Difference between revisions of "BGIOSGA021779"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA021779

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021779, complete gene.

LocusTag

OSJNBB0036B04.22

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA021779-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA021779-PA

Length

16029

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:4761642..4777670

Sequence Coding Region

4777512..4777670,4776297..4776454),complement(4776055..4776216,4775306..4775523),complement(4775109..4775204
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,4761642..4761983

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGCAGCCTGGTGGAGCGGCTGCGGGTGCGGTCGGAGAAGCGGCCGCTGTACACGCTCGATGAGTCCGACGACGACCTCCCGCCGCGCGGCGGGGGCGGGAAGGGGAGGGATCGGCACAGCGACGGCCCCACCGAGCGGATCGAGCGGGAGGACGCGGTTAGCCCTCTTACGGAAATGGAAAAGATATTAGACTGTGAAGAAACAAAACCTGATGCTTCTGAAGAGACTAGTTCTTCTGAGTCCGGATCAAAGAAGAAACCTGTCAAACGATATCTTATAAAATGGAAAGGAATATCACACCTTCACTGCACTTGGGTTTCAGAAAGTGAATATTTGGAAACTGCCAAGATATACCCCCGGCTGAAAACTAGACTCAATAACTTCCATAAGCAAATGGATTCAACGGATAAGTCTGATGATGACTATTCTGCAATTAGACCTGAGTGGACTACTGTTGACAGGATCCTTGCTACCAGAAAAAGCTCTACTGGTGAAAGGGAGTACTATGTGAAATGGAAGGAACTAACATACGACGAATGTACTTGGGAAAATGACTCCGACATTGCAGTCTTTCAGCCTCAGATTGAACGCTTCAATGAGATTCAGTCCAGGAGGAAGAAGTCTACTGACAAGTGCAAGAGTGTCACTCGTGAGATACGTCAATATAAGGAGAGCCCGAAGTTTCTCTCTGGTGGGACACTACATCCCTACCAGCTTGAAGGGTTAAACTTCTTACGCTATTCTTGGTACCATAATAAACGTGTAATACTTGGGGACGAGATGGGTCTTGGTAAAACGATACAGAGTATTGCCTTTTTGGGCTCTCTATTTGTGGACAAGCTTGGTCCTCATCTGGTCGTTGCACCCCTTTCAACCTTGCGAAATTGGGAGCGTGAATTTGCAACTTGGGCACCTCAAATGAATGTTGTAATGTATTTTGGATCCGCAGCTTCTCGTGAAATTATTAGGAAGTATGAATTTTACTACCCCAAAGAGAAACCTAAGAAGCTTAAGAAAAAGAAATCATCTCCATCTAATGAAGACAAGAAACAATCAAGAATAAAATTTGATGTCCTTTTGACATCTTATGAGATGATCAATATGGATTCTACTGTTCTAAAAACCATAGAATGGGAATGCATGATTGTGGATGAGGGGCATCGTTTGAAGAACAAAGATTCCAAGTTGTTCGGTCAACTTAAAGAGTATCATACTAAGCATCGTGTTCTCTTAACGGGAACCCCAGTTCAGAACAACCTGGATGAACTTTTCATGCTTATGCACTTCCTTGAGGGTGACAGTTTTGGTAGTATAGCTGATCTCCAAGAGGAATTCAAGGACATAAACCAGGACAAACAAGTTGAGAAGCTCCATGGAATGCTGAAGCCGCATCTTCTTCGGCGATTCAAGAAAGATGTTATGAAAGAACTTCCTCCGAAAAAGGAGCTGATTTTACGTGTTGAGCTTACAAGCAAACAAAAAGAGTACTATAAAGCAATTCTCACCAAGAATTATGAAGTGTTAACTCGTCGTAGTGGTGGACATGTTTCACTTATTAATGTTGTAATGGAACTACGCAAACTTTGTTGCCATGCATTCATGACAGATGAACCCGAAGAGCCTGCCAATTCAGAAGAAGCTTTAAGGAGGCTTTTAGAATCTTCTGGAAAAATGGAGCTGCTTGACAAGATGATGGTGAAACTGAAAGAGCAGGGTCACAGGGTTCTTATTTATTCACAGTTCCAGCACATGTTGGACTTACTTGAGGATTATTTAAGCTACCGGAAATGGAGTTATGAGCGTATTGATGGAAAAATAGGTGGTGCTGAGAGGCAGATACGAATTGATCGCTTCAATGCTAAAAATTCTACTAGGTTTTGCTTTCTTCTTTCAACCAGAGCTGGTGGTCTTGGTATAAATCTGGCAACTGCCGATACTGTAATTATTTATGACAGTGATTGGAATCCTCATGCTGATTTACAAGCTATGGCGAGAGCCCATCGCTTAGGGCAGACAAGCAAGGTTATGATATATAGGCTTGTTAGTCGTGGTACAATTGAGGAGCGGATGATGCAACTTACAAAGAAAAAAATGGTATTGGAGCACTTAGTTGTTGGGCGTCTCACGAAAGGCACTAATATTGTCCAGGAGGAGTTGGATGATATTATTCGGCATGGCTCAAAGGAACTTTTTGACGATGAAAATGATGAAGCCGGAAAATCTTGCCAAATCCATTATGATGATGCTGCGATTGATAGATTATTGGACCGTGACCAAGCTGACGGGGAAGAGCCTGTGGAAGATGAAGAAGAAGACGAATTTCTAAAAGGATTCAAGGTTGCTAACTTTGAGTACATAGATGAAGCTAAGGCTTTAGCTGCAAAAGAGGAGGAGGCACGCAAAAAGGCCGAAGCTGAAGCTGCAAACTCTGACAGAGCAAATTTTTGGGATAAATTATTGAAGGACAGATACGATGTACAAAAAGTTGAAGAGCATACTACTATGGGAAAAGGAAAAAGGAGCCGCAAACAGATGGCTGCTGCTGATGAGGACGACATTACCGGCCTGCATGACATGAGTTCTGAAGATGATGATTACTCTTATGATGATGATGTGTCAGATAACGACACAAGTTTACAATCAGGCCTTGCTGGGAGGAGGGGCCCATATTCCAAGAAAAAACAACGTAATGTTGATTCACTTCCATTCATGGAGGGCGAAGGACGGGCTTTGAGAGTTTATGGGTTCAACCAAATTCAGCGAACACAATTCCTTCAAACGCTTATGAGATATGGTTTTCAGAACTACGATTGGAAGGAATTTACTCCTCGATTGAAGGGGAAAAGTGTTGAGGAAATCCAGAGATATGCTGAACTTGTCATGATCCATCTTCTTGAGGACATCAATGACTCAGGATATTATGCAGATGGCGTGCCAAAGGAAATGCGCACAGATGAGACATTGGTCAGGCTAGCCAACATATCACTTGTGGAAGAGAAGGTGGCTGCCATGGAACAAGGAAAAATAACAAAACTCTTTCCCAGCTATTTGTTATATGAATTTCCTAGCTTAGTTGGTGGAAGAGTATGGAAAGCGGAACAGGATCTACTGTTGCTGAAAGCATTAATAAAGCATGGGTATGCAAGGTGGCAATATATATCAGATGACAGAGATAATGGGATTTTTGAGGCTGCACGACAAGAGCTGAGGCTTCCTACTGCTAATGAACTGATTAGTTCTCACTCAAACAATGAGACAAACGGAAATCTGGAAAGCACACAAGAAGGCCAGTCGAACCCAACGAGCATGATCCATTACAGGGATACACAGAGAAAGATAGTTGAGTTTATTAGAAAGAGATACCATCTTTTGGAGAGATGTTTGAATCTTGAATACGCTGTGATTAAAACAAAAACCCCTGTTCCTGATGATCTCGCTGAACAAGATTTTCCTGGTGGTCATAGACCGGCCGTTCCAGACTACAGTGAAATGCTGAGAGAATTGCCTGTCCTTGAACCTATTTCCAAAGAAGTGGCGCCTGAAGGCACAACTGATCAGTCACAAGTTTCCCATCTTTACAACAAGATGTGCTTTGTCCTTGAAGACAGTGCTGTTCCTGCACTCAACTCGCATTTCGGTGACAAGGCAGCTTCCTCCGGTTTAGCCAATAGCCTCCATAAGTTTGAAGCTGTATGCGAAGACGTTAGTCGCATCTTGAGATCCCATGAAAATGGTACCACTCCCAAAGAGGAAGTTATGCTAGATGCAAGCTCCAAAGAGACCACGTCTCCAAAAGATCCAGCAACCGAGGTGCCTTCGTCAGCTTCCAAAGAAGCTACGCCTCCAGTACAAGATCCAGTCATAGAGGCAGTGAAGGAGGAGCCACCCACTGTTAAGGCGGAGGACAAAATGGAAATCGATAGTTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSSLVERLRVRSEKRPLYTLDESDDDLPPRGGGGKGRDRHSDGPTERIEREDAVSPLTEMEKILDCEETKPDASEETSSSESGSKKKPVKRYLIKWKGISHLHCTWVSESEYLETAKIYPRLKTRLNNFHKQMDSTDKSDDDYSAIRPEWTTVDRILATRKSSTGEREYYVKWKELTYDECTWENDSDIAVFQPQIERFNEIQSRRKKSTDKCKSVTREIRQYKESPKFLSGGTLHPYQLEGLNFLRYSWYHNKRVILGDEMGLGKTIQSIAFLGSLFVDKLGPHLVVAPLSTLRNWEREFATWAPQMNVVMYFGSAASREIIRKYEFYYPKEKPKKLKKKKSSPSNEDKKQSRIKFDVLLTSYEMINMDSTVLKTIEWECMIVDEGHRLKNKDSKLFGQLKEYHTKHRVLLTGTPVQNNLDELFMLMHFLEGDSFGSIADLQEEFKDINQDKQVEKLHGMLKPHLLRRFKKDVMKELPPKKELILRVELTSKQKEYYKAILTKNYEVLTRRSGGHVSLINVVMELRKLCCHAFMTDEPEEPANSEEALRRLLESSGKMELLDKMMVKLKEQGHRVLIYSQFQHMLDLLEDYLSYRKWSYERIDGKIGGAERQIRIDRFNAKNSTRFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHADLQAMARAHRLGQTSKVMIYRLVSRGTIEERMMQLTKKKMVLEHLVVGRLTKGTNIVQEELDDIIRHGSKELFDDENDEAGKSCQIHYDDAAIDRLLDRDQADGEEPVEDEEEDEFLKGFKVANFEYIDEAKALAAKEEEARKKAEAEAANSDRANFWDKLLKDRYDVQKVEEHTTMGKGKRSRKQMAAADEDDITGLHDMSSEDDDYSYDDDVSDNDTSLQSGLAGRRGPYSKKKQRNVDSLPFMEGEGRALRVYGFNQIQRTQFLQTLMRYGFQNYDWKEFTPRLKGKSVEEIQRYAELVMIHLLEDINDSGYYADGVPKEMRTDETLVRLANISLVEEKVAAMEQGKITKLFPSYLLYEFPSLVGGRVWKAEQDLLLLKALIKHGYARWQYISDDRDNGIFEAARQELRLPTANELISSHSNNETNGNLESTQEGQSNPTSMIHYRDTQRKIVEFIRKRYHLLERCLNLEYAVIKTKTPVPDDLAEQDFPGGHRPAVPDYSEMLRELPVLEPISKEVAPEGTTDQSQVSHLYNKMCFVLEDSAVPALNSHFGDKAASSGLANSLHKFEAVCEDVSRILRSHENGTTPKEEVMLDASSKETTSPKDPATEVPSSASKEATPPVQDPVIEAVKEEPPTVKAEDKMEIDS</aaseq>

Gene Sequence

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