Difference between revisions of "Os09g0109800"
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Revision as of 20:54, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0109800 |
|---|---|
| Description |
Citrate transporter family protein |
| Version |
NM_001069103.1 GI:115477945 GeneID:4346388 |
| Length |
12030 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0109800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:824869..836898 |
| Sequence Coding Region |
824927..825148,828207..828380,828529..828657,829512..829688,830637..830743 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:824869..836898 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcgctctcctcctgcttactcgccgccgtccgacctcatcctccacctccacctcgaccgctctccccttccttcatcccctctgccctccgccaccgccaccgcctcagccaagcgccgcccctcgccacctctctcccacgaccacgaccaccatggtgccgcttctccgcctcctcgccgccaccgccacccgacgaccctgacgactacgagctgttggacacgacaggaaattgtgatcctttatgctccgttgatgaagttagctcacagtattttgaagctaactacaagccaaaaaatgatcttcttaaagctttaactataatagcaacagctttggctggggcagctgcaataaaccattcctgggttgctgaacatcaggacattgcaatggtgctagtgtttgctctcggttatgcaggtatcatatttgaggaatcactagcgtttaacaaaagtggagttggattgctcatggccgtttgcctatgggttatcagaagtatcggggctccatctactgatgtagcagttcaagagttgagtcatacaaccgccgaagttagtgaaatagtctttttcttgctcggtgcaatgaccattgttgagattgttgatgcacatcaaggatttaagctagtgactgacaatatatctactcgaaatccaagaactcttctctgggtgatagggtttgtaactttcttcttgagttctatccttgacaatttgacttccactattgtgatggtttcattgcttcggaaactagtacctccatcagagtacagaaaattgttaggcgctgttgttgtgatatctgcaaatgctgggggtgcatggacaccaattggtgatgtgacgaccactatgttgtggattcatggtcagattacaacgttgaacacaatgcagggcttgtttcttccctcagttgtttcattggcagttccactggctctgatgtccctcacgagtgaagcaaatggatcttctcagaaatcttccagcttgctgtcatcagagcagatggctcctcgaggacaacttgtatttgctgttggccttggagccttagtgtttgttccagtgtttaaagctctcactgggctgccacctttcatgggcatgatgcttggtcttgcaattctttggatcctgacagatgcgatacattatggggactctggaaggcagagattgaaagttccacaagcgctgtcacggattgatacacaaggagttctatttttcttaggaattcttatgtcagttggcagcttggaatctgctggcattttgaggcagttggcgaactatctcgatgccaatattccgaatgccgaccttattgcaagcgctatcggtgtagcatcagcaattatagacaatgttccacttgttgctgcaacaatggggatgtgtggctttcatgggaatggaaaaggtggatttcttttggtatttccgcaaggtaaattgaacttttactctaataataagtggagctgtggaacaacttacacaatacagaatcgtatgttacagaacaagaaacttattcggtgtggttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAALSSCLLAAVRPHPPPPPRPLSPSFIPSALRHRHRLSQAPPL ATSLPRPRPPWCRFSASSPPPPPDDPDDYELLDTTGNCDPLCSVDEVSSQYFEANYKP KNDLLKALTIIATALAGAAAINHSWVAEHQDIAMVLVFALGYAGIIFEESLAFNKSGV GLLMAVCLWVIRSIGAPSTDVAVQELSHTTAEVSEIVFFLLGAMTIVEIVDAHQGFKL VTDNISTRNPRTLLWVIGFVTFFLSSILDNLTSTIVMVSLLRKLVPPSEYRKLLGAVV VISANAGGAWTPIGDVTTTMLWIHGQITTLNTMQGLFLPSVVSLAVPLALMSLTSEAN