Difference between revisions of "BGIOSGA002922"
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Revision as of 18:20, 20 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA002922 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002922, complete gene. |
| LocusTag |
P0512G09.9 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002922-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002922-PA |
| Length |
9957 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:5081626..5091582 |
| Sequence Coding Region |
5081626..5081717,5082579..5082694,5082999..5083207,5084270..5084389,5084502..5084630 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:5081626..5091582 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:5081626..5091582 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAATGGCACAGTGCTCGCCGATGGAGGGGATAGCAGCGAGAAGGGCGGTGGTGGTTCTGGGGGAAGCATCTATATCAAGTCTAAGACTATGCATGGTGCTGGCAAGATAAGTGCTTCAGGAGGGAATGGTCTGGCTGGGGGTGGTGGAGGACGCGTTTCTATTAACGTTTTCAGTAGACATGATGACACCCAAGTTTTTGCTCATGGGGGGAAGAGTTCGGGCTGTCCAGATAATGCAGGAGCTGCCGGAACTCTTTATGAGGCTGTACCTAAGAGTCTTGTTGTTAGCAACAACAACTTGAGTACACAAACTGACACTCTTCTTTTAGAGTTCCCAAATCAACCACTATGGACCAATGTTTTTGTCAAGAATCATGCTAAAGTTGCTGTTCCCTTGCTATGGAGTCGTGTTCAGGTCCAAGGGCAACTTAGTCTTCTATCCGGTGCTATTCTAACTTTTGGTTTGACCCGTTATCCATACTCGGAGTTTGAATTGATGGCTGAGGAGCTTCTTATGAGTGACTCAACAATCAAGGTGTTTGGTGCCTTGAGAATGTCTGTAAAGATGCTTCTTATGTGGAACTCCAAAATGTTAATTGATGGTGGTGGAGATTCAATAGTTGCAACATCGTTACTTGATGCTAGCAATTTGATAGTTCTAAAGGAATCATCTGTAATACACTCTAATGCTAATCTTGGAGTTCGTGGTCAAGGCCTGTTGAATTTATCTGGAGAAGGAGACATAATTGAAGCACAACGACTTATTTTATCTCTATTCTACAGTATAAAAGTTGGACCTGGCTCCATTTTACGGGGTCCACTTGTAAATGGAAGTAGCGGTGACGTGGCACCAAAGCTGAACTGTGAAGATGACATCTGTCCTGTGGAAATAATACACCCACCAGAAGATTGCAATCTGAACTCATCACTGTCATTTACTCTTCAGGTATGTCGTGTTGAAGATATTGACATCTGGGGTCTCGTACAAGGAACTGTAATTCATTTCAATAGAGCTAGAAGTGTCAGTGTGCACACATCTGGTACCATCAGTGCAACAGGCTTGGGCTGCCGAAGTGGAGTAGGACAAGGAAAGATATTAAACAGTGGTGTAAGTGGTGGTGGTGGTCATGGTGGTAGAGGGGGGGATGGCTTTTATAATGAAAGCCATGCTGAGGGTGGATCTATGTACGGTAGTGCTGATTTACCATGTGAACTTGGCAGTGGCAGTGGTAATGACACCACAAAGCTTTCCACCGCTGGTGGTGGTATAATAGTGATGGGCTCATGGGAGTATTCTCTACCAAGTCTTTCCCTCTATGGTTCAGTAGAATCAAATGGTCAAAGTTCCACTGATGTGGTAACAAATGCTTCTATTGGAGGACCCGGTGGTGGTTCTGGGGGCACAATTCTTCTTTTTGTACGTGCTTTGTCCCTAGCGGAGAGCTCCATCCTTTCAAGTGTTGGTGGTCTTGGAAACTTTGGCAGTGGTGGAGGTGGAGGGGGAAGGATTCACTTCCACTGGTCAAACATTCCAACTGGAGATGAGTATGTTCCTGTTGCAGCTGTTAAAGGATCAATACGTACAAGTGGAGGAATCAGCAAAGGGAAAGGATTTCCTGGCGAGAACGGAACAGTTACAGGAAAAGCTTGCCCAAAGGGTCTCTATGGTACATTTTGCAAGGAATGCCCCTTGGGAACGTATAAGAACGTTACTGGATCTTCTAAATCTCTGTGCGTTCAATGCCCTCCAGATGAACTCCCTCATCGTGCGATTTACACAAGTGTCCGAGGAGGTGCTTATGAAACCCCATGCCCATACAAATGTGTATCAGATAGATATCGTATGCCTCACTGTTATACTGCTCTGGAAGAGTTGATATACACTTTTGGGGGACCTTGGTTATTTGGCCTATTACTTTCAGGTCTTCTTGTTTTGTTAGCTCTTGTTTTAAGTGTTGCCAGGATGAAATTTGTTGGTACTGATGAGTTACCTGGGCCTGCACCAACTCAACAAGGATCCCAAATTGATCATTCTTTTCCTTTCCTAGAATCTCTAAATGAGGTCTTGGAAACTAATAGGGCTGAGGAATCGCATGGGCATGTACACAGGATGTATTTCATGGGCCCCAACACCTTCAGTGAACCTTGGCATCTCCCACACACCCCACCAGAACAGATTTCTGAGATTGTGTATGAGGATGCATTTAACCGATTTGTCGATGAGATAAACACTCTTGCAGCTTACCAGTGGTGGGAAGGATCGATTCACAGTATCCTCTGTGTACTTGCATACCCCTTGGCCTGGTCATGGCAACAGTTCCGTAGGAGAAAGAAATTGCAAAGACTTCGTGAATTTGTTCGCTCTGAGTATGACCATTCGTGCTTACGTTCTTGCCGTTCACGTGCGCTTTATGAAGGGCTCAAGGTGACTGCAACTCCTGATCTTATGCTGGGCTATTTAGATTTCTTCCTTGGGGGAGATGAAAAAAGGCCTGATCTTCCACCTCGTCTTCGCCAAAGGTTTCCAATGTGCTTGATCTTTGGAGGTGATGGAAGTTACATGGCTCCATTTTCACTCCATAGTGATAGTGTACTCACTAGCCTTATGAGTCAGGCTGTTCCCTCATCGATATGGCACCGTCTTGTAGCTGGATTGAATGCCCAGTTGCGTTTGGTTCGACGTGGAAATCTCAGAGGAACATTTCTTCCTGTCCTCGACTGGCTTGAAACCCATGCTAATCCCTCTCTGGGTGTGAATGGTGTTCGTGTTGATCTTGCCTGGTTCCAAGCTACAGCATTAGGGTATTGCCAACTTGGTCTTGTCGTTTATGCTGTTGAAGAACCAGTGAGTGCAGAACTTGATGGTAGCCCTAGAATTAAAATAGAGCAACATTCACTAACACAGAACATGCATGCTGATACTCAACTAGGCCATTCTAGAACTAAGGAAGCTCTTATGCGCAAAAGGATCACAGGCGGAATTCTTGATAGTAATAGCTTAAGGACGCTTAAAGACAGGAGAGATTTGTTTTACCCGTTTTCTCTCATCTTGCACAACACTAAACCAGTTGGCCATCAGGATCTTGTTGGCTTAGTAATCTCAATATTGCTTCTCGCAGATTTTAGCTTAGTGTTACTGACTTTTCTCCAGCTATATTCATACTCTATGGCCGATGTTCTCTTAGTTTTATTTGTTCTTCCACTTGGGATACTATCACCTTTTCCTGCTGGAATAAATGCTCTTTTTAGTCATGGACCACGGCGATCAGCAGGCCTTGCTCGTGTGTATGCATTATGGAACATTACTTCACTGGTCAATGTTGTTGTGGCTTTTGCTTGCGGCCTTGTACACTACAAGTCATCAACCAAAAGACATCCTAGTACGCAGCCATGGAACCTTGGAACGGATGAAAGTGGCTGGTGGCTCTTCCCTACTGGACTCATGTTGCTGAAATGCATCCAAGCAAGGCTTGTCGATTGGCATGTGGCTAATTTAGAGATTCAAGACCGCGCAGTATATAGCAATGACCCAAGCATATTTTGGCAGTCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNGTVLADGGDSSEKGGGGSGGSIYIKSKTMHGAGKISASGGNGLAGGGGGRVSINVFSRHDDTQVFAHGGKSSGCPDNAGAAGTLYEAVPKSLVVSNNNLSTQTDTLLLEFPNQPLWTNVFVKNHAKVAVPLLWSRVQVQGQLSLLSGAILTFGLTRYPYSEFELMAEELLMSDSTIKVFGALRMSVKMLLMWNSKMLIDGGGDSIVATSLLDASNLIVLKESSVIHSNANLGVRGQGLLNLSGEGDIIEAQRLILSLFYSIKVGPGSILRGPLVNGSSGDVAPKLNCEDDICPVEIIHPPEDCNLNSSLSFTLQVCRVEDIDIWGLVQGTVIHFNRARSVSVHTSGTISATGLGCRSGVGQGKILNSGVSGGGGHGGRGGDGFYNESHAEGGSMYGSADLPCELGSGSGNDTTKLSTAGGGIIVMGSWEYSLPSLSLYGSVESNGQSSTDVVTNASIGGPGGGSGGTILLFVRALSLAESSILSSVGGLGNFGSGGGGGGRIHFHWSNIPTGDEYVPVAAVKGSIRTSGGISKGKGFPGENGTVTGKACPKGLYGTFCKECPLGTYKNVTGSSKSLCVQCPPDELPHRAIYTSVRGGAYETPCPYKCVSDRYRMPHCYTALEELIYTFGGPWLFGLLLSGLLVLLALVLSVARMKFVGTDELPGPAPTQQGSQIDHSFPFLESLNEVLETNRAEESHGHVHRMYFMGPNTFSEPWHLPHTPPEQISEIVYEDAFNRFVDEINTLAAYQWWEGSIHSILCVLAYPLAWSWQQFRRRKKLQRLREFVRSEYDHSCLRSCRSRALYEGLKVTATPDLMLGYLDFFLGGDEKRPDLPPRLRQRFPMCLIFGGDGSYMAPFSLHSDSVLTSLMSQAVPSSIWHRLVAGLNAQLRLVRRGNLRGTFLPVLDWLETHANPSLGVNGVRVDLAWFQATALGYCQLGLVVYAVEEPVSAELDGSPRIKIEQHSLTQNMHADTQLGHSRTKEALMRKRITGGILDSNSLRTLKDRRDLFYPFSLILHNTKPVGHQDLVGLVISILLLADFSLVLLTFLQLYSYSMADVLLVLFVLPLGILSPFPAGINALFSHGPRRSAGLARVYALWNITSLVNVVVAFACGLVHYKSSTKRHPSTQPWNLGTDESGWWLFPTGLMLLKCIQARLVDWHVANLEIQDRAVYSNDPSIFWQS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..92#954..1069#1374..1582#2645..2764#2877..3005#3086..3211#4148..4203#4302..4401#4492..4609#5025..5234#5323..5635#6232..6325#6547..6655#6936..7207#7290..7417#7525..7759#8261..8449#8536..8819#8909..9089#9177..9419#9595..9677#9810..9957#ATGAATGGCACAGTGCTCGCCGATGGAGGGGATAGCAGCGAGAAGGGCGGTGGTGGTTCTGGGGGAAGCATCTATATCAAGTCTAAGACTATGTAAGTGTTCTTAGAATTGCTTCAAATTCCTTCCTGCTTCCTACATGTGCTAATTGAAATGATGCATGGGCATTTAAACTGCCTAACAAACTTGCAGATTAGAAACAGTTTCCAAAGCTGAGGTCACATATGAATATATTGGTTCAGTAGGATTTATTTCGTATTTATACCTGTTTTTCATTTTGTTATTAATGAGTCATGGATGCGGGGAGGTAGTACTAAACATATTAGGGATTTACAGAGGCTTGCTCGGTCTAATAGATATGAGAACAAGATTTCCTGTCATGCTGTTTATATTTTTGTTAATAAACGATTAGCTGCCACAATGGAATTGCAGCTTCTTCAACGAACAAAAAGAACATGAAGTTATTAAATGTTCAGTCTGGTTGTAATTTTTCTTAACACTTGAGAAGTTAAGGACTAATGTGATAGGAATGTATGAGTTTAGCATATTTAGTATGTAGTCATGAGCTCAAGCTTGACTATGGTACTAGACAATTGGATTTGAGGATTTTTTTTTTGCACTAGGTGTTAATAAGAGAAATTAATGTCACAGTCCAGATTAGTTCAGTGGTTAAATTATGCATATAATTGATTGACTAATAAATGAATATAGGAATAGTTTCATTTTATTGTTACCAACTTTCACAATTGCACATATTTGGTAGTTCAAACCAATCCAGCTAAACACTAGACCACCAATGCAGTAATGAGTGGCATTTGAGTTGAGGAATGCTTTCATTAGCTTGAACTAGCTGTTATTTTGGTTTGTTATAAATCTGTTGACTATGCGCTCTAGTATATTCAATAAGCCCATGCAGAATTGCAAACTTTCCCCTTCTGATCTTCTGTTTGCAACAGGCATGGTGCTGGCAAGATAAGTGCTTCAGGAGGGAATGGTCTGGCTGGGGGTGGTGGAGGACGCGTTTCTATTAACGTTTTCAGTAGACATGATGACACCCAAGTTTTTGCTCATGGTATTGTGCTTGGTCTTATGCACACTGTGACACTGATCCTTTCTTATATCCCTGAAATGCAGATTATCAAATAGCAACTATATATTTGCAGGCAGCATGATCGTACTGTATTGTTTGTCGCAAAATATTCTGAGACTCCTTTTTATTACTGTTAGGCCTCAGTATGTTATTAGTCTTTTGTTTAATGAGATGAAGCTCATATTCTGAGTAACTTTCTAATGATATATAGAATATGGATGGAGCTATAGTGTAGACAATTTTATTGTTTTGTTTATGTTTGAATTAACGTTTATACCTTTTTCAGGGGGGAAGAGTTCGGGCTGTCCAGATAATGCAGGAGCTGCCGGAACTCTTTATGAGGCTGTACCTAAGAGTCTTGTTGTTAGCAACAACAACTTGAGTACACAAACTGACACTCTTCTTTTAGAGTTCCCAAATCAACCACTATGGACCAATGTTTTTGTCAAGAATCATGCTAAAGTTGCTGTTCCCTTGCTATGGAGTCGTGTTCAGGTATGAATCTGTATCTTTCAGATGTTCATTAATTCTCTCTCTACAGATCATGGTTTCTTTACTCTTTAGTATGATATTTGCCATTTTGCTGTCATAAATTCATTGGTTTCTATAATACTTACATGCATATGCACTTCAAATTGTAAGACTGTTAATCTATACTTACTCTTGTTCCTCTTTTTGCATCAGTGGTAGCACGTTGAACAAGTGTGGATAAATTTGTACTGTTAGTGGTGGATCCACCCATTCGGTAGGTTGGGTCGGCTGGCCCAGCTATGGTCCATGTCACCCCACACTCCCCAGAACCCCCTTTTAGTACTGGGCCGCCCATATTAGCCATTATCCACCAGACCATAAGAAGCCCATAAAATTAATTAAGTACTCCAGTCCAGGCATGAGACAATCAATCGTTGTTCCATCTTTCAATTTCGTGATGATGTACCTCTTTGCCAGAGCACCTGACTATTCATCTTTATTGCTTGTCGCTCGACACTTGTCCTCTTCGCTGTGCCGGTTACTATGCTAGCTGCCAGAGTCAGTCTGTGCTAACACTGTGCCGTGCGCGGGCCCGTGGGCACACGACCGCGCCTCTGCCGGTCTGCCCGATGCCCTAGCCAGCAGCCAGCTATGGAGAGGCGACTCTAGAATTATACTCTATTGTGTATCTTTGATGTTCTTTTGTGCCTTAGTTTATTGACTGTAATATGTTTTTTTAATACAATTACAATATAAATATGGTACAGTATATGTTGCGTTTTATTATCTTTATCGAGAATTTTTGCCCCCATCTTTATTTTATAGCTGCGTCTGCCACTGGTACAGTATGATAATTTACACTCAATCAGTAAGGTCTATACATGTTCTTTTTCTGAGTTTGAGGCTGTCTCTGCATTTTGGCAAGTCACATATTTCTTACAGTTTCCATTATTTTGCACTGCACTTCCTTCACGTACATTATGCAAACATGGGAGTTGCCATTACCTGATAATTAGGAAAATGCTTGTCAATATTGCTTTGTGCAATATTTAACGATAGTCCGCAACTTTTTATTTATACTTTCAGGTCCAAGGGCAACTTAGTCTTCTATCCGGTGCTATTCTAACTTTTGGTTTGACCCGTTATCCATACTCGGAGTTTGAATTGATGGCTGAGGAGCTTCTTATGAGTGACTCAACAATCAAGGTGTTATTTTACTATTTGTTCTTGCCATGTATTGTGTTGTTTTATGGTATTCACCTTACTATATGTGCTAAACGCATGCCAATTTCTATGCACCAATATGAATTGTTTTCAGGTGTTTGGTGCCTTGAGAATGTCTGTAAAGATGCTTCTTATGTGGAACTCCAAAATGTTAATTGATGGTGGTGGAGATTCAATAGTTGCAACATCGTTACTTGATGCTAGCAATTTGATAGTTCTAAAGGTAATGTTCACTGTCAATGACTCTTTTTCTCTTCTCTGCCTTAACACTTCGCATAAAAGTTCTGCTCATATATTTGTCAGGAATCATCTGTAATACACTCTAATGCTAATCTTGGAGTTCGTGGTCAAGGCCTGTTGAATTTATCTGGAGAAGGAGACATAATTGAAGCACAACGACTTATTTTATCTCTATTCTACAGTATAAAAGTATGATAACCCTTTGTTCTACTGCATTTTGCTTTAATTCTCCACAGCTTTTCTGTAGTTATTTATTTTTATCTACCACATGGTTGTTGCACCTTCAAAGGAAAGGCTTTTGACTTTAACATGGTGGGTCTGGATTGGCTTCTTTGCCTTAGTTCCCATAAAGGAAAGAAAGTAAAGACTACATTTGCTCCTTGAACTCTGCTCGGAGTCCACTTTCCACCTTGTAACTAAAAAAATGGTTACTTTTTACTCCCATAACAAAACTGGACAAATGTCACTGACAGACAGGTTTTAGTTTTAGTGGTGGTTTTGCCACATCACTCTTTTGTGCCATGGTGCTGACATGTTTAGGGGGTGTACGTTGTTCTGACTGTCTCAGTAAAGAGTGGCAGTGGGGGCGTGCACCTGCGCATATTTAGAGCAGCTCTTGCTGGTGCTGGAGTGGTGAAATGTAAGGTGATGTTCTTCCAATGACAGCTGGACACCATTCATAAGTGTGGTCCACCTCAATGGAAACCACCATTAAAACTAGTATTGGGTGATATTTGCCGGATTTGGAAGTTACTTTTGTATTTTTTGGGGGTGGGTGGGTTGAAAATGGCTGGATTTTGGCTTAGATTGAATATTAGACTCCTGCCAGAGTTAGGGGGCCAAAAAAGTACTTTATTTTAAAAAGGAAAGACATGACAGTGAGACAGGCAGCCAGCTTTCTAAATAAACCTGTCTGTGATGTGATTTGCTTATGTATATTGGATTATTGGATAAAATTTTCTTCACCTGCTGTGTGCTATTGCAGAATTAATTATGACGTGATCACTTCTGCATACTTTCTTTGTTTTGGTGTATTATTTTGTATTTTCCCTGTACTTGTAGTTTTAGGATCTGTACTTGTACTATTATTAAGAAGAGGTTGTGATAAGCATTTTTCTTTTGTAGGTTGGACCTGGCTCCATTTTACGGGGTCCACTTGTAAATGGAAGTAGCGGTGACGTGTAAATACTGCCACCTTCAACATTGAATTGAAATTATCTTTTCTTATGTTTTATATGCCAAAAGATTCATCTCATTTATTCTTGTGTGCATCTATTAGGGCACCAAAGCTGAACTGTGAAGATGACATCTGTCCTGTGGAAATAATACACCCACCAGAAGATTGCAATCTGAACTCATCACTGTCATTTACTCTTCAGGTGCATTCAGTTTTTGAACCTTACCTTGTGATGTGTCATGGATGGGTTCCTTTGCTAGTGTAATGCAAAATTTGACCACTTCTCTTTCAGGTATGTCGTGTTGAAGATATTGACATCTGGGGTCTCGTACAAGGAACTGTAATTCATTTCAATAGAGCTAGAAGTGTCAGTGTGCACACATCTGGTACCATCAGTGCAACAGGCTTGGGTAATTTTTGTACCTTCCTTTTGTTTACCATTCTGTATCATTGGCTTGTTCCCTGCACTTCTGGATCAATGCTGCAGAAATTTGTAGAGTTGCTGGGTTTCTAAGCTTAAGAGAGTTTAAGCTTCTGGATATGGTGCACAT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