Difference between revisions of "BGIOSGA001025"
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Revision as of 18:08, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001025 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001025, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_03262 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001025-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001025-PA |
| Length |
13584 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:31197796..31211379 |
| Sequence Coding Region |
31211164..31211379,31209867..31210010,31209653..31209760,31209132..31209227,31208504..31208613 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:31197796..31211379 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:31197796..31211379 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGGGAGAGGGGAGAGATGAGGGAGGCGAAGGCGCCTCTGATCGCGGAGGCGGCGGAGCACATATCCCATTCCCACGGCTCCGGGTCGTCCGGCACCGGCAGCCACACCAGCGGTGGCGGCGGCGGGTGGAGGGGCTCGAGGCAGTACCAGCGCCGCTCGGACGCCCTCGCCTACGGCGACCGGTACCAGAAGGCGGCCGCCCTCGTCGACCTCGCAGAAGATGGTGTGGGTATCCCTGAGGATGTCTTGAATGACACAAGGTTTGAGAGGGCTATGAGATTCTATTTTGTGTATCTCCGTTTGGATTGGCTGTGGTCACTTAACCTATTTGCTTTGATTCTTTTGAATTTTCTCGAGAAGCCTATCTGGTGCCGGGGATATTCTCAACATGCTTGTGATCAAAGGGATCTTTACTTTCTGGGGCAGTTGCCATACTTGAGCAAAACTGAATCTCTCATATATGAGGGGCTCACACTTGTTATTCTTGTAATGGATATCTTCTATCCACTGTCCTATGAAGGTTTAAACCTATTCTGGAAGAACACAATAAATAAACTGAAGGTTCTTCTTCTCTTCATCTTAGCATGTGACATACTGGTGTTTGCATTTAGTCCCCAACCTTTCAGAGTAGCTCCTTACATCCGTGTTGCGTTTCTAATAATGAATATCAGGGAACTGCGAATGTGTGCTGTTACACTGGTTGGTATGGTTGGGACATACCTTAATGTTTTGGCCCTTTCACTATTGTTCCTCTTATTCGCAAGCTGGCTAGCTTATGTAACATTTGAGGATACACCACAAGGAAAGACTGTTTTCTCGTCATATGGTACCACGTTATATCAGATGTTTATTCTCTTCACCACCTCCAATAATCCTGATGTATGGGTTCCTGCTTATAAGAGCTCTCGTTGGTCCTCACTATTTTTTATTGTCTACGTACTTTTGGGAGTTTACTTCCTAACAAATTTAATTCTTGCTGTCATTTATGATAGCTTTAAGGAGCAGCTAGCAAAGCAAGTTTCTCAGGCAGACTGTACAAGGAAAAGTATACTAGAGAAGGCATTTGGTATCATTGATGCTACTGGTCAGGGTTATCTCAACAAAGAACAGTGCCTATCATTACTAGATGAGCTCAACAAATACAGATCGTTACCTAAAACCTCAAGGGAAGATTTTGAATTAATTTTTGCCGAGCTTGATCAGAGTGGTGATTTTAAGGTTACCTCTGAAGAATTTGCTACACTGTGCAATACCATTGCAATAAAATTCCAGAAAGAACCACCTCCATCCTATCTCGAGAAGTATCCATCTTTCTATCATTCAGCACTGTGTGAACGGTTGAAATCTTTTGTGCGGAGCCCACTGTTTGAGTATATTGTTATTTTTGTTCTTCTGATGAATCTAGTCGCTGTCATTATTGAAACAACGCTGGATATAGAAAACAGTTCCTCGCAGAAAGTGTGGCAAGAAGTTGAGTTTGTCTTTGGATGGATTTATGTTATAGAGATGGCACTCAAAATATTTTCATTAGGATTTGGTGCCTACTGGATGGAAGGTCAAAACAAGTTTGATTTTATGCTTACTTGGACTATATTTATTGGAGAGACTCTAACATTTGCCTTCCCATCGAAGCTTTCTTTTCTTTCAAATGGAGAATGGATTCGGTACCTTCTTCTTGGAAGGATGTTACGCTTGACAAGAATTCTGTTGCAAGTTCGGCGTTTCAGAGCATTTGTTGCAACATTCTTTACTCTGATGTCTAGCTTGATGCCATATTTGGGGATTGTATTCTGCACCCTTTGCATTTACTGCTCCCTTGGTTTGCAGATATTTGGGGGCATTGTGTATGCAGGAAATCCAACACTAGAAGAAACCGATCTCTTCAGTAACGACTATCTTCTTTTTAACTTCAATGACTATCCAAGTGGTATGGTAACTCTGTTCAATTTGTTAGTGATGGGCAATTGGCAAGCTTGGATGGAGAGCTACAGGCAATTGACTGGAAGTTATTGGAGCCTGATTTATTTTGTCAGCTTTTACCTCATTTCAGTATTACTGCTGCTTAATCTGATTGTAGCATTTGTGTTGGAGGCATTTTTTGCTGAGATGGAACTGGAGAAAGATGGCGAAGCTGATATCCAGTGTGAGGACAAAGGGGACCATGGTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRERGEMREAKAPLIAEAAEHISHSHGSGSSGTGSHTSGGGGGWRGSRQYQRRSDALAYGDRYQKAAALVDLAEDGVGIPEDVLNDTRFERAMRFYFVYLRLDWLWSLNLFALILLNFLEKPIWCRGYSQHACDQRDLYFLGQLPYLSKTESLIYEGLTLVILVMDIFYPLSYEGLNLFWKNTINKLKVLLLFILACDILVFAFSPQPFRVAPYIRVAFLIMNIRELRMCAVTLVGMVGTYLNVLALSLLFLLFASWLAYVTFEDTPQGKTVFSSYGTTLYQMFILFTTSNNPDVWVPAYKSSRWSSLFFIVYVLLGVYFLTNLILAVIYDSFKEQLAKQVSQADCTRKSILEKAFGIIDATGQGYLNKEQCLSLLDELNKYRSLPKTSREDFELIFAELDQSGDFKVTSEEFATLCNTIAIKFQKEPPPSYLEKYPSFYHSALCERLKSFVRSPLFEYIVIFVLLMNLVAVIIETTLDIENSSSQKVWQEVEFVFGWIYVIEMALKIFSLGFGAYWMEGQNKFDFMLTWTIFIGETLTFAFPSKLSFLSNGEWIRYLLLGRMLRLTRILLQVRRFRAFVATFFTLMSSLMPYLGIVFCTLCIYCSLGLQIFGGIVYAGNPTLEETDLFSNDYLLFNFNDYPSGMVTLFNLLVMGNWQAWMESYRQLTGSYWSLIYFVSFYLISVLLLLNLIVAFVLEAFFAEMELEKDGEADIQCEDKGDHG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..216#1370..1513#1620..1727#2153..2248#2767..2876#4520..4580#5058..5224#5312..5417#5541..5618#6041..6102#7242..7314#8167..8232#8584..8727#9359..9416#10079..10186#10772..10835#11242..11410#11765..11829#11970..12060#12514..12600#12800..12871#13558..13584#ATGAGGGAGAGGGGAGAGATGAGGGAGGCGAAGGCGCCTCTGATCGCGGAGGCGGCGGAGCACATATCCCATTCCCACGGCTCCGGGTCGTCCGGCACCGGCAGCCACACCAGCGGTGGCGGCGGCGGGTGGAGGGGCTCGAGGCAGTACCAGCGCCGCTCGGACGCCCTCGCCTACGGCGACCGGTACCAGAAGGCGGCCGCCCTCGTCGACCTCGTCGGTTCCCTCCTCCTCTGCCTCCCTCTTGTGTCGTTCGTACTCGTTGTTAGGCGAAGCGCGACGCTGCTTTGCTGTAGGCTGCTCCTGTGTTGGGAATTGCGGTGATCGTGGTCGTGGGTTTGTCGGGGTGGGTGGTGTGCGCTGGCGAGCGTGGATGTAGGGGCGGTGTTTGATGGATTGTCTGCCCGAGCTCGGCATGTTTACGTGGTGCGGGAGCTTGGCGTGGTCGAGGTAGTTGTTTGCAGCTTGTGCTCTGTTCGGAGCCGTGAGATAGGGCCAAGGCGCCACTCGGCATAGGTTGCTTGGCGATAACCTGAACTTTGCGCACATTTACGTGCCAATGCCAGAATTAAGCGTGGTTTCAGTTGTGCTGTTTTATGACAGAAAACGTACTAACAGTGTTTAAGTTGACTTTCACTATTTCCGATGTTGCATATAGCTGTTAACTTTTGTTTCGATTTTTGCAAGCGCTATCTTTGAATTATGTTAAAAATGTACCATCTAAAAATTTTATCATGTGCAAATTGACGTTTTACTATAACTGTCGTGTCATTTGCATGTGAATTCTCACTCAATACCCAGTACCATAACAAGAATATATGTTATCCGTCGACACTCTTAGCTAACGGACTTAGCGCAGTAAATCCCATTTTCTTTTGCAACACAACTAGGGTATCTTTAATGATGCAAAACAAGGTCTACATTTGTGTTTTGCGATCAGGGTTCACTCTATCGGTTCAGGGTTTTCTATCGGGGGTCACCGAAATCCTGAAATTTCGGTCCAAAATTTCCGAAATTTTAAACAAAATTTAGTTGAATTTGAACAAATATTATCCAAATTCATGAAAAAATTGAAAAATTGAAAAATTTCGGCCGAATTAATATCTTATCGGGGGTCACCGAAATGACCGAAATTCCGAAATTTCGGTCCGAAATTTCCAACCCTGTTTGCGATATTGTTGTCATTTTCTAATGAGTTCACGTCCTCTACCATAATATCACTACCATTACAGGCACTGACGTGTGGGACAATAGGAGGATAGGACCCACATACTAGTGATTGTAATGGTACTGTAATGGTAGTGACTTTATGGTAGAGGATCCTCACCCTTTTCTGATATACTGGGAATTAATTGCAATGGTTTGACAGGCAGAAGATGGTGTGGGTATCCCTGAGGATGTCTTGAATGACACAAGGTTTGAGAGGGCTATGAGATTCTATTTTGTGTATCTCCGTTTGGATTGGCTGTGGTCACTTAACCTATTTGCTTTGATTCTTTTGAATTTTCTCGAGGTTAGTTATGAAAATGGAACCCATCTATTACATTGTACAGGAAAGCGGCTAAAATCCTGCAAGTCCCATTATGGTCATGTTTTGAGTTGTTTCTTTTGCATTTCAGAAGCCTATCTGGTGCCGGGGATATTCTCAACATGCTTGTGATCAAAGGGATCTTTACTTTCTGGGGCAGTTGCCATACTTGAGCAAAACTGAATCTCTCATATATGAGGTAAGGCTTTGTCTATAAGAGTGGTGTTTCTATGTTCTCTGAAAACTTTAATTGCAGAAAACTTCAAAAACTACAGTCGGTAGTAGATTAATGAGCAGTTGGAAAGTCAGGTCAATAATTTGCTTTTGTAATTACACTCAACTTTGTTGGTGACCATTAAAGCAACCTTTGGTGACTATACTAATCACAGCTTCTCAATATTATTGTTGAGCTTTGAGATGTATTGCATAGTTAGTTGGGCCAGAGCATGGTCATTTGAGTACATTAAAATCTGAATTCCATCATTCTAGATTTTGTATGGTTATTTGTTGTATAACAGGATAATGCACATGCTTTTTTTAACGAACATGTAATGGTCTGTATTGAGGACCGAAAACATTAATCTGATATATTTGACGCAAACTTGCCGTTCTTTTCAATTTCAGGGGCTCACACTTGTTATTCTTGTAATGGATATCTTCTATCCACTGTCCTATGAAGGTTTAAACCTATTCTGGAAGAACACAATAAATAAACTGAAGGTATGGCATCTGTTTATAAAATAGATATATATGAGTATAAATAGCAAGAATAGCATACATGTTTGTTTTTCTAAGATCCATTGATGTGGATAGCATACAAGTATAAACTGAAGTTAAATAAAACTATGTAACTGCAAAAAATAATGGATGATGTGGATTACATCTTGCCCTACTGAGATAAAATCTAAAATTTGAAGGCATATGTGAGTGACCATTCACATATTTAACTACTTTTTGTAAATGAACTATGTGCTTTTACGTATGAGGGATGGCTATTTTTTTGTTAGATTTGACTAGGCCCTTCCAATTTTTGATACAGTTACATTCAAGCTAAATAAACTTCCTTGTTTTAACTAGACTACCCATTGTGCTAACTCTGTCCCTTTTAATTCCTACGCTGCAAACAGACTGTAATCCTGTTGTTTTACTTTAATTAAGCATATGTTTCTCTCTAAAAATGTGTCTTTCTTACTGCTTCACAAACTGTGGTCTATCCATATTTCTGCTTTGTCTTGTAGGTTCTTCTTCTCTTCATCTTAGCATGTGACATACTGGTGTTTGCATTTAGTCCCCAACCTTTCAGAGTAGCTCCTTACATCCGTGTTGCGTTTCTAATAATGAATATCAGGTATGCAGTGTTTTATCTACTCTAGACTACAGTTTCTGCTGCTAGCTTTCTGAATACAGTATGAAGGCTCGTTACTGAATCAATCTCAAAGAAAACTAGCTGGGTGGCCCGCGCAATTGCGCGTAGCACCCATACAAAATTATCTATTTTTTACATATTATTTTACTTAAATTTTGTTAAATAGCTAACTCATTGTCTTAGGACTTTGAAAGACCGAACTTTATCATCCAAGTGTTTCTAATTTTATATTTTTTAGAAGTCATGCTAGTCGCTACCCCTTTATTTGTTGCCGATTTACCACCAGAACCTTTAAAAATTGGACCTTGTAGTTTTTAGAGATCATTGTCTCTCTGTTTTTATAAATTTTAAAAGTTCCATCAAACGCCACCACTGTACTCCTCTACGGCCCGCCCGCTGCCTCCTCTCTTTATTGTCATTGGGGTTTTAAAAATCGAACATAATTATCATTTGGGTTCACCTTTTACTTTGTAGAAGTCCCACCAAACCGTCAGTGGCTTCGCCACTGTACTCTACGGCCCACCCGTGGCCTCCCCTCTTTATTATCATTGAGACTTTAAAAATTGAACATGATTATAATTGGGGTTTATTTTGTAGTTTCTAGAAGACTCGCCAACCAATGTGACTGTGCTGCTTAATGGCCTGCCCGTCGTCCCTCCTCTTAATCATCATTGAGATTCTATTTGGGGGTTTCGTTTATAGTTTTTAGATGTCCCATCGACCATCATCACTTTACTCCTTTACGGCCCTATTGCTTCTTCCCTCATTTGTCATCGTTGTGTTCTAGATGGACTTTTTTTTTTTTGAAAATTCCATATTTTTCACCCTGATATTTTTTTATTTATAAATTGTTTTCCTACTTGAACTCTTATAATTATTTTTCTATGTTTGGAATTTATTTTATTTGTTACTTCGGATTTTAATTAATCTCGTCATGTGTTCTTGATGGTCTCTTCTTTCAATTGTCTTTATTTTTTATTAAGAATTTTAATTATTTATAATTGTATTCCTAGTTGAACTCTTATTTTCCTTTTTATAATTTCTGAATTTATTTTATTTTTTATTTAGATTTTAATTAATCTTGTTTTGTGTTCTATATGGACTATTCTTTCGATGTTACTTTTTTTTATTTTAAATTTTAGTTGTTTCAAAATTGTATTAATATTTGAACTCTATTTTATTTTTCTAATAATTTCTTAATTTATTTTATTTTTTATTCCAAATTTTAATTAATCGTGTATTGGGTTCTTATATGGACTCTTTTTCTAATATTGCTTATTTTTAATTCCAAATTTCAGTTATTTTAAAATTGTATTCGTACTTGGACTCTTCTTTCTTTTTCTCCGATTAATGTGGTAATTTCTAGCCTCCACAACGAACGTGGTGCCTCCTTTCAATGCTATCTTAATAATATAATAGATAGATAGATGACCTAGATTTCTGCAGGATAATCATACTGCATAGCAAAGAGAAGACCCATAAATAATTATAATTAGCGTTCACATAGACACATAGGCAAACACTTACCTGTCCCATTTAGGAAAAGATACATGTCAATGTTAGTTAAGATATATGTTATTTTTTTGATTGTTTGACAGATGTATTAACTGTTCCTTTTGTGACAGGGAACTGCGAATGTGTGCTGTTACACTGGTTGGTATGGTTGGGACATACCTTAATGTTTTGGTAAGACTTTATTAATTATGCAAAATTACTATACTTCTAGCACTGTAGGACATACAATGATTATATTCCTTCAGAATAAGCCATTAGAAGTTTTTGTCTATGCTTGAGAGTCACGGGGACCTTTCGTTACTCTCTTCATCTGATGGTTTGTG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