Difference between revisions of "BGIOSGA021660"
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Revision as of 16:37, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA021660 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021660, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0024N18.29 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021660-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021660-PA |
| Length |
15843 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:6922291..6938133 |
| Sequence Coding Region |
6937924..6938133,6937058..6937181),complement(6935147..6935233,6934887..6935057),complement(6934655..6934761 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:6922291..6938133 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:6922291..6938133 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGATACCCGCGGCCGCTGGGCCTGGGACGTCCCCGGGTTCGAGCCGCCGCAGCCGGTGGTGGGGGCGGCGGCGGGGATGCCGCTGGCGCCGCCGACCGCCATGCCGAGGGCGCCGCCTACCGCCATGGTGGCCCGCGCCGCAGGGGCCGACGGGGCGGTGGTTCCCGTCGCCGACCGCCTCGACCAGCTCGCGGACAGCGTCCAGCTTGCCAGAGAGGACTGCTTGGAACTTAGACAAGAAGCTAGTGACCTTCTTGAGTATTCCAATGCAAAGCTGGGCCGCGTCACTCGGTATCTTGGATTTCTTGCTGATAGAACTCGAAAATTAGATCAAGCTGCACTTGAAACTGAAGCTAGAATCACTCCTTTGATTCATGAGAAGAAAAGGCTTTTCAATGACTTATTGACCTTGAAAGGCAATGTCAAAGTATTTTGCCGTAGCAGACCCCTATTTGAAGATGAAGGTTCATCAGTAGTAGAGTTTCCAGATGATTTTACTATCCGTGTAAACACTGGAGATGAATCTTTAACCAATCCTAAGAAGGATTATGAGTTCGACAGGGTATATGGACCCCACATTGGGCAAGGTGAACTTTTCCATGATGTTCAACCCCTTGTGCAGTCGGCCTTGGATGGTTACAATGTTGCCATATTTGCTTATGGTCAAAGCCGCTCTGGAAAAACACATACCCTGGAAGGATCTAGCCATGATCGTGGTTTATATCTGCGGAGCTTTGAGGAATTGTTTGATCTTTCAAATTCAGATACTACTTCTACCTCACACTTTAATTTCTATATTACCGCCTGCGAGCTCTACAACGATCAGGTTCGGGATTTGCTATCAGACTCTATAAGCCCCGTCCCAAAAGTTCGCATGGGTGTGCAAGAATCCTTTGTGGAACTTGTGCAGGAGAAGGTTGAAAATCCCCTGGAATTTTCTAATTCGCTAAAGGCTGCACTTGAAAATAGATCCGCGAATTCTTTGAAGGCCATGGTATCACACTTGATTGTTACTATCCACATACACTACAGAAACTATGTAACAGGAGAACACCTGTACAGCAAGCTTTCTTTAGTTGATTTGCCAGCTAGTGAATGCCTCCTTGAAGAAGATGCTAATAGAGACAATGTAACAGATTTCTTGCATGTCTCAAAATCGCTTTCTGCGTTGGGTGATGCTTTAGCCTCATTAAGTGTGAAGAAGGAACCTGTTCTATCCGGGAATTCAAGAATTACACAAATCTTAGCTGATTCTCTTGGAAGTAGCTCAAAGACCTTACTGATCGTGCATGTAAGTCCAAGTGCTTCAAATTTGTCTAGAACCTTGTCTACACTCAGCTTTTCTGCTAGAGCAAAAAATGCTGAACTGAGCCTTGGAAACCGCGATACAATCAAGAAATGGAAAGATGTGGCAAATGATTCACGCAAAGAATTGCATGACAAGGAGAAGGAGGTTCTAGATCTGCGCCAAGAAGTTTTGGGATTAAAGCTCTCTCTTAAAGAGGCTAACGACCAATGTACGCTGCTCTTCAACGAAGTACAGAAGGCCTGGAGAGTTTCTTCTACACTTCAAGCTGATCTGAAGTCTGAAAATTTAATGCTCGCTGAGAAGCACAGGATTGAGAAAGAACAGAACAACCAGCTAAGGGATCAGATTTCTCGTCTTCTGGAAGTTGAACAGGAGCAGAAAATAAAGATGCATGAGCGCGATTTAACAATTCAGTCACTACAGGCAAAACTTAAGTCCATCGAGTCTCAACTTAATGAAGCCCTAAATTCAAGTGATGCTAGATCAACTATTGGGTCTGAATCTGCTTCAGTTATATCTACCCCAAAGATGATGGAGTCAACTGCTGATTCATCCTCAGTGACCAAAAGGCTAGAAGAGGAATTAGCAAAGAGGGATGCCCTTATTGAGAAATTGCATGAGGAGAATGAGAAACTCTTTGACAGACTTGCAGAGAAGTCAGGATTAGGAAGCTCTTCACAGGCTCCAAGTCCTTCAAACAAACAAACTAATGCTCAGGGAAGAGATATAGGAAGGAGTGACAGCACCAAAAGTCAGTCATCAGATGTATTCCCCTTACCAGTGTCACAGGACAAAGCTGGAAACGGTGGAGCTATTGTGAAATCAAGCAATGAGTTAACAAAAACTACACCTGCTGGGGAATATCTTACGTCTGCACTAATGGATTTTGATCCTAATCAGTTTGAGGGAGTTGCCGCGATAGCAGATGGTGCAAATAAGCTTTTGATGCTGCCTTACTTCCACTGTCACTGTGACTATAATGAAACTCCACCCATATCAGATTGGCGTATGGTGTTGGCTGCGGTTATCAAAGCAGGTGCCGCTAGGGAGCATGAGATACTTGCTGAGATCCGAGACGCTGTCTTTTCATTCATCCGCAAAATGGAACCAAGAAAAGTTATGGATACAATGCTAGTTTCAAGGGTTAAGATATTGTACATTAGATCTTTGCTTGCTAGGTCTCCGGAACTTCAGTCAATCAAGGTTTCTCCAGTTGAGCGTTTTCTGGAGAAATCACATACTAGTCGGAGCAGAAGTTCTAGCAGGGGAAGTAGTCCTGGCAGGTCACCTGTTCATCACCACCACGATCATGGTTCACGAACTTCCTTAATCGATGAGCATGTGCATGGTTTCAAAGTTAACATTAAACCAGAAAGGAAATCAAAGTTCTCCTCGATTGTTTTGAAGCTTCGTGGGATTGAGGAGGAGACATGGAGACAACACGTCACTGGAGGAAAGCTTCGGGAAATTACCGAGGAAGCCAAGGCTTTTGCAATTGGAAACAAGGCTTTAGCTGCTCTCTTTGTTCATACGCCAGCTGGTGAATTGCAACGCCAGATCCGAGCATGGCTTGCAGAGAACTTTGAGTTTTTATCTGTAACTGGTGGAGATGTTGCTGGAGCTTCCGGGCAACTTGAATTATTATCAACTGCTATTATGGATGGATGGATGGCTGGCCTTGGTACTGCGAGACCCCCCTCAACTGATGCTTTGGGTCAACTGTTATCCGAGTACACAAAACGAGTTTACACATCCCAACTACATCACTTGAAGGACATTGCTGGCACATTGGCTACAGAGGTGGCTGATGATCCCGCTCATGTCAGTAAGCTACGATCTGCTCTAGAGTCAGTCGATCACAAAAGAAGAAAGATCATGCAACAAATGCGAACGGATACTGTCTTGTTAACCAAAGAAGAAGGTGGTTCACCTATCCGAAATCCTCCAACTGCTGCTGAAGATGCACGATTGGCATCTCTCATATCTTTAGACAACATCATAAAACAAGTGAAGGAAGTAATGAGACAAAGTTCAGCAAGGCCATTGAGAAAATCAAAAAAGAAAGCGTTGCTAGAATCATTGGATGATCTATTGGCACAAATGCCTTCTCTTCTTGACGTTGATCATCCTTGTGCTCAGAAGCAGATCATGGAAGCAAGGAAAGTTGTAGAGTCACTGCAAGAGGATCCCGATGAACCTGCCACAGATTTGAATTCAAACACACTGGGCGAGAGCGAAGTTTCACAGTGGAACGTACTACAGTTCAACACTGGAACATCAGCCCCATTTATCATAAAATGTGGAGCAAATTCGAGCTGTGAACTGGTCATTAAGGCTGACCAAAAAATTCAGGAACCTAAAGGTGATGAGATAATCCGAGTTGTTCCAAAGCCATCAGTTCTTGCAGAAATGAGCTTTGAGGAAATAAAAGGTGTCTTTGAGGAATTACCAGAAGCAATCAGCTTGCTTGCCCTGGCACGAACCGCCGATGGTACAAGAGCCAGATATTCTAGACTGTACAGAACTCTAGCTAACAAAGTACCAGCCTTGAAAGACATCGTTGCGGAGATGGAGAAAGGTGGTGTTTTCAAGGATGTCAGATCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADTRGRWAWDVPGFEPPQPVVGAAAGMPLAPPTAMPRAPPTAMVARAAGADGAVVPVADRLDQLADSVQLAREDCLELRQEASDLLEYSNAKLGRVTRYLGFLADRTRKLDQAALETEARITPLIHEKKRLFNDLLTLKGNVKVFCRSRPLFEDEGSSVVEFPDDFTIRVNTGDESLTNPKKDYEFDRVYGPHIGQGELFHDVQPLVQSALDGYNVAIFAYGQSRSGKTHTLEGSSHDRGLYLRSFEELFDLSNSDTTSTSHFNFYITACELYNDQVRDLLSDSISPVPKVRMGVQESFVELVQEKVENPLEFSNSLKAALENRSANSLKAMVSHLIVTIHIHYRNYVTGEHLYSKLSLVDLPASECLLEEDANRDNVTDFLHVSKSLSALGDALASLSVKKEPVLSGNSRITQILADSLGSSSKTLLIVHVSPSASNLSRTLSTLSFSARAKNAELSLGNRDTIKKWKDVANDSRKELHDKEKEVLDLRQEVLGLKLSLKEANDQCTLLFNEVQKAWRVSSTLQADLKSENLMLAEKHRIEKEQNNQLRDQISRLLEVEQEQKIKMHERDLTIQSLQAKLKSIESQLNEALNSSDARSTIGSESASVISTPKMMESTADSSSVTKRLEEELAKRDALIEKLHEENEKLFDRLAEKSGLGSSSQAPSPSNKQTNAQGRDIGRSDSTKSQSSDVFPLPVSQDKAGNGGAIVKSSNELTKTTPAGEYLTSALMDFDPNQFEGVAAIADGANKLLMLPYFHCHCDYNETPPISDWRMVLAAVIKAGAAREHEILAEIRDAVFSFIRKMEPRKVMDTMLVSRVKILYIRSLLARSPELQSIKVSPVERFLEKSHTSRSRSSSRGSSPGRSPVHHHHDHGSRTSLIDEHVHGFKVNIKPERKSKFSSIVLKLRGIEEETWRQHVTGGKLREITEEAKAFAIGNKALAALFVHTPAGELQRQIRAWLAENFEFLSVTGGDVAGASGQLELLSTAIMDGWMAGLGTARPPSTDALGQLLSEYTKRVYTSQLHHLKDIAGTLATEVADDPAHVSKLRSALESVDHKRRKIMQQMRTDTVLLTKEEGGSPIRNPPTAAEDARLASLISLDNIIKQVKEVMRQSSARPLRKSKKKALLESLDDLLAQMPSLLDVDHPCAQKQIMEARKVVESLQEDPDEPATDLNSNTLGESEVSQWNVLQFNTGTSAPFIIKCGANSSCELVIKADQKIQEPKGDEIIRVVPKPSVLAEMSFEEIKGVFEELPEAISLLALARTADGTRARYSRLYRTLANKVPALKDIVAEMEKGGVFKDVRS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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