Difference between revisions of "BGIOSGA019299"
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Revision as of 16:24, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA019299 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019299, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_18735 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA019299-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA019299-PA |
| Length |
11403 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:5578430..5589832 |
| Sequence Coding Region |
5578430..5579277,5580372..5580487,5581289..5581497,5581916..5582035,5582139..5582267 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:5578430..5589832 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:5578430..5589832 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCACCCACATTCCCCTCGCCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCCCCACCTCGCCCTCGCCCTCCTCGCCGTCGCATCGGGGAACCCTAGCCTCGGGGGTTTCGATCGGGGGGACGCGGAGGCGGAGGCGTACTCGATCCTGACCTTCCACGACTACACCCCGCCGCCGCCCCCCTCGCTGCCGCCGCCGCCGCCCGCCCCGTCGGCGACCTGCGCCGGGGACCTCCGCGGCGTGGGCGACCTCGACACCCGCTGCGTGGTCCCTGCCTCCGTGAGGCTCCGTGGCCCCGGCGTCTACATCAGCGGGAATGGGACGCTGGTGCTCGTCGACGGCGTCGCCCTCACCTGCGAGAGGCCTGGGTGCGTCGTCTCCGCCAATTTGTCCGGCGGCATCTTCTTCGGCCGTGAGGCCCGTGTCGTGGCCGGGTGGGTTTCTCTTTCAGCTACCAACATCACGCTCTCCAGTGATGCTGTAATCGACACCACCGCGCTCGCTGGCGACCCGCCTGATAAGACCAGCGGCGTGCCTACTGGGTCGTATGGTGATGGCGGTGGCCATGGCGGCCGTGGTGCTAGCTGCTACGTCAAGGAGGGGCAGGCGCAGGAGGATTCGTGGGGCGGCGATATGTACGCTTGGGCTGAACTCAAGACCCCCAATAGCTACGGGAGCAAAGGCGGTTCTACCAGCGTCGAGAAGGACTATGGTGGTGGTGGTGGGGGTGTAGTGTGGTTGTTCGCCAAGGATATTATGATGAATGGAACAATTCTTGCTAATGGAGGAGATGGTGGCACCAAAGGTGGGGGTGGCTCTGGGGGAAGCATCTATCTCAAGGCTAAAACCATGCAAGGAGGTGGCACAATAAGTGCTTGCGGAGGGGATGGTTTGGCTGGGGGAGGTGGTGGGCGTGTTTCTGTTGATGTTTTCAGTAGGCATGATGACTCCCAATTTTTTGTTCATGGTGGGAGGAGCTCAGGTTGTCTGGACAATGCAGGTGCAGCTGGGACTCTTTATGAAGAAGTGCCTAAGAGTATTACTGTTAGCAACAATAACTTGAGCACACAAACTGATACAGTTTTTCTAGAACCCCCATATGATCCACTCTGGACAAATGTTTTTATCAAGAATCATGCCAAAGTTTCTCTTCCCTTGCGTTGGAGTCGTATTCAGGCTCAAGGACAAATTAGCCTTCTATCTCGCGCTACATTAACTTTTGGCTTGACACACTATCCATATTCAGAGTTTGAATTGTTGGCTGAGGAACTTCTTATGAGTGATTCTACAATTAAGGTGTTTGGTGCTTTACGAATGTCTGTAAAGATGCTTCTTATGTGGAACTCTAGAATGTTGATTGATGGTGGCAGAGAGTCAGGAGTTGCGACTTCTTTACTAGAGGGTAGCAATTTGATAGTGTTGAAGGAATCATCAGTTATACATTCTATTGGCAATCTTGGAATTCATGGTCAAGGCATCCTGAATTTATCTGGAGATGGAGATACGATTCAGGCGCAACGTCTTATTTTATCACTTTTCTACAACATAGTGATATGCCGTGTTGAAGACATTGTTGTTTCTGGCCTTGTGCAAGGAACTGTTATTAATTTCAACAGAGCAAGAAATGTCACTGTGAGATCATCTGGGACCATTAGTGCAACAGGATTAGGCTGCCGAGGTGGAATTGGACGAGGAAGAATGTTAAGCAGTGGCCTTAGTGGTGGGGGTGGGCATGGTGGTAAAGGAGGGGATGCTTTCTACAGTGGCAGTCATGCAGGGGGTGGAACTGCATATGGTAGTGCTGATTTACCATGTGAACTTGGCAGTGGTAGTGGTAATGTAAGTACATCATCTTCAACAGCTGGTGGTGGTATAATAGTAATGGGTTCTTTGGAGCAATCTCTTCCACTACTCTCCCTTGCTGGTTCAATAGAGGCGAATGGTGGCAGTTTTGCTGGTGCGGTGACTCATGCTGCAAATGAAGGACCTGGTGGTGGTTCCGGGGGCACAATTCTTCTATTTGTGAGGGCATTGTCCTTGGAGGAGGGCTCTGTACTTTCTAGCGCTGGTGGGGTTGGAAGTAATGGTAGTGGCGGAGGTGGAGGTGGCCGGATTCACTTCCACTGGTCTGACATTCCCACTGGAGATGATTATATTCCCTTTGCAACAGTTAATGGATCAATACTTGCAAGAGGAGGAACCGTTGATGGCCAAGGTTTTCCGGGTGAAAATGGAACAGTGACAGGAAAAGATTGCCCAAAAGGTCTTTATGGCACATTTTGCAAGGCCTGTCCTTTAGGAACATATAAGAACATTACTGGGTCTTTGAAGTCCTTGTGTTCTCCATGCCCTACAAATGAGCTCCCTCATCGTGCTGTCTACATAAGCATCCGAGGAGGTGTTACTGAAACCCCGTGCCCATACAAATGTGTGTCCGATAGATACCGCATGCCTCACTGTTTTACTGCTCTTGAAGAGTTAATATACACTTTTGGTGGACCTTGGTTGTTTGGTCTGTTTCTCTCAGGCCTTCTTTTTTTATTAGCCCTTGTTTTGAGTATCGCTCGGATGAAGTTTGTTGGCACTGATGAGTTGCCTGGACCAGCACCAACTCAACATAGCTCCCAAATTGATCACTCTTTTCCCTTCCTCGAATCACTCAATGAGGTACTGGAAACCAATAGGGCCGAAGAATCTCACTGTCATGTGCACAGGATGTATTTCATGGGTCCCAACACCTTCAGTGAACCTTGGCATCTACCACACACCCCACCTGAGCAGATTTCTGAGATTGTGTATGAGGATGCATTTAACAAGTTTGTCGATGAGATAAATGCTCTCGCAGCATATCAGTGGTGGGAAGGATCAATTTATAGTATCCTGTGTATACTTTCATACCCCTTGGCATGGTCTTGGCAACAGTGGCGCAGAAGAAGAAAATTACAAAGATTACGTGAATTTGTTCGATCTGAATATGATCATTCATGTTTACGGTCTTGCCGTTCACGTGCTCTTTATGAAGGGCTGAAGGTTGCTGCTACACCAGATTTAATGCTGGGTTATTTAGATTTCTTTCTTGGTGGGGATGAAAAAAGGCCTGACCTCCCCCCTCGTCTTCATCAAAGGTTGCCAATGTCATTAATCTTTGGAGGCGATGGAAGTTACATGGCTCCATTTTCACTTCACAGTGACAGTGTGGTCACAAGTCTTATTAGTCAGGGTGTACCTTCATCAATATGGCACCGCCTTGTTGCTGGATTGAACGCCCAGTTGCGTTTGGCTCGTCGTGGAAATCTAAAAGCCACATTTCTTCCTGTACTCAAATGGCTTGAAACTCATGCAAATCCTGCTTTGAACACATACCGCGTGCGTGTTGACCTTGCATGGTTCCAAGCTACAGCACTAGGTTACTATCAATTTGGTCTAGTTATTCATTCTGTGGGACCATTCAGTAGTGGCCTTCAAGGTGGCTCTAGAATGAAATTTGATTATCATGCGCAATTTCAGAACACAGATGTTGATTCTCAACTAGACCACTCAAGGAACAATGATGCTGTTATGCTTAAAAGAATAACTGGCAGAGTTCTCGACATTGACAACTTAAGGACACTCAAGGACAAGAGAGATTTATTTTACCCTCTTTCTCTTATATTGCACAATACCAAACCAGTTGGGCATCAGGATCTTGTTGGTTTGGTGATCTCTATATTGCTTCTTGCAGATTTCAGCTTAGTATTGCTTACTTTTCTCCAGCTATATTCATATTCTATGATCGATGTGTTGTTAGTGCTGTTTGTTCTTCCTCTTGGGATACTGGCACCCTTTCCTGCTGGGATAAATGCTCTATTTAGTCATGGACCACGGCGGTCAGCAGGTCTTGCTCGTGTGTATGCGCTGTGGAATATTACATCATTGGTTAATGTTATCGTGGCCTTTGCGTGTGGACTTGTGCATTACAAGTCTTCAGCCAAAAGGCATCCAAGCATGCAACCTTGGAATTTGGGCGGGGATGATACTAGCTGGTGGCTGTTCCCAACAGGACTTGTGTTATGTAAATGCATCCAAGCAAGACTTGTCGATTGGCATGTCTCTATCTTAGAGATCCAGGATCGTGCAGTTTATAGCAATGACCCAACCATATTTTGGCAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATHIPLARLRLRLRLPHLALALLAVASGNPSLGGFDRGDAEAEAYSILTFHDYTPPPPPSLPPPPPAPSATCAGDLRGVGDLDTRCVVPASVRLRGPGVYISGNGTLVLVDGVALTCERPGCVVSANLSGGIFFGREARVVAGWVSLSATNITLSSDAVIDTTALAGDPPDKTSGVPTGSYGDGGGHGGRGASCYVKEGQAQEDSWGGDMYAWAELKTPNSYGSKGGSTSVEKDYGGGGGGVVWLFAKDIMMNGTILANGGDGGTKGGGGSGGSIYLKAKTMQGGGTISACGGDGLAGGGGGRVSVDVFSRHDDSQFFVHGGRSSGCLDNAGAAGTLYEEVPKSITVSNNNLSTQTDTVFLEPPYDPLWTNVFIKNHAKVSLPLRWSRIQAQGQISLLSRATLTFGLTHYPYSEFELLAEELLMSDSTIKVFGALRMSVKMLLMWNSRMLIDGGRESGVATSLLEGSNLIVLKESSVIHSIGNLGIHGQGILNLSGDGDTIQAQRLILSLFYNIVICRVEDIVVSGLVQGTVINFNRARNVTVRSSGTISATGLGCRGGIGRGRMLSSGLSGGGGHGGKGGDAFYSGSHAGGGTAYGSADLPCELGSGSGNVSTSSSTAGGGIIVMGSLEQSLPLLSLAGSIEANGGSFAGAVTHAANEGPGGGSGGTILLFVRALSLEEGSVLSSAGGVGSNGSGGGGGGRIHFHWSDIPTGDDYIPFATVNGSILARGGTVDGQGFPGENGTVTGKDCPKGLYGTFCKACPLGTYKNITGSLKSLCSPCPTNELPHRAVYISIRGGVTETPCPYKCVSDRYRMPHCFTALEELIYTFGGPWLFGLFLSGLLFLLALVLSIARMKFVGTDELPGPAPTQHSSQIDHSFPFLESLNEVLETNRAEESHCHVHRMYFMGPNTFSEPWHLPHTPPEQISEIVYEDAFNKFVDEINALAAYQWWEGSIYSILCILSYPLAWSWQQWRRRRKLQRLREFVRSEYDHSCLRSCRSRALYEGLKVAATPDLMLGYLDFFLGGDEKRPDLPPRLHQRLPMSLIFGGDGSYMAPFSLHSDSVVTSLISQGVPSSIWHRLVAGLNAQLRLARRGNLKATFLPVLKWLETHANPALNTYRVRVDLAWFQATALGYYQFGLVIHSVGPFSSGLQGGSRMKFDYHAQFQNTDVDSQLDHSRNNDAVMLKRITGRVLDIDNLRTLKDKRDLFYPLSLILHNTKPVGHQDLVGLVISILLLADFSLVLLTFLQLYSYSMIDVLLVLFVLPLGILAPFPAGINALFSHGPRRSAGLARVYALWNITSLVNVIVAFACGLVHYKSSAKRHPSMQPWNLGGDDTSWWLFPTGLVLCKCIQARLVDWHVSILEIQDRAVYSNDPTIFWQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
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