Difference between revisions of "BGIOSGA018323"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA018323

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018323, complete gene.

LocusTag

OsI_19416

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA018323-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA018323-PA

Length

12416

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:15253134..15265549

Sequence Coding Region

15265251..15265549,15265023..15265133,15261254..15261607,15260808..15260817,15260017..15260187
,15259287..15259608,15258994..15259189,15258771..15258885,15258451..15258609
,15257670..15258333,15255570..15255779,15253134..15254224

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:15253134..15265549 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:15253134..15265549 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGAGCTGGAGCGGCGGGTGATGGCGGCGGTGAAGGCGTCCGCGGCGCGCGGCGACCCCCCGCTCCTGCAGGCCGCCGAGGCCGCGCGCTGCGCCCGGGAGGCCTCCTCCTCCATCTCCGTCGATGGCGGGGCCGGGGCCGCGCTCGCCGCGGCGCTGGTGTCCAACCTGTGCTTCGCGCACAACACGGGCGCGATGTGGAAGGTGCTGGACCAGGCCATGGCGTCCCGCCTCGTCTCCCCGCTCCTCGCCCTCGCGCTGCTCACCCCGAGGGTGGTGCCCAACCGGCAGGCGCAGCCGGAGGCATACAGGCTCTACCTCGAGCTGCTCGGCCAGTACACGGTCGCCCCGGTCTGCACGGAGAGCGTGGAGACGAAGGCCATGTTAGTCAAATCTATTGATGATGCTTTGCATCTTTCAGATAGCTATGGGTTTCAGAGAGTGGATTTTGGACATACAGTTATTTTGTTTGTGTTAAGCGTTATCAAAATATTGACTGACTGTATATTGGAAGATTGTGGTTTGCCAACTATTGATGGTGATGGACATGACATTTCATATGCTATTGGAGCAGAAAAAAGTATGAACATAGATGGCAAGGGAAGCTCATTTGATAGGAAAGATGAGCACCGTGAATGTCTGAGGAGGAAGAACACAATTATGACTTTAGAAGTAGTTGAGAAGATCACTGCTAACAAAAATACTCAAGTTTTTCTCCGTCTAGTCTATCGTAACACATATTATGCAGGTAGACCTGAAAATTTCAATATTTTGCTCCAGAGGCTTCAGCTTATTGGTGCTCTGAAGTCAAAGAATTTTGGAACTGCACATAATCTGCTAGGCAGCTTGATGATGAATATACGAAAAGTTGTTACTACAGGACATCAATTACACAAAGGCAATCTATCGGGAAGTATTGATCGTGGCATTCCAGAAGGGCCATTTCCTCATCTTCATTCTCGATTGTGCATGTTATTGGCTATTGTACCTCTGTCTATTGCTTCCATTCTTAAGGAAGAGTCTGACAAGATTGAAGGTGGAATGGTCTCTGTTAGAAGAGGAGAATTATTGTCTTCACTTCAAGTTCTAGGGCAATTTTTTGGTCTTCTTTCTCCTCCACCAGCAGTAGTGCAGTCAGCAAATATTGCAGCTAGGAAAGCATTAGTTGCTTTATCTGTTTTGAAGGATCGGAATGAGAGAGGTCACAATTATTCCAAAGATATCTCCTCTATTAAAGCAGCGGGAAATATGCTACATCTTATTGTGGAAGCTTGTATAGCAAGGAATTTAGTTGATACATCTGTTTATTTCTGGCCTAGCTATGTTGTTCCAGTTAAAGACGCATCTGCTGTTGAGGAATCCCCTTGGTCAGCCTTAATGGAAGGGTCACCCCTTATGGGCCTTAAGGATGCACTTATGGTTACACCTGCTTCGAGCCTAGCAGAGTTGGAGAAATTGCAACCTTTTGCAGTAAGTGGGTCAGATGAGGAAAAGTTGGCGGCGTCTAAGATTCTGTGTGGAGCATCCCTTCTTCGTGGCTGGAACATTCAGGAACATGTTATCCAAATGGTGCTTAAGTTGCTGTCTACATTGCTCCCCCTAGACTCTGGATCAGATGGGTTCTATATACATCACATGCCTATGCTGCATGCTCTCATATCTGGGATTTCTTCAATTGATGTGGTTCATATTCTCTCTATGTATGGCTTGGTTCCAGAACTAGCTGCCATTCTAATGCCTTTATGCGAAATATTTGGATCATTACCTTCGTCTGACCATAGGAATTGTAGTTTTGAAGAGGCCTCTGTGTACTCCGTATTCTCATGTGCTTTCCTGTGTCTTCTTCGCTTGTGGAAATTTCATAGACCCCCTGTGGAGTATGCACTATCAAAACATGGAGTCTTTGTTTGCTCAGAGATCAGTTTGGATTTTCTCCTGCTACTACGAAACAGTCATTTTGCTTTGAATAGTCCGTATGATGTTAGCAGAAAGAGCATATTTCAACTAGATCCATCGTTTCAAAAACCGGTGTATATTGACTCATTTCCAAAGCTACGGGCATGGTACTTTCAGAATCAGGCTTGCATAGCCTCTACTCTTTCTAGTTCTTACAAAAGGAAAAGTATCCTTCAAGTAGCCAATAAGATACTGAAAATTGTCTGCCATAAAATGTCAAAAAGTGGCATCCCTCCTGTCAGTTCCCAATCAACATCAAGTTCCAGTATGAGTGGTTCATCTCTAGGCACACAAGATGATGTCTCCCAAGGGCCGCCAGCTACTGCATGGGAAGTGCTGGAAGCTGTTCCTTTTGTGCTTGAGACTGTTTTAGCTGCCTGCGCACATGGGAGGCTTTCGTCTCGTGATTTGATTACAGGCTTGAGGAATCTTGCGGACTTCTTGCCTGCTTCAGTTGCTGTTATCGTCAGCTACTTTTCGGCAGAAATTACTCGTGGCTTATGGAAGCCAGTTATGCTGAATGGGACTGACTGGCCCAGTCCTGCTGCAACGCTTTTAGCAGTTGAGTCCGATATTGAGGAGGCTCTTGCATCCGCTGGTGTTCATATTAACATCTCTCCACGAACACGTCCACCAATCCCAATGCTTCCATTACCAATAGCAACTCTTATCAGCTTATCAATAACTGTTAAGATGGAGGAATTTAATCACTTACAAGGAATTATTGACAAAGGAGTGGAAATTTGTGCTACATCAAGTTCATGGCCTAGCATGGCAATCATAGGGGCATTCTGGGCACAAAAAGTTCGGCGGTGGCATGATTATATCATCCAGTCATGTTCAGAGACACCATTTACCAGAGATAAAAATGCAGTTGCTCAACTAATCAGGAGTTGCTTCTCATCTTTCCTTGGGCCTTTGGTTGATGGGCGTTCTTGCTTTGTAGCTGACAGAGGAGTGAATAGGCTGCTGGGGCAGGCTCACCAAGAAAGAAGTCCCCGGTTTTCTTTATCGCCAGGATTACTTTACACACGATGCTGCCGAATGTTTCCTGACAACTATTTTGTATGTGAAGAGATTTTGAAGGTTGTCATTGAGAGAGCTCGTGCATTAGCAAATGAATGTGACTCTAGTAGACCTCATCTTCTGAAGTCTGGTCGGATGACACTATCTTCTGCCACATGTTCTGTAGAGCAGATAGCATCACTTGCAGCATCTATGCTTTGTCATGCTGGTGGAATGAAGTTGGTTCGTCTTCTGTATGAGCAGATTCTGCCAACAATGCTGCTTTCAGCTGGTGAAGCAAGGCTGGGTTCTGCTGGACCAGTGTGCAGTAGTTTCGAAGGATTTGCTTTGGCATATGTTCTCCTTGTTTCTGGGGCCAGCACCTGGGGAGTAGGAGAAACCTCCCCAGTTTATACTTCCGTATACACATCGAAGAGGCAACGGGTTGTAGATAGGCACTTGGAGTTTGTCGCCAATGTAATGCAGGGTAACATTGAGCTTGGCTGTGGCCAGGTCACTTGGAGAACCTATGTTATATGTTTTGTGGGCTTGCTGGTCGACTTTGCGCCAACATGGATCCCCGAGGTGAAGCTCGAGACGCTGAAGAAGCTGGCGTCTGGGCTTTGGAAATGGCACGAGTGCGATCTTGCCCTCTCTTTGCTCGAGCGAGGGGGTCCAAAGGCCATATCTACAGTGGTTGAATACATCCTATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAATAAAAAELERRVMAAVKASAARGDPPLLQAAEAARCAREASSSISVDGGAGAALAAALVSNLCFAHNTGAMWKVLDQAMASRLVSPLLALALLTPRVVPNRQAQPEAYRLYLELLGQYTVAPVCTESVETKAMLVKSIDDALHLSDSYGFQRVDFGHTVILFVLSVIKILTDCILEDCGLPTIDGDGHDISYAIGAEKSMNIDGKGSSFDRKDEHRECLRRKNTIMTLEVVEKITANKNTQVFLRLVYRNTYYAGRPENFNILLQRLQLIGALKSKNFGTAHNLLGSLMMNIRKVVTTGHQLHKGNLSGSIDRGIPEGPFPHLHSRLCMLLAIVPLSIASILKEESDKIEGGMVSVRRGELLSSLQVLGQFFGLLSPPPAVVQSANIAARKALVALSVLKDRNERGHNYSKDISSIKAAGNMLHLIVEACIARNLVDTSVYFWPSYVVPVKDASAVEESPWSALMEGSPLMGLKDALMVTPASSLAELEKLQPFAVSGSDEEKLAASKILCGASLLRGWNIQEHVIQMVLKLLSTLLPLDSGSDGFYIHHMPMLHALISGISSIDVVHILSMYGLVPELAAILMPLCEIFGSLPSSDHRNCSFEEASVYSVFSCAFLCLLRLWKFHRPPVEYALSKHGVFVCSEISLDFLLLLRNSHFALNSPYDVSRKSIFQLDPSFQKPVYIDSFPKLRAWYFQNQACIASTLSSSYKRKSILQVANKILKIVCHKMSKSGIPPVSSQSTSSSSMSGSSLGTQDDVSQGPPATAWEVLEAVPFVLETVLAACAHGRLSSRDLITGLRNLADFLPASVAVIVSYFSAEITRGLWKPVMLNGTDWPSPAATLLAVESDIEEALASAGVHINISPRTRPPIPMLPLPIATLISLSITVKMEEFNHLQGIIDKGVEICATSSSWPSMAIIGAFWAQKVRRWHDYIIQSCSETPFTRDKNAVAQLIRSCFSSFLGPLVDGRSCFVADRGVNRLLGQAHQERSPRFSLSPGLLYTRCCRMFPDNYFVCEEILKVVIERARALANECDSSRPHLLKSGRMTLSSATCSVEQIASLAASMLCHAGGMKLVRLLYEQILPTMLLSAGEARLGSAGPVCSSFEGFALAYVLLVSGASTWGVGETSPVYTSVYTSKRQRVVDRHLEFVANVMQGNIELGCGQVTWRTYVICFVGLLVDFAPTWIPEVKLETLKKLASGLWKWHECDLALSLLERGGPKAISTVVEYIL</aaseq>

Gene Sequence

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