Difference between revisions of "BGIOSGA002897"

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Revision as of 18:20, 20 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA002897

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002897, complete gene.

LocusTag

P0489A01.6

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA002897-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA002897-PA

Length

18027

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:4824442..4842468

Sequence Coding Region

4824442..4824589,4824705..4826639,4827357..4827432,4829513..4829561,4829658..4830128
,4830208..4830393,4830550..4830843,4831238..4831852,4832637..4833033
,4833126..4833268,4833815..4833985,4834464..4834661,4835173..4835733
,4835820..4835879,4835972..4836288,4836399..4836822,4836958..4837425
,4837524..4837640,4837737..4837858,4837937..4838678,4839056..4839310
,4839406..4839588,4840547..4840885,4841716..4842468

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:4824442..4842468 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:4824442..4842468 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTCTACATCTCGTGAAGTAGATGATGGGCCCGCTGTGCTACAGTTATATAGATGGAAAAGCTCCCAACCGCATCTTGAACTATCGAAATTTCGAGAAGCTTTTATATCTCCTACACGGCGCCTATTTGGGCTGCTCTCGGACCATGGGGATCTTATCTTGTCAATGACCAATGTTGATCAATCACAAGTTGAATCACCTTCCCTCTCAGATAGCTGTAGTCCAGTCGTCTTTGATTGCTTCTCTTCTATTCCTAGAGTGAAGTCTTTAGCATGGGGGCAATGTTATGATGCCTCTAGCCAACTTGAGGATTCAATTTTTAATGAAGTTCTTGTTGTATCTGATGATGATTCTATCACACTTCATGGGTTTTGTCATTCTTACAAAAGCACACTAACAGACAATTCTAAATTGGACACTGGAGATTTGCATGGGGAGTGGAAAGAGTGGCGTCCTACTCAGTGTTCAGTTCCGGAGGATGATGAGGCAGGTACAAAGAACAGTTTTCGTTCTTTTCTGACTACAATCAGTGGATCTGTTTCTGATGGAAAATACCAAGCCAAATTTCCTCTAAAATCTTCACTTCCGCATTCAGCAGAGGTGGTATCGTTTAGCATATACGACATTACTCTATCTTTTATTAAGTTCTGGTCTAGCAATTATCCTTCAAAGACCTGGATGCAAAACGATACTAAATCCCAACAAGGTTTTCTTGGTCATGTTCCTACAACTGAAACATCCTGCAACTGCCAGTGGGAATGTTTGAAGGTTTTGCCTAGTTCTTCAGGTTATTTGATTGGCTTGGTCTTAATTCGTAATGAACCAGTGAGCTGTGAGGTCCATCAACGCAACATGAAGGATATTTTGGTTGTTGTTATTGAGCTAAATCAGTGGGGTATACAGTGGAACTTTGTGGCAGACCTTCAGAATGTATATGATGGTGCTGTTCCTAATCAACAATGGGTTGATTTCCAATTGTCAGATGATTTTCTTGCATGCCTTAACTCGGGAGGGTTTGTTGTCATTTGGAATGTGAGAACTTGTAACATTGCCGCCTCCTTTAGTGTTCTTGAACGGTGCAGAACAGATATAGATATTCCTATGGGGAGCATCACCCCCACCGTAAAAACTTCTGATGGAGAAAATATCTATATTGGGAATCATGCAAGAAGAATGTTTAAGAGGTTAGTTTTGGCATCATATTCTCTTGTTCTTGCTGTCGTAGATGAGGTTGGGGTAATCTATTTGTTCTATGCCAAGGACATCTTAGATTTCAAAACCAGTATGCATGGAAACTTTCATCCGCCTTCCATGTTTTATCGTGGTGATAGTTTTGCTGCCTGGGAAGCTGCTGGTCATGATATTGGGAGTGTAACATTTTGTTGTCATCGGTCTGTACAGCAATTGGTCTATGACTTCTCAGAAAGAGACAATCCTGGTGTTGTCAGGCCTAGGAAAAGAAGAAAACATTGTAGCAGTAATGAAAATCAGGTGGATAGCTGGCCAAGTGGTTTCAGTACTACAACACCGATGAAAGATGGGTTAGCTTACCCTGATACAATGGCAGTTTCCAATCCATTAAGAAGAGTGATCCTTCCACCATGCAGATTACAGGAGAATATAATTAGCCTCTCACCATTTGGGTTAACGAGAATCTTTAAAAGTCACAATGCGGATGGAAACAAGCATTTTAGAATTGTTCACACAAACTTTCTTATGGCTTCATTACACCTTGATGAGAGGGATATTGATGCTAGTTTCCTTAAAAGGTCCTCATTTCAGAAGGACTCTACTTTTACCGGAGAGTGTGTCCTTTGCTCCTTTCAGGGATATGTGTATCTGATTACCCAGGATAGCCTTTCTGTGGTTCTTCCATCAATTTCTGTTTCATCCTTTTCATCTCACAACAATGGCATCAAATTTTGGCAACCGACTTCTGCTGGTGGTAGTGCATGCGATGCTCTGAATTTGTCCTCAGTAAACAGACCTGAAACAAGATGGAAGCCTTGGCAAATAGAAGTTTTGGACAGGGCATTATTGTATGAAGGACCTGCATTTGCAGACAGGCTCTGCTGGGAGAATGGATGGGACCTTAAATTCTCTAGGTTACGTTGGCTGCAATTGGCCTTGCACTACACAAAGATCAGTGATCTTGAGCAAAGTATCCAGAGCCGAATCTCTGCAAAGAACCAGAATTCTATTCGGATGGGTGATGACAAAAACTCATCGAAAATAGGTGCAGAAGTATCACTGAACACTTCACTGCCAATTGTTGTAGTGGATGGTGTTTCAGCAGGACAATCAGGTGGTATAGAATCTCGTGATAGGCAAGAGTCAACACCTGCGATGTTTGAGTTAGTTTCTGGTAGCAATGGACAATTAGCTTTAACTCCAGTTGAATCCTCTATTAGTGCTACTATGCATCATGCCATTGATACTGATCAAGTTGTAATACCAAGTACTCAAGGAAATATCAAAGATATGATGAACCGGTGGGAAACGAATAATCTGGACTTGAGAACTGTAGTAAAAGAAGCACTGCAGTCTGGTAGACTACCTTTGGCTGTCCTTCAATTGCAACTATTGCGCCAGAGGGAATCATTTTCCAACGATCCAGAAGATGTTTTCTCTGAAGTTCATGAAATAGGAAGGTCCATCGTATATGACCTGTTAATGAAGGGTGAAACTGGATTGGCTGTCGCAACCCTGGAAAGACTAGGAGATGACATAGAGTCAGACCTCAGACAACTTATGCAAGGTACAGTCAGGAGGCTACTTAGGCGGCAAATTGCCGAGGAGATGAAGAAGCGTGGGTACATGAGTTCAAATGAGTGGAAGATGCTGGAGATAATATCATTGATTGAGCAATTTTACCCAAGCAGCAGTTTCTGGGACACGTATCTTGGCAGGGAGAATGTCATTCACGATGCTGCAAAAATTGTTACTCTACCAGGAGAAGATAAACCAGTACTAGTTCTCGATATTCATAACCACTGTCCTATTGAATGTGGTGATGTTGATGGAGCTGTGATCGGTTCTTGGGCGAATGTGAATGATTACACTAATTTGAAGGAGTTCTCTGAAAGCAATTTATCTGATGGTTATTGGGCCTGTGCTGCCATATGGTCTGATGCTTGGGATCAAAGAACTGTGGACCGTATTATACTGGACCAGCCTTGTCACGCACATGCGTATGCTCATTTCTCATGGGAATCTCAGTTTGAATATTTTGTTGCTCATAATGATGTGCTGGAAGTCTGCAAACTCCTGGACAGTATTCCTGACAGTGTACTTCTAGAAGGGATTCTTAGAGTGAATGTGGACAATTCACAAGCTACTTACAACACTCTGTCTGACGTAGCAACCCACGATTATAAAATGTACTTATTTGACTCAGAAGAGATAGAACCTGTTTGTATGGAAATACCACATGTCAAAGTGTTCAGATCTTTGTGTAATCATGAATCAACTTCTTGGATGAGAATGATCATGCTACAGGAATTGGCAAAGAAGCATATCTTTATGAAAGAGTACTGGCAAAGCACTACTGAAATTATACCTATACTTGCCCGCGCGGGCATGCTTGTTAATACTTCAGAGCTTTGTTCAGATGTTCTACATGGTGCATACCACCAGGATTGTGACGGAGCATTACACAAATTAGTCCTACGCTTCTGTGTGCAGTATAACACACCAAACCTACTGGACCTCTATCTGGACTACTGTAACTTGGCTCTTGAAAAGGATTCTATTCCTTTGCTCAAGGAAGCTACTGGTGATTGCAAGTGGGCGCAGTGGTTACTCTTCTCCAGGGTCAAAGGTTATGAATACGAGGCATCCTTTTGTAATGCACTTTGGAATCTGTCACAGGAAATGGTTAGGCATAACAATCTTGCTGCTATTGAGATAGATGAAATACTGTACACTGTTGATGATATGGCTGAACGAATCGGGGAAATGTCTGCTCTAGCAACCCTGATGTATGCTTCAACACCAATTCAGAAGTCCATATGTACTGGAAGTGTGAACAGAAATCGTGGGGTATCTTCTCAGTGCACATTAGAGAATCTAAGCCCTCACCTTCAGCAATTTCCAACACTATGGAAGACCCTTCTTTCTTCTTGTTTTGGGCAAGATGGGTATGGTTGTTTAAACTGTTCTCCAACTAATGAGTTTGGGAAATCACCAATTTCAGAGTATTTGCGCTGGCGCTATAACATTTTTTCCTCAGCTGGAGGAGACACTTCATTGTTGCAAATGCTCCCATGTTGGTTCCCAAAGTCTATTAGAAGATTAGTTCAGCTATTTGAACAGGGCCCTTTTGGAATGCAACTGCTATCAAATGCACCATCATCCGAAGAGTTATTTACTCACAGTGTCACAGATTATATATACAATACCGCAGGGTATAGCGAAGCTAATGCTTTGTCCTTAGAAGCATCCATCCAAAAAAGTGTTGAGGAAGAACTATACTCTTCCCTTGAGGAGAAAGACTTGAGGGTGGAACATCATTTGCACCGTGGTCGAGCACTAGCTGCTTTCAGGCATCTTCTTGGTAAAAGAGCTTCACAGTTAAAATCAGCCAATGCAAGCCAAGTGATCTCAGTGCAGTCTAGTGTTCAAGCAGATGTACAATTGATACTAGCTCCTTTAAGTCAAACTGAACGACCTATTCTTCTATCGGTAGCTCCACTTGCTATTACAAACTTTGAGGACTCAACTCTTGTTGCTTCGTGCACATTCCTGTTGGAACTCTGTGGTCTCTGTGCTAACATGCTTCGTCTAGATATTGCTGCACTTCAACGTATCTCCTCCTACTATAAGTCATTTCAGCAAAATAAACAATGTGATCTATCTTCACCGAGGAGTCCTGGGCTACATGTACTCTCCCATGGAGCTGACCTTGCTCCTACTCTTGCCCGAACATTAGCAGAAGATTATATCCAGTCTGATCATCTTCATGTTTTGGAGCAGAAGCAGCCCTCTAAGGC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Protein Sequence

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Gene Sequence

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