Difference between revisions of "BGIOSGA001150"
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Revision as of 18:09, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001150 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001150, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02992 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001150-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001150-PA |
| Length |
11318 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:28673563..28684880 |
| Sequence Coding Region |
28684837..28684880,28684708..28684748,28683891..28684054,28683466..28683568,28683225..28683394 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:28673563..28684880 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:28673563..28684880 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGTACAGATTAAGGAACTTGGCGAGGGCAGCAGCCATGCTGGGCAAGTTGTTATAAGAGGGCTGCCTAGCGAATTGTCATATGCTGACCTAGCAGACTATTTCATTAAATATGGAAAGATAGTTGATTTGATTATTATCAGGGCCAAGGGCACAGCCCAGGCAGGGGATTCTGCTAAAATTACTTATGCCGATGCTGCCATTTCTGATAAAATAATCAAGTGCAGGCATATTATCAAAGGAAAACATGTTGTAGTTGATAGAACATTAATGGAAGACACCATTCAGTATAAGGACAAGAAGACAAACCGGAGGATAACTCTGGATGGCCTTCCCTGGACAGTGTCCAATGATGATATTGTGCACTTCTTCTCTCCATATGGAACAGTAGTTGACCATCAGATCACTCAGAAGGATGAAAATAAACTTTCTGAAGGATCAGGGTTTGTGCTCTTCAGTTCTGAGCTAGCTGTAATTAAAATTCTCTCAAATGGCAACACTGTTAATCTTGGTGGTGAAAAGGTGTCTATTAATAGATCAGGTGCTTTTGTTATCGCAGCAACTGGACACCATATAAAACACCCCTTTCTCCTTCCTAGTGAGATATTTTCTAGTCTCTTCCCTCATCAAAAGGATGGGCTTGAATGGCTCTGGAGGCTCCACTGTGAAAAATCCGGTGGGGGAATTCTTGCGGATGATATGGGCCTAGGCAAAACCCGCCAGGCTTCAGCCTTTCTAGCTGGCCTTTTTTATTCCGATTTGACACAAAGGGTATTGATTGTTGCCCCGGGCACAATCTTGCATCAGTGGATTGCTGAATTAACAAAAGTTGGTTTTAATGAAGATCTTATACATAGCTTCTGGTGTGCCAAGACAAGGCATGATTCTCTAGCGCAGGTGCTAAAGGAAGGTGGTGTTCTGCTTATTACGTATGATCTGGTGAGGTTGTATAATGAAGAACTAAACGGCATGAGCAGTAAAAGCTCAAAGATGAGAAGAGCTTGTCCTTCATGGGACTATGTGATTCTTGATGAGGAGTTCCGCAAAATGGTGCGACCTTATTTTCTTAGGCGCACCAAGGAAAGTATTGAAAGCCTTTTACCTAATAAAGCTGATCTTGTCATCTGGCTGAAGCTAACGCCATATCAGATAGAATTATATGAAACATTTATGAAGAGCAATTTGATTGATAAGACAGTGAAGGGATCAACATTTGTTGCAACAATGCTGCTCCAAAAGATATGCAACCATCCTCAGAACTTGACAGCTGTAGATTCCTGTGAGGAACAATTAGCGTTGAAAGAAAACAGGACGTTACAGGGCATTGTCAAAAAACTTGAAGCTTTGATTGCAAAGAATACCACAAAGACATCAAATTGTCTCAAGTCATGCAAGCTTACATTTATACTGCAATTGTTGAAAACATGGCAGGAAAAACTTAAGGAAGAAGGGCACAAGGTGCTAATTTTCTCACAGACGCGCCTAATGCTTGATGAAATAGAGGAGGCACTAACCAACAAGGGAGTACATTTTGCTCGTATGGATGGGACTGTTACAGCTTCTAAAAGAGAAGCTATTATTAAGGGCTTTCAAAGTAAAGATGGGCCTCCCATATTTTTAATGACCACAAAAGTGGGTGGTATAGGTCTAAATTTAACTAATGCTTCCAGAGTTATCATCGCTGATCCATCTTGGAATCCGAGCCTGGATAATCAATGCGTTGATAGAGTGTACAGAATTGGACAGGAGAAGAATGTCATCATCTATAGGCTTATAACCTCGTGTACTATTGAGGAAAGAATATATGAAAAACAGGTATCCAAAGAAGGGATTTTCAAAGCTGCAACAGAAGAACGTGATTTCAGGCGCTACATCAACAAACTGGGTTACAAAGAATTTTTAAAACTTCCTGAGATGGGTTTCGGAACATCCTTATTACAGAAAAGGCTTGAGATAGAGACCATGACAGATAACATGTCTGAGTTAGCAGTGAATCCAAAAGCAAAACCTGTTAGAAATACATCATTCAGAGTTGAAAAAGTTGAAGTAGACCGGACTGTGAAAATTGAAGCTAAAAGGGTTGAGCTAGAATGCAAGACTAAGTTGTATGAACATATCAAGGAAGCAGCTCATGACTCTGGAGCCAATGTTCTTCGACAAATGAAGGCTATTGAAAAAGAGATTTCTGAACTAACATCACAAGAAGAGATAGAAGAAAAGAAAAGGAAAGGGGCCTCGGCCCCCGCCTCCGCGGGTCTGCCACTCTCCCGCACGGGCTCGGTCGCGCCTCTCCGCCACGGCTTCGGTTCCGCCGTCGTCACCGCGCCGCCGGCCGAGGACGAGGACTTCGCCACAGCTGCTGACCTCCAGTTCGAGCCGCCGCTCAAGGTCGTGAAGTACCCCGACCCAATCCTACGGGCTCGCAACAAGCGCATCAATACCTTCGATGACAACCTCCGCAGCCTCACTGACGAGATGTTCGACGTTATGTACAAGACTGATGGAATTGGTCTCTCTGCACCACAAGTTGGGGTGAATGTACAACTTATGGTATTTAATCCAGCTGGTGTGAAGGGAGAAGGAGAGGAGATTGTCCTTGTCAACCCGGTTGTATACAAAATGTCGAAGAGATTGTTAGTGTATGAGGAAAGCTGCTTATCATTCCCTGGGATATATGCCAATGTGGTGAGACCAGACAATGTCAAAATTGATGCTCAGGATGTTACAGGGGCAAAGATTAAAGTTAAATTGTCAGGTCTGTCTGCAAGAGTTTTCCAACATGAATTTGATCATTTACAGGGGATTCTTTTCTTTGACAGGATGTCTCTTGATGTTCTTGAGAGCGTGCGTGAGGGACTGAAGGACCTAGAGAAGAAATATGAGGAAAGTACAGGACTAGCAATGCTGAAAATTCTATCTCCGGTACTTCTTGAACAGGTTCTGGCAGTTTTTCAAAACATCCTGCTGAGCTTCACATTGAAGATTGTGTATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVQIKELGEGSSHAGQVVIRGLPSELSYADLADYFIKYGKIVDLIIIRAKGTAQAGDSAKITYADAAISDKIIKCRHIIKGKHVVVDRTLMEDTIQYKDKKTNRRITLDGLPWTVSNDDIVHFFSPYGTVVDHQITQKDENKLSEGSGFVLFSSELAVIKILSNGNTVNLGGEKVSINRSGAFVIAATGHHIKHPFLLPSEIFSSLFPHQKDGLEWLWRLHCEKSGGGILADDMGLGKTRQASAFLAGLFYSDLTQRVLIVAPGTILHQWIAELTKVGFNEDLIHSFWCAKTRHDSLAQVLKEGGVLLITYDLVRLYNEELNGMSSKSSKMRRACPSWDYVILDEEFRKMVRPYFLRRTKESIESLLPNKADLVIWLKLTPYQIELYETFMKSNLIDKTVKGSTFVATMLLQKICNHPQNLTAVDSCEEQLALKENRTLQGIVKKLEALIAKNTTKTSNCLKSCKLTFILQLLKTWQEKLKEEGHKVLIFSQTRLMLDEIEEALTNKGVHFARMDGTVTASKREAIIKGFQSKDGPPIFLMTTKVGGIGLNLTNASRVIIADPSWNPSLDNQCVDRVYRIGQEKNVIIYRLITSCTIEERIYEKQVSKEGIFKAATEERDFRRYINKLGYKEFLKLPEMGFGTSLLQKRLEIETMTDNMSELAVNPKAKPVRNTSFRVEKVEVDRTVKIEAKRVELECKTKLYEHIKEAAHDSGANVLRQMKAIEKEISELTSQEEIEEKKRKGASAPASAGLPLSRTGSVAPLRHGFGSAVVTAPPAEDEDFATAADLQFEPPLKVVKYPDPILRARNKRINTFDDNLRSLTDEMFDVMYKTDGIGLSAPQVGVNVQLMVFNPAGVKGEGEEIVLVNPVVYKMSKRLLVYEESCLSFPGIYANVVRPDNVKIDAQDVTGAKIKVKLSGLSARVFQHEFDHLQGILFFDRMSLDVLESVREGLKDLEKKYEESTGLAMLKILSPVLLEQVLAVFQNILLSFTLKIVY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..44#133..173#827..990#1313..1415#1487..1656#1864..2064#2161..2294#2378..2426#2886..3014#3441..3554#3628..3705#3872..4063#4136..4219#4296..4376#5172..5290#5366..5477#5761..5829#5907..5998#6454..6589#6911..7031#8305..8427#8544..8682#9151..9343#10139..10249#10616..10678#11049..11084#11223..11318#ATGGTACAGATTAAGGAACTTGGCGAGGGCAGCAGCCATGCTGGGTAAGACACTATCCCCACCCCTTCCCACCATTTCACCAGTTATTTATTGATCTTAATTAACATCAGTGTGGTCTGGTTGGTGCTGCAGGCAAGTTGTTATAAGAGGGCTGCCTAGCGAATTGTCATATGGTAATTTGCTCCTTTATACCCTAGTTAATGAAACCACATCATATTCTGTTAAGTAGGGTGGTTTAAATTTCCATATTATTGCAGGTATTTTTTGGGGATATTATTCCGTTATTTTTTCTGCTCCAAATAAAAGTTTCTAACAGCTCAAAGCAAGTCCTGGAAGATAGATATTCATAGATTCCGTTAAGTACTGTACTTGACAATAAATATCTGACTGGAATGACACACTAGGTTGCTGAGGCAAATTCTTCAATCTGTGTGCTCAGTTTCTGGGTTTTTGTTTCTATATTCTATGCAAGTAGCAAATGGTGCGCACCTATTTCATGAGCCCATTCGTCTGCCCTGGTTGGTATTTATGTTTCCTTATAAATATATACAGTTCAATTGACTCAAAGGCATAACTCCATCATGCGATTTAAGAGATGTTTGTACTTTATGAGTTGAAACTGGTAAGAACAACAGTGAATAATTCCTATAATGGAGGATGATGGATTATAACATCTATTGCACCGGTTCAATGATTACGATTTTCTCATTAACTAATCTGAATTCCATAGTTATAATATTTACAGTCAGCTACCTGGTAAACAGATTTTCCATGGCATACTAACTTTTTGTAATACTAATTTGGTTTCTGTCATTTTTTATGACAGCTGACCTAGCAGACTATTTCATTAAATATGGAAAGATAGTTGATTTGATTATTATCAGGGCCAAGGGCACAGCCCAGGCAGGGGATTCTGCTAAAATTACTTATGCCGATGCTGCCATTTCTGATAAAATAATCAAGTGCAGGCATATTATCAAAGGAAAACATGTAAGTCATTCTCCCAATTTCCATATTCCTACCTAAACAACATGGCTCATCATTCAATGTCTGTTATGTGCTCATTTGAAATTTTTTGTATTCTAATATTCCCAATCTAAATAACTTGGTTAAAAATATTCTAAGTTATTTTTCAAAAGGAGGATTTTAATCCTCGACATATCCAAATGCACTTCCTTACTCATCCTAATTCCCAGCTACCTGCAAGTAAAAACCATATGGATTTTTGTTCCTCTAGAATTATCACATATTTTTCAGTTCCATAATGTCCCAACTGAAAGGTACTTATTGGTTTGTCTATTGATATTTCCAGGTTGTAGTTGATAGAACATTAATGGAAGACACCATTCAGTATAAGGACAAGAAGACAAACCGGAGGATAACTCTGGATGGCCTTCCCTGGACAGTGTCCAATGGTATTATTAATACAGAAGATAGTCATCTGCTTCCTTATAGTGTTAACCTGATGGTTATTTTGATTTCTCAGATGATATTGTGCACTTCTTCTCTCCATATGGAACAGTAGTTGACCATCAGATCACTCAGAAGGATGAAAATAAACTTTCTGAAGGATCAGGGTTTGTGCTCTTCAGTTCTGAGCTAGCTGTAATTAAAATTCTCTCAAATGGCAACACTGTTAATCTTGGTGGTGAAAAGGTGAGTCATAAGCAGTTAATTACAAAGATCATCAATTTTTGTCCTATCTGCGATATTCTATAGTGCAAAATGTGTTGACTCTTCGGCAGAAATTGACAACTCACAATAGTGTTATTGCTATACAACATGAATATGTGATGCTATACAAATAATTGACAGAGGATTTATAAGTTTGTTTTAATAGAATTTCGGTCATTTGTGTTGCAGGTGTCTATTAATAGATCAGGTGCTTTTGTTATCGCAGCAACTGGACACCATATAAAACACCCCTTTCTCCTTCCTAGTGAGATATTTTCTAGTCTCTTCCCTCATCAAAAGGATGGGCTTGAATGGCTCTGGAGGCTCCACTGTGAAAAATCCGGTGGGGGAATTCTTGCGGATGATATGGGCCTAGGCAAAACCCGCCAGGTTTAGTTGAAATTTCCTTTATCCTTCCCTTGAATTCTTGTATGATGTGTTCTTTTCATATAGGCTTCTAATCTAGTTTTTTTTTTTGCTATTCAGGCTTCAGCCTTTCTAGCTGGCCTTTTTTATTCCGATTTGACACAAAGGGTATTGATTGTTGCCCCGGGCACAATCTTGCATCAGTGGATTGCTGAATTAACAAAAGTTGGTTTTAATGAAGATCTTATACATAGGTATGCATTTGTCTTATTTCTCTCTTGCCTTTTAGTTGAAGGAGATAAGCTCAGCTTAATATTCCTTTTTTACTCGGTTGTAGCTTCTGGTGTGCCAAGACAAGGCATGATTCTCTAGCGCAGGTGCTAAAGGTTTGTTATTCAATCTAAATTTATTGAGAAACTAAGTAGAATTTGTGGGAAGTAGCTAAGGGTACAAAAACATGTGAGTTGGATGCAATCTAGTGCAACACCTTGCAAAATACTCGGAACTGGTACAAGAACTTGTTTAATGAATGCAAAAGAGAGCCTGGTTACCCATGTTGGCAAGTTTTGCATCCATCAAACAAGATAGCACACTAGTTTGAGCTTCTTTTTTTTTTGCAAGATATTGCACTAGACTGAACGCACCTAGATGGATGCACCGCCAACACACAAATTTGCTTTAATAAAAAGTTGCATGGAGTTAACATGGAATGAATCACAGCATAGGGTAAATGAATTAAATTTGTCCATACATAAGATTGGAACTATCTTAAATTTCAACCCAATACCTTGCTTTTAAGTTTGGAATATTCTCAATGAGAATATGCTATTGTGAAAATAATGCAGGAAGGTGGTGTTCTGCTTATTACGTATGATCTGGTGAGGTTGTATAATGAAGAACTAAACGGCATGAGCAGTAAAAGCTCAAAGATGAGAAGAGCTTGTCCTTCATGGGACTATGTGATTCTTGATGAGGTCACGTGCTGAAGAACCCAAATACGAAAAATGCTGCTGCGCTGAAAAGCTTATCTCGTGGGCAAACAGTTGTCCTCACAGGAACACCGGTTCAAAATAACCTTTCGGTATATCTTTTTGCATTTCATATCTATACTAGAATGTAATTTTTCATTGAGCTTGTCTTTATGCATTAAGGAAAATGTCACATGCAGGAATTTCATTCACTAATGAGTCTTTGCTGTCCTACTGTCTTGGGCTCTCTTGCTGCTTTTGAAAGAGACTTCTGTAAACCAATTGACATGGGAAATGTGCTTGAGGCAACAACTGAAGTAGTAATGATATCTTCTAAAAAGGCCATGGTATTTTCCTATTTCATCGTTTGCTTTTGTTTCCGAAAACATCTTGTATTATTTGTTCTATTCAGTTATTATTTGTTGCTTGCAGGAGTTCCGCAAAATGGTGCGACCTTATTTTCTTAGGCGCACCAAGGAAAGTATTGAAAGCCTTTTACCTAATAAAGCTGATCTTGTCATCTGGCTGAAGCTAACGCCATATCAGGTAGAAATTACGTTGATGAAAAAGCTACATTCAGTTATTAGCATTATTTATTCCTCTTTTCTTGTGTACGCAGATAGAATTATATGAAACATTTATGAAGAGCAATTTGATTGATAAGACAGTGAAGGGATCAACATTTGTTGCAACAATGGTACTTCTGAAATTTCTCTTTAATCGTCCTTTTTTAAGTTATGTATGGTGCTCTCTCATGATCTTATGGTCCTTGATGGTCTGTAGCACTAGTCGAGTAATTTCCTTAGAGATGGATTGTATCTTTTTTCATAATATTGAGATATTTCATGTTTACATTTAAACAGCTGCTCCAAAAGATATGCAACCATCCTCAGAACTTGACAGCTGTAGATTCCTGTGAGGAACAATTAGCGTTGAAAGAAAACAGGACGTTACAGGGCATTGTCAAAAAACTTGAAGCTTTGATTGCAAAGAATACCACAAAGACATCAAATTGTCTCAAGTCATGCAAGCTTACATTTATACTGCAATTGTTGGTCTGCACTCAATGCTTTTCTTTAGAGCAATGTATGCTTATCCATTGATAATCTTGCATGCATAATACATAGAAAACATGGCAGGAAAAACTTAAGGAAGAAGGGCACAAGGTGCTAATTTTCTCACAGACGCGCCTAATGCTTGATGAAATAGAGGTTTGTATATTTATTTATCTTGTAATAGACTGTAGCATGACACCATTTTTTGAAAATTTATCCCCTATAAAAACAGGAGGCACTAACCAACAAGGGAGTACATTTTGCTCGTATGGATGGGACTGTTACAGCTTCTAAAAGAGAAGCTATTATTAAGGTACATTTCTTCACCTACTTATTTATTATGTTTTTGCTAGATTTCAGTCAATGCTATCCAATCTGTCCTCCAACCTGTTCTCTAGTTTGGGTTTTGTCTTTTGTATTGGGTTTGTTCATTGGATCCAATAGCATAATACTCATCTGGTGCGGGCATGCATGGTGATGGACTGGCTATGCCATTCTATATACTAAGATAATTTTGATGCAGCAAGTTGATTATCCTTTTCTTTCCTGTGGGCTGTATCTGAAAATGCATTTTTATGCTAAGATAGTGTGTATATGTGATGTGAAATGGCCTTGAGTAACGTAGGC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