GSSQKSSSLLSSEQMAPRGQLVFAVGLGALVFVPVFKALTGLPPFMGMMLGLAILWIL TDAIHYGDSGRQRLKVPQALSRIDTQGVLFFLGILMSVGSLESAGILRQLANYLDANI PNADLIASAIGVASAIIDNVPLVAATMGMCGFHGNGKGGFLLVFPQGKLNFYSNNKWS CGTTYTIQNRMLQNKKLIRCG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>59..280#3339..3512#3661..3789#4644..4820#5769..5875#7305..7425#8802..8863#8952..9254#9950..10090#10192..10345#gcactctcactcacacggagagagagagagagagagactagactagtagtaccaattaatggcggcgctctcctcctgcttactcgccgccgtccgacctcatcctccacctccacctcgaccgctctccccttccttcatcccctctgccctccgccaccgccaccgcctcagccaagcgccgcccctcgccacctctctcccacgaccacgaccaccatggtgccgcttctccgcctcctcgccgccaccgccacccgacgaccctgacgactacgaggtactactctgctgcggacctccactctttctaccagtgccggaccctaacccccgccaagtctaactcctatccaataacataaacaccacactaatcaccactaaaagtacaatacaaattttaattgcaatctgatagtgatacataagtataaatacctcgttgtgcattagcttcctctcatcctataagtgatacataagtacaaatacctcgttgcgcattagcttcctttcatcctataatatcctcgtggacctctttcaactatagtagctgcagatcttcatcctataaagtaaaaaaataaaaatgtatattaaagacagtgtttgggaataaataaaattaataataagaaaatcttagaacaagaattgacataccaaagacaattcacctgttttgccaccggtaaaacaaaagctaattcgatgaaccaataaaccaaaggaaaaactgtgtgcctcactctgaaccatcttcacataatcacaagaaaaaactgcgctgctgagtgctgccggctcctataaccactctttggaggattgtgggcttgtggctccaattgggcatacgaagattttagtgacgtcctaaaccatagctctctcttcatctttcatttctaattctctattacaagtttattacaaattgaatggaattactattctgtacttctgcagctaatttacttaggcatttcatcatttaaaaataaaagaaatagtcaaatagcgattggaagtttcaccataccaagtcagcagcaagtctcacaatgtcctctgcttgcttgctgctccttgccggatgctaacggagcgacagagtaggccactggcggcaaaccgtgcagcggtgccggcgtgccgcacgcccgcaccccacgtggccgcgttcacagcacaatgccacggcgcctatgcagagccagggagtcagggagaggagcttaggaggcagcactgcaggagacagggttagagggtagggatgtgaccggggagggtggtcggaggctcagaggagcggtgcgcatgctgacggtgggcggtcaacggaagagtagcgacatttggcggctgggcaagagggagcagggagggaatcgctgggtgatggctagggatggcaacggggccatccccatcgggttgtagcccaccgtccccatccccgtgcagtcagaaatcactcgaccaccgtccttgtccccatcattggggcttttaatttctcccgtccccgagccccacgggggacacggggctccaacggggccgcacacctgacaaggccattgtcagatagagaacatatcgagaaaaatcatcttggagagcatacatctatattttctaatagtacatacatgaccacggagagttggagacacagatcaatcagaagctacggtattcaattattaagcaccagctacattgagccataaacacgagaaaaaaagaaacgttgagaaaacaagccaagtagatgcatgtgcatgcaccaagtgccatcgccatcctcttgcattgctccttgcaaattgctgcacgagcaagctgcttggaggcggcaacaggagctcggcgtggtcacttgcatgtggcggtgcgacactatgtcgcagcacagagaacgtggcctgcagcacgctacgcggcgcggcctggaggcgtcggtgctgtggcctaggccctagaggcgcgacggtcgacggctgaagacctcgtcccttggccggtgtttgattggatctgagaggaaggggatcggtggggaggatgggaagagtgacctagggtttcttggtttatatacaagcacatacgaattgggcttctaaatgggctttagtttctatggactatgggctgtgggcatgtacatgtgaccactctcggggcaccccagggattcggggctgggggactgggaacgtccccatccccgctcacctgatgggggcaactttttcccgaaaatagccccatgggtgacaatttcatcccatttacatcccctaatggagtttttcctagtcggggtttgggtccccattgccatccctagtgacggcgcactctctcggtctctcgtcgcatagcggagaagtagggctagccacatgttgggcctcgggccaaaccttgttgggccaaaacttctgagatacatctaggtggaggtccattattatttggcccaagctccggtctgtggcccagggtgcccgggccctgggttcgcccctgctttctactatattatacacctacacctcctcttgcttctgccattttcgctctccttatcacaggaatactacatacaatctcaaacggaattcatttctctcccgatcccttatgccttgctcacttaatctgcaagacggacggatttgattggaggctcccttccaatccccttgtggccttgtaggtgggattaacccaacaaggccgcccttagtgttttcgcaacaagtactcaccatgccactacctttcgcacaggcccgcctggctttagtagcaaacacgtgaattactgctaattgttggatactactacatgtatataaatgaaattggtgcaacaaaaaatttatgccaatgctcactcacttgaaggaacatctcactcctgcatccgcataaaagacttgtcatcaccctctctatcaaacttgtacataaggatttgcactgcacgatatctgcagtaaaatacaaggctgcatccaaataggagtagcatattctccttttcttttacaaaaaggaacagatagagatgtaactagcaacataatattctgttatttttattccagcaatcttgcagatcgtgcaataatactttgacagggttgccactttaagctgtttccacctcagctatgaagttaccggtggttttactttttgtgtgagacagagccattatttgtatcattgtatgcgcacttgtactaaaattttgttaaattttcatatgtagtatttgttaacaagttcctgttccattaatttttcagctgttggacacgacaggaaattgtgatcctttatgctccgttgatgaagttagctcacagtattttgaagctaactacaagccaaaaaatgatcttcttaaagctttaactataatagcaacagctttggctggggcagctgcaataaaccattcctgggttgctgaacatcaggtcagttcattcgtaggcatcatgctcaaataccccatcttttaaatctggttttcttttcatccctccacttatctttaactatctgtagttgtggatgttcgagtgatgattcttccgagcttagttcatatatttacttttgcaggacattgcaatggtgctagtgtttgctctcggttatgcaggtatcatatttgaggaatcactagcgtttaacaaaagtggagttggattgctcatggccgtttgcctatgggttatcagaagtatcggggtaagctaatctgtgaagttgccgtgaagacttgaacaaccctttccgaatgacaagctatcggtcctacatcttgtatctttaagatttaacctatcaatcctaaatcttaaatctctacttcatagtttctccattagactgccttgattattgttgttggaacacatgtccttgagaagtttagacagaaattgatagctttttgagtagtcaaattgatattaatattgttattgcttcaggctcaaaataattaaatctgtaagagaaacattctatttatattttatggaattttcttgaggctctggctggctggttgcatcagccctcttaatcatttatgtttttcacattttagtttagtttatttgcataataggcaactaagaacatatttaatattctgcattttttttaactgtaataaaaaaagagaagaaatttaagacacttttagcgaatacatttctagcctcgtcattattgagtcagaatatggtgcttagttgcaacatgagcaatgttagatagttgatactttgaatgccattcagatgcagtatagcgctcaccacgatcaaattgattaaaaaaattgcaaactcctctgaaatttgaactgaataagaaatgcggttgactaaaatatctcatcttccttagtgaatatctagctttgtagtgccagcatttcaacctgcggagggtttgcatttccattgaagtaatgtggttcatgttctgaactttttatcacctattatattctatttactgaatcactttttttttaatcatggtggatcacctttattgttgtctattttctgtttcttcctgcaatttaggctccatctactgatgtagcagttcaagagttgagtcatacaaccgccgaagttagtgaaatagtctttttcttgctcggtgcaatgaccattgttgagattgttgatgcacatcaaggatttaagctagtgactgacaatatatctactcgaaatccaagaactcttctctgggtggtgagttttttgttttttacatatgctttgatcattgaatattctgttatattggt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