Difference between revisions of "BGIOSGA018366"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA018366

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018366, complete gene.

LocusTag

OS05G0295300

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA018366-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA018366-PA

Length

11927

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:14067726..14079652

Sequence Coding Region

14079448..14079652,14078951..14079008,14077928..14078300,14077606..14077812,14077366..14077527
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,14072028..14072297,14071525..14071802,14071214..14071436,14070771..14071123
,14070477..14070690,14070166..14070345,14067928..14070069,14067726..14067782

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGACATCCACACATGTGGCGACATTGGGAGTTGGTGCCCAGGCACCTCCTCGTCACCAGAAAAAGTCAGCTGGCACTGCATTTGTATCATCTGGGTCATCAAGACCCTCATACCGAAAGAATGGTCAGCGTACTCGGTCACTTAGGGAAGAAAGCAATGGAGGAGTGTCTGATTCCAAAAAGCTTAACCACTCTATTCGCCAAGGTCTTGCTGGCATCATTGACCTCCCAAATGACGCAGCTTCAGAAGTTGATATTTCACATGGTTCCGAAGATCCCAGGGGGCCTACGGTCCCAGGTTCCTACCAAATGAATGGGATTATCAATGAAACACATAATGGGAGGCATGCTTCAGTCTCCAAGGTTGTTGAGTTTTGTACGGCACTTGGTGGCAAAACACCAATTCACAGTGTATTAGTGGCCAACAATGGAATGGCAGCAGCTAAGTTCATGCGGAGTGTCCGAACATGGGCTAATGATACTTTTGGATCAGAGAAGGCAATTCAGCTGATAGCTATGGCAACTCCGGAGGATCTGAGGATAAATGCAGAGCACATCAGAATTGCCGATCAATTTGTAGAGGTACCTGGTGGAACAAACAACAACAACTATGCAAATGTCCAACTCATAGTGGAGATAGCAGAGAGAACAGGTGTTTCTGCTGTTTGGCCTGGTTGGGGTCATGCATCTGAGAATCCTGAACTTCCAGATGCGCTGACTGCAAAAGGAATTGTTTTTCTTGGGCCACCAGCATCATCAATGCATGCATTAGGAGACAAGGTTGGCTCAGCTCTCATTGCTCAAGCAGCTGGAGTTCCAACACTTGCTTGGAGTGGATCACATGTGGAAGTTCCTCTGGAGTGTTGCTTGGACTCAATACCTGATGAGATGTATAGAAAAGCTTGTGTTACTACCACAGAGGAAGCAGTTGCAAGTTGTCAGGTGGTTGGTTATCCTGCCATGATTAAGGCATCTTGGGGTGGTGGTGGTAAAGGAATAAGGAAGGTTCATAATGATGATGAGGTTAGGACATTATTTAAGCAAGTTCAAGGCGAAGTACCTGGTTCCCCAATATTTATCATGAGGCTAGCTGCTCAGAGTCGACATCTTGAAGTTCAGTTGCTTTGTGATCAATATGGCAACGTAGCAGCACTTCACAGTCGAGATTGCAGTGTACAACGGCGACACCAAAAGATAATCGAGGAAGGACCAGTTACTGTTGCTCCTCGTGAGACTGTGAAAGAGCTTGAGCAGGCAGCACGGAGGCTTGCTAAAGCTGTGGGTTATGTTGGTGCTGCTACTGTTGAATACCTTTACAGCATGGAAACTGGTGAATATTATTTTCTGGAACTTAATCCACGGCTACAGGTTGAGCATCCTGTCACTGAGTGGATAGCTGAAGTAAATTTGCCTGCGGCTCAAGTTGCTGTTGGAATGGGTATACCCCTTTGGCAGATTCCAGAGATCAGGCGCTTCTACGGAATGAACCATGGAGGAGGCTATGACCTTTGGAGGAAAACAGCAGCTCTAGCGACTCCATTTAACTTTGATGAAGTAGATTCTAAATGGCCAAAAGGCCACTGCGTAGCTGTTAGAATAACTAGCGAGGATCCAGATGATGGGTTTAAGCCTACTGGTGGAAAAGTAAAGGAGATAAGTTTCAAGAGTAAACCAAATGTTTGGGCCTATTTCTCAGTAAAGTCTGGTGGAGGCATCCATGAATTCGCTGATTCTCAGTTCGGACATGTTTTTGCGTATGGAACTACTAGATCGGCAGCAATAACTACCATGGCTCTTGCACTAAAAGAGGTTCAAATTCGTGGAGAAATTCATTCAAACGTAGACTACACAGTTGACCTATTAAATGCCTCAGATTTTAGAGAAAATAAGATTCATACTGGTTGGCTGGATACCAGGATAGCCATGCGTGTTCAAGCTGAGAGGCCTCCATGGTATATTTCAGTCGTTGGAGGGGCTTTATATAAAACAGTAACTGCCAACACGGCCACTGTTTCTGATTATGTTGGTTATCTTACCAAGGGCCAGATTCCACCAAAGCATATATCCCTTGTCTATACGACTGTTGCTTTGAATATAGATGGGAAAAAATATACAATCGATACTGTGAGGAGTGGACATGGTAGCTACAGATTGCGAATGAATGGATCAACGGTTGACGCAAATGTACAAATATTATGTGATGGTGGGCTTTTAATGCAGCTGGATGGAAACAGCCATGTAATTTATGCTGAAGAAGAGGCCAGTGGTACACGACTTCTTATTGATGGAAAGACATGCATGTTACAGAATGACCATGACCCATCAAAGTTATTAGCTGAGACACCATGCAAACTTCTTCGTTTCTTGGTTGCTGATGGTGCTCATGTTGATGCTGATGTACCATATGCGGAAGTTGAGGTTATGAAGATGTGCATGCCCCTCTTATCACCCGCTTCTGGTGTCATACATGTTGTAATGTCTGAGGGCCAAGCAATGCAGGCTGGTGATCTTATAGCTAGGCTGGATCTTGATGACCCTTCTGCTGTTAAGAGAGCTGAGCCGTTCGAAGATACTTTTCCACAAATGGGTCTCCCTATTGCTGCTTCTGGCCAAGTTCACAAATTATGTGCTGCAAGTCTGAATGCTTGTCGAATGATCCTTGCGGGGTATGAGCATGATATTGACAAGGTTGTGCCAGAGTTGGTATACTGCCTAGACACTCCGGAGCTTCCTTTCCTGCAGTGGGAGGAGCTTATGTCTGTTTTAGCAACTAGACTTCCAAGAAATCTTAAAAGTGAGTTGGAGGGCAAATATGAGGAATACAAAGTAAAATTTGACTCTGGGATAATCAATGATTTCCCTGCCAATATGCTACGAGTGATAATTGAGGAAAATCTTGCATGTGGTTCTGAGAAGGAGAAGGCTACAAATGAGAGGCTTGTTGAGCCTCTTATGAGCCTACTGAAGTCATATGAGGGTGGGAGAGAAAGTCATGCTCACTTTGTTGTCAAGTCCCTTTTTGAGGAGTATCTCTATGTTGAAGAATTGTTCAGTGATGGAATTCAGTCTGATGTGATTGAGCGTCTGCGCCTTCAACATAGTAAAGACCTACAGAAGGTCGTAGACATTGTGTTGTCCCACCAGAGTGTTAGAAATAAAACTAAGCTGATACTAAAACTCATGGAGAGTCTGGTCTATCCAAATCCTGCTGCCTACAGGGATCAATTGATTCGCTTTTCTTCCCTTAATCACAAAGCGTATTACAAGTTGGCACTTAAAGCTAGTGAACTTCTTGAACAAACAAAACTTAGTGAGCTCCGTGCAAGAATAGCAAGGAGCCTTTCAGAGCTGGAGATGTTTACTGAGGAAAGCAAGGGTCTCTCCATGCATAAGCGAGAAATTGCCATTAAGGAGAGCATGGAAGATTTAGTCACTGCTCCACTGCCAGTTGAAGATGCGCTCATTTCTTTATTTGATTGTAGTGATACAACTGTTCAACAGAGAGTGATTGAGACTTATATAGCTCGATTATACCAGCCTCATCTTGTAAAGGACAGTATCAAAATGAAATGGATAGAATCGGGTGTTATTGCTTTATGGGAATTTCCTGAAGGGCATTTTGATGCAAGAAATGGAGGAGCGGTTCTTGGTGACAAAAGATGGGGTGCCATGGTCATTGTCAAGTCTCTTGAATCACTTTCAATGGCCATTAGATTTGCACTAAAGGAGACATCACACTACACTAGCTCTGAGGGCAATATGATGCATATTGCTTTGTTGGGTGCTGATAATAAGATGCATATAATTCAAGAAAGTGGTGATGATGCTGACAGAATAGCCAAACTTCCCTTGATACTAAAGGATAATGTAACCGATCTGCATGCCTCTGGTGTGAAAACAATAAGTTTCATTGTTCAAAGAGATGAAGCACGGATGACAATGCGTCGTACCTTCCTTTGGTCTGATGAAAAGCTTTCTTATGAGGAAGAGCCAATTCTCCGGCATGTGGAACCTCCTCTTTCTGCACTTCTTGAGTTGGACAAGTTGAAAGTGAAAGGATACAATGAAATGAAGTATACCCCATCACGGGATCGTCAATGGCATATCTACACACTTAGAAATACTGAAAACCCCAAAATGTTGCACCGGGTATTTTTCCGAACCCTTGTCAGGCAACCCAGTGTATCCAACAAGTTTTCTTCGGGCCAGATTGGTGACATGGAAGTTGGGAGTGCTGAAGAACCTCTGTCATTTACATCAACCAGCATATTAAGATCTTTGATGACTGCTATAGAGGAATTGGAGCTTCACGCAATTAGAACTGGCCATTCACACATGTATTTGCATGTATTGAAAGAACAAAAGCTTCTTGATCTTGTTCCAGTTTCAGGGAATACAGTTTTGGATGTTGGTCAAGATGAAGCTACTGCATATTCACTTTTAAAAGAAATGGCTATGAAGATACATGAACTTGTTGGTGCAAGAATGCACCATCTTTCTGTATGCCAATGGGAAGTGAAACTTAAGTTGGACTGCGATGGTCCTGCCAGTGGTACCTGGAGGATTGTAACAACCAATGTTACTAGTCACACTTGCACTGTGGATATCTACCGTGAGATGGAAGATAAAGAATCACGGAAGTTAGTATACCATCCCGCCACTCCGGCGGCTGGTCCTCTGCATGGTGTGGCACTGAATAATCCATATCAGCCTTTGAGTGTCATTGATCTCAAACGCTGTTCTGCTAGGAATAATAGAACTACATACTGCTATGATTTTCCACTGGCATTTGAAACTGCAGTGAGGAAGTCATGGTCCTCTAGTACCTCTGGTGCTTCTAAAGGTGTTGAAAATGCCCAATGTTATGTTAAAGCTACAGAGTTGGTATTTGCGGACAAACATGGGTCATGGGGCACTCCTTTAGTTCAAATGGACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCAC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Protein Sequence

