Difference between revisions of "BGIOSGA019083"

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA019083

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019083, complete gene.

LocusTag

OsI_18253

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA019083-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA019083-PA

Length

9563

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:1312408..1321970

Sequence Coding Region

1312408..1312599,1315522..1315617,1315735..1315836,1315957..1316079,1317189..1317362
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Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:1312408..1321970 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:1312408..1321970 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGATGACGTCAGGAGGTTGGACAGCGCGGATCAGGACCTGCTCCTGTGCGTCGAGGATGATGTGGTCGCCACCACCACCGCCGGCGACGGGGCCTGGGCGGATGACCTAGAGGAAAGGGCGGCAAATCTTGGTGAGCCGGGGCAATTTGGTCTCATCAAGCCGCATTCCAACGAAATAGAATTGAAAATGATGGTTCACGCAAAGGATAGTGATGAAATTTTTGTTGATTCTACTTCTTCTGATTCTAAAAGTTCTGAAAATGATGATGTTATTTCTGATAGTGAAGACTCTAAAACTAGTTGTGATGAGATATCAAAAGAGGAGCTATTGCGATCTTTGAAGCTAAAGTTGAATAAAAAGAAAGTATCTGTTGACTGCAATTTGAAGAGAAAAAGATCTGAAACAGCAGAAGTTGATTTCAAAAATCAGTTGGATTCAGCATTACTTGAAATTTTTAGAGACAATGTTTTGATTGGTACGAAACGAAAACTCTACTGCCATAAAAGCAAGGTCAATTACTTGGATTTTCTTAACTTTGGTATGCGAAAAGTGTTGCAAGATACTCCAAGAATCAAAGTATGGAAAGGAACAATGATCAAAAAATTTTCAAAGTTTGATAAAATAAGCAAAGGAGTCTATGGCAAAAGACCGATAAAAGATTTTTCTGAGAGCTGTTACAAAATGATTGAAACTGGTACTGCCAAAGCAACTTTTCTTCAAAGGCTTGATTTTGCAATTGGTGTTGACTTACCTCAAGAAATCAAAAAAGACATAAATGAGTTGCTTCTGCACCATTTGGGTCCTGATGAAAATTGCATCAATGATAGAGTGAAGAATCTTCTCATTGATATATTTGATCTTTTATCTAATGCTAGCAAGCCAAGTGTTCCTGATAATACTGATTTTAATCCTTCTGAAGATGACAAGAATAAGTTGAATGATGGCAGCATAATAAATGAAGCTAACATTTGTGAAACCCCAAAGATCCATTCCACTTGTGATGACAATGCAATTCTAAATGAACAGTCCCCAATGCTGTGCAAAGATACTAAAACTCCCGAAAGATCATGTTCTGAAAAGGATAAAAATTCTGATGTTGATGGTATAATGAGAAAGCTTTGTAAGCCTGGAATGATTTCTAGTCCTCCAAAGATAACTAAAGCAAGATTTGTTGGTTTCAATGAAAGAAAACCCATCTATTTTGATCATGAGAAGCCACAGTTTCAAATCTGGGATTCAGATGATGATAACATTAATCAAGAAGATAATTTGAGGTCTGAAGTAACACCAAGACATGGACTCAAATCAAGCAAAATTGTTCCTGATTCTTACTCCCCAACATGCCCTACTGAATTGAACAAAACCAAGATTATTCCATTGGACCTGTCACAAAATTTATATGATTTATCTCAAAACCAAGAAAACAATTCAGAAAACGAGGACCAGTTGATAATGGTAACTTTGGAAGATTCAGAAACACAATCTCAACACAAGAAAAGGAAAATTTGCCTGTTCAACAACAGTACACTAAGACAACAGAAAACAAAAAGCTTTTTTTTTCCAATTGTCAAGAATCGGCACTGGTTTGTGTTTGCAATTGATCTGAAAGCTCAGAGATTTGACTGTGGTATTTTTACTCTCAAGTTCATGGAGACCTTTACAAACTACTGGATGATCACTTTTGAAGGTGTGCTGAAGATCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDDVRRLDSADQDLLLCVEDDVVATTTAGDGAWADDLEERAANLGEPGQFGLIKPHSNEIELKMMVHAKDSDEIFVDSTSSDSKSSENDDVISDSEDSKTSCDEISKEELLRSLKLKLNKKKVSVDCNLKRKRSETAEVDFKNQLDSALLEIFRDNVLIGTKRKLYCHKSKVNYLDFLNFGMRKVLQDTPRIKVWKGTMIKKFSKFDKISKGVYGKRPIKDFSESCYKMIETGTAKATFLQRLDFAIGVDLPQEIKKDINELLLHHLGPDENCINDRVKNLLIDIFDLLSNASKPSVPDNTDFNPSEDDKNKLNDGSIINEANICETPKIHSTCDDNAILNEQSPMLCKDTKTPERSCSEKDKNSDVDGIMRKLCKPGMISSPPKITKARFVGFNERKPIYFDHEKPQFQIWDSDDDNINQEDNLRSEVTPRHGLKSSKIVPDSYSPTCPTELNKTKIIPLDLSQNLYDLSQNQENNSENEDQLIMVTLEDSETQSQHKKRKICLFNNSTLRQQKTKSFFFPIVKNRHWFVFAIDLKAQRFDCGIFTLKFMETFTNYWMITFEGVLKI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..192#3115..3210#3328..3429#3550..3672#4782..4955#5037..5253#5382..5464#5548..5643#5746..5794#5919..6157#6651..6722#6798..6907#7949..8014#9275..9311#9430..9463#9547..9563#ATGGATGACGTCAGGAGGTTGGACAGCGCGGATCAGGACCTGCTCCTGTGCGTCGAGGATGATGTGGTCGCCACCACCACCGCCGGCGACGGGGCCTGGGCGGATGACCTAGAGGAAAGGGCGGCAAATCTTGGTGAGCCGGGGCAATTTGGTCTCATCAAGCCGCATTCCAACGAAATAGAATTGAAAATGGTGAAAATGACAAAGTGGCTATGATCGCCCGCTCCATATTGTCATTTTAGCGAAACGCCTTTTTGGATGGCATTCCAGCGAAACCGCTTTTTTAACGTGGCTAAATGTCCATTTTCTCCAAGCTAGCATAGGTATCTTTTGTGTATGGGCCTACCTTGTTTTTCTCGTCATAGGCTTATACATTGTGGGGCTCAATAACAACTACTATCACCGGATCAATGGTCACATGTTGTTACCCACTTGTTTTTGTTATTCCATTATCTTAAAAAAAATTACCTACTTGTAAAATAAAAATTGTACATGCCCTAAAAATATCCAAATATATCAGGGGAATTCAACTTTTTGTTGAAGCTATAACTAAACTCAGTTGAGAGACACGTCATTTATATAGCTACGAAGAAATTAAGAAGACATATCAATATGTCATATATCACTTCACAAACAGGGGTGAAGCTAGAGCGAAATGGAGGGTGGTGCCACTTGCTTAATTTACTCCACTTTAGATCGAGTTTAAGCTGATGCGGGTGTCTAAGTTTGCATAAGGGGGTGCATACATGGTGAAAATAGATAAAATATAGCCCTGGGATCCCCCAAACATATACTAGCTCCGCCCCTGTTCACGAACATATAATTTAAAACTATACTTTTGCATATCATAACGAAAAAACAAATTAAATATTTTTAATACGGATTGGCTACTCTTCTGTCGACAGATTTTGCTGGGCTCCATCTTTCGTTTTTTGGGCCGTCCATCATGTTTAAGATTCGTGCAATAATTGGGTTGTGGGATGGACTTCTCTGTTTGGGCTACCGATCTTTTTTATCTATTGGGCTGGCCTTTTTATTGATTCCTCGTGGGTCCCATAGCAACTGTTCAATTTTGAAATCCGCGCCTGCTTTTTTCTTTTCTCTTCTGTGGGTCCCACATTTGCTGAATTTTCTCATTTCTTCCGACTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACGCTTTTAGGAGAGGAGAGCAGAGAGCGGCGACGATTTCGTCGTCGTCAACAGAAGGCCATTTCGCTGCGGCAGCGATTCTGGCGGAGCGACGTGAGGGCGATTCGTTGGTGAGTAGCTCGACGTGAGGGTGATTAGTTGGTAGATTCGTCCATTCTTCCTCCATTCTCCCCTTCAAGCATCACCTGAATCTGCTCAACTGCATGCGTTGATGAGTTTTTTCGTTTTGGTTTGGGTTTGCTGTTGATGAGTTTTGAGTGGATTTTTTTGCTGTTGATGAGTGGGGTATTGTTGCTGTTTGATGTGTGGGGAATTTTCGCTGTTGATTGGGGGGGGAGAGGTGGGTGGGGGGTGGGAAGTGTTGTTGCTGCTGTTGAGGTTTTGAGTGGATTTTTTTCTGTTGATGAGTGGGGCATTGTTACTGTTTGATGTGTGGGGGATTTTTGCTGTTGATTGGGGGGGGGGACGACGGTGGGTGGGGCGGTGGGACCGGGTTGTTGCTGCTGTTGACGGTTTTGACGTGGACTTTTTTTCTGTTGACTAGTGGGGCACTTTTTGCTGTTGACTTGGGGGGAGAGGTGGGTGGTTGTTGCTGTTGAGGAGGAGTGGATTGTTTTTGCTTTTGATGAGGAGGGGATTTGTTCATGTTTATGAGGAGGGGATTTTTGGGATCTCGTTTTTTTGGATGAGTAGTAGTATTTTGTGTGTGCTTATGTTTTTTGCTTTGGAGATTGTGTTATTTGGCTTTCATCAACGATGTGATGTTGTTCATGTGCGATTAGATCATGTTGTTTAATTTTCTCTTAGGTGTTTGAAGCTTCGATCTGGTGGATTCAGTTAAGGTTAGTTATTTGTCTGAACTTGATGTGGTGTAGATCTGAAAATGAATGTACTAAATTATGTAGAACACTATGTGTGATCTGAAGTTGTTTTTAACTGGATTTAATAGAGTTTGATTTCTCATGTAGATCTGTTTACCAATGCCCTAGACTGATTTACTTTTGTTTTGGTTTTTTGTTTGGATGCTCAGATCTGTAGTTTTGCAGATATATAGTTTGAATCTAAGAATGATTTGTGTGATCCTAAGTGAGTGTGGTTATATGATTTGTGTTCATTGGAAGCACCATAAGACATAGCTGTACCGAATTTTTAATTCACCTTGGATGAAGTGTCTGTGTGTGCACTGATGAAAGTTCATCCTCACTTTCCTCCGTGACATCAGTTGTCACTTAAATTGATGATTTAATGTGTGTCTGTTTTGGATTGGAACCTTTTGTCATCTCAAGTGGAGCTGGCATTATATCTCTGCTGAACATGCTTAATGAAATGATGGGTTGATATGTGGTTGCACCTCTTTTTATTAGTTAACTATAAACTATAAGCTCACATTCATGCATGTACCATGATTCAGGAAATGACAAAGACAAATGATAATTAAATGAAATGATTTAATCTGTAGTAGTTTTATTTTGAAGTTAATTTAAGTTTTTTCATTACTTCAATCTGTTCTAACTGTATTTCCTCTATTCTTTTTAGGTTTTATTTGTAATATTTGATCCAATAGTACTATACCTATTTCATTTCCTGTGTTTGTTGAGTCCTTACAGTGTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGCTGTGTGAGTGTGACAGTTTATCCAGCTATATAAGGTTCATATAATGCATTTGGTGCTATCCTCCAGCAATGCACTTAATAACATAGTTTCATCTTTTTCAGTAACTGAAAACATTATTCTATATACGGACTTTTTTTTTGTGGATTAATGTTTGAACAATTATGTTACATAGGTTACTTTTGTCCAAGTACTTCTGCAGTCTTCTTGTTATATGTAATTTGATTACTTTAGCATTATTTAAAATATTTGCTCCTGCTTTTGTTTGCTATTCCCATTGTGTAATCACATTTCTTTTTTTTTTTAATAGATGGTTCACGCAAAGGATAGTGATGAAATTTTTGTTGATTCTACTTCTTCTGATTCTAAAAGTTCTGAAAATGATGATGTTATTTCTGATAGTGAAGTGAGTATTTCTGTCTTAATTTTTTTTTCCTTTTTTTTGTACAATGAAGCAAGAGACTTATATATTTTTTTATTGTGTTTTCTAATTACATGATTAATTTTCACTATTATTTTGTAGGACTCTAAAACTAGTTGTGATGAGATATCAAAAGAGGAGCTATTGCGATCTTTGAAGCTAAAGTTGAATAAAAAGAAAGTATCTGTTGACTGCAATTTGAAGGTTACTTTTTTTTGTTATGTTCAGTTTTAATTATTATTTTTACAGCTTTCCCATTTTTTGTATTCACTTGGTAAATACATTTCCAGTTTTTTTTTAAAAAAATTCCCTATTCTTGCGCAGAGAAAAAGATCTGAAACAGCAGAAGTTGATTTCAAAAATCAGTTGGATTCAGCATTACTTGAAATTTTTAGAGACAATGTTTTGATTGGTACGAAACGAAAACTCTACTGCCATAAAAGCAAGGTAAATGCAATATATCGAAGCAAGAAATTGAAGATGTGCACTAGTTTGTTCTAGTTTTCATAAACTCTACTACATAAATTCTGTTTGTTCTAGTTTTCATCTTCTACTCTTTTCTTTTCATCACACATCACTTGCTTGTGTTGATTTCTGATTTCTTCTTGACCCTTTTGCTCAACTGTTGTACTTCGTCTTGATGACTTTTGCCTATTTCTGTATTCTCCTTTTTGCTTGGTTTTCTTTTCTTTGAAGTAGCTTCCTTCTTCTCTTCTTCTCCACTCTGTAAATGAGCCAAAAATTAATCACTCATAATATCTTAAAATATGAAAAACAGAATTCATTTGTTTTTGCAGATTACCTTTTGTGGTTTACTTGGAATTTTTCTTTTCCTTTTCCTTGCCAAATCAAACTCAATATGCTTGAAGGGACATGTTGGAAAAGTATGTTCTGTCCTACCGCAGTGACTGCAGTGATTTGTTTCTTTGTCCTCTATTTGCTCTCTAATTGTTTTATATCTTTGCTTAGGCCTCCCTGTTGAATTTGCTATATCTGGATCTTCAATGTAATCTTCTTTATGGATTGCCCAAAAAGTTGATGTCAATTCTTGTGACATCATTGTTCGAGACAAAGTAATTCCACTTTCAAAAGAATATGTTCATATAGTTTTAGGTCTTCCTATTGGAGGTTTACCTATCAGTTCCAATTCTGAAATTGGCAAGCAGAAAATTCTTGACACTTTTGGTCTCTCTTCTTTGCCTACTGTCAAATTTTTTGGAGATAAGCTGATAAGGAACGAATCAATGTCTGATGATCAAGTGTTGATATCCTTCATGATGGTTTCTTTGAATTGTTTTCTTTGCCCAAACTCATCCCTTCAACCTAGCACAAAATATCTCAGTGCTTTTGCGGATCTTACTTCTATTGATAAATTGGATTGGAGCAATCTTGTTTTTGAATGGTTGATGAAACATCTTAGCAAGCTTGAGAAGTCCAAAAGTTTTGGTGGTTGTCTGTACTACCTTGTGGTTAGTATTATTACTCTATCTTTTTTTCAATTGCTTTGCTTTTTTGTAACCACTTAACTTTATATTTTTGCTTTTTCTTATTAATAGGTCAATTACTTGGATTTTCTTAACTTTGGTATG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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA019083