Difference between revisions of "BGIOSGA020967"
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Revision as of 16:33, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA020967 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020967, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_23519 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020967-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020967-PA |
| Length |
9932 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:23735510..23745441 |
| Sequence Coding Region |
23745373..23745441,23743788..23743880,23743576..23743620,23743312..23743473,23742837..23743201 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:23735510..23745441 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:23735510..23745441 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGAGGAACAGCGGTCTGCAAAGAGCTCGTTAACGGATACTACATCATTCATGAGAAGGGTAATGAGAGGACTGGGTACATAACAAACACATATGAAGTCCGCTATGGATTTATAGCAACGATGGATGTTTATGGCTTCTCGTTAACCCCAGGCCAATTGGTCAAACCAGGTGATGAACGCCCTGTTTTTGACCTCTATTGCAAGACGTCGGATCTTAGCTCTCCGTTAACAGATCCCTCCCATATGGACGAAGACTGCCCTGGTTTTCGACCCGAGAGGGGCGCATACATACGTCCTGGCGACCCAATCCCTGGTATCTCACAACCAAATGGAGCCAAGCAATACATCACACTTAAAGTATTCAAGGATATGGCATCAGGGGATTGGTTGGTGCACTATGGGTTTAATAACAAGCATCCTGAACTCGTCGGGCGCATCCCTTTGTCATTCTTCAAAAGTCTATCTTACTCTGCCATCAATATGTGGTTTGGAGGCATTGTAGTTACTAATGTAACTTTTCAACCAACACCTCTTCCACCTCCTATGGGCAATGGTTACATGGCAGTTGACGGTGGCAATATGGCAGCATCCATGAAAAACCTTCAGTTCATTGATGGGCAAGGACGAGCTTGGTCGGCAGAGAATGATTTGATTGGCTTCTCCACCAATGAGAATATCTACACCTTCACATCTATTGTTGGTGACCAGCTTTTCTACGGTGGCCCCTTTCGTAGATTAAACTTTTTACAGATTTTTAGTTGTAAGCATGATTCTACTTTCCATGTCCCTTGGATAGTTATGGCTCCTGCTGCTAAGAGAAATTTGGGTAAAGCACCTATTGTAGATGATTCTGATGAATCTGATTGTGTTGTTAAAGATGTTAAGAAAGAAATATTGAATCGAAAATCTTGTTCTCATGCTTTTCGTTATGCGAAGGATAATAAGCTAAAGGAGGCTGCAAAGATTGATTCATCATTTACAAGGTTTTCCACCAAGTATTTCTGTCGAGTTATATCTGCACTTTCTCCACATCAGAAAACTATTATTCAGGGTGCTGGTTTTCAGAATTTGCTTGAGTTTAACAGCAATTATGTTCCAAATAAATTTGCTACTTGGATTGCAAAACATGTGGATTTTAAGACCTCACAAATAATTTTAAGAGACAAAGTAATTTCAGTTACAAAGCAGACTGTTTGTGACATTTTTGGTTTACCTTCTGGTGGCTTGGAGTTTGGAAAGGATTTTGAAGCTGGAAAGGAATACATTCTTTCGATGTATGGGCTTAGTTGTTTGCCTTCAGTGAGGTTCTTTGGAGACCAGTTCATTAAAAAGGAACCTTTGACAAATGAGAAAGTGATTACTTCATTTCTTATTGTTGCTTTGGCTTGTTTTCTTTGCCCGAATTCTTCTATATTGCCAAGCACCAAGTACCTCACCATTTTTCAAGATGTTAATAATCTGAGGAATTATGATTGGTCCAAATTCATATATGATTGGTCAATGAACTACATGAAGAAGTTTGTGAAGACTAACAGCTTGGGAGGATGTTTGTACATGTGGGCTGTGGTGTACCTTGACAATGTTGAATTTGGTGATAACAATGTTTCAAATGAAATTCCACGTATTTGTGTTTGGAAAAGTGACATGATCCATGCTTATTCTGAGTTTGATAAAATTGATGATGACACTTTTGGTCTTAGGCCTCTAAGGGATTTTAAATCTACTTGCTATTTCCAGCCTCAACCTTGTGATGAAAGAAGGATTTCTTTTCAGCAGAAACTTGACTGTGCTCTTCAGAATATGTTGCCAGTTTACATGAAAGAGAAAATATGTTCTATGTTTGATAGTCATTGCACTTCACTTCATACTATTGATGATTCATCTTGTGGAGATCTTTTGATTTCTGTTCTTGCTATGATTGGTGAAGCTAGCTGTAATGAATCAGATCAAAATGTTGTAATTGAGGAAAATGTAATTGAGAATGTTGGCACTTCTAAAGCTGATGATGACATTGGTATTTCTTCTGCTGGTATTAGTGCTCAAGTTCATGTGCCTAATGATAATGTGTTACCTCATTCTCCTATTCATAATGCTTTTCATGGAAATGAAGATGCTTTTGTTTCTAAATCTGCTGTTGAACTTAATGATTCAAGACAATGTGATGATGATCTGAATTTTGTTACCCCTCAAGTTGGTAATGCTAATCATTCCAAACAGTCTGTTGATGATCTTTTGGATGGTTCTGGAATTGCTGCTGCAGCTGCTGCTATTCATCGTGTTGCAAAAAAATTTAGATCAAGATTTAATGATTATGGGAATGTGGAAAATATCTTTAATCAGTCAAGGCCCTTATTTAGTTTGCTAGATTCTGAAGATGATGCTAGTGATTATGAACATGTTTTCTCAGTTCAGAATGAAGATGAAGGCTCTGAAAATGTTTCCCCTTCTTCAACCCAACCTTTTATTTCTTTTCAATCACTCCCTGAAACTCCAGACAATGATACTTGCAACACTGTCATTAATGAAAACCCTGGAACTAGTGCAGCACATAATTCTCAGAATTCGAATAAGAGGCTTTTTAAAGATGTTACAAATTCTCCTGATGTTGTTTGTTTGGGTGAAAATAAAATTTGTGATTCATCAAAAAGAATGTGTGTTAAAGCTGAACAGTTATATAATTCAACAAATCAACTGAACAAGTACATTCGTGGAATGAGTTCTTCTGGCGGAAAGCTTCCTGTACATGGTCCAAGAAGGGTTTTAGTTCCTGCTAGGCATGCTTCTGATCCTTTTGTCTTTTCTCTAAGGCGTCGTTTTACAGTTTCTGATCAAGAGAATAGATATTATATTGCAATTTGTCGTCTTCCAGATAGTTCAAAGTGGCAGAGTTACTATGCAGTTGATATTGACAATGTCAAAGCAAAGTTCTACAGTTTTGGTCATTCCCTCAAGAAGAATTGTATTGTGTCACCTTATGTCATTTCAGTCTTCTGCCGTGTTTTGTTTCAAGATAGTCATCCATCAAAGTCTAAAAGAAACTACTTTTTTCCATCAATTGGTGCTGAATTGATTAATGATATAAGTGATAAAGGACTGGAAAAGGTTAAGAAGTCATTCGAAGGAGCTACCAATGCTAGAAAATTGCATCTTTGTGACATGTTATATTTTCCTATTCTACATCTTCAACATTGGTTTCTATTCATTGTGGATTTAAAGGATAGAATGCTTGTCATACTAGATTGTGTATATCATGAAGGAGATGATTTCTATGAACCTATTATGACTCAATTGATAAATAATCTCCAGACTTTTTGGGACAAATTTGAATGCTCTCCAATGAATTTTAGCAATTTCAAATTGAAGTTTCCATCTGTTCCAGCCCATATTTCTAGTGCGGATTCTGGGATTTTTGTTATGAAAAGCATGGAATTGTGGTCTCCAAGAGTTATTCTGCAAAATGAATTCTCAAATGACAATATCAGTAACATTCGAGTTCAGTATGCAAATAGAATTTTCTTCCATCCTAGCAACAAGCTTTTAAGTACTGAAGTTGAAGATGTAGTTCTCAATTGGTTTGACCCTGCTAAGTTTCCACGTGTTGATACTCCTGGTGCTGCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGTAVCKELVNGYYIIHEKGNERTGYITNTYEVRYGFIATMDVYGFSLTPGQLVKPGDERPVFDLYCKTSDLSSPLTDPSHMDEDCPGFRPERGAYIRPGDPIPGISQPNGAKQYITLKVFKDMASGDWLVHYGFNNKHPELVGRIPLSFFKSLSYSAINMWFGGIVVTNVTFQPTPLPPPMGNGYMAVDGGNMAASMKNLQFIDGQGRAWSAENDLIGFSTNENIYTFTSIVGDQLFYGGPFRRLNFLQIFSCKHDSTFHVPWIVMAPAAKRNLGKAPIVDDSDESDCVVKDVKKEILNRKSCSHAFRYAKDNKLKEAAKIDSSFTRFSTKYFCRVISALSPHQKTIIQGAGFQNLLEFNSNYVPNKFATWIAKHVDFKTSQIILRDKVISVTKQTVCDIFGLPSGGLEFGKDFEAGKEYILSMYGLSCLPSVRFFGDQFIKKEPLTNEKVITSFLIVALACFLCPNSSILPSTKYLTIFQDVNNLRNYDWSKFIYDWSMNYMKKFVKTNSLGGCLYMWAVVYLDNVEFGDNNVSNEIPRICVWKSDMIHAYSEFDKIDDDTFGLRPLRDFKSTCYFQPQPCDERRISFQQKLDCALQNMLPVYMKEKICSMFDSHCTSLHTIDDSSCGDLLISVLAMIGEASCNESDQNVVIEENVIENVGTSKADDDIGISSAGISAQVHVPNDNVLPHSPIHNAFHGNEDAFVSKSAVELNDSRQCDDDLNFVTPQVGNANHSKQSVDDLLDGSGIAAAAAAIHRVAKKFRSRFNDYGNVENIFNQSRPLFSLLDSEDDASDYEHVFSVQNEDEGSENVSPSSTQPFISFQSLPETPDNDTCNTVINENPGTSAAHNSQNSNKRLFKDVTNSPDVVCLGENKICDSSKRMCVKAEQLYNSTNQLNKYIRGMSSSGGKLPVHGPRRVLVPARHASDPFVFSLRRRFTVSDQENRYYIAICRLPDSSKWQSYYAVDIDNVKAKFYSFGHSLKKNCIVSPYVISVFCRVLFQDSHPSKSKRNYFFPSIGAELINDISDKGLEKVKKSFEGATNARKLHLCDMLYFPILHLQHWFLFIVDLKDRMLVILDCVYHEGDDFYEPIMTQLINNLQTFWDKFECSPMNFSNFKLKFPSVPAHISSADSGIFVMKSMELWSPRVILQNEFSNDNISNIRVQYANRIFFHPSNKLLSTEVEDVVLNWFDPAKFPRVDTPGAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..69#1562..1654#1822..1866#1969..2130#2241..2605#4292..4358#4833..4901#5147..5215#5884..6510#6602..6775#6866..7169#7282..7340#7433..7499#7587..7658#7793..8010#8159..8293#8405..8700#8783..8954#9040..9138#9229..9360#9454..9554#9641..9830#9894..9932#ATGGGAGGAACAGCGGTCTGCAAAGAGCTCGTTAACGGATACTACATCATTCATGAGAAGGGTAATGAGGTCAGTTCTTTACTTGAAACGAACCCGTTTGCATGGATCAAGACTAATATTTATTTTTGCAAATAGTATTATTGCATTGGACATACATATCACGTTTTGCTATAGACATAATTGTAGTTTGGATATAATTGCATTAATTGATCAAACCCGTTATAATCTGATCCCATTATAATTAGCTACGTGTATCTATTTTTATATTAATGTAGTAATATTTATGCTCACTAGGAAAATGGCCCGTGTGTTGCTATATGGTTAAAGATAATTTTTAAAATTTATTAAATTATGTTCGTTGATGTCCTGCTTTCCTGAGCATATTTCCACGACATCTTGCGGAACATGTTTCTTACCAGCTGTTCCATTTTCATACTTGGTTGATAACCGCAATGAAGATTGATACACGCAGCAGAACCCTTCTTAAAGGATCTTCGGTTAGATGTTGTGCGTCGCGAGGATAAGAACATGAGACTGAATAGGATAGGGCGTCGCATGAGATGGAGGAACCTAAGATTTGAGGATGATGCAGACGGACAGCTTATGGGCTTGATCGCTTGCGGCCTGTTGCGTGGTGTATGTGCCACGGAAACTGACTGCGCTAGGAAGACAGGGGAAGACGCTCGCATGACACGGATATATGGATGTGACGATCAGAAAGTTGCGAATTTTTTAAGTAGTTATGATAGAGCGTATATGGTGGTTCATTTTAGTCATCTCTTTCTAGTGTTATACTAGTAAATAGATTGACATACAAGAATTAATATTGCCTGCCATACGGTGTTATATTTGAGAAAATTCTTTGTGTGCCCTGAAATCTTTGCGCTGTTCTGTCCATACCCCTAAGTTTTATCATCTCCTTTATATGCCTATACCTATGAGTTTTCGTTTTGATCTACTCTGTCCCCATTCCATTAGTTGTCGTTAGATTTTTTTAATGACTACCTCCTTACATAGAGGCTAACTTGAAAGGTATACTTCTTAAGGCAAAAACAATTTTAGATTAAAAACAAAGGAGATAATTATATTACTGCAAATTTTAATTTTGAAATTATTTTTAAAATTGATAAAATTTTAAATGGTATTTGACCATCTCTCGCTATGGAGATATATTAAAATTTTTGTTGAAGTTGTTTTAAAAGTAGAAATTTCTGGTTTCTAAGTAGAGGAAACATAGGAAAAGCAAATTATTATTTGTTGAATTTTTGCTCTTTGAAATTTCATTAAATTTGATTGCGATTCTTTTAAAATTTTTATCTTCGATTTGTAAAACGACTCTCATTCAATTAACTATGACTGAAGCTTTCGCCTTAGTAATTATTTTATAAGAAGCTTTTCAACTAACTGAATGGATAGAGTGGTTCAAAATGAGAACTCCAGGGCATACAAGAGAGATGACAAAACTCAAAAGCATGAAAGGGATAGGGAAAAGTTTAGAGGAAAAATAATTTTCTTGTTATTTTTACTTATTTATGTAACTAACTTGTTGTTTATTTCCCAGAGGACTGGGTACATAACAAACACATATGAAGTCCGCTATGGATTTATAGCAACGATGGATGTTTATGGCTTCTCGTTAACCCCAGGCCAATTGGTCAGTTATGGTTCAGTTTGGATCATAACTGATAATGGTGATGCCCCAGCATCCAGTTTAGAAGTATTTCAGATTGGTTGGAGGGAAGGTTTCTTAGTTCTTGTCCCTATTTTTCTCTTAAAGATCATAGCATCAGTTTCTAGTTGATCGTTTAACTATCCTCGTAGGTCAAACCAGGTGATGAACGCCCTGTTTTTGACCTCTATTGCAAGGTAGGTGGTTTTATTTACACATCCATAATATTCGACCTTTTGTATTCTGTTTAGTGATACTCTTGCTGCTACTAAAAATAATCATTTATCTCTTTAAAAAAGACGTCGGATCTTAGCTCTCCGTTAACAGATCCCTCCCATATGGACGAAGACTGCCCTGGTTTTCGACCCGAGAGGGGCGCATACATACGTCCTGGCGACCCAATCCCTGGTATCTCACAACCAAATGGAGCCAAGCAATACATCACACTTAAAGTATTCAAGGTTGGTTTTCATCAATCCATAAATTAATCCTGTTTATCAGTAGATGATACTCCTACGCGAGAACAAGAAAAAAAAGTTTAATCTATTTTCTCTTTGATAATGATGTGCAGGATATGGCATCAGGGGATTGGTTGGTGCACTATGGGTTTAATAACAAGCATCCTGAACTCGTCGGGCGCATCCCTTTGTCATTCTTCAAAAGTCTATCTTACTCTGCCATCAATATGTGGTTTGGAGGCATTGTAGTTACTAATGTAACTTTTCAACCAACACCTCTTCCACCTCCTATGGGCAATGGTTACATGGCAGTTGACGGTGGCAATATGGCAGCATCCATGAAAAACCTTCAGTTCATTGATGGGCAAGGACGAGCTTGGTCGGCAGAGAATGATTTGATTGGCTTCTCCACCAATGAGAATATCTACACCTTCACATCTATTGTTGGTGACCAGCTTTTCTACGGTGGCCCCTTTCGGTAGGCTAGCTTGGGAGCCATATTGCGCACTCATGTCCTTTACTCCTTTTTGCTAATGTTTTTCTTTTACTATCTTTTGTCGTAGCCACCTTTGGCTTAGGCTAAACAATAATTTAGATCACAACTATTGGAATGAATTCGCTATGATATAGTAAAATATTTGTTTGAGTTATTTGTATTAGTTTCATGTAATTATTCTATAGTTAACATTACAACCATACTTGCGATATTATGCTCTCTGTAAGATAATACGGAGATCAAACGAATGCTGATCATTTGTGCATCCGCTCCCTTTAGGTTATCTTTCCCTTCTTCGCATCGTAATAAATGCTATGTGATGAAATCTCTCCGTCAACCGCCATATGTAGTAGACTTCAGTGGTGTACCTATGTACACTTTCCTGATTCACTGTACCTAGTACCTAGGGCAGATTATATAAGTCTAGCTAATTTATATCATTAGAATATCAATCTATAATAATTTTTACGTAATTGCTATACATTTGTCGAAAGATTTTTTGGGTGTGGATTTGTCGTTTTTCCTGCCGTTGGATTAGCTTTTGCGATTCGTGCGGATGGATGGATAGTCTTGCTTGTGGTCAACGTGGGCCCCACCTTTTGTTTTTTTTTCTCAAATTTTGGATTCCGCGCCTGTCCTTACCTGCTTTTTCTCTCTCTCATTCTTTCCCCTCTTCTCGTTTCTTCTCGGTTTCTCCGGCGAGAGAGAGAACGAGAGAACTCGCCGACGATTTCGTTGTCGCGGTGAGATTTCTTCATTTTTCTTCGGTGAAATTGATCTCTCTTGCTTGTAGATTTAGGTGGAGGTGGAGGTCTCTCTCTCATTCTTTCCCCTCTTCTCGTTTTTTCTCAGTTTCTCCGGCGAGAGAGAGGGAGAGCTCGTCGACGATTTTGTCGTTGCGTTGAGATTTTTTCATTTTTCTCCGGTGAAATTGATCTCTCTTGCTTGTAGATTTAGGTGGAGGTGGAGGTTTCTTAAATCGTTGGCTTGTGTGTGTAATTTTTTTGGTTTTTGGTTCATAGGTTGCTCTTTTGCTGTTGATTTTTCTGTTGTTTCTGAAGTGTTCGAACTAGATCTCTAACATTTTGTTTGTTCTCGTTTGGGATTTTTGGTGTATGGATGTGTTTGTTGATCCGATTCGGTGTAGTTGTTCTCTCGTCAAGCATGAGCTCTTTTTGAAACCTATTTTGATTGAGTTTTCTCTTGGTGGTCTTCGAATCTGTTAGGAAGTTAGGTGTTATGTGATGTTCGTGAACTAGATCTGTGTGAGGTAGATCTCGGTAGTTTTCTCTCGTTAGATTAGCAAGTTAGTGTATATATGTGAGCTGTTTGAACAAAATTTGGTGTGCTTGTGTTTTATTATGCTTTAGATCTGGGAATGTTTGTGAGGTGTTCGAATTAGTTGCAGTTGTGTACTGTTCAGGGTAGTATTTTGATGGCTGGCGCGCATGTGTTCTATTATGCTTTAGATCTAGGGATGTTTGTGAGGTGTTCGAATTAGTTGTAGGTGTGTACTTTTCAGGGTAGTATTGATGGCTTGTGAGGTAGAATTGATAACTTGACAGCTAGTTAGTTTCTAAAATTTTGTGATGTCTGAACTTAGTTTGTTGTATTTTTGTTTTTGTTATTATTATTACTGTAATTATTTTTGAATTTTGTATATTGTAGTAGATTAAACTTTTTACAGATTTTTAGTTGTAAGCATGATTCTACTTTCCATGTCCCTTGGATAGTTGTAAGCATTTCCTAATTTTTTACTTCCAAGTTATTCTTGTGTAATTGACAGCTACTAGTGCTTCAAAATCTATTGATTGTTGTTTGTCAGTTTTTTTTTAATTCCTATCAACTGTACCCTGTTTTCTTCATCTTCATTAACTTGCTGTGCCTGTTGATTCCATTCAGCTTGTTGTTATGTTATTTTTCTGCCACCTTCTCCTTGGTATAGCTTGTGTGCAGCTGCTATACTTCTTTAGTGAAATCTTCTGCTTGTTCTTTTGTTTCCATCAGCTGTGTCATGTTGTTGGAGTCTTGTTTCCTTGTGCACTCTCCATGATAAAGCATCTTTAGCTGTGCACTCCTATTTTTTTTTTGTTTTTCTTCTAATTATAGTTGTAA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