Difference between revisions of "BGIOSGA018256"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA018256

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018256, complete gene.

LocusTag

B1036C05.8

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA018256-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA018256-PA

Length

11708

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:16950439..16962146

Sequence Coding Region

16962000..16962146,16960498..16960654,16960295..16960413,16960131..16960205,16959443..16959536
,16959235..16959353,16958574..16958644,16957575..16957722,16957305..16957480
,16956132..16956288,16955837..16956001,16955250..16955326,16954745..16954819
,16953986..16954178,16953771..16953890,16953312..16953450,16953106..16953152
,16951423..16951683,16950439..16951140

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:16950439..16962146 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:16950439..16962146 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCAAGCAAGTTCGGGCTCGCCGGGGGCATCCCGGAGAGGCGGGTGCGGCCGATCTGGGACGCCGTCGACTCGCGCCAGTACAAGGCTGCGCTCAAGCTCTGCACCGCGCTCCTCGCCAAGCACCCGACCTCCCCTTACGTCCTCGCTCTCAAGGGTCTTATTTTGGAAAGGATGGGAAAGCCTGATGAAGCACTCAGTGTGTGTTTGAATGCCAAGGAGCAGTTGTATTCTGACAACATCTTTCATTTTGATGATCTCACTCTTAGCACCCTGCAGATAGTATTTCAAAGGCTTGAGCGATTGGATCTTGCTACTTCATGCTATGAGTATGCTTGTACAAAGTACCCCAATAACTTGGAGTTAATGATGGGCCTTTTTAATTGCTATGTCAGAGAGTACTCATATGTGAAGCAGCAACATACAGCAATAAAAATGTACAAAACTGTTGGAGAAGAAAGGTTTTTGCTCTGGGCTATTTGCAGTATTCAACTGCAGGTACACTTTAGCATTGGAGGTGAGAAGTTATTACCACTGGCTGAAGCGTTGCTTAAAAAACACATAACTTCTCATAGTTTACATGAGCCAGAAGCACTGGCTCTCTATATTTCAATTCTGGAACAGCAGTCAAAATATGATGCTGCTTTGGAAGTTCTTTCTGGAGACTTGGGGTCTCTTATGGGAAGGGAGGAGGACAAGCTTCGTCTGCAGGGACGGCTTCTTGCTCAAGCATGCAACTACACTGCTGCTTCCGAGATATATCAAAAGATCCTTGAATCTTGTCCTGATGACTGGGAGTCCTTTCTCCATTATTTAGGCTGCTTGCTGGAGCATGATGTGAACTTGCCTAAATCAAGGACAAGTGAACACCCTTCTTCATTACCTGTAGATTCTGCTCTGGCCCTTAAGACTTCTTTAAGCGACGAGCTGGTAGAGTCTCGCCTTGCAAGTGCATTGTCATTCGTGCAAAAGCTACAGGTTAATGACACCAGCGACTGTGTCAGAGGACCTCATTTAGCCAGTATTGAAATTGAACGGCAACGGTGCCGAAGTGGAAACCCAACTGATAGAAAATTCATTGAAGCTTTGATAAATTACTTTCACAGATTTGGTCATTTGTCTTGTGCAGCATCAGATGTTGAGATATACCTCCACATGCTATCAAGTGATGAAACAACTGAATTGTTAGATACAATCTCCAGATCTTTTGATGCATCATCACTTTCAGTAAAAGGACTGGGTTTGGCAATAACCACTTTTAAGTTTCTCACACCTTCAAGTTTATTTAACAATCCAGAACTCCAGCACATTGCAAAAGGAATGGTTGAGGCATTTTATAAAAACTTGCCTCTCTCAAGAGACCTTGATCCTCAAGAAAGCATGCATGGTGAAGAATTGCTATGTATGGCCAGCAGTATTCTTGTGCAGCTATTCTGGCGTACAAGGAACTTAGGATACTTAATTGAAGCAATTCTGGTGCTAGAGTTTGGATTGACTGTTCGCAAGTATGTCTGGCAATACAAAGTTATGCTGGTGCATCTCTACTCTTACCTAGGAGCACTTCCATTAGCACATCGATGGTATGTAACCCTGGAGGTGAAAAACATTCTTCTTGAATCTGCGTCGCATCACATCCTGCCACAGATGTTGAATTCACCTTTACTGCAGCAAACTGCTGATCTTGTTAAGGACTATCTAAAATTTATGGATGATCATTTGAAAGAATCTGCTGATCTTACCTGTCTTGCATATAGACACCGTACTTACTCAAAGGTAATTGAATTTGTTCAGTTCAAAGAACGCCTGCAACACTCCATGCAGTATCTTTCTGTAAGATCTGATTCCATAATATTGAGTCTGAAGCAGAAGGCTGAGTCTCTTGATGAAGTGGAGTCTATTCTTGAAAATGTGAACCATGGGGCAAGGTTGGTTGAACTATCAAACGAAGACAACGTGAAACGCTTTACTTTTAACGAAGATCTTCAGGCACGCCCTTGGTGGACACCAACAACAAGTGTTAATTTTCTGTCAGAACCATTTGATGAAGGTTCTACACCTGCATGCTTTAGAGCCAAAGCGTGTGAACACAAATCTACTGAGAAGGATGACTCAAAGATAAAATATGCTGAGAGAAAAGCTCTTCTTCCTCGTCTTGTTTATCTTTCGATGCATGGTTGTGCATCTTCCCTCAGGGAGACTCAACTCAATGGATCTGGTTTGGATACTGATGCCACAGAGATGAAACCATTACTTTTGAAATATGCTAGGAGTATTGGATATTCCATTGATGATGCCCTTAGTGTGATTCTGGGTATGTCATCTGGCAAGAAGTCTGTCAAGGATTTTACCCCTGATATAGTCAGTTGGATGAGCTTTGCTGTATTTATCAATGCATGGAACTTGTGGTCTAATGAATCGGTAGTCCCCAGAGCTGATGAGAGCAGCCCAAGTTCCTGGCAAATTGTGGATAGCTTGGTAAAAATTTGCGTAGAGGAGCAGCTGATTGATGCCAACCGAATCCTAACTTCTCCTGGCAATAACATACCAGTCCTAGTGCAGATGATTACAGAACCCATTTCTTGGCATCTCGTGGTTATTCAGTCTTGTGTGAGGTCGATGGCTCCACAGGGAAAGAAGAAAAAGAAGGGTGGTCCATCGGAGCGACCAAATGTACCTCGGTTGCAGGCGATTCAAAGATCTGTGCAGTGCATGATCGACACACTCCGCAGTGTTCAATCCTGGTTATCTGACCAGATGAGGCCGGAGGAGCAAGCTTTGGATATTTTGTTGTCATATTTGCAAGGAGGTAATGAGGATGGGCCAGGACAGATATCCTGTATCTTGGAGGAGAATTCAGCAAGACATAACCCTGAACTCGGCGAACGGATTGCTCAATCTTTGGAAACATGGAGTTCTGCTGGTGTGGTCAGAAGAATCGTTGGAGCAGAGAAGGAGCTGTTAGTTGAGTTAAAGAAAATATGCGACTCAAAACTAAAGCTGCTTGCTTCAGTATCGGCTTCTCTATCATCGGCCTTACATTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASKFGLAGGIPERRVRPIWDAVDSRQYKAALKLCTALLAKHPTSPYVLALKGLILERMGKPDEALSVCLNAKEQLYSDNIFHFDDLTLSTLQIVFQRLERLDLATSCYEYACTKYPNNLELMMGLFNCYVREYSYVKQQHTAIKMYKTVGEERFLLWAICSIQLQVHFSIGGEKLLPLAEALLKKHITSHSLHEPEALALYISILEQQSKYDAALEVLSGDLGSLMGREEDKLRLQGRLLAQACNYTAASEIYQKILESCPDDWESFLHYLGCLLEHDVNLPKSRTSEHPSSLPVDSALALKTSLSDELVESRLASALSFVQKLQVNDTSDCVRGPHLASIEIERQRCRSGNPTDRKFIEALINYFHRFGHLSCAASDVEIYLHMLSSDETTELLDTISRSFDASSLSVKGLGLAITTFKFLTPSSLFNNPELQHIAKGMVEAFYKNLPLSRDLDPQESMHGEELLCMASSILVQLFWRTRNLGYLIEAILVLEFGLTVRKYVWQYKVMLVHLYSYLGALPLAHRWYVTLEVKNILLESASHHILPQMLNSPLLQQTADLVKDYLKFMDDHLKESADLTCLAYRHRTYSKVIEFVQFKERLQHSMQYLSVRSDSIILSLKQKAESLDEVESILENVNHGARLVELSNEDNVKRFTFNEDLQARPWWTPTTSVNFLSEPFDEGSTPACFRAKACEHKSTEKDDSKIKYAERKALLPRLVYLSMHGCASSLRETQLNGSGLDTDATEMKPLLLKYARSIGYSIDDALSVILGMSSGKKSVKDFTPDIVSWMSFAVFINAWNLWSNESVVPRADESSPSSWQIVDSLVKICVEEQLIDANRILTSPGNNIPVLVQMITEPISWHLVVIQSCVRSMAPQGKKKKKGGPSERPNVPRLQAIQRSVQCMIDTLRSVQSWLSDQMRPEEQALDILLSYLQGGNEDGPGQISCILEENSARHNPELGERIAQSLETWSSAGVVRRIVGAEKELLVELKKICDSKLKLLASVSASLSSALH</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..147#1493..1649#1734..1852#1942..2016#2611..2704#2794..2912#3503..3573#4425..4572#4667..4842#5859..6015#6146..6310#6821..6897#7328..7402#7969..8161#8257..8376#8697..8835#8995..9041#10464..10724#11007..11708#ATGGCAAGCAAGTTCGGGCTCGCCGGGGGCATCCCGGAGAGGCGGGTGCGGCCGATCTGGGACGCCGTCGACTCGCGCCAGTACAAGGCTGCGCTCAAGCTCTGCACCGCGCTCCTCGCCAAGCACCCGACCTCCCCTTACGTCCTCGTGAGTGGACCTCTACCCTCCCCCTCCCTCGCTCGGTTTGTTTCTGGAGTAGCTTTGGTTGCGGTTTTGATGAATCTGGCGCGCCAATGGGCTAGGTCGGTGGTTGTTTAATCAGCAGCCGCGGTCACTGTCGCCGCGCCTGGTTTGTGCTTACATGGTTTATCGGAGTGTTTTTTTTTGGATCAATGGATACCTTACTAGTTTTAGAGATAGTAAGCTGGATGATTAGTTTTGCATTGCATCTGATTTATGGCTAGTTGACCAACTTGCTTGAACTAGTTTTTAACTGCTTGTAAGGACTTATGTTCTCATTTTGCCTACATTACAATTTGGAAGTAGCTGTGTAGTTCATATTTGATTGCATTAGTGTCTGGTTGGGACGAAAATCCAATAGCAGGAGCATGTGAGCAGTCCTATGAAACAAACAGTTTGGATCAACTGAAGAAACCACTGGCATTTTTGAAGCCATAGTAGCTCACATTAATCCTTGATCCAAATTGCATTGCCACAAGGTCTTCAACCCCTTTCTTGGTAGGAAGTTCGCTATCACTTTTTTTCAACCAGGTTGCTGCTTACAAGGTGATGAAAGGATATGATAGGCTAGGACTGGCGTAATAATTCATTTGGTTACGAAGTTAGGATACGTGGTTAAAAAGGTTCATGACCATTGGAAGGAACATGAGATGAACTTGACATGAAACCAGGAGGGTGCAGGCTAGAGGGGCAGGGAGCAGCAGAGTACTGTTAGGACAAGCAGAGTTAATATTTTCTTTGGAGATGTTATTAATTATCTTGTAGGAAATAACAAACAGGTTATTTCTAGTGACTAGTAAGGCAGATTTAATATCTCAAATGGCAGAGATTTCATATTTGGATTAATTCATAAATACCAGACAGCAGGTATTTGGGCTTGAATTTGGTTTATTTCATCATTTTCAAGCTGAGCCTAGCAGCAAACTGAAATTTTATCACAATTTCAAAGCAAATGGCCTATTCCTAGCAGTCGGCAAGGTGTTAGCTTTTGATTTGTGGCAAAAAGTTAATGCATTGTTTTGATAATTCAGAGATGTATAATCAGGCATTGAATGTTTTTTATTCTGACACTATAAATTCTTGATTCACTTTGGATGCTGAGAAACTGACAAATTATCTATTTGGTTTATGTGCCTAATGTAAGTGCCATTGATTTGTTCCCTTCGTGACTGTTATAGATCTGATATGAAAACCTGTCTTCTTTTGTTGCTATGCTTTTGGCCCAAGGGATTAGCTCAGGCTTTTTACAGGATTTTATGCTCGCTGTATAGAGAATGCGATTTAACTGTACTTTTGAATTATCTCATTTCAGGCTCTCAAGGGTCTTATTTTGGAAAGGATGGGAAAGCCTGATGAAGCACTCAGTGTGTGTTTGAATGCCAAGGAGCAGTTGTATTCTGACAACATCTTTCATTTTGATGATCTCACTCTTAGCACCCTGCAGATAGTATTTCAAAGGCTTGAGCGATGTACGTTTGCACTTGGTCTTTTGATTATATCTCCTTAGCATCTTATTTTTTTCCCTGAATTATTTATGCATATGTTTGTACCAGTGGATCTTGCTACTTCATGCTATGAGTATGCTTGTACAAAGTACCCCAATAACTTGGAGTTAATGATGGGCCTTTTTAATTGCTATGTCAGAGAGTACTCATATGTGAAGCAGCAACATGTATGATGATATTTTTCCTGCTAGTTTGTTAATTTTTTTTTGTGCTTTCTTGTTCAATTCTTGACCACCCTGTTTTGTATCTTCTGCAGACAGCAATAAAAATGTACAAAACTGTTGGAGAAGAAAGGTTTTTGCTCTGGGCTATTTGCAGTATTCAACTGCAGGTGGGACATTGTAGTTTGTTATATCTCGACTAATGATGAGATCTGCATCTGCATTTATAGATCCAGTACTGTATAAAGACACTGCTATGCTTTTTATTACGGAAAAAAAGGGAACACTCTAGGTAGAAACAATAATTTCCTTGAATATACGGGTAAAATGATTGTTCTAGATGCATGGCCCAAGCCGCCAAGGAGATGCTCTTCAGGGCAGGTGAGAGGGAGTATAGAGGGAGTGGAGATGGCTATTTGTGCAGGACAGAAATGTATGAGAGAGGGGGAAGGGAGAGATGGAGAGGGAGAGGGAGTTTTTCATCTGGTGCATTACAATTTACACTACCAGAAGTATAGAGATGACAATTCTTGAACATGTTTAGCACCTTGGTACTAACTTATCCCTGCCATGACCCTTGCTATTCATTGAAAAAGACATTGAATTAGAAATCTAGTAGCAGTACTTGCAATGCCGTAGGCCCGTAGCTACTAGCTTGAACAAGTCCATCGAGAATGCGTCTGCTGTATTATTGACCAGGATTATCTTCATTAATCTTCTTTATGTGTTATTGTGCAAGTAACTTATCCTTTTGCCCATGACAGGTACACTTTAGCATTGGAGGTGAGAAGTTATTACCACTGGCTGAAGCGTTGCTTAAAAAACACATAACTTCTCATAGTTTACATGAGCCAGAAGGTATTTTATATTTTTCTGAAGTGCTGCGTTCACCATTTTTTTTTGCATGCATAAATGCTCTCTTTTGACGTAATTTGAACTTCATGCAGCACTGGCTCTCTATATTTCAATTCTGGAACAGCAGTCAAAATATGATGCTGCTTTGGAAGTTCTTTCTGGAGACTTGGGGTCTCTTATGGGAAGGGAGGAGGACAAGCTTCGTCTGCAGGTAACTTACTTTTGTTCTTGTACATATCTGAAATACATATTAATGTTAAGTAGTTCATTACATATGCCTTTCCAAATTCAAAATTCTGTTATATAATTGTATATTAGAACATCTAGAAATTGCAAGTCATTGTAGTTCATGACTGAATTCTGCATTTATGTCATAGTAATATCTGAATTGAATCCTTAGCTTGCTCACTGCTCTTCATGTGCTAAAAATCTACATAAAGTTATCATGAACATGAAGTTAAACTGTTAAAGCAACTAATAAAAAAAGTGGTTTTTAGAACTGATCATGTGCAGCTTACTGCTCTGCTTGCATGGAGAATGTACGGTCTATTTATTTCTTGATAAAGGATAACTACATTGAACATGGGGTTAAAGCTGTTCATTAAAATGTGTTTTTAGCAAATAATTATCCCTTTTGTTTGCGTTGTTGAGTGTTGATTTCCAGAAAAAGTACTATTTGGCCAAGTCAGCTATATCTCCAGCACATTCATATGCTTGTGTAGAAAATACAACTTCAAATTACAATCCTTCGTTTTTTCCCTTCCTACCCACTTACATTATTACCTGACTTCAAGTTGACAGGGACGGCTTCTTGCTCAAGCATGCAACTACACTGCTGCTTCCGAGATATATCAAAAGATCCTTGAATCTTGGTAATGTTTCCATAATTGGCTTTGTACAATTTTCATTTACTCTAGTTCTTTTGATTGGCCATGCATTGTTGCTTAATCATAGTCAATCAATAAATATGTTCTGTGAATTGTAGTAATATATGTATCTCAGGTTCTACCCACAAACACTTGTTGAGATGCACTTTACCAAGTATCAACTATTTGGTTCATAAGTACATGTTTCGATATGCATAATATATTGGTGTCCTGCAAGCTCACCGTAGAAATTCTTATGTAGGGGTTTACACAATTTCATTTATATCATCAGAGTCTTTCGATCTACTGCTGCCTTTTTTCCTTTAAAAATGGTAAACTTTGTTTTTGTACACTAGCCCCTCAGAGCTTTAGAGCCTGATCACTTCAATATATGTTTTACTAGAAAAAATGCCCGTGCGTTGCAATGGGCGAAGGTTATTTTAACCTTGTTATTGTTATACTGTTTAGTTAAGGTGAAATTCACTATTGGAATTCGCTTGGATATATATTTTTCTAGAAAATCACGAGCTGCAATTAGGGTGACCATCTCAAGTTAGCATGTGAGTATTTTAAAGAGATATCTTATACAACTCCTGTATTTCCAAAAGCGAACGAACTGAAAACCCGACTCAAATACAGATTTGTATTTCCAAAATCGAACAAACTTAAAAACTGACTCATACACGGATGACGTACCGAAGTACCAGCAAAAAACATCTTCAATTTTTATAATAGTAGAGATTTGTTCCTCATTCCTCAATTTATTTAAGCATATTTCACCTGTGTTAATCAAACTATGGAAAATTGCTCTTGTGATTAGTTTTTGATAATTGTCCTCTCTTTCTTTGACTGGGCAGTCCTGATGACTGGGAGTCCTTTCTCCATTATTTAGGCTGCTTGCTGGAGCATGATGTGAACTTGCCTAAATCAAGGACAAGTGAACACCCTTCTTCATTACCTGTAGATTCTGCTCTGGCCCTTAAGACTTCTTTAAGCGACGAGCTGGTACTTGCTACACTTAATAATAAGTTTCTTTTAGTATATATTACTTATGTTAGTGATAACATGCATGTTATTTACTGAAATCACTTTTATGCAGGTAGAGTCTCGCCTTGCAAGTGCATTGTCATTCGTGCAAAAGCTACAGGTTAATGACACCAGCGACTGTGTCAGAGGACCTCATTTAGCCAGTATTGAAATTGAACGGCAA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA018256