Difference between revisions of "BGIOSGA001299"
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Revision as of 18:10, 20 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001299 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001299, complete gene. |
| LocusTag |
P0710A02.28-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001299-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001299-PA |
| Length |
9994 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:25802726..25812719 |
| Sequence Coding Region |
25812690..25812719,25812295..25812581,25811989..25812128,25811290..25811371,25811039..25811189 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:25802726..25812719 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:25802726..25812719 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACCGCGTCCTCGAATCCCTCCAGCAGGGGAAAAACGCGCTGCTGGAGAGCCCCACGGGGACGGGGAAGACGCTGTGCCTCCTCTGCTCGGCGCTCGCGTGGCGCCGCACCTTTGGGGAGTTTCTGCGTGGAGGCGGAGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGGAGCCAGCAGCCGCCGTATGGGAGCCAGCCTTCTGGGAGCCAGCACTCGGGGGGTTCGGCGTCGCAGTCGTCTCGGTACCCCGTGATCATCTACGCCTCACGGACTCACAGCCAGCTCCGGCAGGTCATCAAGGAGCTCAAGGCCACCAGTTACAGGCCAAAAATGGCAGTACTGGGCTCCCGCGAGCAGATGTGCATCCACGAGGAAGTGAGCAAACTCCGGGGAAGGCAACAAAACAACGCCTGCCACTACCTCTGCAAGAAACGGTGGTGCCGCCATCACAACTCTGTCGCTGAATTCATGAGGAACAACAGTGAGCTTGGGAGTGAGGCTTGCGACATTGAAGACTTGGTTAATATTGGGAGAACTAAGGGCCCGTGTCCATATTACATCTCCCGGGAACTTTCCAAGTCGGTTGATATTCTTTTTGCTCCATACAACTATCTTATTGATCCAGGAAATCGACGTTCTTTAAATGGAATACCATGGGATAATGCAGTACTTATATTTGATGAAGCACACAACTTGGAGAGTATATGTGCAGATGCTGCATCTTTTGACTTGCTTCCCAATAACCTCTCTTCTTGCATTGCGGAAGCTCAGGAATGCATCCAATTGTGTTCAGCAAAGAGGACCTTTGAAAATTCTGCTGATAAACAATTTGACCCTGAAAATTATGCTATTCTCAAAGCCCTTTTAATGGCACTTGAAAAGAAAATTAGTGAGGTGGTGATTGATTCCAAGGAGCTGGGCCATACAAAACCTGGCAATTACATATATGAGTTCCTCTCTGAACTGAATATTACTTCTGAAACATCCAAAAAGCTAATTGACACAATTGATGGTGCTTCTCTATTACTTGAGGAAGGAAATTCTGCTGAAACTGGACCTGGGATGAAGGCGAAGGCTACTGTCTGTAGATTGGAAACAATCAGGGACATTCTTGACATAATTTTTAGAGGTGGTGGTCAAAGCCATGCAAAGTATTATCGTTTTCATGTGAATGAATGCCAACAAAATTCTGGAGATGCTCTTAAAGTTTTGGGTAAGGTATCAAGGACTCTTAGTTGGTGGTGTTTTAACCCAGGGCTTGCTATGGAAGAGTTTCTCAAGTTGGGTGTGCGCTCGATTATATTAACATCTGGCACTTTATCTCCCTTGGATTCACTTGCCCTGGAACTAAACCTGGAATTTCCAGTTAGGCTAGAGAACCCACATGTCATTGCTTCAGATCAAATCTGGGTTGGAGTTGTGCCTGTAGGCCCATCAGGACATCCACTTAATTCTTCTTACCGGACGCGTGAGACTCTGAAATACAAACAAGAATTGGGTATAACTATTGTTAATTTCGCCCGCATTGTACCAGATGGTCTGCTTGTTTTCTTTCCGTCATATTCTATGATGGATAAGTGTATCAACTGCTGGAAAGATAGGAACCATGAAAATTCAAGTGATGAGCACACAATTTGGCAACGAATCTGCAAGCACAAGCAGCCAGTTATAGAGCCTAGGCAGTCATCGAACTTTCCAAATGCAATCGAGGATTATGCAGCCAAGCTACGTGATTCTTCTACAACCGGGGCAATATTTTTTGCAGTTTGTCGGGGCAAAGTTAGTGAGGGTCTTGATTTTGCTGACCGTGCTGGAAGAGCTGTAATAGTTACTGGAATGCCCTTCGCTACCCCAACTGATCCTAAGGTTCGGCTCAAGCGTGATTATTTGGATAAGCTGGGTTCAGCATCTAACAAGAACTCAAAGGCTTTGACAGGGGAGGAATGGTATGTACAACAAGCGGCAAGAGCTGTCAATCAGGCTGTTGGACGTGTCATTAGACATCGCCATGACTATGGAGCAATTATTTATTGTGATGAAAGGTTTGTTTGGCAAAATTATCAATCTCAGATGTCATATTGGCTGCGACCTTACATAAAGTGCTATAAAAAGTATGGGGAAGTAGTCCAAGGGTTAACAAGATTTTTCCGAGATAAAGTGTCTATTGATTCTTCAAAGCCAAATGAGACAGATTTTAATGATAATATTGTACTGCTTGCAGACAAACATAAACCTCAGGAGACTATATCTGCTTTGGCTGTCACCACAGCAAATGAGAACCAGAGAACTGCATTATCTGTGAATCCAACCACCAAAAGAAGTAACTATATCAAGTTTGCCCAGATCACTCCTGCCAATCGCTCTACCCTTTCTATGAAACATGGCTGTTCATCTACTTCGCAGCTCTTATACTCAGGAGACAAACTGTCTACGGATGCTCAGGTTATTGATTTGGCTGCTGATGTGGCAACAAGTCATCTTGCAGGATATAGATTTAAGTCCTTAGGACCTAAAAAGGCTAAAGTAATGGTTGGATCCAAAGATGTTTGTTTTGATGATGGATCTCCAAAATTGCAACATAATGTTGAGTCAAGAGCTTTGGCTGGGTGCTTGGGTGAGCAATCTACAGCTTCATCAAAGAAGAGTAATATTACACATGCACCTGGAAACAGTGGGGCTATTCATGAGAAATCTGGAGGCCAGGAATCTAATGCAGGGCCGGCCTTCTTGAAGCTGGCTCGAGAAAAGCTCAGTACTGCAGAGTACAGAGATTTTGTTGAATATATGAAGGCCTTAAAATTGAAAACCATGCACATAAAGGACTCACTTGATGCAATAGCAAAACTGTTTTCGTCTCCAGAGCGACTCCCACTTCTTGAAGGGTTTAGGGTTTTTGTTCCTAAGAATCATCTTTCATTATATGAGCAGCTTGTTCAAAGCTATACTGTGCCTAATACATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDRVLESLQQGKNALLESPTGTGKTLCLLCSALAWRRTFGEFLRGGGGGGGGGGSQQPPYGSQPSGSQHSGGSASQSSRYPVIIYASRTHSQLRQVIKELKATSYRPKMAVLGSREQMCIHEEVSKLRGRQQNNACHYLCKKRWCRHHNSVAEFMRNNSELGSEACDIEDLVNIGRTKGPCPYYISRELSKSVDILFAPYNYLIDPGNRRSLNGIPWDNAVLIFDEAHNLESICADAASFDLLPNNLSSCIAEAQECIQLCSAKRTFENSADKQFDPENYAILKALLMALEKKISEVVIDSKELGHTKPGNYIYEFLSELNITSETSKKLIDTIDGASLLLEEGNSAETGPGMKAKATVCRLETIRDILDIIFRGGGQSHAKYYRFHVNECQQNSGDALKVLGKVSRTLSWWCFNPGLAMEEFLKLGVRSIILTSGTLSPLDSLALELNLEFPVRLENPHVIASDQIWVGVVPVGPSGHPLNSSYRTRETLKYKQELGITIVNFARIVPDGLLVFFPSYSMMDKCINCWKDRNHENSSDEHTIWQRICKHKQPVIEPRQSSNFPNAIEDYAAKLRDSSTTGAIFFAVCRGKVSEGLDFADRAGRAVIVTGMPFATPTDPKVRLKRDYLDKLGSASNKNSKALTGEEWYVQQAARAVNQAVGRVIRHRHDYGAIIYCDERFVWQNYQSQMSYWLRPYIKCYKKYGEVVQGLTRFFRDKVSIDSSKPNETDFNDNIVLLADKHKPQETISALAVTTANENQRTALSVNPTTKRSNYIKFAQITPANRSTLSMKHGCSSTSQLLYSGDKLSTDAQVIDLAADVATSHLAGYRFKSLGPKKAKVMVGSKDVCFDDGSPKLQHNVESRALAGCLGEQSTASSKKSNITHAPGNSGAIHEKSGGQESNAGPAFLKLAREKLSTAEYRDFVEYMKALKLKTMHIKDSLDAIAKLFSSPERLPLLEGFRVFVPKNHLSLYEQLVQSYTVPNT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..30#139..425#592..731#1349..1430#1531..1681#1883..2045#2182..2358#2562..2686#3221..3272#3880..4021#4381..4535#4627..4718#4795..4902#4982..5050#5589..5675#6123..6182#6818..6933#7331..7388#7459..7558#8937..8992#9076..9555#9687..9832#9916..9994#ATGGACCGCGTCCTCGAATCCCTCCAGCAGGTAACCCCCCAATCCCCTCCGATTCCCCCCCGTCGGCGCGGAATCGGAAACCCTTCGATTCCATTCGATTTGAGTGATGGGGGCGAGCTCGCCGGATCGATCCGACAGGGGAAAAACGCGCTGCTGGAGAGCCCCACGGGGACGGGGAAGACGCTGTGCCTCCTCTGCTCGGCGCTCGCGTGGCGCCGCACCTTTGGGGAGTTTCTGCGTGGAGGCGGAGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGGAGCCAGCAGCCGCCGTATGGGAGCCAGCCTTCTGGGAGCCAGCACTCGGGGGGTTCGGCGTCGCAGTCGTCTCGGTACCCCGTGATCATCTACGCCTCACGGACTCACAGCCAGCTCCGGCAGGTCATCAAGGAGCTCAAGGCCACCAGTTACAGGTGAAGCCCGATGGCGAGCAAATTACGCTTATCTGTCAGTTGTTTTTATCTAAGCTAACTGCGCCGGATGTATGCTGTTCTGTAATTCCATTTGAATGTCTTTGTCTTGGAGGTCTGGAGTAATGGAGTTAGTGCCCTCGCACTATTAACTCGTTCAGTTTTGTAGGCCAAAAATGGCAGTACTGGGCTCCCGCGAGCAGATGTGCATCCACGAGGAAGTGAGCAAACTCCGGGGAAGGCAACAAAACAACGCCTGCCACTACCTCTGCAAGAAACGGTGGTGCCGCCATCACAACTCTGTCGCTGGTAATTGCAATAGGATCCTTGTTACATATAACCATAAAATTTATCTCTGCACATAAAGTTAAAGCCATGGTAAATCCATGCACACCCACACACATTAGGCATTTCTGTATCATAGGCCCATTTGATTCGTACAAGAAGTTTATTGTCAATGCCACAATCAACAACTTGAATGCTTGAGTCATATAAGTTATCCTTCAAGTCAGATGTTACTGCCGCGCTGATGCTTCTGTAGTACTACCCGTGATGACAAAAAACATATCACCCTTGAATGCACAGTCAAACTATATTTATTTTGGCGAGAACTGCTGTCTAAATGTATAAAATGTAGTTCTGATATTGGAAAATGGTATGAGTAAATTTGATGTGGAAGAACTACCGTGATATTTTACAAAGTTTTCGAATAGACAATGGTCAACTTTAGTGGTTAAAGGGACATCTTGCTTTTCCTTCATAAAAGGGACACCTTGTTGACTTTGAAAATTCAAAACAACTTATTTTTGTTGTCAAAGGAAGTATCTCCCTATGTTCCCATGCTGGCCTGTCCATGTTAGGTATTTTGTTGTAGTTTCTTTTAAACAATTCTTTTACAGATTAACCATATGTTGCTTATCCTGTAGAATTCATGAGGAACAACAGTGAGCTTGGGAGTGAGGCTTGCGACATTGAAGACTTGGTTAATATTGGGAGAACTAAGGGCCCGTAAGTTTCATATTTCATCTGCCCTAACTTGCACACCACATGCACACAACAGAACGCCTACAGATTTTGCTGACTACAATTGTTTTATTTTCCATTTTAGGTGTCCATATTACATCTCCCGGGAACTTTCCAAGTCGGTTGATATTCTTTTTGCTCCATACAACTATCTTATTGATCCAGGAAATCGACGTTCTTTAAATGGAATACCATGGGATAATGCAGTACTTATATTTGATGAAGCACACAACTTGGTATGGAAATACATGCTCCAGTCCTTTGTTCAATCTACAACTATCTGAATATCTGTTTGCTTTAGTGTTAAAACTCTCTTTATGCTTAAGACTTGAGTTAAATGAACCAATCGCAATATTATCTATATACATAAGTTTCATTCAATATATGTCTGGTTATAGTTCTGTTTGTTTCGAATTTACCATTACCCTTTTATGCAGGAGAGTATATGTGCAGATGCTGCATCTTTTGACTTGCTTCCCAATAACCTCTCTTCTTGCATTGCGGAAGCTCAGGAATGCATCCAATTGTGTTCAGCAAAGAGGACCTTTGAAAATTCTGCTGATAAACAATTTGACCCTGAAAATTATGCTATTCTCAAAGGTGAACCATATTTCTTCTTACAGCAGCAAATCATACCTGTATCCATATTCTTAGTTAGAAAGTGTTTACCTATGTTAATGATTCGGACTGTGAGATTTCGTACTGTAATAGACTAATAATCAAACTTTTTCCCCAGCCCTTTTAATGGCACTTGAAAAGAAAATTAGTGAGGTGGTGATTGATTCCAAGGAGCTGGGCCATACAAAACCTGGCAATTACATATATGAGTTCCTCTCTGAACTGAATATTACTTCTGAAACATCCAAAAAGCTAATTGACACAATTGATGGTGCTTCTCTATTACTTGAGGAAGGTAATCAATTTTTCCAGGTTTCTTCTTTCCACTGAAATGTACTATTCCATTTTCTCGATCTGAATAGTTACTTTAAGCTTTCATTATTTTTCTAGCTCTAAGTGTTACCTTAGTTGAACATATTGAATTTCTGATAACTATTGATAATTGTTTGCCGGTTCATGCAAAGCAGTTGAGTGTCTGTATTTTTCCTGCACACTTAGGAAATTCTGCTGAAACTGGACCTGGGATGAAGGCGAAGGCTACTGTCTGTAGATTGGAAACAATCAGGGACATTCTTGACATAATTTTTAGAGGTGGTGGTCAAAGCCATGCAAAGTATTATCGTGTAAGTTTCTCTACCTTAGATAAGTTCTGCTGCTTTCTTCTGTCATTTAATGTTTGCAGCAACCATGCACAATAATATATGATATATACATCTCTCTCTCTCTCTCCCCCCCCCTCTTCCTGACTTCCATTGTCCCTGTTTAGAAGACAGGAAATTTTCTCAATTTCTTGAACTGTTACCTCCAAAATTCCTGTGTTCCAAGTAGGGCTTCAGTTTTTTCATCCTAGGGGTGCAAGCGGGCCGACCCGCGAGTTTAAATAAATAATAATTTATGGGTTTTCGCGTCGCGGCCTGGCTTGCCGCATCTAAATATACAAGTGGATCAATTTATAAACCCATTTATAAGTCAAATTCATAGTTAACCCGCTAGTCAAACCGGCGGGTTACACACTATTTTTGCCTATAAGCGGGTTCGCGGGTAAACCCACTTGCACCCCTATTTCATCCTACCTCTTTTCACACTTTACTGTATAAGCTTGCATACTCTGCTGGAATTTTATGCTTTTACAATTGCACTCATTCTTTTCATTCCAGTTTCATGTGAATGAATGCCAACAAAATTCTGGAGATGCTCTTAAAGTTTTGGGTAAGTTCACTCGTATTATGGTCACTCGTTATTTAAATCTGGTTCAATGTTTTCATGGCTCTGTAGCTGATGCCCATATCTTCTTTTGGTACTAATAATTCATACTTATCTAATAATATTCATCCAAATGCTAATAATTCATACTTATCTAATAATATTCATCCAAATGCTCTCATGCTGTCACCTGACAATTGTTTTTTTCATATCCGTAGTGTAAGCATATTTTTTTTATAGATTTGTATCCATTTAATGGTGGCAGAAGCTGCAAGATCTGCCTTCAGGAGTTGTGTCCAAGCTGACCTCATTTAGTTGCATCAATATTGTACAACTATCTCTTAATGGTGGAATTTACAAGATCTGCTTTTAAGATTTGTCTCCAAGCCTGCAGCATTTAGTTGCATACTTGCATCAATATTATATGTATAATCCATGAGCAAGAGTTAATTGCTCTTTAACTTCCATTGTTTGTATTCGTTCTTCTCTATTTCCATACGCTTAACTCGACTCCTGATACAATTCCCTGTAACCCGAAATATTTAAAAGTTAACATTTGAGTCAGTAATTGTTTACTTATATACTTAATTCTCTAGATTTTCTTATATTGCAGGTAAGGTATCAAGGACTCTTAGTTGGTGGTGTTTTAACCCAGGGCTTGCTATGGAAGAGTTTCTCAAGTTGGGTGTGCGCTCGATTATATTAACATCTGGCACTTTATCTCCCTTGGATTCACTTGCCCTGGAACTAAACCTGTAAGAACAAAGAAGTCTAAATTTTACTTTTATTTTTACTTAATTATCAGCTCACTCAAATTTTATATGTACTCCCTCCGCTCCAAAATATAAATATCTGTACGTTTTTTTAGCAAAAACTAAGGTAGATGGAAAAAAAAATCTCTTTTAGTCACAGTGGTCAAAATTTGAATTGTTTAGATTCTCTTCCCAAGCATCTCATTGGCTGAAAATGTATATAGATTTCCGTGCATTTGAATCAGTGCCCCAGAAATGCTTATATTGTGGTACAAATTTTGAATACTAGAAATGCTTATATTTTGGAACAGAGGGAGTTTTTGACTATTGAATGTTGAGGTCATATGTTTTCATGAATCCAGGGAATTTCCAGTTAGGCTAGAGAACCCACATGTCATTGCTTCAGATCAAATCTGGGTTGGAGTTGTGCCTGTAGGCCCATCAGGACATCCACTTAATTCTTCTTACCGGACGCGTGAGACTCTGAAATACAAACAAGAATTGGGTATAACTATTGGTAGGCAGTTGAGAACACCTAACAGTATGCAGCTGTTTGTATTTTGAAATACCTTTACTGTATGCATCTGATTTGGATACTTGTTTTGCAGTTAATTTCGCCCGCATTGTACCAGATGGTCTGCTTGTTTTCTTTCCGTCATATTCTATGATGGATAAGTGTATCAACTGCTGGAAAGATAGGGTATGTGTAATTTCAATGAGTTAT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