<aaseq>MTSTHVATLGVGAQAPPRHQKKSAGTAFVSSGSSRPSYRKNGQRTRSLREESNGGVSDSKKLNHSIRQGLAGIIDLPNDAASEVDISHGSEDPRGPTVPGSYQMNGIINETHNGRHASVSKVVEFCTALGGKTPIHSVLVANNGMAAAKFMRSVRTWANDTFGSEKAIQLIAMATPEDLRINAEHIRIADQFVEVPGGTNNNNYANVQLIVEIAERTGVSAVWPGWGHASENPELPDALTAKGIVFLGPPASSMHALGDKVGSALIAQAAGVPTLAWSGSHVEVPLECCLDSIPDEMYRKACVTTTEEAVASCQVVGYPAMIKASWGGGGKGIRKVHNDDEVRTLFKQVQGEVPGSPIFIMRLAAQSRHLEVQLLCDQYGNVAALHSRDCSVQRRHQKIIEEGPVTVAPRETVKELEQAARRLAKAVGYVGAATVEYLYSMETGEYYFLELNPRLQVEHPVTEWIAEVNLPAAQVAVGMGIPLWQIPEIRRFYGMNHGGGYDLWRKTAALATPFNFDEVDSKWPKGHCVAVRITSEDPDDGFKPTGGKVKEISFKSKPNVWAYFSVKSGGGIHEFADSQFGHVFAYGTTRSAAITTMALALKEVQIRGEIHSNVDYTVDLLNASDFRENKIHTGWLDTRIAMRVQAERPPWYISVVGGALYKTVTANTATVSDYVGYLTKGQIPPKHISLVYTTVALNIDGKKYTIDTVRSGHGSYRLRMNGSTVDANVQILCDGGLLMQLDGNSHVIYAEEEASGTRLLIDGKTCMLQNDHDPSKLLAETPCKLLRFLVADGAHVDADVPYAEVEVMKMCMPLLSPASGVIHVVMSEGQAMQAGDLIARLDLDDPSAVKRAEPFEDTFPQMGLPIAASGQVHKLCAASLNACRMILAGYEHDIDKVVPELVYCLDTPELPFLQWEELMSVLATRLPRNLKSELEGKYEEYKVKFDSGIINDFPANMLRVIIEENLACGSEKEKATNERLVEPLMSLLKSYEGGRESHAHFVVKSLFEEYLYVEELFSDGIQSDVIERLRLQHSKDLQKVVDIVLSHQSVRNKTKLILKLMESLVYPNPAAYRDQLIRFSSLNHKAYYKLALKASELLEQTKLSELRARIARSLSELEMFTEESKGLSMHKREIAIKESMEDLVTAPLPVEDALISLFDCSDTTVQQRVIETYIARLYQPHLVKDSIKMKWIESGVIALWEFPEGHFDARNGGAVLGDKRWGAMVIVKSLESLSMAIRFALKETSHYTSSEGNMMHIALLGADNKMHIIQESGDDADRIAKLPLILKDNVTDLHASGVKTISFIVQRDEARMTMRRTFLWSDEKLSYEEEPILRHVEPPLSALLELDKLKVKGYNEMKYTPSRDRQWHIYTLRNTENPKMLHRVFFRTLVRQPSVSNKFSSGQIGDMEVGSAEEPLSFTSTSILRSLMTAIEELELHAIRTGHSHMYLHVLKEQKLLDLVPVSGNTVLDVGQDEATAYSLLKEMAMKIHELVGARMHHLSVCQWEVKLKLDCDGPASGTWRIVTTNVTSHTCTVDIYREMEDKESRKLVYHPATPAAGPLHGVALNNPYQPLSVIDLKRCSARNNRTTYCYDFPLAFETAVRKSWSSSTSGASKGVENAQCYVKATELVFADKHGSWGTPLVQMDRPAGLNDIGMVAWTLKMSTPEFPSGREIIVVANDITFRAGSFGPREDAFFEAVTNLACEKKLPLIYLAANSGARIGIADEVKSCFRVGWSDDGSPERGFQYIYLSEEDYARIGTSVIAHKMQLDSGEIRWVIDSVVGKEDGLGVENIHGSAAIASAYSRAYKETFTLTFVTGRTVGIGAYLARLGIRCIQRLDQPIILTGYSALNKLLGREVYSSHMQLGGPKIMATNGVVHLTVSDDLEGVSNILRWLSYVPAYIGGPLPVTTPLDPPDRPVAYIPENSCDPRAAIRGVDDSQGKWLGGMFDKDSFVETFEGWAKTVVTGRAKLGGIPVGVIAVETQTMMQTIPADPGQLDSREQSVPRAGQVWFPDSATKTAQALLDFNREGLPLFILANWRGFSGGQRDLFEGILQAGSTIVENLRTYNQPAFVYIPMAAELRGGAWVVVDSKINPDRIECYAERTAKGNVLEPQGLIEIKFRSEELQDCMSRLDPTLIDLKAKLEVANKNGSADTKSLQENIEARTKQLMPLYTQIAIRFAELHDTSLRMAAKGVIKKVVDWEESRSFFYKRLRRRISEDVLAKEIRAVAGEQFSHQPAIELIKKWYSASHAAEWDDDDAFVAWMDNPENYKDYIQYLKAQRVSQSLSSLSDSSSDLQALPQGLSMLLDKMDPSRRAQLVEEIRKVLG</aaseq>

Gene Sequence

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