Difference between revisions of "BGIOSGA000977"

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA000977

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000977, complete gene.

LocusTag

OS01G0694300

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA000977-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA000977-PA

Length

14118

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:32002289..32016406

Sequence Coding Region

32016288..32016406,32015293..32015452,32013761..32013853,32013190..32013292,32012934..32013099
,32012301..32012475,32011263..32011382,32010552..32011139,32009880..32010470
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,32005027..32005101,32004501..32004596,32004214..32004294,32004058..32004129
,32003756..32003800,32003050..32003133,32002835..32002938,32002289..32002409

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:32002289..32016406 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGTTCGAGGCGGACGGCGCCCGGTGGCCGGAGCCGCGAGGCGACGCTGCCGGGGCGCCGCCGCTGGAGCGTGGCGATGCGCCTTCCCCTCGCTTCGATTCGTCTCGTGCCCTAAGATTGCTGAGAGAGCTTGGCTCAAATGTAACAGAAGATTTGGTTGTGCTGATGCCAAATTTGCTATCATTTCTGAAACATGATGATCCTGCGGTTGTTAATCAATCCATAGCTAGTGGGACAAATTTATTTGCTGCTGTATTGGAAGAGATGACACTTCAGATTAATAAGTGTGGAAGGGTTGATGCTTGGCTTGAAGAGATGTGGGCTTGGACGAAGCAGTTTAAAGATGCAGTCCATAATCTGATCCATGAGTCTGTCCCAGTTGCTACTAAACTGTTTGCTGTAAAGTTCATTGAAACATGGATCCTGTGTTTCGCACCTCAATCCAAAAGTGACCGGATGCAGCCAACTGAAGGAAGGAACAGGAGGTTGTTTGATAGTTCAAGATTATCTCAATTCCATCCCAGCCTTAACCCTGCTGTTCTCGAAGCTGATGCAAACAGGGCTCTCATCCTCCTTGTGGATATACTGCAGTCAGCTTGTGCTCATCAAGGATCCTTCCTAGTTGGCACCATTAATTCTCTTGCAGCTATTGCAAAGAATAGACCTGTTTACTACGAACGCATACTGCCAGTGCTACTTGGTTTTGACCCTAGTTTGGAGGTTGCAAAAGGAGCTCATCCTGCAAGTCTGCGGTATTCCCTGAAAACAGCTTTTTTAGGGTTTCTAAGGAGTCCTTGCCAGGCAATGATTGAGTCCAAGGATACTCTGGTAAGGCAGCTTCGTGTTCTGAGCCCTGGTGAAGCAACAGAACAGATTATTAGGCAAGTAGAGAAGATGACTAGAAATATTGAGCGCGCTTCTCGTGCTAGCAAGGATGAACCTTCAACGTTGGATATGCCTTACGGAGATGTTAGTCGGAAATATCCTGCTGCCAGATCAAGTGATGCTTTTGCTACAGCTGATGGCATAGCTAAAAGAGCAAGATTTGATACCTCTGCTGCTTTAAACCCACCATTTCAGGGAGCATCTGATTATTCTAATATGCAGGTTGACAATGAAGCGAATGTGGATCATTCCTCTGATCCAGCTCTCTTGAATTGTGATATGTCTCCTGTTGAGAAGATGATTGAAATGATTGGTGCTTTACTTGCTGAAGGGGAAAGAGGAGCTGAATCCCTTGGCATTCTCATCTCAACAGTAGAAGCAGATGTCATGGCTGACATTGTAATAGAAACAATGAAACATCTACCTGAAACTTCAATTCTATTAGCTACCAGCAACAATGGCCAGCAAAAGAAAATTCAATCTTCCTCCAGTCCCCTGACAGAAAACTTGCCAGCAAACTCCCACTCAATGCCCTACAGTACGCAGTTCGCACTTCCTGCAGATGGAGTCAGCATGTCAATGTCAGATGTGCCTGTTGTGTCTGGCGTTCATGATTCTAAGCGTGACCCAAGAAGAGATCCTCGTCGCCTTGATCCTCGTCGGACAGTTGCCCCTGCAGCCACTAGTTCCATACATGTGAAGGGGGAAACCACCGGCGTGCATCAGACAAATAACTTGTCAAATGTACCTTATCCTGTTTCAGGGAAGGTTGAAAACTCTTTAGACTATTCAGGAGACCTATCTAAAAATGAAGACGTGCAGCAAACATCTTGTCAACCCAATCAATCACTCCCAAAGGAAAATAGTGAGATTTTGGATGATGCCTTGGAACTGGAGCCGAAATTTGAAGTGCAGGCATTAGCAGATGTTGGATTTCATTCTTCTGATGTTGATAAAGAGATGGTCAATCCATTGTCTCCAGAAGCTACTTTAAACAATGAATTGGATAGCGTGGAATTGGAGGTTGATCCATTTTCCCCAGTTTTGAAGGCATCAACGCCGGAGGATACTACTAATCATGATTTGCCAGTTCTTCCATCTCATCTGGAATTAAGTGACGATGAGAAAATCTTGTTGCACAAATTAGCAATTAGACGGATAATCGATGATTACAAGAAAAACAGCGTTAACACAAGATTTTCCCTCCTTGCTCATTTGATTGCCCAGAGTACTGCTGATGACAATATTATGGATTTGATTCAGAGACACATTATATACCATTATCATGATCAGGGTCATGAACTGGCAATGCATGTGCTGTATCAGCTGCACAGTGTGAGTGTTGCTGATTCACCAGAAAGCACCGCACCTGCTTCTAAAAATTATGAGAACTTCTTTATATCACTTGCAAGGTCCTTGATTCACTCGCTACCTGCTTCAGACAAATCTTTTAGCAAATTTCTGTGTGATGCACCATACTTGCCTGAGTCTATGCTTAAATTACTGGAGGATATTTGTGTGTCACAAGGCAACAGCCAGCAAACAAAGGACAGTGATGGTGATCGTGTCACCCAAGGCCTTGGAACCGTGTGGAGTCTTATCTTAGCACGGCCTCCACTTCGACAAGATTGCTTAGATATTGCTCTTAAGTGTGCCATTCACTCTCAAGATGAAGTCAGGGGAAAGGCAGTTAGATTGGTTACAAAAAAACTCTATGAACTAACATACGCATCAGAAAGAGTTGAGCAGTTTGCCATCGACAGTCTTTTGGCAATTGCTAATAAACATGGTGTGGAGACGGACATTAATTTCACATCCTTGAAAGAATCTTCACCTGAGTTTGAGGCAGGCAGCCAGGAAACTTCGGTTAGTGGCTCCCATATTTCAGATGCTGAACCTTCTGAAAGTACATGCAATAAGACCGATTTGGTTTCACCTAAGCAATCTGCAGTATCTGTATCTGAGGCCAAACGCCATACTTCATTGTTCTTTGCACTTTGCACGAAGATATTGCAAACTCTGACAGAAGATTCAACTCCTTCAGCCGAACTTGTAGCGGCAGTTAAACATCTATATGAAACCAAGCTGAAGGATGCATCTATTCTCATTCCGTTGTTATCTTCATTTCCAAAGGAAGAGGTGCTGCCCATATTTCCAAGACTAGTTGATCTCCCACCTGATAGATTCCAAGATGCACTTGCTCGGATATTGCAGGGATCTGCTCATACTGGTCCGGCTTTAACCCCTGCTGAAGTTCTTATAGCCATTCATGATATTAATCCTGAAAAGGATAGAGTTGCCCTGAAGAAGGTCACTGATGCTTGCACAGCTTGCTTTGAACAGCGCACGGTATTTACTCAGCAAGTTTTGGAGAAGTCACTGAATAAATTGGTTGACAATGTACCAATTCCACTTCTTTTCATGAGAACAGTTATTCAAGCACTTGATGCTTTCCCAGCTTTGGTTGATTTTGTCATGGAAATACTCTCCAGGCTTGTTAATAAGCAGATATGGAAAATGCCAAAGCTGTGGGTTGGGTTCTTAAAATTGGCATATCAGACTCAGCCACGCTCGTTTGATGTTATTTTGCAGTTACCTCCACCCCAGCTTGAAATAGCTTTGAATAAGTACCCCAATCTACGAACTCCTCTTTGTTCCTTTGTTAATCAGCGGAACATGCACAGCATCTTGCCCAGACAGATTTTGAAAGTTCTGGGCTTCATCAATGAACCGCACCAGGCACCAATTCCATTTGTGCCTGCTGCAATGCAAACGGCAGATGCAACCTCCTCTCTTCCTGGTGCAACTCTTATGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEFEADGARWPEPRGDAAGAPPLERGDAPSPRFDSSRALRLLRELGSNVTEDLVVLMPNLLSFLKHDDPAVVNQSIASGTNLFAAVLEEMTLQINKCGRVDAWLEEMWAWTKQFKDAVHNLIHESVPVATKLFAVKFIETWILCFAPQSKSDRMQPTEGRNRRLFDSSRLSQFHPSLNPAVLEADANRALILLVDILQSACAHQGSFLVGTINSLAAIAKNRPVYYERILPVLLGFDPSLEVAKGAHPASLRYSLKTAFLGFLRSPCQAMIESKDTLVRQLRVLSPGEATEQIIRQVEKMTRNIERASRASKDEPSTLDMPYGDVSRKYPAARSSDAFATADGIAKRARFDTSAALNPPFQGASDYSNMQVDNEANVDHSSDPALLNCDMSPVEKMIEMIGALLAEGERGAESLGILISTVEADVMADIVIETMKHLPETSILLATSNNGQQKKIQSSSSPLTENLPANSHSMPYSTQFALPADGVSMSMSDVPVVSGVHDSKRDPRRDPRRLDPRRTVAPAATSSIHVKGETTGVHQTNNLSNVPYPVSGKVENSLDYSGDLSKNEDVQQTSCQPNQSLPKENSEILDDALELEPKFEVQALADVGFHSSDVDKEMVNPLSPEATLNNELDSVELEVDPFSPVLKASTPEDTTNHDLPVLPSHLELSDDEKILLHKLAIRRIIDDYKKNSVNTRFSLLAHLIAQSTADDNIMDLIQRHIIYHYHDQGHELAMHVLYQLHSVSVADSPESTAPASKNYENFFISLARSLIHSLPASDKSFSKFLCDAPYLPESMLKLLEDICVSQGNSQQTKDSDGDRVTQGLGTVWSLILARPPLRQDCLDIALKCAIHSQDEVRGKAVRLVTKKLYELTYASERVEQFAIDSLLAIANKHGVETDINFTSLKESSPEFEAGSQETSVSGSHISDAEPSESTCNKTDLVSPKQSAVSVSEAKRHTSLFFALCTKILQTLTEDSTPSAELVAAVKHLYETKLKDASILIPLLSSFPKEEVLPIFPRLVDLPPDRFQDALARILQGSAHTGPALTPAEVLIAIHDINPEKDRVALKKVTDACTACFEQRTVFTQQVLEKSLNKLVDNVPIPLLFMRTVIQALDAFPALVDFVMEILSRLVNKQIWKMPKLWVGFLKLAYQTQPRSFDVILQLPPPQLEIALNKYPNLRTPLCSFVNQRNMHSILPRQILKVLGFINEPHQAPIPFVPAAMQTADATSSLPGATLM</aaseq>

Gene Sequence

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