Difference between revisions of "BGIOSGA001492"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA001492

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001492, complete gene.

LocusTag

OsI_02281

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA001492-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA001492-PA

Length

15994

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:21767476..21783469

Sequence Coding Region

21783377..21783469,21781685..21781797,21781497..21781581,21781281..21781391,21781051..21781191
,21780213..21780317,21779987..21780078,21779785..21779908,21778583..21778711
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,21772785..21772866,21772539..21772699,21772282..21772408,21772089..21772189
,21771923..21772007,21771664..21771815,21770759..21770868,21770560..21770682
,21770412..21770477,21770149..21770335,21769947..21770061,21769545..21769667
,21768849..21768967,21768675..21768758,21767476..21767512

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:21767476..21783469 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCCATGGGAAGCAGGCTCGGTGCAAGCCCTGAGATGATTGAGAGGAATATGTCACTAATGCTCTTACTCATAGTTGAAAAGACTGGACCGGATGAACACGAGACACAGCGCAGACTTGCAGGAACAGATGCGAAAGAGATTCAGCGGTTTTATGAGCATTATTGTAAAAAAAATCTTGTGGACGGTCTTAAGACAAAAAAACCGGAGGAGATGGCTAGACACTATCAGATTGCGTCCGTCCTATATGATGTGCTAAAAACCGTGACACCTGAAAAATTTCATGCTGAGTTTGATATATATGCTAAAGAGGTTGAAAAGGAGAAAGCTTCCTTCTCACACTACAACATTCTACCCCTTAATATTTCTGGTCAGCGACAACCAGTAATGGAAATTCCTGAGATTAAAGCAGCAGTGGACCTTCTTCGCAAGATAGACGGCCTCCCGATGCCAAGGCTTGATCCAGTTTCTGCTGAAAAAGAGACAGATGTACCTACTGTCCGTGATTTGTTTGATTGGCTCTGGCTGACATTTGGATTTCAGAAAGGCAATGTTGAGAATCAGAAGGAGCATTTGATTTTGCTGCTTGCAAACATTGATATGAGAAAAGGGGCTAATGCCTACCAAAGTGACAGACACAATCATGTGATGCATAGTGATACAGTTAGATCCTTGATGAGGAAAATCTTTGAAAACTACATTTCTTGGTGCCGATATTTACATTTGGAGTCAAACATAAAAATTCCAAACGATGCCTCCACACAACAACCTGAGATTCTTTACATAGGGTTGTATTTGCTGATCTGGGGTGAAGCTTCTAATGTTCGCTTTATGCCTGAATGTATTTGTTATATCTTCCATCATATGGCAAGGGATTTGTATGACATCATATCTGATAGAAGACAAGATTTTGATCCACCCTTTCGGCGAGAGGGGAGTGATGATGCCTTTCTACAGCTTGTTATTCAACCCATCTACAGTGTTATGAAGCAGGAAGCTGCAATGAATAAACGTGGTAGGACAAGCCACTCAAAGTGGAGAAACTATGATGACCTGAATGAATACTTTTGGTCAAAGAGATGCTTCAAACAGCTTAAATGGCCGATGGATTCAGCAGCTGACTTTTTTGCAGTTCCTCTGAAAATTAAAACTGAAGAGCATCATGATCGTGTGATTACCAGACGGAGAATACCCAAAACAAATTTTGTTGAAGTTCGTACATTTTTGCACCTATTCAGAAGTTTTGATCGAATGTGGGCTTTCTTTATATTAGCCTTCCAGGCGATGGTAATTGTTGCTTGGAGCCCTTCTGGATTACCGTCTGCTATTTTTGATCCTACTGTTTTCAGAAATGTTTTGACAATATTCATAACGGCTGCATTTCTGAACTTCCTGCAAGCCACGCTTGAGATAATTCTTAACTGGAAAGCTTGGAGGAGTCTGGAGTGCTCGCAGATGATACGATATATCCTGAAATTTGTTGTAGCTGTTGCTTGGTTGATAATTCTTCCTACAACGTATATGAGTTCTATTCAAAATTCCACGGGCCTTATCAAGTTCTTCAGCAGCTGGATTGGAAATCTGCAGAGTGAATCGATATATAATTTTGCCGTTGCTCTTTACATGTTACCAAACATATTCAGTGCTTTGTTTTTCATATTTCTACCATTTCGAAGGGTATTGGAGCGTTCAAATTCTCGCATTATTAGATTTTTTTTGTGGTGGACACAGCCAAAGCTATATGTTGCCCGAGGCATGTATGAGGATACATGTTCACTTCTAAAGTATACATTATTCTGGATACTATTGCTCATATGCAAGCTCGCCTTCAGTTTCTATGTTGAGATTTATCCTCTCGTTGGACCAACGAGGACAATTATGTTCTTGGGACGAGGGCAATACGCATGGCATGAGTTCTTTCCATACTTGCAGCATAATTTAGGTGTTGTAATTACTGTATGGGCACCAATTGTCATGGTATACTTCATGGACACACAAATATGGTATGCCATTTTTTCAACAATATGTGGTGGAGTGAATGGTGCCTTCAGCCGCTTGGGTGAGATCCGGACCCTTGGAATGTTAAGATCACGATTCGAGGCAATTCCAATAGCATTTGGCAAACATCTTGTGCCGGGACATGATAGTCAACCAAAGAGACACGAGCATGAGGAAGACAAAATTAACAAGTTCTCTGACATATGGAATGCATTTATTCACTCTTTGAGAGAAGAAGACTTAATAAGCAATAGGGAGAGAAATTTACTGATTGTTCCATCATCTATGGGTGATACTACTGTTTTTCAGTGGCCTCCTTTCCTTCTCGCTAGTAAGATTCCAATTGCACTTGACATGGCTAATAGTGTCAAAAAAAGGGATGAAGAATTGAGAAAGAGGATAAATCAGGATCCATATACCTATTATGCTGTAGTAGAATGCTACCAGACATTGTTTAGTATTCTAGACAGCCTTATTGTGGAACAAAGTGATAAGAAAGTTGTTGATAGAATACATGATAGGATTGAAGATAGCATAAGACGTCAGTCACTTGTAAAAGAGTTCCGATTGGATGAACTTCCTCAGCTAAGTGCTAAGTTTGATAAGCTGCTAAATCTATTGTTGAGAACTGATGAAGACATTGAACCGATAAAGACACAAATTGCCAATTTGTTACAAGATATAATGGAAATCATCACACAGGATATTATGAAGAATGGACAAGGTATTTTGAAGGATGAAAACAGAAACAATCAATTGTTTGCAAATATAAATCTGGATTCAGTAAAAGATAAAACTTGGAAGGAGAAGTGTGTTAGGCTTCAACTATTATTGACAACGAAAGAATCTGCAATATATGTACCTACAAACTTGGATGCTCGTCGCAGGATCACTTTCTTTGCAAACTCACTTTTCATGAAAATGCCAAAGGCTCCACAGGTCCGCAGTATGATGTCCTTTAGTGTTTTAACTCCCTACTTCAAAGAGGAGGTGCTCTTTTCAGCAGAAGACCTTTATAAAAAGAATGAGGATGGAATATCCATACTGTTCTATCTACGGAAAATATATCCAGATGAATGGAAGAATTTTCTTGAGAGGATAGAATTTCAACCAACGGATGAAGAATCACTGAAAACAAAGATGGATGAAATCCGGCCCTGGGCATCTTATAGGGGGCAAACACTCACCAGAACTGTAAGAGGAATGATGTACTACCGCAGAGCACTTGAGATTCAGTGTATTCAAGACAAAACTGATATTGTTAAACTGGAACATCGTAGAACAGTTGAGTCTTCTCAACAGGGGTGGGCCAGTTTCGATATGGCACGGGCAATTGCTGATATCAAATTTACCTATGTTGTCTCTTGTCAAGTCTATGGAATGCAAAAGACATCCAAGGATCCCAAAGACAAAGCTTGCTATTTAAACATCCTTAATCTCATGTTAATGTACCCATCGTTACGTGTTGCTTATATTGATGAAGTAGAAGCTCCAGCTGGTAATGGGACAACAGAGAAGACTTATTATTCTGTTCTTGTCAAAGGAGGTGAAAAGTATGATGAGGAAATTTATCGCATCAAGCTTCCTGGCAAACCTACAGATATTGGAGAGGGAAAACCTGAAAATCAAAACCATGCCATTGTTTTCACCAGGGGAGAGGCACTCCAGGCCATTGATATGAATCAGGATAATTACCTCGAAGAGGCATTTAAAATGAGAAATGTGCTGGAGGAGTTTGAGAGTGAAAAGTATGGAAAGAGAAAACCCACTATATTAGGCCTCCGTGAGCACATTTTTACTGGGAGTGTTTCATCACTTGCTTGGTTTATGTCCAACCAAGAGACCAGTTTTGTTACCATTGGGCAACGAGTCTTGGCTAATCCTCTCAATTTTTATGGCCCTTCATTCATTGATAGACACCACTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPMGSRLGASPEMIERNMSLMLLLIVEKTGPDEHETQRRLAGTDAKEIQRFYEHYCKKNLVDGLKTKKPEEMARHYQIASVLYDVLKTVTPEKFHAEFDIYAKEVEKEKASFSHYNILPLNISGQRQPVMEIPEIKAAVDLLRKIDGLPMPRLDPVSAEKETDVPTVRDLFDWLWLTFGFQKGNVENQKEHLILLLANIDMRKGANAYQSDRHNHVMHSDTVRSLMRKIFENYISWCRYLHLESNIKIPNDASTQQPEILYIGLYLLIWGEASNVRFMPECICYIFHHMARDLYDIISDRRQDFDPPFRREGSDDAFLQLVIQPIYSVMKQEAAMNKRGRTSHSKWRNYDDLNEYFWSKRCFKQLKWPMDSAADFFAVPLKIKTEEHHDRVITRRRIPKTNFVEVRTFLHLFRSFDRMWAFFILAFQAMVIVAWSPSGLPSAIFDPTVFRNVLTIFITAAFLNFLQATLEIILNWKAWRSLECSQMIRYILKFVVAVAWLIILPTTYMSSIQNSTGLIKFFSSWIGNLQSESIYNFAVALYMLPNIFSALFFIFLPFRRVLERSNSRIIRFFLWWTQPKLYVARGMYEDTCSLLKYTLFWILLLICKLAFSFYVEIYPLVGPTRTIMFLGRGQYAWHEFFPYLQHNLGVVITVWAPIVMVYFMDTQIWYAIFSTICGGVNGAFSRLGEIRTLGMLRSRFEAIPIAFGKHLVPGHDSQPKRHEHEEDKINKFSDIWNAFIHSLREEDLISNRERNLLIVPSSMGDTTVFQWPPFLLASKIPIALDMANSVKKRDEELRKRINQDPYTYYAVVECYQTLFSILDSLIVEQSDKKVVDRIHDRIEDSIRRQSLVKEFRLDELPQLSAKFDKLLNLLLRTDEDIEPIKTQIANLLQDIMEIITQDIMKNGQGILKDENRNNQLFANINLDSVKDKTWKEKCVRLQLLLTTKESAIYVPTNLDARRRITFFANSLFMKMPKAPQVRSMMSFSVLTPYFKEEVLFSAEDLYKKNEDGISILFYLRKIYPDEWKNFLERIEFQPTDEESLKTKMDEIRPWASYRGQTLTRTVRGMMYYRRALEIQCIQDKTDIVKLEHRRTVESSQQGWASFDMARAIADIKFTYVVSCQVYGMQKTSKDPKDKACYLNILNLMLMYPSLRVAYIDEVEAPAGNGTTEKTYYSVLVKGGEKYDEEIYRIKLPGKPTDIGEGKPENQNHAIVFTRGEALQAIDMNQDNYLEEAFKMRNVLEEFESEKYGKRKPTILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTIGQRVLANPLNFYGPSFIDRHH</aaseq>

Gene Sequence

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