGTCGGTATTGGAGGGCTTTGTAATTCTGAAGAAGAACCCGGAATATAACGAGGAGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRHHLICIVVRILCTLLGFEAATLAELYPVTSGHDAASSLAIDAPPVDGRWLPMLYPTSPKKKLVKLPSGSNASKVTGPKAGPDQIDDTLEHQEEGVAEEDMQDKLTEHSVSQRLPLIIPDKVHRSKYLPATDDMLALDIAYTIYMKFEDLTSALRIALLLDNKSIQYMKQVYTATEDLQPKKQFSFIIARHGLAMEIDNEIAADDNDKEGLQEIVNNTKLSEGYLTLARDIEVMEPKSLEDIYKVHLIDGGGASSSLDSARQNLAATFVNAFVNAGFGQNKLMTAPSDSSSSGASGNCLFKNKEHGKASAAASLGMILLWDPDSGLAQLDKYLHSNDAHVVAGALLGIGIVTCGVKNDCDLALAILMEYINKDDTNIRIGAILGFGIAYAGSQKGEESVEATTEVSKTFDEKIRKYCDVTLMSLAYARTGNVLKVQKLLGICSQHLEKGETHQGPAVLGIALIAMAEELGAEMAVRPLERLLQYGEQNIRRAVPLALGILCISNPKAAIISLGLIGAGTNNACFAIFQVTITKKLHICFVYILLTSVLEGFVILKKNPEYNEE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..174#2390..2477#2576..2643#3056..3106#5937..6047#6122..6205#6308..6466#6550..6654#6733..6837#7617..7757#9389..9493#10240..10353#10442..10657#11308..11408#12165..12237#ATGCGCCACCACCTTATCTGCATCGTTGTGCGCATCCTCTGCACCCTCCTAGGCTTCGAGGCGGCCACCTTGGCGGAGCTCTACCCGGTGACATCCGGGCACGACGCGGCATCGTCCTTGGCCATCGACGCGCCTCCCGTCGATGGTCGGTGGCTCCCCATGCTCTACCCGACAGTGAGGCCACTATTGTCCATCTGTTCTCTCTCGCTCCCCCTCCTCGGCAGTGGTGGGAGTGGTAGAACTACGGCTTAACTAGTGTCCGACGCCCTCGCCATGTTAGGCGCTCCATTCACCCTCACTACTGAGGGAGAGAGATGAGGAGAAAATAATAAGGGAAAGAAATGTCGCTGACATGTGGGCCCCACATGCTGTCTCAACCGATTGGACTAGTCAACATGCCACATCAGTGAAAACCATCCTCAAAACCACTTGAGGGAGTCAAAAATTATACTGATTTTGATAGTTGAGGGGTGAAGATATCCAGTATTGTGAATGAGGGATTTGAATTAGATTTGAAGTGTATTTAAGGAAGTCAAAGTAGACTTATTCCTTACAATAAACGGGTTGGAATGCGATTTCGATGAATACACTGTGTTTTCACTACTTGGGTCAGGACGTATCCTACGAAGTATAGGAGGCTCCCATTCCAGCTGGGCCGGCGAACGAGTGAGTAATCTATGGTAGGCCAAACCCCACGAATAGAGTGACATATTGTCCTTTTTCTCGGCTCTCCACATCTTGATATCCACCACGACCTACGGCACCTACTCCTTCGACATCGCGACCTCTGAGTGGACCAAGTCGGGCGATTGGAGGCTACCCTTCCGCGGCCGCGCCGAGCACGTCCTTGAACACGGCCTCTGGTTGGGCATCTCCGCCATAGATGACACCATTCTCGGCGCGTGGAATCTGTCCTCCGTTCCAGAAGTCGATGGCGAGCCTCCAGTTGAAGGGGTTCTCTGTGGACAGTCGAGAAAAAGGATAATATGCCACTATTCATGGGGTTTGGCCCACCATAGATTACTCACTCGTTCGCTGGCCCGGCTGGGACAAGGGCCTCTTACACTTCGTAGGATATGTCCTGGCCCCCAAGTAGTGAAAGCCCAGCGTGTTCGTCGGAATCGTATTCCAGCCTGTTTATTTTAAGGAATAAGTCTACTTTGACTAACTTAAATATACGCCACGTCAGCAAAACCATAGGGGAGAGGTAAAGTTATTTTGCACTGGTTAAGATATATGGTATCGCGGTTGAGGCCTTGAGGGGTACAAATTATATTGAGGGATACAAGGTGGACTTATATCTTATTGTAACCATGGGCTACTATTAGGCTGGTTATTATAATCTGGCAATCTTGTGAGTAAACCTCCTTTCTCCTCGACCGCAGGTCGACTCGGGCTCCGTCGCCGTTCCACTGCTCCAGCTGTTGCCACCTTCCCTCATCGCCCGCGTCTCTCTCGGCTGGTCCACGTAGTTGGCTGCCTTCCATAGTCGGCTCTGAAGGAGTTTTGAGGGAGGGAGACGCAGGCATGGGCGAGGAAGAAGACCCCGACTAGCTCCGCGCGTTCCAGTTTATCCATCCCTTCTCCACCTCTCGTGGCCATATGATGTGGTGATGTGCCCTAGCTAAATCCTGGCAGGTCTATGGAAATAAGGTCGATCCTACCAAGCGGTTTCGATTTACCCAATTTTGCTCTGCGGATTTAAGTTGAGAATTGAACTGAATTAATAAGTTGATCTATGTCATTTCACAAAATGGCATTCCCTGCTGTGCGTCTAGGTTATGTGTTAAATATGCTTTGTGATGATTGTGAGAATTTCGTGCTCTTGATAATCCTTCACACAACTCGATGCGAATTTTTGGTATTCAGAAAACATTGTTTGTACATGTGTTCAATAACTTTTTTACTTGGTCTATGTCAATGATTTTGCCAAATGGTTCCCGCTATGATATCGCTGATTCCTAGTTTAAACCCAACGAATGCACGTCTTAATTTTGGTGCCGATGTTCGATAGGCTCCGATGTGAGCCAGTAAGCAAGTTCTGTATCTAGTACTTGTTACACTTTCTGTTCTCGGTACAACTTCTTTGGCTTTCCAAGATTGTCACTTGTTATTGCTGATAATATCATGAATTTTATTTTTCTTAATTTTTCGTAGCCACCAACTACATCGATAGTTCAGCAGATTCCCTTTTTTTATTAAGATGCTTTGTTTTTTATGTTAACAATACTTCTTGAATCTTATCTTACAATTGTTCTAGATTTTTTTGTTATTGATCGTCAGATAATACGACTGTTATATTAATATTGACTTCATTGTACATATTACTTAGTTGCAAACACCAGGTCCACTCTGTTGTTAATTTCTATGTCTAATTTTTTTTGTACAGTCTCCAAAGAAGAAGTTAGTTAAACTCCCATCTGGTTCTAATGCTTCAAAGGTTACTGGACCAAAAGCTGGTCCAGATCAAATAGATGGTAAGACTTGTGAAAAGGGTTGTCTTTTAGTGAAAAGTCGGTTTGTGAATTCTTAGTTTCAATGATTGATAATTATAGTCATGGTCATTCATAGATAGATACCTTGGAACATCAAGAAGAGGGAGTTGCTGAGGAAGACATGCAAGATAAACTTACAGAGCACTCTGTGAGATGCCTTAACTTCCTTCTATTTTTAATCTATTTTTTCCTCCACACTACGGTTCCAGAACTTTGAGAACATTGACCCAAAAGAGGAGCAAAGACAACAAAATTAGAGCCCACATCTTAGTATCTTACTGGGAATATCCCAACATGTGTCACTTTTGTTACTGCATTATATTGAACTAGTGAAAGTTGGGTAAATCCTTTTAAGAATGTATAGGAAAATATGAAAATAAATATCATTTTGTAAATATTTATCAAGCTCCAACCGGTTAGTTATTTCCTTGATTACCATAAATTTTGTGGAGCATGATGGCGTGTCTTGTTATTCCTTGAACTAGTTACGTCAATATGTCTGAGATATCTTATGGACTGTCTGAGATATCTTGTGGACTGTAAGCTGTTCTGCGTTCCAGGTCTCCCAGAGGTTGCCATTAATCATTCCTGATAAAGTTCACCGTTCAAAGGTATGATAATTCTAACTGGCATTATCAATTAGAGACCATTGTTCTCATAAAAGGGTCAGTGCGTCAAATCAAAAATCCGGAATGCAATGAGCCAGTCTGCTATCATCCCCCTTTCCCATATTTTCTTCATGAAAAAATATCAGTCGACTTAACATTGGTGGAAAGAATATGAATTGCACAATCAATAGAAATACCGCAATGACAGAGCCATAAATGAGAAGTGGTTGGGGACCCTTTTAGTGCACCAGGAGTTAGAAGGAGTATAGGCTACATTAAAGAGCCATAGATCCTTGACAATCCACCAAAAATGTGTTATATGTGCTAAAATGCAGTAACATCAACATCTTGACCTCTGCAAGTATCATCTACCTGGAAGACTGGAAATCATGACTGACCCAATCAATGTTAGTTTCCCTAAGTTTATAAATTATAATCCTTGTTCTGTTTATTTCTAGCCATTGATTGAATGCGATGGTGACTCGATAGACTTAAGTGGAGATGTTGGAGCTGTTGGGAGGATAGTAATTTCAAACAGTCCTAACGGATATCAGGATTTGTTATTGGACCTAGAAGGTACCAACAAGTCGATTTCTTTAGTATCATTTATGTATTATGTACTTTGGTTTCTGACTAGCAAGGTATTTTTACCAACAAGGGATTTGAAATTAATGTCCGTGTTATCTTACTACATGCACTATTCAAAATACTTTACCCATCTTATTATTATTTTTACTTATATACTCACACAGGAACAATATACAAATCAACAATTGTTCCATCCAGGACATTTTACGTTGTAAGTTACAAACTTAAAGTACACTTGTGCATTTGCCTTGTTTGTTAGTATTGATCTTAAATCCTTGATGGACTGTCTCTTTTTCTCAGGTCAGTGTAGGACAAACAGAAACGAAGGTTGTCAATCATAACATAAATCTCTTATGAGTATTTGACTTCTCCATATTTTTTAGTTTAGGCTGCTCTACTTTCTAGTATGTAGCATGCTATTTTTGCTACTTAATCCAATTGAAATATATTATTCTGAGGGATGTACTGCTTACCTTATTTCAACCGTTTTTTCCCCTTTTGCAGATAGAGTATATTATGAATGAATTTATTCAATTGGAACCCCAATCCAATTTATTTGGCAGAGACTATGATGGAATAGACTATGATGGTGGTCCAAGCATATGTTTGAACTCCAGAGTCCAGACAATGTTTTTGTCCGTACTTTTATTGGGAATGTCAAAGCATGCCTAGTTTATATTTTGAGGTGCCAAATAATTGAGATTGAACTAAACAGCTTTGTCAATAATTGTTAACTAATATTGATGCGACCAATATATTGAGTAACTTGTAGCACCATGGGACAGAACTAACTTTATGATATAGTCATAGCACTGTAGTTACTTCTAAATTATACAGTTTTGTTTATGATTAGGAATATATTTTTTTTGAATCAATATGTCGTTTGTGACCGAGGAGATTGTATTGTTGGAACCTTTTAATTAGTGTCTTTGACATTTTTTTTTGCAGTGACTTATCCCTGATTTATCTCCAAATTACCTGAATTTTAGCTATATTTGATATTTTTACTTTGTATTCAAACTCAATGTATTATACTAATGTATTTTTTTTGTTTTCATTACATATTTGGGTTCTAATGAAATAGCTGTCTCTTGTACAGAAATTTGGCAGGCGAAATTGCACAAGA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA000187