Difference between revisions of "BGIOSGA020788"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA020788

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020788, complete gene.

LocusTag

OS06G0645700

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA020788-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA020788-PA

Length

14215

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:27716815..27731029

Sequence Coding Region

27730978..27731029,27729703..27729815,27728679..27728741,27728551..27728593,27728135..27728386
,27727906..27728015,27727313..27727478,27725737..27726742,27724802..27725004
,27724382..27724619,27723780..27724116,27722623..27722811,27722369..27722461
,27721861..27722067,27720731..27720934,27719813..27720296,27719546..27719721
,27719324..27719443,27718701..27718754,27718282..27718611,27717657..27718187
,27716815..27717165

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:27716815..27731029 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:27716815..27731029 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGCGACGGCGAGCGCCGCGAGGACGAGAACCCGACCACCAGTGCCGCAGATGACGATGATGATGAGGATTATGATGAACCTGGTGGAGGGAATCACTTCTTGGGCTTCATGTTCGGCAATGTTGATGATTCTGGTGACTTGGATGCTGACTATCTCGACGAGGATGCAAAGGAGCACCTTTTTGCACTGGCGGACAAGCTTGGCCCATCTTTGAAAGACATTGATCTGATCAAGCCTTCTGCAGCACCAACTGATCCTTCTGAGCAAGACTATGATGCAAAAGCAGAAGATGCTGTTGATTATGAAGATATTGATGAAGAATATGATGGACCTGAAGTTGAAGCAGCTACAGAGGAGGACCATTTGCTATCCAAAAAAGATTACTTCTCTTCAAATGCAGTTTATGCTTCGGTCAATAGTAAAGTTTCAGTGTTTGATGAGGAGAACTACGATGAGGATGAAGAACCACCAAATGATAATGATTTGCCTAGTGATAATATTTTGCAAAACTGCACTTCAGCTTCAGCTGAGCAACTGGATATGGCACCGTCAAATGACAACCTTGCTGTTGAAAAGATGTCTAGTTCGTTATCAGAACCAGAAGAAAGTTTTGAAAGTGAAGCTTTTCAGAAAGAAATGGTTGCTGAAGAGCAACTTGAGTCTAAAACTGCAACTTCCCTCCCAGTTTTATGCATAGAGGATGGGAGTGTTATATTGAAGTTCTCTGAAATTTTTGGAGCCCAGGAGCCTGTAAGAAAAGCCAAAATGGACCGCCATAAGCGCCCAGTGAATAAAGAGCTCCAGATTACAAATTTCACAGATATTGTTGAAGAAGACGAGGAGGTATTTCTACGCAGCACTATTCAAAATTTGTCAGCTTTGAAGCATATCAAGACGAACGATAATTTTGTTGAGAGTGACAGTGATGAGTCAACTTCAGATGTTGCCTTAAGACTGAAAGACTCGTGCCTTTCCGAACAACCGATGAAAGATAAAGATATTCCTACTGCTGTACAATCTCCAGTTTTCCCTGATTTTTATCCACTCGAGCATGAAAATTGGGAAAATGATATTGTTTGGGGCAATTCACCAACAACCGCAATTCAGCCTTGCTTAACAAGCTGTGCAATATCCAAAGAAAGCTTGGATGACCACAATGAAGACCAGGCCGAGGGTTATGTCTCTGGGTGTTGGGATGTACAGAATAAATTTCATAGTTCTTCAGTAATGGCAGATCCTTTTGGGCATACAGAAATACCTGATTCAACTAGTTACCGTTCCCCTGAGAACAGCTATTCTCCATTAAGAAAGGAGACTGCTCAGGAGAATAACAGCTTAGATGAACCAAATAACATAACTCAACCGGTTAAAATCGACACCACACGGCATTTAAACAAGCTCTCTTTACTGAACAAGGAGTTGTTAGAAGGATCTTGGTTGGATAACATAGTTTGGGATCCCAGTGAGGATGTACCAAAGCCCAAGCTAATCTTTGACCTTAAAGATGATCACATGCTTTTTGAAATATTAGATGAAAAGAATGGGGATCACCTCCGCTCTCATGCTCGTGCCATGATTGTTACTCGGCCAATGAAAACTTCAGCAGTGGAAAATGTTGACCATAACAATCAAGCAATTGCATTGAGTGGGAGATTCAACATTTCCAACGACAAATTTTATTCTAACAGGAAAATGTCGCAGCAAGCTAGATCTCATGCTAAAAAGCGTGCTACAATGGGCTTAAAGTTGGTACATTCTGTTCCTGCTCAGAAGCTCCAGACCATGAAGCCAAAGTTGAGCATCAAAGAAATCGCAAACTTCCATAGACCAAAAGCTAAGTGGTATCCACATGAAAATAAACTTACTGCTAGATTTCAAGGAGATGAGTGCAGTCATGGGCCAATGACTGCTATTGTGATGACTTTGGGAGGAAAAGGAGTCAAATTTCTGGTCAATGCAGAGGAAACTCCACTTTCTGTAAAATCAAAAGCTTCCAAAAAGCTTGAATTTAAACCTTCTGAGAAGATCAAATTGTTCTGTTCTGGAAAAGAGCTTCAGGATGACATCTCCTTGGCTATGCAAAATGTGCGACCAAACTCTGTTCTGCATGTTGTTCGCACTGAAATACATTTATGGCCAAAAGCACAGAGATTGCCTGGTGAGAATAAGCCTCTACGTCCTCCTGGTGCATTCAGGAAAAAATCTGACTTGTCTGTTAAGGATGGACATGTATTTTTGATGGAATACTGTGAGGAGAGGCCTTTGCTTCTTGCAAATGCAGGAATGGCTGCACGACTGTGCACGTATTACCAGAAGACTTCACCTTCTGACCAAACAGCTACATCCCTGCGAAGCAACAGTGATGGACTGGGTACAATGCTTGCTATTGATCCCGCTGACAAATCTCCTTTTCTGGGGAACATTCGTTCTGGCTCCCACCAATCATGTCTTGAGACAAATATGTACAGAGCACCTGTATTTCCTCATAAGGTTGCGACGACAGATTATCTTTTAGTTCGTTCACCCAAAGGGATGCTTTCTCTTCGTCGCATTGACAAGTTGTATGCTGTTGGCCAACAGATTTTATTCTCCTGGCAGGAACCTCATATGGAAGTATTTTCACCTGGGACAAAAAATATGCAGAATTATATTCTGAATCGGATTCTTGTGTATGTATATCGTGAGTTCCGTGCTAGGGAGAAGCCTGGTATTATTCCTCAGATTCGAGCTGATGAATTACCTATTCAGCCTCCTATAACAGAGGCTATTAAAGGACCAAAGGGACATTTGTTCTATATTCAGAGACCTGATTTTCGGATTCCATCGGAGGAAGAACTGAGAAGATTATTGACACCTGAAAATGTCTGCTGTTATGAGAGTATGCAAGCTGGCCAGTATCGTCTCAAGCACTTAGGAATTGAGAAGCTTACTCAGCCTGTGGGACTTGCATCTGCCATGAATCAGCTTCCTGATGAAGCTATTGAGCTTGCTGCTGCAGCTCATATTGAGAGGGAATTGCAAATCACTAGCTGGAATCTTACCAGCAATTTTGTTGCTTGTACAAACCAGGACAAGGAAAATATAGAGAGATTAGAAATTACTGGTGTTGGTGATCCATCTGGCCGTGGGCTAGGATTTAGCTATGTACGAGTAACTCCAAAAGCACCTGTATCCAATTCAACACATAAGAAGAAGTCAGCTGCTGCAAAAGGCACCACTGTGACTGGAACAGATGCTGATCTCCGCAGGTTGAGCATGGATGCAGCTCGAGAGTTGCTACTCAAATTTGGCGTTCCAGAAGAGCAAATTGACAAGTTAACAAGGTGGCATCGGATCGCGATGGTGAGGAAGCTTTCAAGTGAACAAGCTGCATCGGGTGTTACAATGGATGAAATTCCAGTTAGTAAGTTTGCACGGGGACAAAGGATGTCTTTTCTGCAGCTTCAGCAGCAAACTAAAGAGAAATGTCAGGAAATTTGGGACAGACAAATTCAGTCACTTTCAGCTATGGACGGCAATGAAAATGGCAGTGACACAGAAGCTAACAGTGATCTTGACTCATTTGCTGGGGATCTTGAAAATTTGCTAGACGCAGAAGAATTTGATGATGAAGATGTTGGTAATACAGACATAAGAAGCGATAAAATGGATGGAATGAGAGGGCTTAAAATGAGAAGGTGTCATACTCAAGCCCAAATTAATGAGGAAATTCAAGATGATGTAGCAGAGGCTGCTCTAGTAGAAAAACTGCTTGAAGAGAGTGATAGTGATATGAAGAGGAAGAAGCAGCCTGTGGAAACTACAAATTATAGCACTCCTATGTATAATCAGGGCAATAAAATGAAGCAGGGTAAGGCTGGCCAAATGATTAAATCGTCTGCATATGCCGGTGCATTAACCCCAAAAGAGAGCACACCAAGAGAAGCCAAGGAGGTTGAAAATTTTGCTGAAGGAAGTTTACCCTCAAAACTAAGAACAAAGACAGGATTTGATGCAAATGATGATATTATTCTAGTAAAAAGGAAAAATATCCCAGGAAAGGATGGGTTCAAGGAAAAGAGACAGGGTGCAAGGGGAGACACTCTTGTATGTGGAGCTTGTGGTCAGCTCGGGCACATGCGGACCAACAAACTGTGCCCCAAGTACGGGGAGGACCCTGAAACATCCGAAATGGATGTCAATTCCATCAGGTCTCATCCTCCTGATATTGTGAGTAATGCTCAAATAAAAACATCAAACAAGAGGTTGGTAGCAAAAGTTTCATCTGAAGCTTTTGAAACTGAAGGACCTGAAAGTATTGAAAAGGCTAAACCTGTCCCTGTAAAATTCAAATGTGGAGCACCTGAGAAGTCATTGGATAGGAACATGTCAATCTCAGCTTCTTTGGTTTCTGATAAACGTATGATGGATGCTACAGATTCGAAATCAACTGGAAAGTGGAGAAGGATCTACCTCGTAAGCCAAATTATTATCAAGCAGCCCAAGGTGCTTGGAGATCAGCAAAGACCTACTGAACTTAGGAGTGGTCAGGAGCCCAGAAAGACAAGGAAAATTGTTGAATTGTCAAGCTTTGAGAAGAGAGACAGAGAGGATGATAATGGTTTTTCTGGACAACCTATTCAGATCAATTCCTCACATGATAGGGGGTGGGGTCTGGTGGGAAAAAGAAGCAAAGGAATAATGGAAAGTAGTGAATCCTGGAGAGCTTTTGAGGAGCAACGAGAGAGACAAGAACAGAGACTAATTGAAGCTAGGATATATGATGCAAGGAGAGAGGATGAGCTCCAGAAGGCAAAGAAGAAAAACAAGAAAAAGAAAAAACATGAATTTCGAGATGATGACCTACTTGATCCTAGGCCATACAAAAATGACAGAAGGGTACCTGAAAGAGGTCGAGCGGCAAAGAGACGTACCCCAGCTGATATGACAGAATACACACCACCAGCTAAGCGGCACAGAGGAGGAGAGGTTGAGCTCTCCAACATATT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Protein Sequence

<aaseq>MGDGERREDENPTTSAADDDDDEDYDEPGGGNHFLGFMFGNVDDSGDLDADYLDEDAKEHLFALADKLGPSLKDIDLIKPSAAPTDPSEQDYDAKAEDAVDYEDIDEEYDGPEVEAATEEDHLLSKKDYFSSNAVYASVNSKVSVFDEENYDEDEEPPNDNDLPSDNILQNCTSASAEQLDMAPSNDNLAVEKMSSSLSEPEESFESEAFQKEMVAEEQLESKTATSLPVLCIEDGSVILKFSEIFGAQEPVRKAKMDRHKRPVNKELQITNFTDIVEEDEEVFLRSTIQNLSALKHIKTNDNFVESDSDESTSDVALRLKDSCLSEQPMKDKDIPTAVQSPVFPDFYPLEHENWENDIVWGNSPTTAIQPCLTSCAISKESLDDHNEDQAEGYVSGCWDVQNKFHSSSVMADPFGHTEIPDSTSYRSPENSYSPLRKETAQENNSLDEPNNITQPVKIDTTRHLNKLSLLNKELLEGSWLDNIVWDPSEDVPKPKLIFDLKDDHMLFEILDEKNGDHLRSHARAMIVTRPMKTSAVENVDHNNQAIALSGRFNISNDKFYSNRKMSQQARSHAKKRATMGLKLVHSVPAQKLQTMKPKLSIKEIANFHRPKAKWYPHENKLTARFQGDECSHGPMTAIVMTLGGKGVKFLVNAEETPLSVKSKASKKLEFKPSEKIKLFCSGKELQDDISLAMQNVRPNSVLHVVRTEIHLWPKAQRLPGENKPLRPPGAFRKKSDLSVKDGHVFLMEYCEERPLLLANAGMAARLCTYYQKTSPSDQTATSLRSNSDGLGTMLAIDPADKSPFLGNIRSGSHQSCLETNMYRAPVFPHKVATTDYLLVRSPKGMLSLRRIDKLYAVGQQILFSWQEPHMEVFSPGTKNMQNYILNRILVYVYREFRAREKPGIIPQIRADELPIQPPITEAIKGPKGHLFYIQRPDFRIPSEEELRRLLTPENVCCYESMQAGQYRLKHLGIEKLTQPVGLASAMNQLPDEAIELAAAAHIERELQITSWNLTSNFVACTNQDKENIERLEITGVGDPSGRGLGFSYVRVTPKAPVSNSTHKKKSAAAKGTTVTGTDADLRRLSMDAARELLLKFGVPEEQIDKLTRWHRIAMVRKLSSEQAASGVTMDEIPVSKFARGQRMSFLQLQQQTKEKCQEIWDRQIQSLSAMDGNENGSDTEANSDLDSFAGDLENLLDAEEFDDEDVGNTDIRSDKMDGMRGLKMRRCHTQAQINEEIQDDVAEAALVEKLLEESDSDMKRKKQPVETTNYSTPMYNQGNKMKQGKAGQMIKSSAYAGALTPKESTPREAKEVENFAEGSLPSKLRTKTGFDANDDIILVKRKNIPGKDGFKEKRQGARGDTLVCGACGQLGHMRTNKLCPKYGEDPETSEMDVNSIRSHPPDIVSNAQIKTSNKRLVAKVSSEAFETEGPESIEKAKPVPVKFKCGAPEKSLDRNMSISASLVSDKRMMDATDSKSTGKWRRIYLVSQIIIKQPKVLGDQQRPTELRSGQEPRKTRKIVELSSFEKRDREDDNGFSGQPIQINSSHDRGWGLVGKRSKGIMESSESWRAFEEQRERQEQRLIEARIYDARREDELQKAKKKNKKKKKHEFRDDDLLDPRPYKNDRRVPERGRAAKRRTPADMTEYTPPAKRHRGGEVELSNILEKIVDHLRTMSCSFLFRKPVTKKEAPDYFDIIERPMDLGTIRDKVRKMEYKNREDFRHDVAQIALNAHTYNLNRHPHIPPLADELLELCDYLLEESADVLDDAEYAIED</aaseq>

Gene Sequence

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